Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00706691

  Virus:  

SARS-CoV-2 (NC_045512.2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol sars-cov-2-mir-D6-3p JARID2
miRBase
Accession/Entrez ID		 sars-cov-2-mir-D6-3p 3720
Organism SARS-CoV-2 (NC_045512.2) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - JMJ

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR JARID2
chr6:15284844(+) A-I      intronic
chr6:15284884(+) A-I      intronic
chr6:15284892(+) A-I      intronic
chr6:15284905(+) A-I      intronic
chr6:15284918(+) A-I      intronic
chr6:15284920(+) A-I      intronic
chr6:15285398(+) A-I      intronic
chr6:15285442(+) A-I      intronic
chr6:15285459(+) A-I      intronic
chr6:15285471(+) A-I      intronic
chr6:15285541(+) A-I      intronic
chr6:15285553(+) A-I      intronic
chr6:15285577(+) A-I      intronic
chr6:15286558(+) A-I      intronic
chr6:15286600(+) A-I      intronic
chr6:15286632(+) A-I      intronic
chr6:15287215(+) A-I      intronic
chr6:15273828(+) A-I      intronic
chr6:15273834(+) A-I      intronic
chr6:15274178(+) A-I      intronic
chr6:15274179(+) A-I      intronic
chr6:15274229(+) A-I      intronic
chr6:15274260(+) A-I      intronic
chr6:15470247(+) A-I      intronic
chr6:15450586(+) A-I      intronic
chr6:15450581(+) A-I      intronic
chr6:15465597(+) A-I      intronic
chr6:15465639(+) A-I      intronic
chr6:15470155(+) A-I      intronic
chr6:15289738(+) A-I      intronic
chr6:15289833(+) A-I      intronic
chr6:15289838(+) A-I      intronic
chr6:15289992(+) A-I      intronic
chr6:15290889(+) A-I      intronic
chr6:15290893(+) A-I      intronic
chr6:15290900(+) A-I      intronic
chr6:15290924(+) A-I      intronic
chr6:15450527(+) A-I      intronic
chr6:15449720(+) A-I      intronic
chr6:15384937(+) A-I      intronic
chr6:15377796(+) A-I      intronic
chr6:15376824(+) A-I      intronic
chr6:15356063(+) A-I      intronic
chr6:15356062(+) A-I      intronic
chr6:15356028(+) A-I      intronic
chr6:15355877(+) A-I      intronic
chr6:15347993(+) A-I      intronic
chr6:15336143(+) A-I      intronic
chr6:15336116(+) A-I      intronic
chr6:15335370(+) A-I      intronic
chr6:15333443(+) A-I      intronic
chr6:15331409(+) A-I      intronic
chr6:15331341(+) A-I      intronic
chr6:15324808(+) A-I      intronic
chr6:15290936(+) A-I      intronic
chr6:15290976(+) A-I      intronic
chr6:15290979(+) A-I      intronic
chr6:15290989(+) A-I      intronic
chr6:15274299(+) A-I      intronic
chr6:15274341(+) A-I      intronic
chr6:15274348(+) A-I      intronic
chr6:15324807(+) A-I      intronic
chr6:15323966(+) A-I      intronic
chr6:15323961(+) A-I      intronic
chr6:15323925(+) A-I      intronic
chr6:15323893(+) A-I      intronic
chr6:15322127(+) A-I      intronic
chr6:15322055(+) A-I      intronic
chr6:15319728(+) A-I      intronic
chr6:15274358(+) A-I      intronic
chr6:15295939(+) A-I      intronic
chr6:15296081(+) A-I      intronic
chr6:15295994(+) A-I      intronic
chr6:15295974(+) A-I      intronic
chr6:15291286(+) A-I      intronic
chr6:15319709(+) A-I      intronic
chr6:15312574(+) A-I      intronic
chr6:15312373(+) A-I      intronic
chr6:15312361(+) A-I      intronic
chr6:15291306(+) A-I      intronic
chr6:15291346(+) A-I      intronic
chr6:15292352(+) A-I      intronic
chr6:15516201(+) A-I      intronic
chr6:15274423(+) A-I      intronic
chr6:15279038(+) A-I      intronic
chr6:15282898(+) A-I      intronic
chr6:15283995(+) A-I      intronic
chr6:15311644(+) A-I      intronic
chr6:15311638(+) A-I      intronic
chr6:15284036(+) A-I      intronic
chr6:15284041(+) A-I      intronic
chr6:15292365(+) A-I      intronic
chr6:15292929(+) A-I      intronic
chr6:15292950(+) A-I      intronic
chr6:15292962(+) A-I      intronic
chr6:15292963(+) A-I      intronic
chr6:15292973(+) A-I      intronic
chr6:15311575(+) A-I      intronic
chr6:15307712(+) A-I      intronic
chr6:15307674(+) A-I      intronic
chr6:15307637(+) A-I      intronic
chr6:15307473(+) A-I      intronic
chr6:15307295(+) A-I      intronic
