Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00065580

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.4752

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-223-5p:           WNK1:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa-miR-223-5p WNK1
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0004570 65125
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - HSAN2//HSN2//KDP//p65//PPP1R167//PRKWNK1//PSK

ncRNA SNP information:


Resource Symbol SNP ID SNP Position Ref/Alt
miRNASNP-v3 hsa-miR-223-5p
rs1240009384 chrX:66018913    A/T
rs1397275461 chrX:66018904    G/T
rs1464475149 chrX:66018916    T/C
rs761701581 chrX:66018906    C/G
rs772305537 chrX:66018909    G/A
rs774279244 chrX:66018895    C/T
rs890919635 chrX:66018896    G/A

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR WNK1
chr12:874239(+) A-I      intronic
chr12:874201(+) A-I      intronic
chr12:874235(+) A-I      intronic
chr12:1001019(+) A-I      intronic
chr12:874512(+) A-I      intronic
chr12:874518(+) A-I      intronic
chr12:874528(+) A-I      intronic
chr12:874536(+) A-I      intronic
chr12:874553(+) A-I      intronic
chr12:867050(+) A-I      intronic
chr12:867051(+) A-I      intronic
chr12:867049(+) A-I      intronic
chr12:983237(+) A-I      intronic
chr12:867052(+) A-I      intronic
chr12:1007488(+) A-I      intronic
chr12:867044(+) A-I      intronic
chr12:871987(+) A-I      intronic
chr12:867024(+) A-I      intronic
chr12:907497(+) A-I      intronic
chr12:1007459(+) A-I      intronic
chr12:867015(+) A-I      intronic
chr12:864981(+) A-I      intronic
chr12:976133(+) A-I      intronic
chr12:874210(+) A-I      intronic
chr12:903985(+) A-I      intronic
chr12:904186(+) A-I      intronic
chr12:906850(+) A-I      intronic
chr12:906857(+) A-I      intronic
chr12:906925(+) A-I      intronic
chr12:946655(+) A-I      intronic
chr12:882210(+) A-I      intronic
chr12:882205(+) A-I      intronic
chr12:937387(+) A-I      intronic
chr12:937365(+) A-I      intronic
chr12:936834(+) A-I      intronic
chr12:962984(+) A-I      intronic
chr12:882239(+) A-I      intronic
chr12:882247(+) A-I      intronic
chr12:947804(+) A-I      intronic
chr12:882191(+) A-I      intronic
chr12:882162(+) A-I      intronic
chr12:878564(+) A-I      intronic
chr12:878530(+) A-I      intronic
chr12:878512(+) A-I      intronic
chr12:878465(+) A-I      intronic
chr12:878205(+) A-I      intronic
chr12:878021(+) A-I      intronic
chr12:878020(+) A-I      intronic
chr12:878016(+) A-I      intronic
chr12:876639(+) A-I      intronic
chr12:876621(+) A-I      intronic
chr12:876602(+) A-I      intronic
chr12:876558(+) A-I      intronic
chr12:874842(+) A-I      intronic
chr12:874591(+) A-I      intronic
chr12:882249(+) A-I      intronic
chr12:874230(+) A-I      intronic
chr12:936769(+) A-I      intronic
chr12:874181(+) A-I      intronic
chr12:926427(+) A-I      intronic
chr12:874168(+) A-I      intronic
chr12:874167(+) A-I      intronic
chr12:999248(+) A-I      intronic
chr12:874147(+) A-I      intronic
chr12:999236(+) A-I      intronic
chr12:882336(+) A-I      intronic
chr12:874143(+) A-I      intronic
chr12:874119(+) A-I      intronic
chr12:999169(+) A-I      intronic
chr12:946619(+) A-I      intronic
chr12:884619(+) A-I      intronic
chr12:873673(+) A-I      intronic
chr12:944432(+) A-I      intronic
chr12:944454(+) A-I      intronic
chr12:944855(+) A-I      intronic
chr12:944973(+) A-I      intronic
chr12:944989(+) A-I      intronic
chr12:873643(+) A-I      intronic
chr12:873612(+) A-I      intronic
chr12:998855(+) A-I      intronic
chr12:873587(+) A-I      intronic
chr12:872592(+) A-I      intronic
chr12:872573(+) A-I      intronic
chr12:998841(+) A-I      intronic
chr12:998822(+) A-I      intronic
chr12:998821(+) A-I      intronic
chr12:872500(+) A-I      intronic
chr12:998818(+) A-I      intronic
chr12:871993(+) A-I      intronic
chr12:871977(+) A-I      intronic
chr12:871497(+) A-I      intronic
chr12:871245(+) A-I      intronic
chr12:870095(+) A-I      intronic
chr12:870085(+) A-I      intronic
chr12:870079(+) A-I      intronic
chr12:870069(+) A-I      intronic
chr12:870057(+) A-I      intronic
chr12:869937(+) A-I      intronic
chr12:884661(+) A-I      intronic
chr12:868706(+) A-I      intronic
chr12:867683(+) A-I      intronic
chr12:867671(+) A-I      intronic
chr12:867640(+) A-I      intronic
chr12:867634(+) A-I      intronic
chr12:867633(+) A-I      intronic
chr12:867628(+) A-I      intronic
chr12:867617(+) A-I      intronic
chr12:945035(+) A-I      intronic
chr12:926422(+) A-I      intronic
chr12:867183(+) A-I      intronic
chr12:867142(+) A-I      intronic
chr12:867090(+) A-I      intronic
chr12:867086(+) A-I      intronic
chr12:946501(+) A-I      intronic
chr12:867041(+) A-I      intronic
chr12:866621(+) A-I      intronic
chr12:866566(+) A-I      intronic
chr12:884680(+) A-I      intronic
chr12:864989(+) A-I      intronic
chr12:884689(+) A-I      intronic
