Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00703340

  Virus:  

Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hiv1-miR-TAR-3p:  MIMAT0006017          PMF1:  NM_001393910     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hiv1-miR-TAR-3p	PMF1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0006017	11243
Organism	Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	-

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	PMF1	chr1:156195908(+) A-I      intronic chr1:156200852(+) A-I      intronic chr1:156183844(+) A-I      intronic chr1:156194817(+) A-I      intronic chr1:156194943(+) A-I      intronic chr1:156197523(+) A-I      intronic chr1:156194951(+) A-I      intronic chr1:156194830(+) A-I      intronic chr1:156195906(+) A-I      intronic chr1:156185536(+) A-I      intronic chr1:156194960(+) A-I      intronic chr1:156185541(+) A-I      intronic chr1:156194994(+) A-I      intronic chr1:156195926(+) A-I      intronic chr1:156187429(+) A-I      intronic chr1:156194989(+) A-I      intronic chr1:156188858(+) A-I      intronic chr1:156188866(+) A-I      intronic chr1:156183832(+) A-I      intronic chr1:156185959(+) A-I      intronic chr1:156201426(+) A-I      intronic chr1:156197572(+) A-I      intronic chr1:156195880(+) A-I      intronic chr1:156188856(+) A-I      intronic chr1:156201475(+) A-I      intronic chr1:156186164(+) A-I      intronic chr1:156186088(+) A-I      intronic chr1:156197906(+) A-I      intronic chr1:156203747(+) A-I      intronic chr1:156185935(+) A-I      intronic chr1:156188848(+) A-I      intronic chr1:156197387(+) A-I      intronic chr1:156188295(+) A-I      intronic chr1:156188301(+) A-I      intronic chr1:156203592(+) A-I      intronic chr1:156188919(+) A-I      intronic chr1:156188944(+) A-I      intronic chr1:156194560(+) A-I      intronic chr1:156201439(+) A-I      intronic chr1:156198898(+) A-I      intronic chr1:156201419(+) A-I      intronic chr1:156198884(+) A-I      intronic chr1:156201383(+) A-I      intronic chr1:156190016(+) A-I      intronic chr1:156195732(+) A-I      intronic chr1:156188361(+) A-I      intronic chr1:156200760(+) A-I      intronic chr1:156188385(+) A-I      intronic chr1:156201374(+) A-I      intronic chr1:156198769(+) A-I      intronic chr1:156201373(+) A-I      intronic chr1:156185947(+) A-I      intronic chr1:156200595(+) A-I      intronic chr1:156194827(+) A-I      intronic chr1:156185983(+) A-I      intronic chr1:156199461(+) A-I      intronic chr1:156200757(+) A-I      intronic chr1:156200579(+) A-I      intronic chr1:156201347(+) A-I      intronic chr1:156197136(+) A-I      intronic chr1:156188387(+) A-I      intronic chr1:156188395(+) A-I      intronic chr1:156188410(+) A-I      intronic chr1:156188423(+) A-I      intronic chr1:156188434(+) A-I      intronic chr1:156188962(+) A-I      intronic chr1:156194398(+) A-I      intronic chr1:156194741(+) A-I      intronic chr1:156198793(+) A-I      intronic chr1:156192329(+) A-I      intronic chr1:156201341(+) A-I      intronic chr1:156186004(+) A-I      intronic chr1:156192303(+) A-I      intronic chr1:156188485(+) A-I      intronic chr1:156198841(+) A-I      intronic chr1:156199405(+) A-I      intronic chr1:156194356(+) A-I      intronic chr1:156190205(+) A-I      intronic chr1:156186084(+) A-I      intronic chr1:156197119(+) A-I      intronic chr1:156194565(+) A-I      intronic chr1:156198935(+) A-I      intronic chr1:156192340(+) A-I      intronic chr1:156190682(+) A-I      intronic chr1:156201335(+) A-I      intronic chr1:156198901(+) A-I      intronic chr1:156192508(+) A-I      intronic chr1:156190188(+) A-I      intronic chr1:156190086(+) A-I      