chr6:15306769(+) A-I      intronic
chr6:15306752(+) A-I      intronic
chr6:15312558(+) A-I      intronic
chr6:15282972(+) A-I      intronic
chr6:15270546(+) A-I      intronic
chr6:15417810(+) A-I      intronic
chr6:15306726(+) A-I      intronic
chr6:15417847(+) A-I      intronic
chr6:15418675(+) A-I      intronic
chr6:15412614(+) A-I      intronic
chr6:15418704(+) A-I      intronic
chr6:15420487(+) A-I      intronic
chr6:15306708(+) A-I      intronic
chr6:15306666(+) A-I      intronic
chr6:15306635(+) A-I      intronic
chr6:15306629(+) A-I      intronic
chr6:15303217(+) A-I      intronic
chr6:15303150(+) A-I      intronic
chr6:15303132(+) A-I      intronic
chr6:15303131(+) A-I      intronic
chr6:15303111(+) A-I      intronic
chr6:15303105(+) A-I      intronic
chr6:15303102(+) A-I      intronic
chr6:15303046(+) A-I      intronic
chr6:15303040(+) A-I      intronic
chr6:15412705(+) A-I      intronic
chr6:15302536(+) A-I      intronic
chr6:15293033(+) A-I      intronic
chr6:15420513(+) A-I      intronic
chr6:15420514(+) A-I      intronic
chr6:15302497(+) A-I      intronic
chr6:15302488(+) A-I      intronic
chr6:15302431(+) A-I      intronic
chr6:15420554(+) A-I      intronic
chr6:15429571(+) A-I      intronic
chr6:15298916(+) A-I      intronic
chr6:15298843(+) A-I      intronic
chr6:15298832(+) A-I      intronic
chr6:15395823(+) A-I      intronic
chr6:15394818(+) A-I      intronic
chr6:15442123(+) A-I      intronic
chr6:15298831(+) A-I      intronic
chr6:15394776(+) A-I      intronic
chr6:15298758(+) A-I      intronic
chr6:15298755(+) A-I      intronic
chr6:15293034(+) A-I      intronic
chr6:15293090(+) A-I      intronic
chr6:15293110(+) A-I      intronic
chr6:15298752(+) A-I      intronic
chr6:15298749(+) A-I      intronic
chr6:15298727(+) A-I      intronic
chr6:15297485(+) A-I      intronic
chr6:15297446(+) A-I      intronic
chr6:15394684(+) A-I      intronic
chr6:15293531(+) A-I      intronic
chr6:15294622(+) A-I      intronic
chr6:15291005(+) A-I      intronic
chr6:15291240(+) A-I      intronic
chr6:15291281(+) A-I      intronic
chr6:15251384(+) A-I      intronic
chr6:15251409(+) A-I      intronic
chr6:15251422(+) A-I      intronic
chr6:15251447(+) A-I      intronic
chr6:15252007(+) A-I      intronic
chr6:15252053(+) A-I      intronic
chr6:15252056(+) A-I      intronic
chr6:15252059(+) A-I      intronic
chr6:15252105(+) A-I      intronic
chr6:15253399(+) A-I      intronic
chr6:15253412(+) A-I      intronic
chr6:15253518(+) A-I      intronic
chr6:15255070(+) A-I      intronic
chr6:15255119(+) A-I      intronic
chr6:15255188(+) A-I      intronic
chr6:15255516(+) A-I      intronic
chr6:15255596(+) A-I      intronic
chr6:15270428(+) A-I      intronic
chr6:15270463(+) A-I      intronic
chr6:15270923(+) A-I      intronic
chr6:15270929(+) A-I      intronic
chr6:15271057(+) A-I      intronic
chr6:15271093(+) A-I      intronic
chr6:15271174(+) A-I      intronic
chr6:15271176(+) A-I      intronic
chr6:15271807(+) A-I      intronic
chr6:15272120(+) A-I      intronic
chr6:15273713(+) A-I      intronic
chr6:15273747(+) A-I      intronic
chr6:15273755(+) A-I      intronic
chr6:15273756(+) A-I      intronic
chr6:15273768(+) A-I      intronic
chr6:15273777(+) A-I      intronic
chr6:15273793(+) A-I      intronic
chr6:15273812(+) A-I      intronic
chr6:15424419(+) A-I      intronic
chr6:15450669(+) A-I      intronic
chr6:15279243(+) A-I      intronic
chr6:15269870(+) A-I      intronic
chr6:15274277(+) A-I      intronic
chr6:15271976(+) A-I      intronic
chr6:15293525(+) A-I      intronic
chr6:15279213(+) A-I      intronic
chr6:15255084(+) A-I      intronic
chr6:15261732(+) A-I      intronic
chr6:15270450(+) A-I      intronic
chr6:15331301(+) A-I      intronic
chr6:15322290(+) A-I      intronic
chr6:15255094(+) A-I      intronic
chr6:15303066(+) A-I      intronic
chr6:15294630(+) A-I      intronic
chr6:15307711(+) A-I      intronic
chr6:15298725(+) A-I      intronic
chr6:15307634(+) A-I      intronic
chr6:15516127(+) A-I      intronic
chr6:15336210(+) A-I      intronic
