Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00066013

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-186-3p:  MIMAT0004612          HP1BP3:  NR_164850     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-186-3p	HP1BP3
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0004612	50809
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	HP1-BP74//HP1BP74

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-186-3p	rs1241044041 chr1:71067653    C/T rs1318830037 chr1:71067663    C/A rs1318830037 chr1:71067663    C/T rs771255877 chr1:71067645    A/C rs776722712 chr1:71067655    C/T rs934513177 chr1:71067651    T/C rs1292420312 chr1:71067659    T/A

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	HP1BP3	chr1:21111511(-) A-I      intronic chr1:21076884(-) A-I      intronic chr1:21109888(-) A-I      intronic chr1:21083231(-) A-I      intronic chr1:21087653(-) A-I      intronic chr1:21109519(-) A-I      intronic chr1:21078147(-) A-I      intronic chr1:21110687(-) A-I      intronic chr1:21111686(-) A-I      intronic chr1:21083037(-) A-I      intronic chr1:21101911(-) A-I      intronic chr1:21076899(-) A-I      intronic chr1:21082981(-) A-I      intronic chr1:21078156(-) A-I      intronic chr1:21081930(-) A-I      intronic chr1:21110695(-) A-I      intronic chr1:21078953(-) A-I      intronic chr1:21083013(-) A-I      intronic chr1:21109284(-) A-I      intronic chr1:21076939(-) A-I      intronic chr1:21078132(-) A-I      intronic chr1:21078133(-) A-I      intronic chr1:21084556(-) A-I      intronic chr1:21111544(-) A-I      intronic chr1:21083387(-) A-I      intronic chr1:21091411(-) A-I      intronic chr1:21091257(-) A-I      intronic chr1:21090869(-) A-I      intronic chr1:21087801(-) A-I      intronic chr1:21095130(-) A-I      intronic chr1:21087735(-) A-I      intronic chr1:21087728(-) A-I      intronic chr1:21095885(-) A-I      intronic chr1:21095116(-) A-I      intronic chr1:21087654(-) A-I      intronic chr1:21083380(-) A-I      intronic chr1:21087336(-) A-I      intronic chr1:21111585(-) A-I      intronic chr1:21109468(-) A-I      intronic chr1:21087285(-) A-I      intronic chr1:21111591(-) A-I      intronic chr1:21087190(-) A-I      intronic chr1:21085891(-) A-I      intronic chr1:21082005(-) A-I      intronic chr1:21084373(-) A-I      intronic chr1:21083011(-) A-I      intronic chr1:21084988(-) A-I      intronic chr1:21076921(-) A-I      intronic chr1:21087158(-) A-I      intronic chr1:21084577(-) A-I      intronic chr1:21097003(-) A-I      intronic chr1:21084159(-) A-I      intronic chr1:21078214(-) A-I      intronic chr1:21111610(-) A-I      intronic chr1:21078170(-) A-I      intronic chr1:21078044(-) A-I      intronic chr1:21095115(-) A-I      intronic chr1:21077997(-) A-I      intronic chr1:21086474(-) A-I      intronic chr1:21084942(-) A-I      intronic chr1:21076904(-) A-I      intronic chr1:21076802(-) A-I      intronic chr1:21086506(-) A-I      intronic chr1:21077961(-) A-I      intronic chr1:21076792(-) A-I      intronic chr1:21109461(-) A-I      intronic chr1:21078896(-) A-I      intronic chr1:21087147(-) A-I      intronic chr1:21077589(-) A-I      intronic chr1:21085215(-) A-I      intronic chr1:21087138(-) A-I      intronic chr1:21109355(-) A-I      intronic chr1:21086575(-) A-I      intronic chr1:21091657(-) A-I      intronic chr1:21109349(-) A-I      intronic chr1:21085042(-) A-I      intronic chr1:21086583(-) A-I      intronic chr1:21085637(-) A-I      intronic chr1:21077569(-) A-I      intronic chr1:21108332(-) A-I      intronic chr1:21076770(-) A-I      intronic chr1:21076147(-) A-I      intronic chr1:21076057(-) A-I      intronic chr1:21083330(-) A-I      intronic chr1:21109347(-) A-I      intronic chr1:21108158(-) A-I      intronic chr1:21108126(-) A-I      intronic chr1:21097099(-) A-I      intronic chr1:21084106(-) A-I      intronic chr1:21109317(-) A-I      intronic chr1:21109285(-) A-I      intronic chr1:21085814(-) A-I      intronic chr1:21086609(-) A-I      intronic chr1:21096973(-) A-I      intronic