Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00065602

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-223-5p:           CCDC18:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa-miR-223-5p CCDC18
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0004570 343099
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - NY-SAR-41

ncRNA SNP information:


Resource Symbol SNP ID SNP Position Ref/Alt
miRNASNP-v3 hsa-miR-223-5p
rs1240009384 chrX:66018913    A/T
rs1397275461 chrX:66018904    G/T
rs1464475149 chrX:66018916    T/C
rs761701581 chrX:66018906    C/G
rs772305537 chrX:66018909    G/A
rs774279244 chrX:66018895    C/T
rs890919635 chrX:66018896    G/A

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR CCDC18
chr1:93715670(+) A-I      intronic
chr1:93706601(+) A-I      intronic
chr1:93706638(+) A-I      intronic
chr1:93706641(+) A-I      intronic
chr1:93706651(+) A-I      intronic
chr1:93707127(+) A-I      intronic
chr1:93740851(+) A-I      intronic
chr1:93740849(+) A-I      intronic
chr1:93740839(+) A-I      intronic
chr1:93740794(+) A-I      intronic
chr1:93740225(+) A-I      intronic
chr1:93740222(+) A-I      intronic
chr1:93740199(+) A-I      intronic
chr1:93739891(+) A-I      intronic
chr1:93739880(+) A-I      intronic
chr1:93739879(+) A-I      intronic
chr1:93739871(+) A-I      intronic
chr1:93715664(+) A-I      intronic
chr1:93715663(+) A-I      intronic
chr1:93715163(+) A-I      intronic
chr1:93707148(+) A-I      intronic
chr1:93707132(+) A-I      intronic
chr1:93740876(+) A-I      intronic
chr1:93740863(+) A-I      intronic
chr1:93740765(+) A-I      intronic
chr1:93674539(+) A-I      intronic
chr1:93692144(+) A-I      intronic
chr1:93740758(+) A-I      intronic
chr1:93740745(+) A-I      intronic
chr1:93706637(+) A-I      intronic
chr1:93739840(+) A-I      intronic
chr1:93715731(+) A-I      intronic
chr1:93739839(+) A-I      intronic
chr1:93706584(+) A-I      intronic
chr1:93693278(+) A-I      intronic
chr1:93693310(+) A-I      intronic
chr1:93693356(+) A-I      intronic
chr1:93693368(+) A-I      intronic
chr1:93693386(+) A-I      intronic
chr1:93693412(+) A-I      intronic
chr1:93693430(+) A-I      intronic
chr1:93694557(+) A-I      intronic
chr1:93694573(+) A-I      intronic
chr1:93673982(+) A-I      intronic
chr1:93673912(+) A-I      intronic
chr1:93664338(+) A-I      intronic
chr1:93661831(+) A-I      intronic
chr1:93660648(+) A-I      intronic
chr1:93660557(+) A-I      intronic
chr1:93655365(+) A-I      intronic
chr1:93655361(+) A-I      intronic
chr1:93655349(+) A-I      intronic
chr1:93655332(+) A-I      intronic
chr1:93655269(+) A-I      intronic
chr1:93693291(+) A-I      intronic
chr1:93693247(+) A-I      intronic
chr1:93692871(+) A-I      intronic
chr1:93692857(+) A-I      intronic
chr1:93692276(+) A-I      intronic
chr1:93692275(+) A-I      intronic
chr1:93692236(+) A-I      intronic
chr1:93692230(+) A-I      intronic
chr1:93692195(+) A-I      intronic
chr1:93675406(+) A-I      intronic
chr1:93675387(+) A-I      intronic
chr1:93674652(+) A-I      intronic
chr1:93674645(+) A-I      intronic
chr1:93674616(+) A-I      intronic
chr1:93693277(+) A-I      intronic
chr1:93692987(+) A-I      intronic
chr1:93714277(+) A-I      intronic
chr1:93665934(+) A-I      intronic
chr1:93693296(+) A-I      intronic
chr1:93647204(+) A-I      intronic
chr1:93674410(+) A-I      intronic
chr1:93665559(+) A-I      intronic
chr1:93692154(+) A-I      intronic
chr1:93706642(+) A-I      intronic
chr1:93714334(+) A-I      intronic
chr1:93715140(+) A-I      intronic
chr1:93692326(+) A-I      intronic
chr1:93698366(+) A-I      intronic
chr1:93706773(+) A-I      intronic
chr1:93692232(+) A-I      intronic
chr1:93707168(+) A-I      intronic
chr1:93706677(+) A-I      intronic
chr1:93661782(+) A-I      intronic
chr1:93707017(+) A-I      intronic
chr1:93740830(+) A-I      intronic
chr1:93675512(+) A-I      intronic
chr1:93717664(+) A-I      intronic
chr1:93717734(+) A-I      intronic
chr1:93714423(+) A-I      intronic
chr1:93655359(+) A-I      intronic
chr1:93715123(+) A-I      intronic