chr12:925666(+) A-I      intronic
chr12:884690(+) A-I      intronic
chr12:884694(+) A-I      intronic
chr12:925539(+) A-I      intronic
chr12:949561(+) A-I      intronic
chr12:885661(+) A-I      intronic
chr12:925510(+) A-I      intronic
chr12:919333(+) A-I      intronic
chr12:885677(+) A-I      intronic
chr12:885683(+) A-I      intronic
chr12:937400(+) A-I      intronic
chr12:919273(+) A-I      intronic
chr12:886506(+) A-I      intronic
chr12:919269(+) A-I      intronic
chr12:937393(+) A-I      intronic
chr12:918069(+) A-I      intronic
chr12:892199(+) A-I      intronic
chr12:892618(+) A-I      intronic
chr12:892628(+) A-I      intronic
chr12:986323(+) A-I      intronic
chr12:986254(+) A-I      intronic
chr12:892712(+) A-I      intronic
chr12:985454(+) A-I      intronic
chr12:892723(+) A-I      intronic
chr12:892729(+) A-I      intronic
chr12:946511(+) A-I      intronic
chr12:892752(+) A-I      intronic
chr12:946590(+) A-I      intronic
chr12:983268(+) A-I      intronic
chr12:898005(+) A-I      intronic
chr12:983218(+) A-I      intronic
chr12:983217(+) A-I      intronic
chr12:946593(+) A-I      intronic
chr12:906926(+) A-I      intronic
chr12:976296(+) A-I      intronic
chr12:976209(+) A-I      intronic
chr12:946660(+) A-I      intronic
chr12:906994(+) A-I      intronic
chr12:965106(+) A-I      intronic
chr12:976198(+) A-I      intronic
chr12:946681(+) A-I      intronic
chr12:976195(+) A-I      intronic
chr12:908977(+) A-I      intronic
chr12:946672(+) A-I      intronic
chr12:882215(+) A-I      intronic
chr12:962948(+) A-I      intronic
chr12:910687(+) A-I      intronic
chr12:946661(+) A-I      intronic
chr12:976174(+) A-I      intronic
chr12:976160(+) A-I      intronic
chr12:976142(+) A-I      intronic
chr12:946695(+) A-I      intronic
chr12:976139(+) A-I      intronic
chr12:946620(+) A-I      intronic
chr12:976136(+) A-I      intronic
chr12:910704(+) A-I      intronic
chr12:976128(+) A-I      intronic
chr12:944247(+) A-I      intronic
chr12:941417(+) A-I      intronic
chr12:941399(+) A-I      intronic
chr12:941394(+) A-I      intronic
chr12:963193(+) A-I      intronic
chr12:963178(+) A-I      intronic
chr12:963177(+) A-I      intronic
chr12:965135(+) A-I      intronic
chr12:963138(+) A-I      intronic
chr12:965151(+) A-I      intronic
chr12:965158(+) A-I      intronic
chr12:965256(+) A-I      intronic
chr12:965359(+) A-I      intronic
chr12:965413(+) A-I      intronic
chr12:965481(+) A-I      intronic
chr12:965570(+) A-I      intronic
chr12:975694(+) A-I      intronic
chr12:1007879(+) A-I      intronic
chr12:891832(+) A-I      intronic
chr12:1001069(+) A-I      intronic
chr12:874475(+) A-I      intronic
chr12:874835(+) A-I      intronic
chr12:864957(+) A-I      intronic
chr12:874459(+) A-I      intronic
chr12:963320(+) A-I      intronic
chr12:975778(+) A-I      intronic
chr12:1007606(+) A-I      intronic
chr12:936734(+) A-I      intronic
chr12:872635(+) A-I      intronic
chr12:865020(+) A-I      intronic
chr12:884670(+) A-I      intronic
chr12:874465(+) A-I      intronic
chr12:963332(+) A-I      intronic
chr12:999180(+) A-I      intronic
chr12:983247(+) A-I      intronic
chr12:893051(+) A-I      intronic
chr12:985388(+) A-I      intronic
chr12:1003128(+) A-I      intronic
chr12:871990(+) A-I      intronic
chr12:909252(+) A-I      intronic
chr12:1007601(+) A-I      intronic
chr12:998730(+) A-I      intronic
chr12:963278(+) A-I      intronic
chr12:874175(+) A-I      intronic
chr12:874184(+) A-I      intronic
chr12:892103(+) A-I      intronic
chr12:1007490(+) A-I      intronic
chr12:986293(+) A-I      intronic
chr12:1001033(+) A-I      intronic
chr12:975686(+) A-I      intronic
chr12:1008048(+) A-I      intronic
chr12:1007528(+) A-I      intronic
chr12:908506(+) A-I      intronic
chr12:868757(+) A-I      intronic
chr12:1007497(+) A-I      intronic
chr12:864954(+) A-I      intronic
chr12:864990(+) A-I      intronic
chr12:1000404(+) A-I      intronic
chr12:1007396(+) A-I      intronic
chr12:873538(+) A-I      intronic
chr12:906955(+) A-I      intronic
chr12:965493(+) A-I      intronic
chr12:944320(+) A-I      intronic
chr12:963279(+) A-I      intronic
chr12:946564(+) A-I      intronic
chr12:865082(+) A-I      intronic
chr12:882164(+) A-I      intronic
chr12:885317(+) A-I      intronic
chr12:891764(+) A-I      intronic
chr12:1000430(+) A-I      intronic
chr12:872121(+) A-I      intronic
chr12:867042(+) A-I      intronic
chr12:1000493(+) A-I      intronic
chr12:976058(+) A-I      intronic
chr12:1001035(+) A-I      intronic
chr12:967621(+) A-I      intronic
chr12:1007395(+) A-I      intronic
chr12:896518(+) A-I      intronic
chr12:937278(+) A-I      intronic
chr12:918030(+) A-I      intronic
chr12:1011445(+) A-I      intronic
chr12:874458(+) A-I      intronic
chr12:1007373(+) A-I      intronic
chr12:867016(+) A-I      intronic
chr12:969021(+) A-I      intronic
chr12:1002874(+) A-I      intronic
chr12:985321(+) A-I      intronic
chr12:963373(+) A-I      intronic