chr1:21097004(-) A-I      intronic chr1:21083320(-) A-I      intronic chr1:21086615(-) A-I      intronic chr1:21077492(-) A-I      intronic chr1:21085728(-) A-I      intronic chr1:21084110(-) A-I      intronic chr1:21085139(-) A-I      intronic chr1:21085134(-) A-I      intronic chr1:21109281(-) A-I      intronic chr1:21091444(-) A-I      intronic chr1:21077409(-) A-I      intronic chr1:21083311(-) A-I      intronic chr1:21109751(-) A-I      intronic chr1:21097011(-) A-I      intronic chr1:21085731(-) A-I      intronic chr1:21091436(-) A-I      intronic chr1:21084576(-) A-I      intronic chr1:21110163(-) A-I      intronic chr1:21086922(-) A-I      intronic chr1:21085060(-) A-I      intronic chr1:21109543(-) A-I      intronic chr1:21110578(-) A-I      intronic chr1:21084391(-) A-I      intronic chr1:21097035(-) A-I      intronic chr1:21091418(-) A-I      intronic chr1:21084379(-) A-I      intronic chr1:21085270(-) A-I      intronic chr1:21083281(-) A-I      intronic chr1:21085059(-) A-I      intronic chr1:21109261(-) A-I      intronic chr1:21095816(-) A-I      intronic chr1:21110758(-) A-I      intronic chr1:21076030(-) A-I      intronic chr1:21109244(-) A-I      intronic chr1:21109535(-) A-I      intronic chr1:21083976(-) A-I      intronic chr1:21109583(-) A-I      intronic chr1:21097045(-) A-I      intronic chr1:21073501(-) A-I      intronic chr1:21095153(-) A-I      intronic chr1:21076982(-) A-I      intronic chr1:21079062(-) A-I      intronic chr1:21108834(-) A-I      intronic chr1:21111476(-) A-I      intronic chr1:21076973(-) A-I      intronic chr1:21075957(-) A-I      intronic chr1:21084120(-) A-I      intronic chr1:21084432(-) A-I      intronic chr1:21083244(-) A-I      intronic chr1:21095821(-) A-I      intronic chr1:21111677(-) A-I      intronic chr1:21078631(-) A-I      intronic chr1:21110219(-) A-I      intronic chr1:21110742(-) A-I      intronic chr1:21111654(-) A-I      intronic chr1:21090952(-) A-I      intronic chr1:21086813(-) A-I      intronic chr1:21084043(-) A-I      intronic chr1:21081917(-) A-I      intronic chr1:21091286(-) A-I      intronic chr1:21095737(-) A-I      intronic chr1:21110249(-) A-I      intronic chr1:21108701(-) A-I      intronic chr1:21083475(-) A-I      intronic chr1:21108842(-) A-I      intronic chr1:21111540(-) A-I      intronic chr1:21079055(-) A-I      intronic chr1:21072818(-) A-I      intronic chr1:21110639(-) A-I      intronic chr1:21109949(-) A-I      intronic chr1:21075990(-) A-I      intronic chr1:21077439(-) A-I      intronic chr1:21108257(-) A-I      intronic chr1:21075919(-) A-I      intronic chr1:21087127(-) A-I      intronic chr1:21076021(-) A-I      intronic chr1:21087662(-) A-I      intronic chr1:21110225(-) A-I      intronic chr1:21111506(-) A-I      intronic chr1:21108185(-) A-I      intronic chr1:21081986(-) A-I      intronic chr1:21078893(-) A-I      intronic chr1:21083373(-) A-I      intronic chr1:21108668(-) A-I      intronic chr1:21083382(-) A-I      intronic chr1:21083251(-) A-I      intronic chr1:21077599(-) A-I      intronic chr1:21081908(-) A-I      intronic chr1:21087247(-) A-I      intronic chr1:21077475(-) A-I      intronic chr1:21084136(-) A-I      intronic chr1:21074450(-) A-I      intronic chr1:21108976(-) A-I      intronic chr1:21083256(-) A-I      intronic chr1:21085701(-) A-I      intronic chr1:21108192(-) A-I      intronic chr1:21078103(-) A-I      intronic chr1:21073452(-) A-I      intronic chr1:21078210(-) A-I      intronic chr1:21111531(-) A-I      intronic chr1:21079631(-) A-I      intronic chr1:21087734(-) A-I      intronic chr1:21073323(-) A-I      intronic chr1:21078164(-) A-I      intronic chr1:21086998(-) A-I      intronic chr1:21085040(-) A-I      intronic chr1:21111144(-) A-I      intronic chr1:21078099(-) A-I      intronic chr1:21108400(-) A-I      intronic chr1:21085395(-) A-I      intronic chr1:21109150(-) A-I      intronic chr1:21111633(-) A-I      intronic chr1:21095247(-) A-I      intronic chr1:21109039(-) A-I      intronic chr1:21110713(-) A-I      intronic