chr6:15382260(+) A-I      intronic
chr6:15515810(+) A-I      intronic
chr6:15270438(+) A-I      intronic
chr6:15262943(+) A-I      intronic
chr6:15306834(+) A-I      intronic
chr6:15455784(+) A-I      intronic
chr6:15291314(+) A-I      intronic
chr6:15252008(+) A-I      intronic
chr6:15286972(+) A-I      intronic
chr6:15412604(+) A-I      intronic
chr6:15291391(+) A-I      intronic
chr6:15286683(+) A-I      intronic
chr6:15319698(+) A-I      intronic
chr6:15515322(+) A-I      intronic
chr6:15255087(+) A-I      intronic
chr6:15284798(+) A-I      intronic
chr6:15278356(+) A-I      intronic
chr6:15372756(+) A-I      intronic
chr6:15516116(+) A-I      intronic
chr6:15255617(+) A-I      intronic
chr6:15273732(+) A-I      intronic
chr6:15412720(+) A-I      intronic
chr6:15272110(+) A-I      intronic
chr6:15255093(+) A-I      intronic
chr6:15326906(+) A-I      intronic
chr6:15302576(+) A-I      intronic
chr6:15412640(+) A-I      intronic
chr6:15323895(+) A-I      intronic
chr6:15271052(+) A-I      intronic
chr6:15277541(+) A-I      intronic
chr6:15319817(+) A-I      intronic
chr6:15465498(+) A-I      intronic
chr6:15302427(+) A-I      intronic
chr6:15253480(+) A-I      intronic
chr6:15412750(+) A-I      intronic
chr6:15311554(+) A-I      intronic
chr6:15274400(+) A-I      intronic
chr6:15322188(+) A-I      intronic
chr6:15255032(+) A-I      intronic
chr6:15307553(+) A-I      intronic
chr6:15307352(+) A-I      intronic
chr6:15302422(+) A-I      intronic
chr6:15291050(+) A-I      intronic
chr6:15372740(+) A-I      intronic
chr6:15264193(+) A-I      intronic
chr6:15516114(+) A-I      intronic
chr6:15297642(+) A-I      intronic
chr6:15273882(+) A-I      intronic
chr6:15286982(+) A-I      intronic
chr6:15291423(+) A-I      intronic
chr6:15253568(+) A-I      intronic
chr6:15289983(+) A-I      intronic
chr6:15429574(+) A-I      intronic
chr6:15295989(+) A-I      intronic
chr6:15274289(+) A-I      intronic
chr6:15324417(+) A-I      intronic
chr6:15297645(+) A-I      intronic
chr6:15407291(+) A-I      intronic
chr6:15322123(+) A-I      intronic
chr6:15298682(+) A-I      intronic
chr6:15292328(+) A-I      intronic
chr6:15331525(+) A-I      intronic
chr6:15449778(+) A-I      intronic
chr6:15289726(+) A-I      intronic
chr6:15255085(+) A-I      intronic
chr6:15271802(+) A-I      intronic
chr6:15324158(+) A-I      intronic
chr6:15252129(+) A-I      intronic
chr6:15291445(+) A-I      intronic
chr6:15312469(+) A-I      intronic
chr6:15255610(+) A-I      intronic
chr6:15380449(+) A-I      intronic
chr6:15355944(+) A-I      intronic
chr6:15412681(+) A-I      intronic
chr6:15252198(+) A-I      intronic
chr6:15252089(+) A-I      intronic
chr6:15322128(+) A-I      intronic
chr6:15381443(+) A-I      intronic
chr6:15295995(+) A-I      intronic
chr6:15298678(+) A-I      intronic
chr6:15291315(+) A-I      intronic
chr6:15271051(+) A-I      intronic
chr6:15278714(+) A-I      intronic
chr6:15418604(+) A-I      intronic
chr6:15316411(+) A-I      intronic
chr6:15255095(+) A-I      intronic
chr6:15470246(+) A-I      intronic
chr6:15312387(+) A-I      intronic
chr6:15278223(+) A-I      intronic
chr6:15311553(+) A-I      intronic
chr6:15255465(+) A-I      intronic
chr6:15255586(+) A-I      intronic
chr6:15303198(+) A-I      intronic
chr6:15303000(+) A-I      intronic
chr6:15274422(+) A-I      intronic
chr6:15258863(+) A-I      intronic
chr6:15335386(+) A-I      intronic
chr6:15311711(+) A-I      intronic
chr6:15454934(+) A-I      intronic
chr6:15394643(+) A-I      intronic
chr6:15291207(+) A-I      intronic
chr6:15307571(+) A-I      intronic
chr6:15251317(+) A-I      intronic
chr6:15284847(+) A-I      intronic
chr6:15515833(+) A-I      intronic
chr6:15312466(+) A-I      intronic
chr6:15470310(+) A-I      intronic
chr6:15287199(+) A-I      intronic
chr6:15360084(+) A-I      intronic
chr6:15291033(+) A-I      intronic
chr6:15298746(+) A-I      intronic
chr6:15302485(+) A-I      intronic
chr6:15319820(+) A-I      intronic
chr6:15271975(+) A-I      intronic
chr6:15412603(+) A-I      intronic