chr12:871944(+) A-I      intronic
chr12:906903(+) A-I      intronic
chr12:965473(+) A-I      intronic
chr12:1002946(+) A-I      intronic
chr12:1002960(+) A-I      intronic
chr12:867080(+) A-I      intronic
chr12:947765(+) A-I      intronic
chr12:897869(+) A-I      intronic
chr12:1007967(+) A-I      intronic
chr12:963423(+) A-I      intronic
chr12:957154(+) A-I      intronic
chr12:1007526(+) A-I      intronic
chr12:973474(+) A-I      intronic
chr12:910763(+) A-I      intronic
chr12:874190(+) A-I      intronic
chr12:940583(+) A-I      intronic
chr12:985320(+) A-I      intronic
chr12:947730(+) A-I      intronic
chr12:963301(+) A-I      intronic
chr12:986505(+) A-I      intronic
chr12:867121(+) A-I      intronic
chr12:957103(+) A-I      intronic
chr12:940448(+) A-I      intronic
chr12:963083(+) A-I      intronic
chr12:1007555(+) A-I      intronic
chr12:1009335(+) A-I      intronic
chr12:908745(+) A-I      intronic
chr12:1009326(+) A-I      intronic
chr12:1009324(+) A-I      intronic
chr12:887625(+) A-I      intronic
chr12:884667(+) A-I      intronic
chr12:871936(+) A-I      intronic
chr12:999158(+) A-I      intronic
chr12:999366(+) A-I      intronic
chr12:865021(+) A-I      intronic
chr12:872030(+) A-I      intronic
chr12:871969(+) A-I      intronic
chr12:874606(+) A-I      intronic
chr12:1009293(+) A-I      intronic
chr12:1009256(+) A-I      intronic
chr12:892680(+) A-I      intronic
chr12:872696(+) A-I      intronic
chr12:1002878(+) A-I      intronic
chr12:867095(+) A-I      intronic
chr12:976201(+) A-I      intronic
chr12:897973(+) A-I      intronic
chr12:873626(+) A-I      intronic
chr12:926444(+) A-I      intronic
chr12:975695(+) A-I      intronic
chr12:1008087(+) A-I      intronic
chr12:1008092(+) A-I      intronic
chr12:941448(+) A-I      intronic
chr12:865062(+) A-I      intronic
chr12:940449(+) A-I      intronic
chr12:884660(+) A-I      intronic
chr12:944449(+) A-I      intronic
chr12:983276(+) A-I      intronic
chr12:874270(+) A-I      intronic
chr12:1003304(+) A-I      intronic
chr12:925459(+) A-I      intronic
chr12:998886(+) A-I      intronic
chr12:947681(+) A-I      intronic
chr12:998823(+) A-I      intronic
chr12:892286(+) A-I      intronic
chr12:925494(+) A-I      intronic
chr12:874085(+) A-I      intronic
chr12:983242(+) A-I      intronic
chr12:872494(+) A-I      intronic
chr12:929876(+) A-I      intronic
chr12:872158(+) A-I      intronic
chr12:976130(+) A-I      intronic
chr12:872634(+) A-I      intronic
chr12:913759(+) A-I      intronic
chr12:874141(+) A-I      intronic
chr12:910637(+) A-I      intronic
chr12:963169(+) A-I      intronic
chr12:986405(+) A-I      intronic
chr12:936756(+) A-I      intronic
chr12:976168(+) A-I      intronic
chr12:981372(+) A-I      intronic
chr12:874258(+) A-I      intronic
chr12:874131(+) A-I      intronic
chr12:910809(+) A-I      intronic
chr12:872042(+) A-I      intronic
chr12:1000444(+) A-I      intronic
chr12:1003290(+) A-I      intronic
chr12:909259(+) A-I      intronic
chr12:981313(+) A-I      intronic
chr12:998890(+) A-I      intronic
chr12:1002325(+) A-I      intronic
chr12:874532(+) A-I      intronic
chr12:864896(+) A-I      intronic
chr12:865098(+) A-I      intronic
chr12:986347(+) A-I      intronic
chr12:957073(+) A-I      intronic
chr12:962965(+) A-I      intronic
chr12:867055(+) A-I      intronic
chr12:897799(+) A-I      intronic
chr12:874104(+) A-I      intronic
chr12:986286(+) A-I      intronic
chr12:986414(+) A-I      intronic
chr12:986330(+) A-I      intronic
chr12:872530(+) A-I      intronic
chr12:940518(+) A-I      intronic
chr12:867103(+) A-I      intronic
chr12:963265(+) A-I      intronic
chr12:874108(+) A-I      intronic
chr12:963374(+) A-I      intronic
chr12:936794(+) A-I      intronic
chr12:1007932(+) A-I      intronic
chr12:874513(+) A-I      intronic
chr12:873651(+) A-I      intronic
chr12:867760(+) A-I      intronic
chr12:944275(+) A-I      intronic
chr12:874607(+) A-I      intronic
chr12:873759(+) A-I      intronic
chr12:918023(+) A-I      intronic
chr12:940517(+) A-I      intronic
chr12:976131(+) A-I      intronic
chr12:885474(+) A-I      intronic
chr12:871406(+) A-I      intronic
chr12:872146(+) A-I      intronic
chr12:946646(+) A-I      intronic
chr12:926452(+) A-I      intronic
chr12:998945(+) A-I      intronic
chr12:975724(+) A-I      intronic
chr12:873723(+) A-I      intronic
chr12:885386(+) A-I      intronic
chr12:937280(+) A-I      intronic
chr12:876217(+) A-I      intronic
chr12:975629(+) A-I      intronic
chr12:898016(+) A-I      intronic
chr12:1011302(+) A-I      intronic
chr12:940544(+) A-I      intronic
chr12:975708(+) A-I      intronic
chr12:1000398(+) A-I      intronic
chr12:1000325(+) A-I      intronic
chr12:963045(+) A-I      intronic
chr12:986252(+) A-I      intronic
chr12:872186(+) A-I      intronic
chr12:941381(+) A-I      intronic
chr12:872012(+) A-I      intronic
chr12:1007499(+) A-I      intronic
chr12:867081(+) A-I      intronic