chr1:21078717(-) A-I      intronic chr1:21082062(-) A-I      intronic chr1:21075035(-) A-I      intronic chr1:21077448(-) A-I      intronic chr1:21087164(-) A-I      intronic chr1:21109779(-) A-I      intronic chr1:21083470(-) A-I      intronic chr1:21108967(-) A-I      intronic chr1:21078146(-) A-I      intronic chr1:21072748(-) A-I      intronic chr1:21087807(-) A-I      intronic chr1:21085441(-) A-I      intronic chr1:21072751(-) A-I      intronic chr1:21085834(-) A-I      intronic chr1:21084454(-) A-I      intronic chr1:21078905(-) A-I      intronic chr1:21076808(-) A-I      intronic chr1:21109493(-) A-I      intronic chr1:21083224(-) A-I      intronic chr1:21091327(-) A-I      intronic chr1:21087229(-) A-I      intronic chr1:21101943(-) A-I      ncRNA chr1:21087666(-) A-I      intronic chr1:21075131(-) A-I      intronic chr1:21109832(-) A-I      intronic chr1:21111242(-) A-I      intronic chr1:21075924(-) A-I      intronic chr1:21095794(-) A-I      intronic chr1:21108854(-) A-I      intronic chr1:21079056(-) A-I      intronic chr1:21075952(-) A-I      intronic chr1:21091270(-) A-I      intronic chr1:21075255(-) A-I      intronic chr1:21095743(-) A-I      intronic chr1:21111671(-) A-I      intronic chr1:21085784(-) A-I      intronic chr1:21078988(-) A-I      intronic chr1:21097081(-) A-I      intronic chr1:21078074(-) A-I      intronic chr1:21096139(-) A-I      intronic chr1:21084471(-) A-I      intronic chr1:21075349(-) A-I      intronic chr1:21086608(-) A-I      intronic chr1:21078842(-) A-I      intronic chr1:21079708(-) A-I      intronic chr1:21086951(-) A-I      intronic chr1:21084539(-) A-I      intronic chr1:21091048(-) A-I      intronic chr1:21076909(-) A-I      intronic chr1:21077431(-) A-I      intronic chr1:21084633(-) A-I      intronic chr1:21087676(-) A-I      intronic chr1:21109470(-) A-I      intronic chr1:21108820(-) A-I      intronic chr1:21078719(-) A-I      intronic chr1:21078000(-) A-I      intronic chr1:21081956(-) A-I      intronic chr1:21085362(-) A-I      intronic chr1:21110591(-) A-I      intronic chr1:21087636(-) A-I      intronic chr1:21110601(-) A-I      intronic chr1:21078945(-) A-I      intronic chr1:21078159(-) A-I      intronic chr1:21087207(-) A-I      intronic chr1:21110031(-) A-I      intronic chr1:21087743(-) A-I      intronic chr1:21109960(-) A-I      intronic chr1:21077504(-) A-I      intronic chr1:21076022(-) A-I      intronic chr1:21101923(-) A-I      intronic chr1:21091306(-) A-I      intronic chr1:21084948(-) A-I      intronic chr1:21092298(-) A-I      intronic chr1:21078672(-) A-I      intronic chr1:21078645(-) A-I      intronic chr1:21111661(-) A-I      intronic chr1:21084517(-) A-I      intronic chr1:21110636(-) A-I      intronic chr1:21097103(-) A-I      intronic chr1:21087648(-) A-I      intronic chr1:21081958(-) A-I      intronic chr1:21083892(-) A-I      intronic chr1:21086775(-) A-I      intronic chr1:21109929(-) A-I      intronic chr1:21111560(-) A-I      intronic chr1:21087686(-) A-I      intronic chr1:21108991(-) A-I      intronic chr1:21085018(-) A-I      intronic chr1:21110658(-) A-I      intronic chr1:21086560(-) A-I      intronic chr1:21109310(-) A-I      intronic chr1:21078955(-) A-I      intronic chr1:21086958(-) A-I      intronic chr1:21087640(-) A-I      intronic chr1:21087324(-) A-I      intronic chr1:21111037(-) A-I      intronic chr1:21101900(-) A-I      intronic chr1:21091618(-) A-I      intronic chr1:21084382(-) A-I      intronic chr1:21110709(-) A-I      intronic chr1:21091316(-) A-I      intronic chr1:21109829(-) A-I      intronic chr1:21111492(-) A-I      intronic chr1:21075963(-) A-I      intronic chr1:21110729(-) A-I      intronic chr1:21082953(-) A-I      intronic chr1:21109210(-) A-I      intronic chr1:21111554(-) A-I      intronic chr1:21075118(-) A-I      intronic chr1:21109769(-) A-I      intronic chr1:21082054(-) A-I      intronic chr1:21083376(-) A-I      intronic chr1:21085418(-) A-I      intronic chr1:21108720(-) A-I      intronic chr1:21090965(-) A-I      intronic