intronic chr1:156188838(+) A-I      intronic chr1:156198875(+) A-I      intronic chr1:156188834(+) A-I      intronic chr1:156201333(+) A-I      intronic chr1:156188812(+) A-I      intronic chr1:156194318(+) A-I      intronic chr1:156188809(+) A-I      intronic chr1:156188808(+) A-I      intronic chr1:156200643(+) A-I      intronic chr1:156188762(+) A-I      intronic chr1:156199498(+) A-I      intronic chr1:156188518(+) A-I      intronic chr1:156200698(+) A-I      intronic chr1:156188494(+) A-I      intronic chr1:156188446(+) A-I      intronic chr1:156185932(+) A-I      intronic chr1:156190705(+) A-I      intronic chr1:156192254(+) A-I      intronic chr1:156190257(+) A-I      intronic chr1:156185629(+) A-I      intronic chr1:156188984(+) A-I      intronic chr1:156185619(+) A-I      intronic chr1:156185560(+) A-I      intronic chr1:156186177(+) A-I      intronic chr1:156187297(+) A-I      intronic chr1:156185559(+) A-I      intronic chr1:156201318(+) A-I      intronic chr1:156185411(+) A-I      intronic chr1:156185373(+) A-I      intronic chr1:156199466(+) A-I      intronic chr1:156184929(+) A-I      intronic chr1:156201308(+) A-I      intronic chr1:156187302(+) A-I      intronic chr1:156195763(+) A-I      intronic chr1:156184870(+) A-I      intronic chr1:156184835(+) A-I      intronic chr1:156189438(+) A-I      intronic chr1:156189518(+) A-I      intronic chr1:156201307(+) A-I      intronic chr1:156184834(+) A-I      intronic chr1:156187311(+) A-I      intronic chr1:156184440(+) A-I      intronic chr1:156184414(+) A-I      intronic chr1:156201293(+) A-I      intronic chr1:156183970(+) A-I      intronic chr1:156197133(+) A-I      intronic chr1:156183936(+) A-I      intronic chr1:156192313(+) A-I      intronic chr1:156192560(+) A-I      intronic chr1:156183907(+) A-I      intronic chr1:156189872(+) A-I      intronic chr1:156183904(+) A-I      intronic chr1:156183802(+) A-I      intronic chr1:156187432(+) A-I      intronic chr1:156198960(+) A-I      intronic chr1:156194440(+) A-I      intronic chr1:156183264(+) A-I      intronic chr1:156203816(+) A-I      intronic chr1:156188469(+) A-I      intronic chr1:156200707(+) A-I      intronic chr1:156200751(+) A-I      intronic chr1:156189859(+) A-I      intronic chr1:156201292(+) A-I      intronic chr1:156189658(+) A-I      intronic chr1:156200814(+) A-I      intronic chr1:156195746(+) A-I      intronic chr1:156198800(+) A-I      intronic chr1:156201255(+) A-I      intronic chr1:156189774(+) A-I      intronic chr1:156189998(+) A-I      intronic chr1:156198817(+) A-I      intronic chr1:156201284(+) A-I      intronic chr1:156195739(+) A-I      intronic chr1:156195911(+) A-I      intronic chr1:156201274(+) A-I      intronic chr1:156201247(+) A-I      intronic chr1:156197405(+) A-I      intronic chr1:156201332(+) A-I      intronic chr1:156197164(+) A-I      intronic chr1:156201238(+) A-I      intronic chr1:156201134(+) A-I      intronic chr1:156197674(+) A-I      intronic chr1:156201093(+) A-I      intronic chr1:156200901(+) A-I      intronic chr1:156200861(+) A-I      intronic chr1:156197144(+) A-I      intronic chr1:156200847(+) A-I      intronic chr1:156200846(+) A-I      intronic chr1:156200803(+) A-I      intronic chr1:156189894(+) A-I      intronic chr1:156197806(+) A-I      intronic chr1:156200790(+) A-I      intronic chr1:156186023(+) A-I      intronic chr1:156185435(+) A-I      intronic chr1:156200672(+) A-I      intronic chr1:156200752(+) A-I      intronic chr1:156194971(+) A-I      intronic chr1:156183803(+) A-I      intronic chr1:156184522(+) A-I      intronic chr1:156189702(+) A-I      intronic chr1:156200844(+) A-I      