chr12:965569(+) A-I      intronic
chr12:872540(+) A-I      intronic
chr12:999183(+) A-I      intronic
chr12:976035(+) A-I      intronic
chr12:947801(+) A-I      intronic
chr12:888734(+) A-I      intronic
chr12:865002(+) A-I      intronic
chr12:998729(+) A-I      intronic
chr12:867133(+) A-I      intronic
chr12:937287(+) A-I      intronic
chr12:936824(+) A-I      intronic
chr12:998824(+) A-I      intronic
chr12:872644(+) A-I      intronic
chr12:892821(+) A-I      intronic
chr12:946490(+) A-I      intronic
chr12:1008090(+) A-I      intronic
chr12:865066(+) A-I      intronic
chr12:940539(+) A-I      intronic
chr12:936795(+) A-I      intronic
chr12:871500(+) A-I      intronic
chr12:1007463(+) A-I      intronic
chr12:906968(+) A-I      intronic
chr12:963355(+) A-I      intronic
chr12:867026(+) A-I      intronic
chr12:866949(+) A-I      intronic
chr12:874654(+) A-I      intronic
chr12:1001014(+) A-I      intronic
chr12:975662(+) A-I      intronic
chr12:986411(+) A-I      intronic
chr12:941426(+) A-I      intronic
chr12:975711(+) A-I      intronic
chr12:872574(+) A-I      intronic
chr12:985409(+) A-I      intronic
chr12:1007493(+) A-I      intronic
chr12:873646(+) A-I      intronic
chr12:912796(+) A-I      intronic
chr12:937325(+) A-I      intronic
chr12:897827(+) A-I      intronic
chr12:946563(+) A-I      intronic
chr12:975609(+) A-I      intronic
chr12:888710(+) A-I      intronic
chr12:867037(+) A-I      intronic
chr12:1007999(+) A-I      intronic
chr12:963191(+) A-I      intronic
chr12:1000324(+) A-I      intronic
chr12:893046(+) A-I      intronic
chr12:1007498(+) A-I      intronic
chr12:963356(+) A-I      intronic
chr12:908752(+) A-I      intronic
chr12:965075(+) A-I      intronic
chr12:963407(+) A-I      intronic
chr12:865027(+) A-I      intronic
chr12:986334(+) A-I      intronic
chr12:867122(+) A-I      intronic
chr12:891804(+) A-I      intronic
chr12:998910(+) A-I      intronic
chr12:975572(+) A-I      intronic
chr12:867040(+) A-I      intronic
chr12:976233(+) A-I      intronic
chr12:926836(+) A-I      intronic
chr12:975628(+) A-I      intronic
chr12:963462(+) A-I      intronic
chr12:985413(+) A-I      intronic
chr12:949518(+) A-I      intronic
chr12:892196(+) A-I      intronic
chr12:872013(+) A-I      intronic
chr12:1007663(+) A-I      intronic
chr12:866592(+) A-I      intronic
chr12:908766(+) A-I      intronic
chr12:892254(+) A-I      intronic
chr12:946468(+) A-I      intronic
chr12:998942(+) A-I      intronic
chr12:1007473(+) A-I      intronic
chr12:872559(+) A-I      intronic
chr12:873582(+) A-I      intronic
chr12:897800(+) A-I      intronic
chr12:963287(+) A-I      intronic
chr12:868626(+) A-I      intronic
chr12:873722(+) A-I      intronic
chr12:975727(+) A-I      intronic
chr12:867752(+) A-I      intronic
chr12:940551(+) A-I      intronic
chr12:963372(+) A-I      intronic
chr12:925535(+) A-I      intronic
chr12:963075(+) A-I      intronic
chr12:873691(+) A-I      intronic
chr12:965532(+) A-I      intronic
chr12:898778(+) A-I      intronic
chr12:910764(+) A-I      intronic
chr12:1000405(+) A-I      intronic
chr12:963663(+) A-I      intronic
chr12:873681(+) A-I      intronic
chr12:916392(+) A-I      intronic
chr12:874248(+) A-I      intronic
chr12:874105(+) A-I      intronic
chr12:986310(+) A-I      intronic
chr12:870039(+) A-I      intronic
chr12:999319(+) A-I      intronic
chr12:1008617(+) A-I      intronic
chr12:910808(+) A-I      intronic
chr12:864888(+) A-I      intronic
chr12:932834(+) A-I      intronic
chr12:1011300(+) A-I      intronic
chr12:864955(+) A-I      intronic
chr12:877419(+) A-I      intronic
chr12:998863(+) A-I      intronic
chr12:873592(+) A-I      intronic
chr12:957091(+) A-I      intronic
chr12:976018(+) A-I      intronic
chr12:1000975(+) A-I      intronic
chr12:873688(+) A-I      intronic
chr12:873655(+) A-I      intronic
chr12:940584(+) A-I      intronic
chr12:1007881(+) A-I      intronic
chr12:873679(+) A-I      intronic
chr12:871963(+) A-I      intronic
chr12:867031(+) A-I      intronic
chr12:897867(+) A-I      intronic
chr12:864994(+) A-I      intronic
chr12:965541(+) A-I      intronic
chr12:1007502(+) A-I      intronic
chr12:983232(+) A-I      intronic
chr12:998919(+) A-I      intronic
chr12:885422(+) A-I      intronic
chr12:872522(+) A-I      intronic
chr12:973413(+) A-I      intronic
chr12:876690(+) A-I      intronic
chr12:1000385(+) A-I      intronic
chr12:981371(+) A-I      intronic
chr12:963300(+) A-I      intronic
chr12:975646(+) A-I      intronic
chr12:874689(+) A-I      intronic
chr12:976178(+) A-I      intronic
chr12:909243(+) A-I      intronic
chr12:983261(+) A-I      intronic
chr12:874257(+) A-I      intronic
chr12:940475(+) A-I      intronic
chr12:944999(+) A-I      intronic
chr12:1011303(+) A-I      intronic
chr12:892771(+) A-I      intronic
chr12:985484(+) A-I      intronic
chr12:998873(+) A-I      intronic
chr12:873546(+) A-I      intronic
chr12:947607(+) A-I      intronic