chr1:21075192(-) A-I      intronic chr1:21084936(-) A-I      intronic chr1:21111174(-) A-I      intronic chr1:21076938(-) A-I      intronic chr1:21078055(-) A-I      intronic chr1:21086653(-) A-I      intronic chr1:21085223(-) A-I      intronic chr1:21108847(-) A-I      intronic chr1:21086859(-) A-I      intronic chr1:21082987(-) A-I      intronic chr1:21108892(-) A-I      intronic chr1:21077084(-) A-I      intronic chr1:21108727(-) A-I      intronic chr1:21110690(-) A-I      intronic chr1:21078026(-) A-I      intronic chr1:21110641(-) A-I      intronic chr1:21079599(-) A-I      intronic chr1:21083377(-) A-I      intronic chr1:21090961(-) A-I      intronic chr1:21087733(-) A-I      intronic chr1:21081899(-) A-I      intronic chr1:21077585(-) A-I      intronic chr1:21081916(-) A-I      intronic chr1:21077479(-) A-I      intronic chr1:21083016(-) A-I      intronic chr1:21109497(-) A-I      intronic chr1:21083274(-) A-I      intronic chr1:21095806(-) A-I      intronic chr1:21085769(-) A-I      intronic chr1:21085317(-) A-I      intronic chr1:21109151(-) A-I      intronic chr1:21085004(-) A-I      intronic chr1:21093285(-) A-I      intronic chr1:21110735(-) A-I      intronic chr1:21081959(-) A-I      intronic chr1:21087167(-) A-I      intronic chr1:21072835(-) A-I      intronic chr1:21091066(-) A-I      intronic chr1:21108686(-) A-I      intronic chr1:21091405(-) A-I      intronic chr1:21085199(-) A-I      intronic chr1:21072807(-) A-I      intronic chr1:21078605(-) A-I      intronic chr1:21083388(-) A-I      intronic chr1:21084032(-) A-I      intronic chr1:21087217(-) A-I      intronic chr1:21108761(-) A-I      intronic chr1:21110582(-) A-I      intronic chr1:21077018(-) A-I      intronic chr1:21110200(-) A-I      intronic chr1:21083277(-) A-I      intronic chr1:21084491(-) A-I      intronic chr1:21083357(-) A-I      intronic chr1:21082042(-) A-I      intronic chr1:21081985(-) A-I      intronic chr1:21108386(-) A-I      intronic chr1:21111637(-) A-I      intronic chr1:21082980(-) A-I      intronic chr1:21109757(-) A-I      intronic chr1:21076006(-) A-I      intronic chr1:21109912(-) A-I      intronic chr1:21110630(-) A-I      intronic chr1:21081981(-) A-I      intronic chr1:21079012(-) A-I      intronic chr1:21111589(-) A-I      intronic chr1:21082037(-) A-I      intronic chr1:21111108(-) A-I      intronic chr1:21073408(-) A-I      intronic chr1:21084906(-) A-I      intronic chr1:21079606(-) A-I      intronic chr1:21075928(-) A-I      intronic chr1:21083476(-) A-I      intronic chr1:21091285(-) A-I      intronic chr1:21095878(-) A-I      intronic chr1:21111066(-) A-I      intronic chr1:21083454(-) A-I      intronic chr1:21078190(-) A-I      intronic chr1:21085813(-) A-I      intronic chr1:21085280(-) A-I      intronic chr1:21110640(-) A-I      intronic chr1:21079531(-) A-I      intronic chr1:21075141(-) A-I      intronic chr1:21091578(-) A-I      intronic chr1:21085345(-) A-I      intronic chr1:21078052(-) A-I      intronic chr1:21105556(-) A-I      intronic chr1:21084096(-) A-I      intronic chr1:21075980(-) A-I      intronic chr1:21083902(-) A-I      intronic chr1:21076913(-) A-I      intronic chr1:21109895(-) A-I      intronic chr1:21090871(-) A-I      intronic chr1:21075912(-) A-I      intronic chr1:21081968(-) A-I      intronic chr1:21084915(-) A-I      intronic chr1:21109591(-) A-I      intronic chr1:21111656(-) A-I      intronic chr1:21087126(-) A-I      intronic chr1:21085019(-) A-I      intronic chr1:21110579(-) A-I      intronic chr1:21078070(-) A-I      intronic chr1:21111655(-) A-I      intronic chr1:21078860(-) A-I      intronic chr1:21083406(-) A-I      intronic chr1:21110560(-) A-I      intronic chr1:21083482(-) A-I      intronic chr1:21076957(-) A-I      intronic chr1:21078967(-) A-I      intronic chr1:21078587(-) A-I      intronic chr1:21110730(-) A-I      intronic chr1:21108832(-) A-I      intronic chr1:21086585(-) A-I      intronic chr1:21075050(-) A-I      intronic chr1:21078877(-) A-I      intronic chr1:21097040(-) A-I      intronic