intronic chr1:156200620(+) A-I      intronic chr1:156187341(+) A-I      intronic chr1:156197139(+) A-I      intronic chr1:156184906(+) A-I      intronic chr1:156197562(+) A-I      intronic chr1:156201239(+) A-I      intronic chr1:156185920(+) A-I      intronic chr1:156190240(+) A-I      intronic chr1:156185910(+) A-I      intronic chr1:156197175(+) A-I      intronic chr1:156200606(+) A-I      intronic chr1:156186067(+) A-I      intronic chr1:156189621(+) A-I      intronic chr1:156207715(+) A-I      intronic chr1:156186102(+) A-I      intronic chr1:156197093(+) A-I      intronic chr1:156200888(+) A-I      intronic chr1:156200887(+) A-I      intronic chr1:156185580(+) A-I      intronic chr1:156187396(+) A-I      intronic chr1:156188393(+) A-I      intronic chr1:156189456(+) A-I      intronic chr1:156190279(+) A-I      intronic chr1:156187454(+) A-I      intronic chr1:156183973(+) A-I      intronic chr1:156203195(+) A-I      intronic chr1:156189707(+) A-I      intronic chr1:156195907(+) A-I      intronic chr1:156188972(+) A-I      intronic chr1:156187384(+) A-I      intronic chr1:156183897(+) A-I      intronic chr1:156200674(+) A-I      intronic chr1:156186011(+) A-I      intronic chr1:156188907(+) A-I      intronic chr1:156190681(+) A-I      intronic chr1:156199501(+) A-I      intronic chr1:156186045(+) A-I      intronic chr1:156197024(+) A-I      intronic chr1:156186000(+) A-I      intronic chr1:156190135(+) A-I      intronic chr1:156189653(+) A-I      intronic chr1:156194920(+) A-I      intronic chr1:156184516(+) A-I      intronic chr1:156198007(+) A-I      intronic chr1:156203870(+) A-I      intronic chr1:156203607(+) A-I      intronic chr1:156187370(+) A-I      intronic chr1:156184449(+) A-I      intronic chr1:156206915(+) A-I      intronic chr1:156203590(+) A-I      intronic chr1:156207689(+) A-I      intronic chr1:156203668(+) A-I      intronic chr1:156183286(+) A-I      intronic chr1:156189564(+) A-I      intronic chr1:156188316(+) A-I      intronic chr1:156187330(+) A-I      intronic chr1:156190191(+) A-I      intronic chr1:156194434(+) A-I      intronic chr1:156188892(+) A-I      intronic chr1:156189706(+) A-I      intronic chr1:156189516(+) A-I      intronic chr1:156196829(+) A-I      intronic chr1:156201244(+) A-I      intronic chr1:156187355(+) A-I      intronic chr1:156197039(+) A-I      intronic chr1:156203733(+) A-I      intronic chr1:156197094(+) A-I      intronic chr1:156186035(+) A-I      intronic chr1:156195829(+) A-I      intronic chr1:156197910(+) A-I      intronic chr1:156184902(+) A-I      intronic chr1:156195867(+) A-I      intronic chr1:156201232(+) A-I      intronic chr1:156197826(+) A-I      intronic chr1:156197427(+) A-I      intronic chr1:156185926(+) A-I      intronic chr1:156183395(+) A-I      intronic chr1:156199479(+) A-I      intronic chr1:156183758(+) A-I      intronic chr1:156192230(+) A-I      intronic chr1:156202540(+) A-I      intronic chr1:156197909(+) A-I      intronic chr1:156184413(+) A-I      intronic chr1:156199607(+) A-I      intronic chr1:156184699(+) A-I      intronic chr1:156184867(+) A-I      intronic chr1:156185646(+) A-I      intronic chr1:156185641(+) A-I      intronic chr1:156187307(+) A-I      intronic chr1:156203806(+) A-I      intronic chr1:156190233(+) A-I      intronic chr1:156185548(+) A-I      intronic chr1:156197865(+) A-I      intronic chr1:156195677(+) A-I      intronic chr1:156184748(+) A-I      intronic chr1:156189940(+) A-I      intronic chr1:156186110(+) A-I      intronic chr1:156186006(+) A-I      intronic chr1:156192278(+) A-I      intronic chr1:156197511(+) A-I      intronic chr1:156192235(+) A-I      