chr12:864980(+) A-I      intronic
chr12:865026(+) A-I      intronic
chr12:940503(+) A-I      intronic
chr12:876522(+) A-I      intronic
chr12:946485(+) A-I      intronic
chr12:874565(+) A-I      intronic
chr12:976091(+) A-I      intronic
chr12:867107(+) A-I      intronic
chr12:866631(+) A-I      intronic
chr12:944864(+) A-I      intronic
chr12:884732(+) A-I      intronic
chr12:907565(+) A-I      intronic
chr12:872052(+) A-I      intronic
chr12:944304(+) A-I      intronic
chr12:927059(+) A-I      intronic
chr12:981385(+) A-I      intronic
chr12:946581(+) A-I      intronic
chr12:967603(+) A-I      intronic
chr12:885423(+) A-I      intronic
chr12:976137(+) A-I      intronic
chr12:870040(+) A-I      intronic
chr12:946584(+) A-I      intronic
chr12:976026(+) A-I      intronic
chr12:885783(+) A-I      intronic
chr12:976124(+) A-I      intronic
chr12:1008046(+) A-I      intronic
chr12:986931(+) A-I      intronic
chr12:975556(+) A-I      intronic
chr12:1000998(+) A-I      intronic
chr12:976274(+) A-I      intronic
chr12:963413(+) A-I      intronic
chr12:986304(+) A-I      intronic
chr12:999231(+) A-I      intronic
chr12:1009317(+) A-I      intronic
chr12:866609(+) A-I      intronic
chr12:999382(+) A-I      intronic
chr12:1009337(+) A-I      intronic
chr12:1009318(+) A-I      intronic
chr12:976269(+) A-I      intronic
chr12:965145(+) A-I      intronic
chr12:874554(+) A-I      intronic
chr12:976129(+) A-I      intronic
chr12:936759(+) A-I      intronic
chr12:965467(+) A-I      intronic
chr12:872564(+) A-I      intronic
chr12:986493(+) A-I      intronic
chr12:875845(+) A-I      intronic
chr12:865030(+) A-I      intronic
chr12:1008006(+) A-I      intronic
chr12:963137(+) A-I      intronic
chr12:868636(+) A-I      intronic
chr12:1003309(+) A-I      intronic
chr12:985481(+) A-I      intronic
chr12:1007852(+) A-I      intronic
chr12:985415(+) A-I      intronic
chr12:873652(+) A-I      intronic
chr12:986483(+) A-I      intronic
chr12:976127(+) A-I      intronic
chr12:985412(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED WNK1
chr12:873679(+) A-I intron -    22327324
chr12:983218(+) A-I intron -    21960545
chr12:983242(+) A-I intron -    21960545
chr12:864888(+) A-G intron -    22484847
chr12:872494(+) A-G intron -    22484847
chr12:872522(+) A-G intron -    22484847
chr12:872540(+) A-G intron -    22484847
chr12:872559(+) A-G intron -    22484847
chr12:872564(+) A-G intron -    22484847
chr12:872696(+) A-G intron -    22484847
chr12:873626(+) A-G intron -    22484847
chr12:873646(+) A-G intron -    22484847
chr12:873651(+) A-G intron -    22484847
chr12:873679(+) A-G intron -    22484847
chr12:873681(+) A-G intron -    22484847
chr12:873688(+) A-G intron -    22484847
chr12:873691(+) A-G intron -    22484847
chr12:874085(+) A-G intron -    22484847
chr12:874105(+) A-G intron -    22484847
chr12:874131(+) A-G intron -    22484847
chr12:874141(+) A-G intron -    22484847
chr12:874190(+) A-G intron -    22484847
chr12:874257(+) A-G intron -    22484847
chr12:874258(+) A-G intron -    22484847
chr12:874532(+) A-G intron -    22484847
chr12:874554(+) A-G intron -    22484847
chr12:874607(+) A-G intron -    22484847
chr12:892196(+) A-G intron -    22484847
chr12:975724(+) A-G intron -    22484847
chr12:983261(+) A-G intron -    22484847
chr12:1000975(+) A-G intron -    22484847
chr12:1007852(+) A-G intron -    22484847
chr12:864954(+) A-G intron -    22484847
chr12:864955(+) A-G intron -    22484847
chr12:864957(+) A-G intron -    22484847
chr12:864994(+) A-G intron -    22484847
chr12:865002(+) A-G intron -    22484847
chr12:865020(+) A-G intron -    22484847
chr12:865021(+) A-G intron -    22484847
chr12:865026(+) A-G intron -    22484847
chr12:865027(+) A-G intron -    22484847
chr12:865030(+) A-G intron -    22484847
chr12:865082(+) A-G intron -    22484847
chr12:866592(+) A-G intron -    22484847
chr12:866609(+) A-G intron -    22484847
chr12:866949(+) A-G intron -    22484847
chr12:867016(+) A-G intron -    22484847
chr12:867026(+) A-G intron -    22484847
chr12:867080(+) A-G intron -    22484847
chr12:867081(+) A-G intron -    22484847
chr12:867095(+) A-G intron -    22484847
chr12:867107(+) A-G intron -    22484847
chr12:867121(+) A-G intron -    22484847
chr12:867122(+) A-G intron -    22484847
chr12:867133(+) A-G intron -    22484847
chr12:870040(+) A-G intron -    22484847
chr12:871227(+) A-T intron -    22484847
chr12:871963(+) A-G intron -    22484847
chr12:871990(+) A-G intron -    22484847
chr12:872012(+) A-G intron -    22484847
chr12:872030(+) A-G intron -    22484847
chr12:872042(+) A-G intron -    22484847
chr12:872052(+) A-G intron -    22484847
chr12:872121(+) A-G intron -    22484847
chr12:872146(+) A-G intron -    22484847
chr12:872158(+) A-G intron -    22484847
chr12:872530(+) A-G intron -    22484847
chr12:872635(+) A-G intron -    22484847
chr12:872644(+) A-G intron -    22484847
chr12:873592(+) A-G intron -    22484847