chr1:93693361(+) A-I      intronic
chr1:93700643(+) A-I      intronic
chr1:93717846(+) A-I      intronic
chr1:93661651(+) A-I      intronic
chr1:93714339(+) A-I      intronic
chr1:93660562(+) A-I      intronic
chr1:93695834(+) A-I      intronic
chr1:93682691(+) A-I      intronic
chr1:93714387(+) A-I      intronic
chr1:93696032(+) A-I      intronic
chr1:93715754(+) A-I      intronic
chr1:93740804(+) A-I      intronic
chr1:93684247(+) A-I      intronic
chr1:93655270(+) A-I      intronic
chr1:93655284(+) A-I      intronic
chr1:93693309(+) A-I      intronic
chr1:93743644(+) A-I      intronic
chr1:93665590(+) A-I      intronic
chr1:93660625(+) A-I      intronic
chr1:93693342(+) A-I      intronic
chr1:93721127(+) A-I      intronic
chr1:93740285(+) A-I      intronic
chr1:93655276(+) A-I      intronic
chr1:93714422(+) A-I      intronic
chr1:93707228(+) A-I      intronic
chr1:93682699(+) A-I      intronic
chr1:93647289(+) A-I      intronic
chr1:93707025(+) A-I      intronic
chr1:93740739(+) A-I      intronic
chr1:93707026(+) A-I      intronic
chr1:93660502(+) A-I      intronic
chr1:93694584(+) A-I      intronic
chr1:93660608(+) A-I      intronic
chr1:93715859(+) A-I      intronic
chr1:93661615(+) A-I      intronic
chr1:93661830(+) A-I      intronic
chr1:93706653(+) A-I      intronic
chr1:93661789(+) A-I      intronic
chr1:93675460(+) A-I      intronic
chr1:93740790(+) A-I      intronic
chr1:93692312(+) A-I      intronic
chr1:93665978(+) A-I      intronic
chr1:93675515(+) A-I      intronic
chr1:93740928(+) A-I      intronic
chr1:93714329(+) A-I      intronic
chr1:93665671(+) A-I      intronic
chr1:93700658(+) A-I      intronic
chr1:93743637(+) A-I      intronic
chr1:93712641(+) A-I      intronic
chr1:93665729(+) A-I      intronic
chr1:93661733(+) A-I      intronic
chr1:93715229(+) A-I      intronic
chr1:93698454(+) A-I      intronic
chr1:93661749(+) A-I      intronic
chr1:93706576(+) A-I      intronic
chr1:93661781(+) A-I      intronic
chr1:93743819(+) A-I      intronic
chr1:93646619(+) A-I      intronic
chr1:93660573(+) A-I      intronic
chr1:93661678(+) A-I      intronic
chr1:93740219(+) A-I      intronic
chr1:93740806(+) A-I      intronic
chr1:93717696(+) A-I      intronic
chr1:93655994(+) A-I      intronic
chr1:93674767(+) A-I      intronic
chr1:93675507(+) A-I      intronic
chr1:93661801(+) A-I      intronic
chr1:93714393(+) A-I      intronic
chr1:93660577(+) A-I      intronic
chr1:93646664(+) A-I      intronic
chr1:93675468(+) A-I      intronic
chr1:93692224(+) A-I      intronic
chr1:93707128(+) A-I      intronic
chr1:93693312(+) A-I      intronic
chr1:93675538(+) A-I      intronic
chr1:93743683(+) A-I      intronic
chr1:93698417(+) A-I      intronic
chr1:93674601(+) A-I      intronic
chr1:93706613(+) A-I      intronic
chr1:93695990(+) A-I      intronic
chr1:93675544(+) A-I      intronic
chr1:93706786(+) A-I      intronic
chr1:93693279(+) A-I      intronic
chr1:93739807(+) A-I      intronic
chr1:93715727(+) A-I      intronic
chr1:93706579(+) A-I      intronic
chr1:93707118(+) A-I      intronic
chr1:93715788(+) A-I      intronic
chr1:93660597(+) A-I      intronic
chr1:93714409(+) A-I      intronic
chr1:93714352(+) A-I      intronic
chr1:93714383(+) A-I      intronic
chr1:93698273(+) A-I      intronic
chr1:93661813(+) A-I      intronic
chr1:93693253(+) A-I      intronic
chr1:93740886(+) A-I      intronic
chr1:93692908(+) A-I      intronic
chr1:93740831(+) A-I      intronic
chr1:93660545(+) A-I      intronic
chr1:93692313(+) A-I      intronic
chr1:93693376(+) A-I      intronic
chr1:93699991(+) A-I      intronic
chr1:93707158(+) A-I      intronic
chr1:93665717(+) A-I      intronic
chr1:93675543(+) A-I      intronic
chr1:93707126(+) A-I      intronic
chr1:93721030(+) A-I      intronic
chr1:93715662(+) A-I      intronic
chr1:93706721(+) A-I      intronic
chr1:93660637(+) A-I      intronic
chr1:93692934(+) A-I      intronic
chr1:93693372(+) A-I      intronic
chr1:93715732(+) A-I      intronic
chr1:93693388(+) A-I      intronic
chr1:93665983(+) A-I      intronic
chr1:93675467(+) A-I      intronic
chr1:93665593(+) A-I      intronic