chr6:15291320(+) A-I      intronic
chr6:15273881(+) A-I      intronic
chr6:15394681(+) A-I      intronic
chr6:15406614(+) A-I      intronic
chr6:15450518(+) A-I      intronic
chr6:15331910(+) A-I      intronic
chr6:15412679(+) A-I      intronic
chr6:15303065(+) A-I      intronic
chr6:15290911(+) A-I      intronic
chr6:15251360(+) A-I      intronic
chr6:15417711(+) A-I      intronic
chr6:15307654(+) A-I      intronic
chr6:15292387(+) A-I      intronic
chr6:15292322(+) A-I      intronic
chr6:15516119(+) A-I      intronic
chr6:15318380(+) A-I      intronic
chr6:15322124(+) A-I      intronic
chr6:15271785(+) A-I      intronic
chr6:15429017(+) A-I      intronic
chr6:15302495(+) A-I      intronic
chr6:15255146(+) A-I      intronic
chr6:15294684(+) A-I      intronic
chr6:15347156(+) A-I      intronic
chr6:15312475(+) A-I      intronic
chr6:15286515(+) A-I      intronic
chr6:15412824(+) A-I      intronic
chr6:15515511(+) A-I      intronic
chr6:15286836(+) A-I      intronic
chr6:15255061(+) A-I      intronic
chr6:15298813(+) A-I      intronic
chr6:15343339(+) A-I      intronic
chr6:15277607(+) A-I      intronic
chr6:15306683(+) A-I      intronic
chr6:15318432(+) A-I      intronic
chr6:15285422(+) A-I      intronic
chr6:15289826(+) A-I      intronic
chr6:15311665(+) A-I      intronic
chr6:15382259(+) A-I      intronic
chr6:15376849(+) A-I      intronic
chr6:15376880(+) A-I      intronic
chr6:15272116(+) A-I      intronic
chr6:15515330(+) A-I      intronic
chr6:15336211(+) A-I      intronic
chr6:15311688(+) A-I      intronic
chr6:15271998(+) A-I      intronic
chr6:15336218(+) A-I      intronic
chr6:15418668(+) A-I      intronic
chr6:15335441(+) A-I      intronic
chr6:15282905(+) A-I      intronic
chr6:15417854(+) A-I      intronic
chr6:15302494(+) A-I      intronic
chr6:15356023(+) A-I      intronic
chr6:15270493(+) A-I      intronic
chr6:15311687(+) A-I      intronic
chr6:15323979(+) A-I      intronic
chr6:15252044(+) A-I      intronic
chr6:15429016(+) A-I      intronic
chr6:15418644(+) A-I      intronic
chr6:15273785(+) A-I      intronic
chr6:15293555(+) A-I      intronic
chr6:15516155(+) A-I      intronic
chr6:15323970(+) A-I      intronic
chr6:15307287(+) A-I      intronic
chr6:15303194(+) A-I      intronic
chr6:15251954(+) A-I      intronic
chr6:15270924(+) A-I      intronic
chr6:15251449(+) A-I      intronic
chr6:15258760(+) A-I      intronic
chr6:15279117(+) A-I      intronic
chr6:15418726(+) A-I      intronic
chr6:15251509(+) A-I      intronic
chr6:15377823(+) A-I      intronic
chr6:15424413(+) A-I      intronic
chr6:15269900(+) A-I      intronic
chr6:15286755(+) A-I      intronic
chr6:15515854(+) A-I      intronic
chr6:15432536(+) A-I      intronic
chr6:15312380(+) A-I      intronic
chr6:15272233(+) A-I      intronic
chr6:15378233(+) A-I      intronic
chr6:15252050(+) A-I      intronic
chr6:15302375(+) A-I      intronic
chr6:15251999(+) A-I      intronic
chr6:15293560(+) A-I      intronic
chr6:15360022(+) A-I      intronic
chr6:15253479(+) A-I      intronic
chr6:15291360(+) A-I      intronic
chr6:15340271(+) A-I      intronic
chr6:15261635(+) A-I      intronic
chr6:15271786(+) A-I      intronic
chr6:15258753(+) A-I      intronic
chr6:15378370(+) A-I      intronic
chr6:15515867(+) A-I      intronic
chr6:15279237(+) A-I      intronic
chr6:15324058(+) A-I      intronic
chr6:15287226(+) A-I      intronic
chr6:15322163(+) A-I      intronic
chr6:15255130(+) A-I      intronic
chr6:15292299(+) A-I      intronic
chr6:15322104(+) A-I      intronic
chr6:15270503(+) A-I      intronic
chr6:15273841(+) A-I      intronic
chr6:15293526(+) A-I      intronic
chr6:15255519(+) A-I      intronic
chr6:15289957(+) A-I      intronic
chr6:15412796(+) A-I      intronic
chr6:15318430(+) A-I      intronic
chr6:15420559(+) A-I      intronic
chr6:15324005(+) A-I      intronic
chr6:15336206(+) A-I      intronic
chr6:15271808(+) A-I      intronic
chr6:15418550(+) A-I      intronic
chr6:15312425(+) A-I      intronic
chr6:15282967(+) A-I      intronic
