Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hsa-miR-223-5p | CCNT1 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0004570 | 904 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | CCNT//CYCT1//HIVE1 |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | |||||||||||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-223-5p |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | CCNT1 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | CCNT1 |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | CCNT1 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||||||||||||||||
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RNALocate | hsa-miR-223-5p |
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CCNT1 |
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Interactor1: hsa-miR-223-5p | Interactor2: CCNT1 |
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Strong-Evidence | Ago2-IP//Luciferase reporter assay//qPCR//Western blot | |
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Weak-Evidence | Microarray | |
Prediction-Evidence | RNA22//RNAHybrid | |
Support Database | ViRBase |
[1]PMID | 22205749 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | Upregulation |
Tissue or cell line | CD4(+) T cells//HeLa cells//Jurkat cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | Cells overexpressing miR-27b showed decreased viral gene expression levels of the HIV-1 reporter virus and a decreased replication of strain NL4.3; a partial rescue of viral transcription could be seen following the transfection of cyclin T1. These results implicate miR-27b as a novel regulator of cyclin T1 protein levels and HIV-1 replication, while miR-29b, miR-223, and miR-150 may regulate cyclin T1 indirectly. |
[2]PMID | 22936931 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | Upregulation |
Tissue or cell line | CD4(+) T cells//HeLa cells//Jurkat cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | Table2 summarizes the list of cellular microRNAs with their validated host cellular protein targets and their corresponding cellular functions.Table 2 List of published cellular microRNAs and their target HIV-1 and cellular gene products. |