chr1:21076758(-) A-I      intronic chr1:21091610(-) A-I      intronic chr1:21108968(-) A-I      intronic chr1:21109950(-) A-I      intronic chr1:21101899(-) A-I      intronic chr1:21077488(-) A-I      intronic chr1:21109820(-) A-I      intronic chr1:21108964(-) A-I      intronic chr1:21083405(-) A-I      intronic chr1:21077970(-) A-I      intronic chr1:21085020(-) A-I      intronic chr1:21078926(-) A-I      intronic chr1:21075231(-) A-I      intronic chr1:21073505(-) A-I      intronic chr1:21086546(-) A-I      intronic chr1:21084978(-) A-I      intronic chr1:21085785(-) A-I      intronic chr1:21077511(-) A-I      intronic chr1:21091141(-) A-I      intronic chr1:21076757(-) A-I      intronic chr1:21110588(-) A-I      intronic chr1:21083269(-) A-I      intronic chr1:21083341(-) A-I      intronic chr1:21111684(-) A-I      intronic chr1:21085296(-) A-I      intronic chr1:21108833(-) A-I      intronic chr1:21085725(-) A-I      intronic chr1:21111626(-) A-I      intronic chr1:21087661(-) A-I      intronic chr1:21081936(-) A-I      intronic chr1:21087079(-) A-I      intronic chr1:21085305(-) A-I      intronic chr1:21109903(-) A-I      intronic chr1:21109900(-) A-I      intronic chr1:21110180(-) A-I      intronic chr1:21109293(-) A-I      intronic chr1:21084595(-) A-I      intronic chr1:21091051(-) A-I      intronic chr1:21108375(-) A-I      intronic chr1:21101903(-) A-I      intronic chr1:21084137(-) A-I      intronic chr1:21091140(-) A-I      intronic chr1:21109849(-) A-I      intronic chr1:21097007(-) A-I      intronic chr1:21110627(-) A-I      intronic chr1:21081999(-) A-I      intronic chr1:21087741(-) A-I      intronic chr1:21111584(-) A-I      intronic chr1:21086561(-) A-I      intronic chr1:21085217(-) A-I      intronic chr1:21110719(-) A-I      intronic chr1:21075158(-) A-I      intronic chr1:21109505(-) A-I      intronic chr1:21082066(-) A-I      intronic chr1:21077449(-) A-I      intronic chr1:21083305(-) A-I      intronic chr1:21110642(-) A-I      intronic chr1:21085833(-) A-I      intronic chr1:21110736(-) A-I      intronic chr1:21109269(-) A-I      intronic chr1:21078496(-) A-I      intronic chr1:21086971(-) A-I      intronic chr1:21084131(-) A-I      intronic chr1:21078655(-) A-I      intronic chr1:21109483(-) A-I      intronic chr1:21110659(-) A-I      intronic chr1:21085753(-) A-I      intronic chr1:21090948(-) A-I      intronic chr1:21091540(-) A-I      intronic chr1:21078046(-) A-I      intronic chr1:21078490(-) A-I      intronic chr1:21085781(-) A-I      intronic chr1:21083276(-) A-I      intronic chr1:21078216(-) A-I      intronic chr1:21090929(-) A-I      intronic chr1:21087320(-) A-I      intronic chr1:21101917(-) A-I      intronic chr1:21085282(-) A-I      intronic chr1:21084527(-) A-I      intronic chr1:21072825(-) A-I      intronic chr1:21108155(-) A-I      intronic chr1:21087246(-) A-I      intronic chr1:21083337(-) A-I      intronic chr1:21111555(-) A-I      intronic chr1:21084945(-) A-I      intronic chr1:21109043(-) A-I      intronic chr1:21081982(-) A-I      intronic chr1:21081973(-) A-I      intronic chr1:21085771(-) A-I      intronic chr1:21084474(-) A-I      intronic chr1:21109974(-) A-I      intronic chr1:21095848(-) A-I      intronic chr1:21108734(-) A-I      intronic chr1:21110638(-) A-I      intronic chr1:21073328(-) A-I      intronic chr1:21078038(-) A-I      intronic chr1:21079639(-) A-I      intronic chr1:21109496(-) A-I      intronic chr1:21087718(-) A-I      intronic chr1:21086846(-) A-I      intronic chr1:21109025(-) A-I      intronic chr1:21077083(-) A-I      intronic chr1:21095956(-) A-I      intronic chr1:21109477(-) A-I      intronic chr1:21086652(-) A-I      intronic chr1:21084555(-) A-I      intronic chr1:21079630(-) A-I      intronic chr1:21085711(-) A-I      intronic chr1:21084600(-) A-I      intronic chr1:21083340(-) A-I      intronic chr1:21109169(-) A-I      intronic chr1:21109271(-) A-I      intronic chr1:21091067(-) A-I      intronic chr1:21078641(-) A-I      intronic chr1:21095847(-) A-I      intronic