chr6:15269693(+) A-I      intronic
chr6:15298790(+) A-I      intronic
chr6:15294670(+) A-I      intronic
chr6:15335593(+) A-I      intronic
chr6:15270443(+) A-I      intronic
chr6:15291258(+) A-I      intronic
chr6:15286612(+) A-I      intronic
chr6:15323968(+) A-I      intronic
chr6:15252047(+) A-I      intronic
chr6:15286303(+) A-I      intronic
chr6:15252134(+) A-I      intronic
chr6:15303022(+) A-I      intronic
chr6:15295948(+) A-I      intronic
chr6:15417828(+) A-I      intronic
chr6:15262828(+) A-I      intronic
chr6:15295914(+) A-I      intronic
chr6:15424943(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED JARID2
chr6:15255153(+) A-I intron -    22327324
chr6:15515856(+) A-I intron -    22327324
chr6:15293034(+) A-I intron -    21960545
chr6:15295948(+) A-I intron -    21960545
chr6:15417828(+) A-I intron -    21960545
chr6:15418950(+) A-I intron -    21960545
chr6:15455304(+) A-I intron -    21960545
chr6:15515322(+) A-I intron -    21960545
chr6:15515330(+) A-I intron -    21960545
chr6:15515511(+) A-I intron -    21960545
chr6:15251317(+) A-G intron -    22484847
chr6:15251360(+) A-G intron -    22484847
chr6:15251372(+) A-G intron -    22484847
chr6:15251382(+) A-G intron -    22484847
chr6:15251401(+) T-C intron -    22484847
chr6:15251449(+) A-G intron -    22484847
chr6:15251508(+) A-G intron -    22484847
chr6:15251509(+) A-G intron -    22484847
chr6:15251521(+) A-G intron -    22484847
chr6:15251954(+) A-G intron -    22484847
chr6:15251955(+) A-G intron -    22484847
chr6:15251999(+) A-G intron -    22484847
chr6:15252008(+) A-G intron -    22484847
chr6:15252025(+) A-G intron -    22484847
chr6:15252044(+) A-G intron -    22484847
chr6:15252047(+) A-G intron -    22484847
chr6:15252050(+) A-G intron -    22484847
chr6:15252088(+) A-G intron -    22484847
chr6:15252089(+) A-G intron -    22484847
chr6:15252094(+) A-G intron -    22484847
chr6:15252134(+) A-G intron -    22484847
chr6:15252198(+) A-G intron -    22484847
chr6:15253332(+) T-A intron -    22484847
chr6:15253334(+) A-C intron -    22484847
chr6:15253408(+) C-T intron -    22484847
chr6:15253479(+) A-G intron -    22484847
chr6:15253480(+) A-G intron -    22484847
chr6:15255032(+) A-G intron -    22484847
chr6:15255061(+) A-G intron -    22484847
chr6:15255084(+) A-G intron -    22484847
chr6:15255085(+) A-G intron -    22484847
chr6:15255087(+) A-G intron -    22484847
chr6:15255093(+) A-G intron -    22484847
chr6:15255094(+) A-G intron -    22484847
chr6:15255095(+) A-G intron -    22484847
chr6:15255126(+) A-G intron -    22484847
chr6:15255130(+) A-G intron -    22484847
chr6:15255152(+) A-G intron -    22484847
chr6:15255153(+) A-G intron -    22484847
chr6:15255162(+) A-G intron -    22484847
chr6:15255173(+) C-T intron -    22484847
chr6:15255519(+) A-G intron -    22484847
chr6:15255586(+) A-G intron -    22484847
chr6:15255610(+) A-G intron -    22484847
chr6:15255617(+) A-G intron -    22484847
chr6:15258753(+) A-G intron -    22484847
chr6:15258760(+) A-G intron -    22484847
chr6:15258836(+) A-G intron -    22484847
chr6:15258863(+) A-G intron -    22484847
chr6:15258965(+) A-G intron -    22484847
chr6:15261798(+) G-A intron -    22484847
chr6:15262943(+) A-G intron -    22484847
chr6:15262952(+) A-G intron -    22484847
chr6:15263948(+) A-T intron -    22484847
chr6:15269693(+) A-G intron -    22484847
chr6:15270438(+) A-G intron -    22484847
chr6:15270443(+) A-G intron -    22484847
chr6:15270450(+) A-G intron -    22484847
chr6:15270468(+) A-G intron -    22484847
chr6:15270481(+) A-G intron -    22484847
chr6:15270493(+) A-G intron -    22484847
chr6:15270503(+) A-G intron -    22484847
chr6:15271051(+) A-G intron -    22484847
chr6:15271052(+) A-G intron -    22484847
chr6:15271078(+) A-G intron -    22484847
chr6:15271092(+) A-G intron -    22484847
chr6:15271808(+) A-G intron -    22484847
chr6:15272060(+) A-G intron -    22484847
chr6:15272110(+) A-G intron -    22484847
chr6:15272111(+) A-G intron -    22484847
chr6:15272116(+) A-G intron -    22484847