chr1:93740138(+) A-I      intronic
chr1:93739774(+) A-I      intronic
chr1:93700426(+) A-I      intronic
chr1:93665741(+) A-I      intronic
chr1:93715166(+) A-I      intronic
chr1:93740140(+) A-I      intronic
chr1:93675471(+) A-I      intronic
chr1:93674715(+) A-I      intronic
chr1:93715665(+) A-I      intronic
chr1:93698480(+) A-I      intronic
chr1:93707080(+) A-I      intronic
chr1:93715222(+) A-I      intronic
chr1:93727144(+) A-I      intronic
chr1:93682778(+) A-I      intronic
chr1:93706612(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED CCDC18
chr1:93700443(+) A-I intron -    22327324
chr1:93707168(+) A-I intron -    22327324
chr1:93715254(+) A-I intron -    22327324
chr1:93715727(+) A-I intron -    22327324
chr1:93721028(+) A-I intron -    22327324
chr1:93729423(+) A-I intron -    22327324
chr1:93729424(+) A-I intron -    22327324
chr1:93729563(+) A-I intron -    22327324
chr1:93740290(+) A-I intron -    22327324
chr1:93743817(+) A-I intron -    22327324
chr1:93715222(+) A-G intron -    22484847
chr1:93715229(+) A-G intron -    22484847
chr1:93715662(+) A-G intron -    22484847
chr1:93715730(+) T-C intron -    22484847
chr1:93725217(+) T-C intron -    22484847
chr1:93729423(+) T-C intron -    22484847
chr1:93647204(+) A-G intron -    22484847
chr1:93647289(+) A-G intron -    22484847
chr1:93655250(+) T-C intron -    22484847
chr1:93655270(+) A-G intron -    22484847
chr1:93655276(+) A-G intron -    22484847
chr1:93655284(+) A-G intron -    22484847
chr1:93655441(+) T-C intron -    22484847
chr1:93660502(+) A-G intron -    22484847
chr1:93660524(+) T-C intron -    22484847
chr1:93660573(+) A-G intron -    22484847
chr1:93660577(+) A-G intron -    22484847
chr1:93660597(+) A-G intron -    22484847
chr1:93660608(+) A-G intron -    22484847
chr1:93660625(+) A-G intron -    22484847
chr1:93660637(+) A-G intron -    22484847
chr1:93661733(+) A-G intron -    22484847
chr1:93661749(+) A-G intron -    22484847
chr1:93661782(+) A-G intron -    22484847
chr1:93661813(+) A-G intron -    22484847
chr1:93661830(+) A-G intron -    22484847
chr1:93665741(+) A-G intron -    22484847
chr1:93665752(+) T-C intron -    22484847
chr1:93665791(+) T-C intron -    22484847
chr1:93665978(+) A-G intron -    22484847
chr1:93674390(+) T-C intron -    22484847
chr1:93674391(+) T-C intron -    22484847
chr1:93674396(+) T-C intron -    22484847
chr1:93674601(+) A-G intron -    22484847
chr1:93674715(+) A-G intron -    22484847
chr1:93674767(+) A-G intron -    22484847
chr1:93675467(+) A-G intron -    22484847
chr1:93675468(+) A-G intron -    22484847
chr1:93675471(+) A-G intron -    22484847
chr1:93675512(+) A-G intron -    22484847
chr1:93675515(+) A-G intron -    22484847
chr1:93675538(+) A-G intron -    22484847
chr1:93675543(+) A-G intron -    22484847
chr1:93675544(+) A-G intron -    22484847
chr1:93675608(+) T-C intron -    22484847
chr1:93675614(+) T-C intron -    22484847
chr1:93691258(+) T-C intron -    22484847
chr1:93692154(+) A-G intron -    22484847
chr1:93692163(+) T-C intron -    22484847
chr1:93692224(+) A-G intron -    22484847
chr1:93692232(+) A-G intron -    22484847
chr1:93692312(+) A-G intron -    22484847
chr1:93692313(+) A-G intron -    22484847
chr1:93692318(+) T-C intron -    22484847
chr1:93692326(+) A-G intron -    22484847
chr1:93692908(+) A-G intron -    22484847
chr1:93692934(+) A-G intron -    22484847
chr1:93693253(+) A-G intron -    22484847
chr1:93693279(+) A-G intron -    22484847
chr1:93693388(+) A-G intron -    22484847
chr1:93693458(+) T-C intron -    22484847
chr1:93694584(+) A-G intron -    22484847
chr1:93695962(+) T-C intron -    22484847
chr1:93695986(+) T-C intron -    22484847
chr1:93695990(+) A-G intron -    22484847
chr1:93698265(+) T-C intron -    22484847
chr1:93698273(+) A-G intron -    22484847
chr1:93698362(+) T-C intron -    22484847
chr1:93698416(+) T-C intron -    22484847
chr1:93698454(+) A-G intron -    22484847
chr1:93698471(+) T-C intron -    22484847
chr1:93698484(+) T-C intron -    22484847
chr1:93700443(+) T-C intron -    22484847