intronic chr1:156183979(+) A-I      intronic chr1:156190090(+) A-I      intronic chr1:156207699(+) A-I      intronic chr1:156187383(+) A-I      intronic chr1:156197130(+) A-I      intronic chr1:156197550(+) A-I      intronic chr1:156200845(+) A-I      intronic chr1:156184808(+) A-I      intronic chr1:156194271(+) A-I      intronic chr1:156188323(+) A-I      intronic chr1:156199547(+) A-I      intronic chr1:156187397(+) A-I      intronic chr1:156195704(+) A-I      intronic chr1:156197145(+) A-I      intronic chr1:156184454(+) A-I      intronic chr1:156197174(+) A-I      intronic chr1:156186103(+) A-I      intronic chr1:156200850(+) A-I      intronic chr1:156203793(+) A-I      intronic chr1:156189596(+) A-I      intronic chr1:156203642(+) A-I      intronic chr1:156197524(+) A-I      intronic chr1:156194953(+) A-I      intronic chr1:156183842(+) A-I      intronic chr1:156184769(+) A-I      intronic chr1:156198967(+) A-I      intronic chr1:156188881(+) A-I      intronic chr1:156201112(+) A-I      intronic chr1:156194874(+) A-I      intronic chr1:156185451(+) A-I      intronic chr1:156186111(+) A-I      intronic chr1:156197469(+) A-I      intronic chr1:156194335(+) A-I      intronic chr1:156183890(+) A-I      intronic chr1:156183355(+) A-I      intronic chr1:156203852(+) A-I      intronic chr1:156184803(+) A-I      intronic chr1:156183330(+) A-I      intronic chr1:156194312(+) A-I      intronic chr1:156201440(+) A-I      intronic chr1:156187460(+) A-I      intronic chr1:156192217(+) A-I      intronic chr1:156188813(+) A-I      intronic chr1:156194444(+) A-I      intronic chr1:156201449(+) A-I      intronic chr1:156188334(+) A-I      intronic chr1:156187442(+) A-I      intronic chr1:156197216(+) A-I      intronic chr1:156188889(+) A-I      intronic chr1:156197551(+) A-I      intronic chr1:156197417(+) A-I      intronic chr1:156185418(+) A-I      intronic chr1:156203684(+) A-I      intronic chr1:156186139(+) A-I      intronic chr1:156185962(+) A-I      intronic chr1:156186017(+) A-I      intronic chr1:156190017(+) A-I      intronic chr1:156197048(+) A-I      intronic chr1:156185503(+) A-I      intronic chr1:156198021(+) A-I      intronic chr1:156187469(+) A-I      intronic chr1:156194378(+) A-I      intronic chr1:156201443(+) A-I      intronic chr1:156186061(+) A-I      intronic chr1:156189680(+) A-I      intronic chr1:156200624(+) A-I      intronic chr1:156203784(+) A-I      intronic chr1:156194348(+) A-I      intronic chr1:156187352(+) A-I      intronic chr1:156188392(+) A-I      intronic chr1:156200774(+) A-I      intronic chr1:156197388(+) A-I      intronic chr1:156189463(+) A-I      intronic chr1:156186094(+) A-I      intronic chr1:156199418(+) A-I      intronic chr1:156189962(+) A-I      intronic chr1:156199544(+) A-I      intronic chr1:156183820(+) A-I      intronic chr1:156189477(+) A-I      intronic chr1:156200716(+) A-I      intronic chr1:156194313(+) A-I      intronic chr1:156185393(+) A-I      intronic chr1:156199625(+) A-I      intronic chr1:156194965(+) A-I      intronic chr1:156197563(+) A-I      intronic chr1:156195723(+) A-I      intronic chr1:156201094(+) A-I      intronic chr1:156197782(+) A-I      intronic chr1:156199592(+) A-I      intronic chr1:156187340(+) A-I      intronic chr1:156197795(+) A-I      intronic chr1:156187419(+) A-I      intronic chr1:156203744(+) A-I      intronic chr1:156184688(+) A-I      intronic chr1:156186085(+) A-I      intronic chr1:156201080(+) A-I      intronic chr1:156199626(+) A-I      intronic chr1:156197118(+) A-I      intronic chr1:156203654(+) A-I      intronic chr1:156187267(+) A-I      intronic chr1:156185663(+) A-I      