chr6:15272233(+) A-G intron -    22484847
chr6:15273655(+) A-G intron -    22484847
chr6:15273657(+) A-G intron -    22484847
chr6:15273678(+) A-G intron -    22484847
chr6:15273732(+) A-G intron -    22484847
chr6:15273785(+) A-G intron -    22484847
chr6:15273881(+) A-G intron -    22484847
chr6:15273882(+) A-G intron -    22484847
chr6:15274277(+) A-G intron -    22484847
chr6:15274289(+) A-G intron -    22484847
chr6:15274422(+) A-G intron -    22484847
chr6:15277541(+) A-G intron -    22484847
chr6:15277607(+) A-G intron -    22484847
chr6:15278223(+) A-G intron -    22484847
chr6:15278714(+) A-G intron -    22484847
chr6:15279237(+) A-G intron -    22484847
chr6:15282905(+) A-G intron -    22484847
chr6:15283864(+) T-C intron -    22484847
chr6:15284145(+) A-G intron -    22484847
chr6:15284744(+) T-C intron -    22484847
chr6:15284843(+) A-G intron -    22484847
chr6:15284847(+) A-G intron -    22484847
chr6:15286515(+) A-G intron -    22484847
chr6:15286523(+) A-G intron -    22484847
chr6:15286548(+) A-G intron -    22484847
chr6:15286622(+) A-G intron -    22484847
chr6:15286683(+) A-G intron -    22484847
chr6:15286717(+) A-G intron -    22484847
chr6:15286836(+) A-G intron -    22484847
chr6:15286972(+) A-G intron -    22484847
chr6:15286982(+) A-G intron -    22484847
chr6:15287199(+) A-G intron -    22484847
chr6:15289826(+) A-G intron -    22484847
chr6:15289901(+) A-G intron -    22484847
chr6:15289956(+) A-G intron -    22484847
chr6:15289957(+) A-G intron -    22484847
chr6:15289983(+) A-G intron -    22484847
chr6:15290911(+) A-G intron -    22484847
chr6:15291036(+) A-G intron -    22484847
chr6:15291258(+) A-G intron -    22484847
chr6:15291283(+) A-G intron -    22484847
chr6:15291313(+) A-G intron -    22484847
chr6:15291314(+) A-G intron -    22484847
chr6:15291315(+) A-G intron -    22484847
chr6:15291320(+) A-G intron -    22484847
chr6:15291360(+) A-G intron -    22484847
chr6:15291391(+) A-G intron -    22484847
chr6:15291423(+) A-G intron -    22484847
chr6:15292292(+) A-G intron -    22484847
chr6:15292322(+) A-G intron -    22484847
chr6:15292387(+) A-G intron -    22484847
chr6:15292957(+) A-G intron -    22484847
chr6:15293526(+) A-G intron -    22484847
chr6:15293555(+) A-G intron -    22484847
chr6:15294630(+) A-G intron -    22484847
chr6:15294670(+) A-G intron -    22484847
chr6:15295914(+) A-G intron -    22484847
chr6:15295948(+) A-G intron -    22484847
chr6:15295989(+) A-G intron -    22484847
chr6:15295995(+) A-G intron -    22484847
chr6:15298682(+) A-G intron -    22484847
chr6:15298746(+) A-G intron -    22484847
chr6:15298790(+) A-G intron -    22484847
chr6:15302375(+) A-G intron -    22484847
chr6:15302422(+) A-G intron -    22484847
chr6:15302427(+) A-G intron -    22484847
chr6:15302485(+) A-G intron -    22484847
chr6:15302494(+) A-G intron -    22484847
chr6:15302495(+) A-G intron -    22484847
chr6:15302496(+) A-G intron -    22484847
chr6:15302576(+) A-G intron -    22484847
chr6:15303000(+) A-G intron -    22484847
chr6:15303022(+) A-G intron -    22484847
chr6:15303065(+) A-G intron -    22484847
chr6:15303066(+) A-G intron -    22484847
chr6:15303189(+) A-G intron -    22484847
chr6:15303194(+) A-G intron -    22484847
chr6:15303198(+) A-G intron -    22484847
chr6:15306683(+) A-G intron -    22484847
chr6:15306830(+) A-G intron -    22484847
chr6:15306834(+) A-G intron -    22484847
chr6:15306835(+) C-T intron -    22484847
chr6:15306843(+) A-G intron -    22484847
chr6:15307287(+) A-G intron -    22484847
chr6:15307289(+) A-G intron -    22484847
chr6:15307352(+) A-G intron -    22484847
chr6:15307634(+) A-G intron -    22484847
chr6:15307654(+) A-G intron -    22484847
chr6:15307711(+) A-G intron -    22484847
chr6:15311553(+) A-G intron -    22484847
chr6:15311554(+) A-G intron -    22484847
chr6:15311560(+) A-G intron -    22484847
chr6:15311619(+) A-G intron -    22484847
chr6:15311665(+) A-G intron -    22484847
chr6:15311711(+) A-G intron -    22484847