chr1:93700658(+) A-G intron -    22484847
chr1:93706612(+) A-G intron -    22484847
chr1:93706613(+) A-G intron -    22484847
chr1:93706644(+) T-C intron -    22484847
chr1:93706653(+) A-G intron -    22484847
chr1:93706721(+) A-G intron -    22484847
chr1:93706786(+) A-G intron -    22484847
chr1:93706801(+) T-C intron -    22484847
chr1:93707017(+) A-G intron -    22484847
chr1:93707024(+) T-C intron -    22484847
chr1:93707025(+) A-G intron -    22484847
chr1:93707036(+) T-C intron -    22484847
chr1:93707094(+) T-C intron -    22484847
chr1:93707118(+) A-G intron -    22484847
chr1:93707168(+) A-G intron -    22484847
chr1:93707195(+) T-C intron -    22484847
chr1:93713069(+) T-C intron -    22484847
chr1:93713137(+) T-C intron -    22484847
chr1:93713181(+) T-C intron -    22484847
chr1:93713228(+) T-C intron -    22484847
chr1:93713709(+) T-C intron -    22484847
chr1:93713716(+) T-C intron -    22484847
chr1:93713860(+) T-C intron -    22484847
chr1:93714276(+) T-C intron -    22484847
chr1:93714289(+) T-C intron -    22484847
chr1:93714316(+) T-C intron -    22484847
chr1:93714334(+) A-G intron -    22484847
chr1:93714364(+) T-C intron -    22484847
chr1:93714387(+) A-G intron -    22484847
chr1:93714393(+) A-G intron -    22484847
chr1:93714402(+) T-C intron -    22484847
chr1:93714406(+) T-C intron -    22484847
chr1:93714408(+) T-C intron -    22484847
chr1:93714473(+) T-C intron -    22484847
chr1:93714524(+) T-C intron -    22484847
chr1:93715123(+) A-G intron -    22484847
chr1:93715139(+) T-C intron -    22484847
chr1:93715143(+) T-C intron -    22484847
chr1:93715144(+) T-C intron -    22484847
chr1:93715147(+) T-C intron -    22484847
chr1:93715753(+) T-C intron -    22484847
chr1:93715754(+) A-G intron -    22484847
chr1:93715770(+) T-C intron -    22484847
chr1:93715813(+) T-C intron -    22484847
chr1:93715869(+) T-C intron -    22484847
chr1:93715876(+) T-C intron -    22484847
chr1:93717673(+) T-C intron -    22484847
chr1:93717679(+) T-C intron -    22484847
chr1:93717687(+) T-C intron -    22484847
chr1:93717696(+) A-G intron -    22484847
chr1:93717734(+) A-G intron -    22484847
chr1:93717866(+) T-C intron -    22484847
chr1:93720780(+) T-C intron -    22484847
chr1:93720794(+) T-C intron -    22484847
chr1:93721028(+) T-C intron -    22484847
chr1:93721127(+) A-G intron -    22484847
chr1:93721171(+) T-C intron -    22484847
chr1:93721193(+) T-C intron -    22484847
chr1:93721198(+) T-C intron -    22484847
chr1:93721207(+) T-C intron -    22484847
chr1:93721210(+) T-C intron -    22484847
chr1:93721217(+) T-C intron -    22484847
chr1:93722706(+) T-C intron -    22484847
chr1:93722798(+) A-C intron -    22484847
chr1:93727144(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase CCDC18
chr1:93645870-93645871(+) m6A 5'UTR//intron       24284625//24981863//27773535//27371828//27773536//22608085
chr1:93645909-93645910(+) m6A 5'UTR//intron       24284625//25456834//24981863//27773535//27371828//27773536//22608085
chr1:93645938-93645939(+) m6A 5'UTR//intron       24284625//25456834//24981863//27773535//27371828//27773536//22608085
chr1:93645981-93645982(+) m6A 5'UTR//intron       24284625//25456834//24981863//27773535//27371828//27773536//22608085
chr1:93646381-93646382(+) m6A 5'UTR//CDS//intron       24284625//24981863//22608085
chr1:93648937-93648938(+) m6A CDS//exon       -
chr1:93648952-93648953(+) m6A CDS//exon       -
chr1:93659223-93659224(+) m6A CDS       24981863
chr1:93659270-93659271(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr1:93659280-93659281(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr1:93659289-93659290(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr1:93667535-93667536(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr1:93671161-93671162(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr1:93672756-93672757(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr1:93672791-93672792(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr1:93672812-93672813(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr1:93672836-93672837(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr1:93677784-93677785(+) m6A 3'UTR//CDS       22608085