chr12:873652(+) A-G intron -    22484847
chr12:874184(+) A-G intron -    22484847
chr12:874459(+) A-G intron -    22484847
chr12:874513(+) A-G intron -    22484847
chr12:875845(+) A-G intron -    22484847
chr12:876522(+) A-G intron -    22484847
chr12:877395(+) G-A intron -    22484847
chr12:884660(+) A-G intron -    22484847
chr12:884670(+) A-G intron -    22484847
chr12:884732(+) A-G intron -    22484847
chr12:885422(+) A-G intron -    22484847
chr12:885423(+) A-G intron -    22484847
chr12:885612(+) T-G intron -    22484847
chr12:891764(+) A-G intron -    22484847
chr12:891804(+) A-G intron -    22484847
chr12:891827(+) C-T intron -    22484847
chr12:891832(+) A-G intron -    22484847
chr12:892103(+) A-G intron -    22484847
chr12:897799(+) A-G intron -    22484847
chr12:897800(+) A-G intron -    22484847
chr12:897827(+) A-G intron -    22484847
chr12:897869(+) A-G intron -    22484847
chr12:898778(+) A-G intron -    22484847
chr12:906903(+) A-G intron -    22484847
chr12:906968(+) A-G intron -    22484847
chr12:907565(+) A-G intron -    22484847
chr12:908766(+) A-G intron -    22484847
chr12:909252(+) A-G intron -    22484847
chr12:910637(+) A-G intron -    22484847
chr12:910808(+) A-G intron -    22484847
chr12:910809(+) A-G intron -    22484847
chr12:913759(+) A-G intron -    22484847
chr12:916392(+) A-G intron -    22484847
chr12:918023(+) A-G intron -    22484847
chr12:918030(+) A-G intron -    22484847
chr12:925459(+) A-G intron -    22484847
chr12:925494(+) A-G intron -    22484847
chr12:936734(+) A-G intron -    22484847
chr12:936756(+) A-G intron -    22484847
chr12:936759(+) A-G intron -    22484847
chr12:936794(+) A-G intron -    22484847
chr12:936824(+) A-G intron -    22484847
chr12:940448(+) A-G intron -    22484847
chr12:940449(+) A-G intron -    22484847
chr12:940517(+) A-G intron -    22484847
chr12:940518(+) A-G intron -    22484847
chr12:940539(+) A-G intron -    22484847
chr12:940544(+) A-G intron -    22484847
chr12:940584(+) A-G intron -    22484847
chr12:941381(+) A-G intron -    22484847
chr12:941426(+) A-G intron -    22484847
chr12:941448(+) A-G intron -    22484847
chr12:946738(+) T-A intron -    22484847
chr12:947681(+) A-G intron -    22484847
chr12:963083(+) A-G intron -    22484847
chr12:963137(+) A-G intron -    22484847
chr12:963169(+) A-G intron -    22484847
chr12:963265(+) A-G intron -    22484847
chr12:963278(+) A-G intron -    22484847
chr12:963279(+) A-G intron -    22484847
chr12:963287(+) A-G intron -    22484847
chr12:963300(+) A-G intron -    22484847
chr12:963301(+) A-G intron -    22484847
chr12:963332(+) A-G intron -    22484847
chr12:963355(+) A-G intron -    22484847
chr12:963356(+) A-G intron -    22484847
chr12:963372(+) A-G intron -    22484847
chr12:963373(+) A-G intron -    22484847
chr12:963374(+) A-G intron -    22484847
chr12:963407(+) A-G intron -    22484847
chr12:963413(+) A-G intron -    22484847
chr12:963423(+) A-G intron -    22484847
chr12:963462(+) A-G intron -    22484847
chr12:963663(+) A-G intron -    22484847
chr12:965075(+) A-G intron -    22484847
chr12:965145(+) A-G intron -    22484847
chr12:965467(+) A-G intron -    22484847
chr12:965473(+) A-G intron -    22484847
chr12:965493(+) A-G intron -    22484847
chr12:965532(+) A-G intron -    22484847
chr12:965541(+) A-G intron -    22484847
chr12:965569(+) A-G intron -    22484847
chr12:973276(+) G-T intron -    22484847
chr12:973294(+) G-T intron -    22484847
chr12:973295(+) A-T intron -    22484847
chr12:975556(+) A-G intron -    22484847
chr12:975628(+) A-G intron -    22484847
chr12:975629(+) A-G intron -    22484847
chr12:975646(+) A-G intron -    22484847
chr12:975662(+) A-G intron -    22484847
chr12:976018(+) A-G intron -    22484847
chr12:976026(+) A-G intron -    22484847
chr12:976058(+) A-G intron -    22484847
chr12:976124(+) A-G intron -    22484847
chr12:976127(+) A-G intron -    22484847
chr12:976129(+) A-G intron -    22484847
chr12:976131(+) A-G intron -    22484847
chr12:976168(+) A-G intron -    22484847
chr12:981372(+) A-G intron -    22484847
chr12:981379(+) T-C intron -    22484847
chr12:985320(+) A-G intron -    22484847
chr12:985321(+) A-G intron -    22484847
chr12:985409(+) A-G intron -    22484847
chr12:985412(+) A-G intron -    22484847
chr12:985413(+) A-G intron -    22484847
chr12:985484(+) A-G intron -    22484847
chr12:986252(+) A-G intron -    22484847
chr12:986286(+) A-G intron -    22484847
chr12:986293(+) A-G intron -    22484847
chr12:986310(+) A-G intron -    22484847
chr12:986330(+) A-G intron -    22484847
chr12:986334(+) A-G intron -    22484847
chr12:986347(+) A-G intron -    22484847
chr12:986414(+) A-G intron -    22484847
chr12:993074(+) G-A intron -    22484847
chr12:993137(+) T-C intron -    22484847
chr12:993142(+) T-C intron -    22484847
chr12:998729(+) A-G intron -    22484847
chr12:998730(+) A-G intron -    22484847
chr12:998823(+) A-G intron -    22484847