chr6:15311816(+) G-A intron -    22484847
chr6:15312380(+) A-G intron -    22484847
chr6:15312387(+) A-G intron -    22484847
chr6:15312390(+) A-G intron -    22484847
chr6:15312425(+) A-G intron -    22484847
chr6:15312466(+) A-G intron -    22484847
chr6:15312469(+) A-G intron -    22484847
chr6:15312475(+) A-G intron -    22484847
chr6:15312546(+) A-G intron -    22484847
chr6:15316411(+) A-G intron -    22484847
chr6:15316835(+) A-G intron -    22484847
chr6:15318430(+) A-G intron -    22484847
chr6:15318432(+) A-G intron -    22484847
chr6:15319698(+) A-G intron -    22484847
chr6:15319723(+) T-G intron -    22484847
chr6:15322098(+) A-G intron -    22484847
chr6:15322117(+) G-A intron -    22484847
chr6:15322123(+) A-G intron -    22484847
chr6:15322124(+) A-G intron -    22484847
chr6:15322128(+) A-G intron -    22484847
chr6:15322180(+) G-A intron -    22484847
chr6:15322198(+) A-G intron -    22484847
chr6:15322278(+) A-G intron -    22484847
chr6:15323895(+) A-G intron -    22484847
chr6:15323970(+) A-G intron -    22484847
chr6:15324158(+) A-G intron -    22484847
chr6:15324240(+) T-C intron -    22484847
chr6:15331301(+) A-G intron -    22484847
chr6:15335356(+) A-G intron -    22484847
chr6:15335384(+) A-G intron -    22484847
chr6:15335441(+) A-G intron -    22484847
chr6:15336206(+) A-G intron -    22484847
chr6:15336210(+) A-G intron -    22484847
chr6:15336211(+) A-G intron -    22484847
chr6:15336218(+) A-G intron -    22484847
chr6:15347156(+) A-G intron -    22484847
chr6:15355944(+) A-G intron -    22484847
chr6:15356023(+) A-G intron -    22484847
chr6:15376849(+) A-G intron -    22484847
chr6:15376870(+) A-G intron -    22484847
chr6:15376880(+) A-G intron -    22484847
chr6:15378132(+) C-T intron -    22484847
chr6:15378370(+) A-G intron -    22484847
chr6:15382469(+) A-G intron -    22484847
chr6:15384150(+) T-C intron -    22484847
chr6:15389441(+) T-G intron -    22484847
chr6:15394681(+) A-G intron -    22484847
chr6:15394710(+) A-G intron -    22484847
chr6:15412603(+) A-G intron -    22484847
chr6:15412604(+) A-G intron -    22484847
chr6:15412640(+) A-G intron -    22484847
chr6:15412679(+) A-G intron -    22484847
chr6:15412681(+) A-G intron -    22484847
chr6:15412720(+) A-G intron -    22484847
chr6:15412750(+) A-G intron -    22484847
chr6:15417698(+) A-G intron -    22484847
chr6:15417707(+) A-G intron -    22484847
chr6:15417711(+) A-G intron -    22484847
chr6:15417828(+) A-G intron -    22484847
chr6:15418510(+) A-G intron -    22484847
chr6:15418604(+) A-G intron -    22484847
chr6:15418606(+) A-G intron -    22484847
chr6:15418629(+) A-G intron -    22484847
chr6:15418632(+) A-G intron -    22484847
chr6:15418668(+) A-G intron -    22484847
chr6:15418726(+) A-G intron -    22484847
chr6:15420559(+) A-G intron -    22484847
chr6:15424943(+) A-G intron -    22484847
chr6:15429574(+) A-G intron -    22484847
chr6:15432488(+) T-C intron -    22484847
chr6:15432489(+) G-A intron -    22484847
chr6:15450518(+) A-G intron -    22484847
chr6:15450551(+) T-C intron -    22484847
chr6:15450562(+) G-C intron -    22484847
chr6:15470246(+) A-G intron -    22484847
chr6:15515322(+) A-G intron -    22484847
chr6:15515330(+) A-G intron -    22484847
chr6:15515854(+) A-G intron -    22484847
chr6:15515856(+) A-G intron -    22484847
chr6:15515857(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase JARID2
chr6:15452349-15452350(+) m6A 5'UTR//CDS       -
chr6:15452372-15452373(+) m6A 5'UTR//CDS       -
chr6:15468852-15468853(+) m6A CDS       -
chr6:15468867-15468868(+) m6A CDS       -
chr6:15468921-15468922(+) m6A CDS       -
chr6:15468929-15468930(+) m6A CDS       -
chr6:15487574-15487575(+) m6A CDS       24284625//24981863
chr6:15487586-15487587(+) m6A CDS       24284625//24981863
chr6:15487759-15487760(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22608085
chr6:15487769-15487770(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22608085