chr1:93677789-93677790(+) m6A 3'UTR//CDS       27773535//22608085
chr1:93680335-93680336(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22608085
chr1:93680363-93680364(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535//22608085
chr1:93680384-93680385(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863//22608085
chr1:93687190-93687191(+) m6A CDS       24981863
chr1:93687206-93687207(+) m6A CDS       24981863
chr1:93687216-93687217(+) m6A CDS       24981863
chr1:93687251-93687252(+) m6A CDS//exon       24981863
chr1:93687278-93687279(+) m6A CDS//exon       24981863
chr1:93698099-93698100(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535
chr1:93698132-93698133(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535
chr1:93698137-93698138(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535
chr1:93698146-93698147(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr1:93701812-93701813(+) m6A CDS//intron       24981863//27773535//22608085
chr1:93701818-93701819(+) m6A CDS//intron       24981863//27773535//22608085
chr1:93701824-93701825(+) m6A CDS//intron       24981863//27773535//22608085
chr1:93701833-93701834(+) m6A CDS//intron       24981863//27773535//22608085
chr1:93704996-93704997(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr1:93705002-93705003(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr1:93705020-93705021(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr1:93705274-93705275(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr1:93705279-93705280(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr1:93705316-93705317(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr1:93705321-93705322(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr1:93705360-93705361(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr1:93705447-93705448(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr1:93711684-93711685(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr1:93711739-93711740(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr1:93712441-93712442(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr1:93712489-93712490(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr1:93712507-93712508(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr1:93720065-93720066(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr1:93720070-93720071(+) Y 3'UTR//CDS       26075521
chr1:93720104-93720105(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr1:93720141-93720142(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr1:93721908-93721909(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr1:93721985-93721986(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr1:93736147-93736148(+) m6A CDS//intron       22608085
chr1:93736169-93736170(+) m6A CDS//intron       22608085
chr1:93736222-93736223(+) m6A CDS//intron       22608085
chr1:93736232-93736233(+) m6A CDS//intron       22608085
chr1:93736312-93736313(+) m6A CDS//intron       22608085
chr1:93736325-93736326(+) m6A CDS//intron       22608085
chr1:93736350-93736351(+) m6A CDS//intron       22608085

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa-miR-223-5p
Exosome Primary dendritic cells     21505438
Exosome Breast milk     22211110
Exosome Plasma     23663360
Exosome B cell lymphoma cell lines|EBV-transformed lymphoblastoid B cells     25242326
Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     -
Microvesicle Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     -
CCDC18
Chromatin K562 cells     -
Cytosol HCC cell line (HepG2)     -
Exosome Blood     -
Insoluble cytoplasm K562 cells     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa-miR-223-5p
Interactor2: CCDC18

Evidence Support:


Weak-Evidence PAR-CLIP
Support Database ViRBase

References:


PMID 22291592 Target region CDS
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells Interactor2 expression None
Description We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.

Starting a new search, please wait ...