chr12:998824(+) A-G intron -    22484847
chr12:998863(+) A-G intron -    22484847
chr12:998910(+) A-G intron -    22484847
chr12:999180(+) A-G intron -    22484847
chr12:999231(+) A-G intron -    22484847
chr12:999319(+) A-G intron -    22484847
chr12:999361(+) T-C intron -    22484847
chr12:1000385(+) A-G intron -    22484847
chr12:1000405(+) A-G intron -    22484847
chr12:1001033(+) A-G intron -    22484847
chr12:1001093(+) C-A intron -    22484847
chr12:1007373(+) A-G intron -    22484847
chr12:1007463(+) A-G intron -    22484847
chr12:1007490(+) A-G intron -    22484847
chr12:1007498(+) A-G intron -    22484847
chr12:1007499(+) A-G intron -    22484847
chr12:1007526(+) A-G intron -    22484847
chr12:1007555(+) A-G intron -    22484847
chr12:1007663(+) A-G intron -    22484847
chr12:1007881(+) A-G intron -    22484847
chr12:1007910(+) T-G intron -    22484847
chr12:1007932(+) A-G intron -    22484847
chr12:1007967(+) A-G intron -    22484847
chr12:1007999(+) A-G intron -    22484847
chr12:1008006(+) A-G intron -    22484847
chr12:1008048(+) A-G intron -    22484847
chr12:1008090(+) A-G intron -    22484847
chr12:1009334(+) T-C intron -    22484847
chr12:1011445(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase WNK1
chr12:1005370-1005371(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr12:1005434-1005435(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr12:1005459-1005460(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr12:1005510-1005511(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr12:1005539-1005540(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr12:1005546-1005547(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr12:1005574-1005575(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr12:1005607-1005608(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr12:1005652-1005653(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr12:1005864-1005865(+) m6A CDS//exon       26404942
chr12:1006664-1006665(+) m6A CDS//exon       -
chr12:1006710-1006711(+) m6A CDS//exon       -
chr12:1009688-1009689(+) m6A CDS//exon       -
chr12:1009864-1009865(+) m6A exon//intron       -
chr12:1009895-1009896(+) m6A exon//intron       -
chr12:1009923-1009924(+) m6A exon//intron       -
chr12:1017701-1017702(+) m6A CDS//exon       24284625//22575960
chr12:1017874-1017875(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr12:1017949-1017950(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr12:1017958-1017959(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr12:1017966-1017967(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr12:1017978-1017979(+) Tm 3'UTR//exon       -
chr12:1018168-1018169(+) m6A 3'UTR//exon       -
chr12:1018197-1018198(+) m6A 3'UTR//exon       -
chr12:1018274-1018275(+) m6A 3'UTR       -
chr12:1018291-1018292(+) m6A 3'UTR       -
chr12:1018369-1018370(+) m6A 3'UTR       24981863
chr12:1018377-1018378(+) m6A 3'UTR       24981863
chr12:1018383-1018384(+) m6A 3'UTR       24981863
chr12:1018465-1018466(+) m6A 3'UTR       24981863
chr12:1018601-1018602(+) m6A 3'UTR       24981863
chr12:1018634-1018635(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr12:1018661-1018662(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr12:1019086-1019087(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//27773535
chr12:1019139-1019140(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085
chr12:1019173-1019174(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085
chr12:1019179-1019180(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085
chr12:1019195-1019196(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085
chr12:1019230-1019231(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085
chr12:1019256-1019257(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085
chr12:1019276-1019277(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085
chr12:1019281-1019282(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085
chr12:1019324-1019325(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//27773535//22608085
chr12:1019370-1019371(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//22608085
chr12:1019752-1019753(+) m6A 3'UTR       -
chr12:1019770-1019771(+) m6A 3'UTR       -
chr12:1019810-1019811(+) m6A 3'UTR       -
chr12:1020097-1020098(+) m6A 3'UTR       27773535
chr12:1020144-1020145(+) m6A 3'UTR       27773535
chr12:1020255-1020256(+) m6A 3'UTR       27773535
chr12:1020318-1020319(+) m6A 3'UTR       27773535
chr12:1020332-1020333(+) m6A 3'UTR       27773535
chr12:1020391-1020392(+) m6A 3'UTR       27773535
chr12:1020465-1020466(+) m6A 3'UTR       27773535
chr12:862261-862262(+) m6A 5'UTR       24209618//22575960
chr12:862451-862452(+) m6A 5'UTR       24284625//22575960
chr12:862623-862624(+) m6A 5'UTR       24284625//22575960
chr12:862649-862650(+) m6A 5'UTR       24284625//25456834//22575960
chr12:862724-862725(+) m6A 5'UTR       24284625//25456834//24981863//22575960//22608085
