Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hsa-miR-20a-5p | PURA |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0000075 | 5813 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | MRD31//PUR-ALPHA//PUR1//PURALPHA |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | ||||||||||||||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-20a-5p |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | PURA |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | hsa-miR-20a-5p |
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PURA |
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ncDR | hsa-miR-20a-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | Link | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNAInter | hsa-miR-20a-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | PMID |
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NoncoRNA | hsa-miR-20a-5p |
Interactor1: hsa-miR-20a-5p | Interactor2: PURA |
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Strong-Evidence | Bulge-loop miRNA RT-PCR//Dual luciferase reporter assay//qPCR//Western blot | |
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Weak-Evidence | Microarray | |
Prediction-Evidence | Targetscan | |
Support Database | ViRBase |
[1]PMID | 22835829 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | HEK293T cells//PBMCs//Maji-CCR5 cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | Transfection with miRNA mimics significantly inhibited expression of pGL3cM/Pur-alpha 3'-UTR 171-1560 and pGL3cM/Pur-alpha 3'-UTR 171-3782 (Fig. 4C, D), and the mutation of conserved binding positions abolished the inhibition mediated by miRNA mimics (Fig. 4C). Together, these data demonstrated that miR-15a, miR-15b, miR-16, miR-20a, miR-106b, and miR-93 could target Pur-alpha mRNA 3'-UTR for repression. |
[2]PMID | 23043098 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | HEK293T cells//PBMCs//Maji-CCR5 cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | Independently, miR-17-5p and miR-20a were found by a separate group to target p300/CBP-associated factor (PCAF), another cellular cofactor of the viral Tat protein (29), and a further set of six miRNAs (miR-15a, miR-15b, miR-16, miR-20a, miR-93, and miR-106b) were reported to repress the expression of a third Tat cofactor, Pur-alpha, which was noted also to be enriched in monocytes (45). |