chr6:15496442-15496443(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:15496458-15496459(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:15496520-15496521(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr6:15496531-15496532(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr6:15496538-15496539(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr6:15496590-15496591(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:15496611-15496612(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:15496619-15496620(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:15496696-15496697(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:15496771-15496772(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:15496781-15496782(+) Gm CDS       -
chr6:15496784-15496785(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:15496904-15496905(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27371828//22575960//22608085
chr6:15496914-15496915(+) m1A CDS       26863196
chr6:15496988-15496989(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27371828//22575960//22608085
chr6:15497008-15497009(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr6:15497068-15497069(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:15497236-15497237(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834
chr6:15501224-15501225(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:15501236-15501237(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:15501256-15501257(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22608085
chr6:15501266-15501267(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22608085
chr6:15501541-15501542(+) m6A CDS       24284625//25456834
chr6:15501599-15501600(+) m6A CDS//exon       -
chr6:15504763-15504764(+) m6A CDS//exon       -
chr6:15517453-15517454(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863
chr6:15520301-15520302(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085
chr6:15520366-15520367(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:15520379-15520380(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:15520613-15520614(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr6:15520635-15520636(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr6:15520643-15520644(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr6:15520664-15520665(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr6:15520692-15520693(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr6:15520718-15520719(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr6:15520858-15520859(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085
chr6:15520870-15520871(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085
chr6:15520911-15520912(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085
chr6:15520940-15520941(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085
chr6:15521175-15521176(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:15521207-15521208(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr6:15521276-15521277(+) m6A 3'UTR       24209618//25456834//24981863//22608085
chr6:15521853-15521854(+) m6A 3'UTR       24284625
chr6:15521987-15521988(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863
chr6:15521992-15521993(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863
chr6:15522022-15522023(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863
chr6:15522097-15522098(+) m6A 3'UTR       24284625

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate JARID2
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Insoluble cytoplasm K562 cells     -
Membrane K562 cells     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: sars-cov-2-mir-D6-3p
Interactor2: JARID2

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//miRDB//Targetscan
Support Database ViRBase

References:


PMID 33398248 Target region None
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line None Interactor2 expression None
Description Cytotoxin and gene regulation associated genes targeted by SARS-CoV-2 encoded miRNAs.

Starting a new search, please wait ...