chr12:862844-862845(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27371828//22575960//22608085
chr12:862881-862882(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27371828//22575960//22608085
chr12:862915-862916(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27371828//22575960//22608085
chr12:862921-862922(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27371828//22575960//22608085
chr12:863100-863101(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr12:863165-863166(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22575960//22608085
chr12:863218-863219(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//27371828//22575960//22608085
chr12:863355-863356(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27371828//22575960//22608085
chr12:863449-863450(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr12:863457-863458(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr12:863483-863484(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr12:936298-936299(+) m6A CDS       26404942
chr12:936367-936368(+) Am CDS       -
chr12:936377-936378(+) m6A CDS       26404942
chr12:966402-966403(+) m6A CDS//exon       24981863//26404942
chr12:968424-968425(+) m6A CDS//exon       24981863//26404942
chr12:968433-968434(+) m6A CDS//exon       24981863//26404942
chr12:968456-968457(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535
chr12:970214-970215(+) m6A CDS//exon       24981863//26404942
chr12:970236-970237(+) m6A CDS//exon       24981863//26404942
chr12:970327-970328(+) m6A CDS       24981863//26404942
chr12:970339-970340(+) m6A CDS       24981863//26404942
chr12:970358-970359(+) m6A CDS       -
chr12:970458-970459(+) Cm CDS       -
chr12:971316-971317(+) m6A CDS       -
chr12:971342-971343(+) m6A CDS       -
chr12:977199-977200(+) m6A CDS//intron       24209618//24981863
chr12:977226-977227(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863
chr12:977274-977275(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863
chr12:977360-977361(+) m6A CDS//intron       24209618//24981863
chr12:977387-977388(+) m6A CDS//intron       24209618//24981863
chr12:977393-977394(+) m6A CDS//intron       24209618//24981863
chr12:977480-977481(+) m6A CDS//intron       -
chr12:977531-977532(+) m6A CDS//intron       -
chr12:977884-977885(+) m6A CDS//intron       24284625//25456834//24981863
chr12:977900-977901(+) m6A CDS//intron       24284625//24981863
chr12:978008-978009(+) m6A CDS//intron       24284625//25456834//24981863
chr12:978013-978014(+) m6A CDS//intron       24284625//24981863
chr12:978070-978071(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618//24981863
chr12:978162-978163(+) m6A CDS//intron       24284625//24981863
chr12:978207-978208(+) m6A CDS//intron       24981863
chr12:978300-978301(+) m6A 3'UTR//intron       -
chr12:987202-987203(+) m6A exon//intron       -
chr12:987216-987217(+) m6A exon//intron       -
chr12:988930-988931(+) m6A CDS//intron       24284625
chr12:990665-990666(+) m6A exon//intron       24284625
chr12:990698-990699(+) m6A exon//intron       24284625
chr12:990911-990912(+) m6A CDS//exon       -
chr12:990951-990952(+) m6A CDS//exon       -
chr12:992667-992668(+) m6A CDS       26404942//22575960
chr12:993847-993848(+) m6A CDS       24981863
chr12:993896-993897(+) m6A CDS       24981863//26404942//22608085
chr12:993923-993924(+) m6A CDS       24981863//26404942//22608085
chr12:993943-993944(+) m6A CDS       24981863//26404942//22608085
chr12:993959-993960(+) m6A CDS       24981863//26404942//22608085
chr12:994730-994731(+) m6A CDS       24284625
chr12:994815-994816(+) m6A CDS       24284625//26404942
chr12:994915-994916(+) Y CDS       26075521
chr12:994929-994930(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//22575960//22608085
chr12:994964-994965(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//22575960//22608085
chr12:995007-995008(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//22608085
chr12:995014-995015(+) Tm CDS       -

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa-miR-223-5p
Exosome Primary dendritic cells     21505438
Exosome Breast milk     22211110
Exosome Plasma     23663360
Exosome B cell lymphoma cell lines|EBV-transformed lymphoblastoid B cells     25242326
Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     -
Microvesicle Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     -
WNK1
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -
Ribosome HEK-293 cells     22199352
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa-miR-223-5p
Interactor2: WNK1

Evidence Support:


Weak-Evidence PAR-CLIP
Support Database ViRBase

References:


PMID 22291592 Target region CDS
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells Interactor2 expression None
Description We identified 7, 827 miRNA-interaction sites in 3, 492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.

Starting a new search, please wait ...