chr1:21095747(-) A-I      intronic chr1:21078693(-) A-I      intronic chr1:21083899(-) A-I      intronic chr1:21109890(-) A-I      intronic chr1:21095299(-) A-I      intronic chr1:21083484(-) A-I      intronic chr1:21079614(-) A-I      intronic chr1:21086964(-) A-I      intronic chr1:21083019(-) A-I      intronic chr1:21087606(-) A-I      intronic chr1:21083266(-) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	HP1BP3	chr1:21078159(-) A-I intron -    15545495 chr1:21078164(-) A-I intron -    15545495 chr1:21078210(-) A-I intron -    15545495 chr1:21078282(-) A-I intron -    15545495 chr1:21078490(-) A-I intron -    15545495 chr1:21081804(-) A-I intron -    15342557 chr1:21081826(-) A-I intron -    15342557 chr1:21081936(-) A-I intron -    15342557 chr1:21081956(-) A-I intron -    15342557   //22327324 chr1:21081958(-) A-I intron -    15342557   //22327324 chr1:21081985(-) A-I intron -    15342557 chr1:21082062(-) A-I intron -    15342557   //22327324 chr1:21083251(-) A-I intron -    15342557   //22327324 chr1:21083276(-) A-I intron -    15342557   //22327324 chr1:21083337(-) A-I intron -    15342557   //22327324 chr1:21083340(-) A-I intron -    15342557 chr1:21083405(-) A-I intron -    15342557   //22327324 chr1:21083470(-) A-I intron -    15342557   //22327324 chr1:21083476(-) A-I intron -    15342557   //22327324 chr1:21083482(-) A-I intron -    15342557 chr1:21081817(-) A-I intron -    22327324 chr1:21081840(-) A-I intron -    22327324 chr1:21081959(-) A-I intron -    22327324 chr1:21085345(-) A-I intron -    22327324 chr1:21101899(-) A-I intron -    21960545   //22327324 chr1:21101903(-) A-I intron -    21960545   //22327324 chr1:21101917(-) A-I intron -    22327324 chr1:21101943(-) A-I intron -    21960545   //22327324 chr1:21109890(-) A-I intron -    21960545 chr1:21100753(-) A-I intron -    21960545 chr1:21101369(-) A-I intron -    21960545 chr1:21101923(-) A-I intron -    21960545 chr1:21081804(-) A-G intron -    21725310   //22484847 chr1:21101899(-) A-G intron -    22484847 chr1:21101903(-) A-G intron -    22484847 chr1:21101917(-) A-G intron -    22484847 chr1:21072807(-) A-G intron -    22484847 chr1:21075050(-) A-G intron -    22484847 chr1:21075158(-) A-G intron -    22484847 chr1:21075255(-) A-G intron -    22484847 chr1:21076757(-) A-G intron -    22484847 chr1:21076795(-) G-A intron -    22484847 chr1:21076808(-) A-G intron -    22484847 chr1:21077585(-) A-G intron -    22484847 chr1:21077599(-) A-G intron -    22484847 chr1:21078038(-) A-G intron -    22484847 chr1:21078070(-) A-G intron -    22484847 chr1:21078164(-) A-G intron -    22484847 chr1:21078210(-) A-G intron -    22484847 chr1:21078216(-) A-G intron -    22484847 chr1:21078496(-) A-G intron -    22484847 chr1:21078945(-) A-G intron -    22484847 chr1:21079012(-) A-G intron -    22484847 chr1:21079055(-) A-G intron -    22484847 chr1:21079056(-) A-G intron -    22484847 chr1:21081826(-) A-G intron -    22484847 chr1:21081840(-) A-G intron -    22484847 chr1:21081899(-) A-G intron -    22484847 chr1:21081956(-) A-G intron -    22484847 chr1:21081958(-) A-G intron -    22484847 chr1:21081981(-) A-G intron -    22484847 chr1:21081982(-) A-G intron -    22484847 chr1:21081985(-) A-G intron -    22484847 chr1:21082037(-) A-G intron -    22484847 chr1:21082054(-) A-G intron -    22484847 chr1:21082062(-) A-G intron -    22484847 chr1:21082987(-) A-G intron -    22484847 chr1:21083251(-) A-G intron -    22484847 chr1:21083256(-) A-G intron -    22484847 chr1:21083266(-) A-G intron -    22484847 chr1:21083274(-) A-G intron -    22484847 chr1:21083276(-) A-G intron -    22484847 chr1:21083305(-) A-G intron -    22484847 chr1:21083337(-) A-G intron -    22484847 chr1:21083340(-) A-G intron -    22484847 chr1:21083357(-) A-G intron -    22484847 chr1:21083377(-) A-G intron -    22484847 chr1:21083382(-) A-G intron -    22484847 chr1:21083388(-) A-G intron -    22484847 chr1:21083405(-) A-G intron -    22484847 chr1:21083406(-) A-G intron -    22484847 chr1:21083470(-) A-G intron -    22484847 chr1:21083475(-) A-G intron -    22484847 chr1:21083476(-) A-G intron -    22484847 chr1:21083482(-) A-G intron -    22484847 chr1:21084096(-) A-G intron -    22484847 chr1:21084131(-) A-G intron -    22484847 chr1:21084136(-) A-G intron -    22484847 chr1:21084137(-) A-G intron -    22484847 chr1:21084454(-) A-G intron -    22484847 chr1:21084471(-) A-G intron -    22484847 chr1:21084555(-) A-G intron -    22484847 chr1:21084600(-) A-G intron -    22484847 chr1:21084633(-) A-G intron -    22484847 chr1:21085040(-) A-G intron -    22484847 chr1:21085217(-) A-G intron -    22484847 chr1:21085280(-) A-G intron -    22484847 chr1:21085282(-) A-G intron -    22484847 chr1:21085296(-) A-G intron -    22484847 chr1:21085305(-) A-G intron -    22484847 chr1:21085345(-) A-G intron -    22484847 chr1:21085395(-) A-G intron -    22484847 chr1:21085441(-) A-G intron -    22484847 chr1:21085701(-) A-G intron -    22484847 chr1:21085725(-) A-G intron -    22484847 chr1:21085753(-) A-G intron -    22484847 chr1:21085769(-) A-G intron -    22484847 chr1:21085771(-) A-G intron -    22484847 chr1:21085784(-) A-G intron -    22484847 chr1:21085785(-) A-G intron -    22484847 chr1:21085833(-) A-G intron -    22484847 chr1:21085834(-) A-G intron -    22484847 chr1:21086546(-) A-G intron -    22484847 chr1:21086608(-) A-G intron -    22484847 chr1:21086652(-) A-G intron -    22484847 chr1:21086842(-) C-T intron -    22484847 chr1:21086846(-) A-G intron -    22484847 chr1:21086859(-) A-G intron -    22484847 chr1:21086958(-) A-G intron -    22484847 chr1:21086971(-) A-G intron -    22484847 chr1:21087126(-) A-G intron -    22484847 chr1:21087217(-) A-G intron -    22484847 chr1:21087229(-) A-G intron -    22484847 chr1:21087320(-) A-G intron -    22484847 chr1:21087324(-) A-G intron -    22484847 chr1:21087636(-) A-G intron -    22484847 chr1:21087648(-) A-G intron -    22484847 chr1:21087686(-) A-G intron -    22484847 chr1:21087733(-) A-G intron -    22484847 chr1:21087734(-) A-G intron -    22484847 chr1:21087741(-) A-G intron -    22484847 chr1:21087743(-) A-G intron -    22484847 chr1:21090929(-) A-G intron -    22484847 chr1:21090948(-) A-G intron -    22484847 chr1:21090952(-) A-G intron -    22484847 chr1:21091578(-) A-G intron -    22484847 chr1:21091610(-) A-G intron -    22484847 chr1:21091618(-) A-G intron -    22484847 chr1:21093701(-) G-A intron -    22484847 chr1:21093702(-) T-C intron -    22484847 chr1:21095167(-) G-A intron -    22484847 chr1:21095247(-) A-G intron -    22484847 chr1:21095848(-) A-G intron -    22484847 chr1:21095878(-) A-G intron -    22484847 chr1:21095956(-) A-G intron -    22484847 chr1:21097007(-) A-G intron -    22484847 chr1:21097103(-) A-G intron -    22484847 chr1:21100753(-) A-G intron -    22484847 chr1:21100779(-) A-G intron -    22484847 chr1:21101368(-) A-G intron -    22484847 chr1:21101376(-) A-G intron -    22484847 chr1:21101377(-) A-G intron -    22484847 chr1:21108155(-) A-G intron -    22484847 chr1:21108185(-) A-G intron -    22484847 chr1:21108192(-) A-G intron -    22484847 chr1:21108720(-) A-G intron -    22484847 chr1:21108734(-) A-G intron -    22484847 chr1:21108842(-) A-G intron -    22484847 chr1:21108847(-) A-G intron -    22484847 chr1:21108892(-) A-G intron -    22484847 chr1:21108976(-) A-G intron -    22484847 chr1:21108991(-) A-G intron -    22484847 chr1:21109150(-) A-G intron -    22484847 chr1:21109151(-) A-G intron -    22484847 chr1:21109269(-) A-G intron -    22484847 chr1:21109271(-) A-G intron -    22484847 chr1:21109293(-) A-G intron -    22484847 chr1:21109401(-) C-T intron -    22484847 chr1:21109493(-) A-G intron -    22484847 chr1:21109591(-) A-G intron -    22484847 chr1:21109779(-) A-G intron -    22484847 chr1:21109820(-) A-G intron -    22484847 chr1:21109903(-) A-G intron -    22484847 chr1:21109929(-) A-G intron -    22484847 chr1:21109949(-) A-G intron -    22484847 chr1:21109950(-) A-G intron -    22484847 chr1:21110031(-) A-G intron -    22484847 chr1:21110560(-) A-G