Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hsa-miR-20a-5p | KAT2B |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0000075 | 8850 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | CAF//P/CAF//PCAF |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | ||||||||||||||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-20a-5p |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | KAT2B |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | KAT2B |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | KAT2B |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | hsa-miR-20a-5p |
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KAT2B |
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ncDR | hsa-miR-20a-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | Link | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNAInter | hsa-miR-20a-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | PMID |
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NoncoRNA | hsa-miR-20a-5p |
Interactor1: hsa-miR-20a-5p | Interactor2: KAT2B |
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Strong-Evidence | Luciferase reporter assay//Northern blot//Western blot | |
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Support Database | ViRBase//VIRmiRNA |
[1]PMID | 21569500 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | Downregulation |
Tissue or cell line | HeLa cells//Jurkat cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | Two members of the hsa-miR-17/92 cluster, hsa-miR-17-5p and hsa-miR-20a, target the mRNA of the PCAF cofactor of Tat trans-activation. Our results and published microarrays agree in downregulation of these miRNA by HIV-1 . Their perturbation in HIV-1 infection is near the 2-fold cutoff and sensitive, and specific measurement of the expression changes by RT-qPCR is warranted. |
[2]PMID | 22936931 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | HeLa cells//Jurkat cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | Table2 summarizes the list of cellular microRNAs with their validated host cellular protein targets and their corresponding cellular functions.Table 2 List of published cellular microRNAs and their target HIV-1 and cellular gene products. |
[3]PMID | 23043098 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | HeLa cells//Jurkat cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | Independently, miR-17-5p and miR-20a were found by a separate group to target p300/CBP-associated factor (PCAF), another cellular cofactor of the viral Tat protein (29), and a further set of six miRNAs (miR-15a, miR-15b, miR-16, miR-20a, miR-93, and miR-106b) were reported to repress the expression of a third Tat cofactor, Pur-alpha, which was noted also to be enriched in monocytes (45). |
[4]PMID | 17322031 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase//VIRmiRNA | Interactor1 expression | Downregulation |
Tissue or cell line | HeLa cells//Jurkat cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | Collectively, our results are consistent with miR-17-5p and miR-20a targeting the 3'UTR region of PCAF to inhibit mRNA translation. |