intron -    22484847 chr1:21110579(-) A-G intron -    22484847 chr1:21110588(-) A-G intron -    22484847 chr1:21110601(-) A-G intron -    22484847 chr1:21110627(-) A-G intron -    22484847 chr1:21110636(-) A-G intron -    22484847 chr1:21110638(-) A-G intron -    22484847 chr1:21110640(-) A-G intron -    22484847 chr1:21110642(-) A-G intron -    22484847 chr1:21110659(-) A-G intron -    22484847 chr1:21110690(-) A-G intron -    22484847 chr1:21110709(-) A-G intron -    22484847 chr1:21110729(-) A-G intron -    22484847 chr1:21110735(-) A-G intron -    22484847 chr1:21110742(-) A-G intron -    22484847 chr1:21111554(-) A-G intron -    22484847 chr1:21111560(-) A-G intron -    22484847 chr1:21111626(-) A-G intron -    22484847 chr1:21111633(-) A-G intron -    22484847 chr1:21111637(-) A-G intron -    22484847 chr1:21111654(-) A-G intron -    22484847 chr1:21111671(-) A-G intron -    22484847 chr1:21111684(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	HP1BP3	chr1:21070089-21070090(-) m6A 3'UTR//intron       - chr1:21070953-21070954(-) m6A 3'UTR//intron       - chr1:21071052-21071053(-) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//24981863//27773535 chr1:21071062-21071063(-) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//24981863//27773535 chr1:21071148-21071149(-) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr1:21071159-21071160(-) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863//22608085 chr1:21071174-21071175(-) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863//22608085 chr1:21071397-21071398(-) m6A CDS//exon       24981863//28052920//26404942//27773535 chr1:21071421-21071422(-) m6A CDS//exon       24981863//28052920//26404942//27773535 chr1:21071426-21071427(-) m6A CDS//exon       24981863//26404942//27773535//22575960 chr1:21071517-21071518(-) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22575960 chr1:21071570-21071571(-) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22575960 chr1:21072068-21072069(-) m6A CDS//exon       24981863//27773535 chr1:21094083-21094084(-) m6A CDS//intron       24981863 chr1:21094102-21094103(-) m6A CDS//intron       24981863 chr1:21097425-21097426(-) m6A CDS       24981863 chr1:21100059-21100060(-) m6A 5'UTR//CDS       24981863//27371828 chr1:21102031-21102032(-) m6A exon//intron       24981863 chr1:21102053-21102054(-) m6A exon//intron       24981863 chr1:21103038-21103039(-) m6A exon//intron       24981863 chr1:21103099-21103100(-) m6A CDS//exon       24981863 chr1:21103131-21103132(-) Am CDS//exon       - chr1:21103142-21103143(-) m6A CDS//exon       24981863 chr1:21103186-21103187(-) m6A CDS//exon       24981863 chr1:21103199-21103200(-) m6A CDS//exon       24981863 chr1:21103236-21103237(-) m6A CDS//exon       24981863//22575960 chr1:21106836-21106837(-) Gm intron       - chr1:21107010-21107011(-) m6A 5'UTR//exon//intron       24981863//27371828//27773536 chr1:21112796-21112797(-) m6A 5'UTR//intron       27371828 chr1:21113049-21113050(-) m6A 5'UTR//intron       27773536//22575960 chr1:21113703-21113704(-) m6A 5'UTR       24209618//25456834//24981863//27371828 chr1:21113774-21113775(-) m6A 5'UTR       24209618//25456834//24981863//27371828 chr1:21113782-21113783(-) m6A 5'UTR       24209618//25456834//24981863//27371828

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-186-3p	Exosome Breast milk     22211110 Exosome Plasma     23663360 Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Mesenchymal stem cells     -
	HP1BP3	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol K562 cells     - Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HeLa-S3 cells|K562 cells     - Ribosome-free cytosol Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-186-3p
Interactor2: HP1BP3

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Support Database	ViRBase

References:

PMID	22291592	Target region	3'UTR
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells	Interactor2 expression	None
Description	We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.