intronic chr1:156194755(+) A-I      intronic chr1:156188362(+) A-I      intronic chr1:156188452(+) A-I      intronic chr1:156186152(+) A-I      intronic chr1:156197843(+) A-I      intronic chr1:156197220(+) A-I      intronic chr1:156188406(+) A-I      intronic chr1:156205254(+) A-I      intronic chr1:156206965(+) A-I      intronic chr1:156189937(+) A-I      intronic chr1:156190029(+) A-I      intronic chr1:156200733(+) A-I      intronic chr1:156189400(+) A-I      intronic chr1:156185927(+) A-I      intronic chr1:156194938(+) A-I      intronic chr1:156187239(+) A-I      intronic chr1:156194795(+) A-I      intronic chr1:156190131(+) A-I      intronic chr1:156194408(+) A-I      intronic chr1:156188426(+) A-I      intronic chr1:156189966(+) A-I      intronic chr1:156207627(+) A-I      intronic chr1:156183804(+) A-I      intronic chr1:156197075(+) A-I      intronic chr1:156184773(+) A-I      intronic chr1:156184462(+) A-I      intronic chr1:156201444(+) A-I      intronic chr1:156200589(+) A-I      intronic chr1:156186031(+) A-I      intronic chr1:156185366(+) A-I      intronic chr1:156184859(+) A-I      intronic chr1:156184755(+) A-I      intronic chr1:156183342(+) A-I      intronic chr1:156185645(+) A-I      intronic chr1:156201066(+) A-I      intronic chr1:156197056(+) A-I      intronic chr1:156184509(+) A-I      intronic chr1:156203800(+) A-I      intronic chr1:156184786(+) A-I      intronic chr1:156194820(+) A-I      intronic chr1:156183335(+) A-I      intronic chr1:156197931(+) A-I      intronic chr1:156186062(+) A-I      intronic chr1:156192260(+) A-I      intronic chr1:156194321(+) A-I      intronic chr1:156199564(+) A-I      intronic chr1:156197184(+) A-I      intronic chr1:156188475(+) A-I      intronic chr1:156187402(+) A-I      intronic chr1:156183892(+) A-I      intronic chr1:156187262(+) A-I      intronic chr1:156192267(+) A-I      intronic chr1:156203667(+) A-I      intronic chr1:156195866(+) A-I      intronic chr1:156184830(+) A-I      intronic chr1:156197461(+) A-I      intronic chr1:156194865(+) A-I      intronic chr1:156190129(+) A-I      intronic chr1:156187261(+) A-I      intronic chr1:156199549(+) A-I      intronic chr1:156199431(+) A-I      intronic chr1:156192407(+) A-I      intronic chr1:156200670(+) A-I      intronic chr1:156187381(+) A-I      intronic chr1:156184947(+) A-I      intronic chr1:156188786(+) A-I      intronic chr1:156184853(+) A-I      intronic chr1:156187423(+) A-I      intronic chr1:156204429(+) A-I      intronic chr1:156189727(+) A-I      intronic chr1:156185579(+) A-I      intronic chr1:156194956(+) A-I      intronic chr1:156194856(+) A-I      intronic chr1:156186032(+) A-I      intronic chr1:156194272(+) A-I      intronic chr1:156197472(+) A-I      intronic chr1:156186131(+) A-I      intronic chr1:156184941(+) A-I      intronic chr1:156198009(+) A-I      intronic chr1:156188791(+) A-I      intronic chr1:156194525(+) A-I      intronic chr1:156194952(+) A-I      intronic chr1:156195881(+) A-I      intronic chr1:156199462(+) A-I      intronic chr1:156197565(+) A-I      intronic chr1:156194871(+) A-I      intronic

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	PMF1	chr1:156182933-156182934(+) m6A CDS//exon       24981863//22575960 chr1:156206146-156206147(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24209618//22575960 chr1:156206171-156206172(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24209618//22575960 chr1:156206185-156206186(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24209618//24981863//22575960 chr1:156206365-156206366(+) m6A exon//intron       24209618 chr1:156207078-156207079(+) m6A exon//intron       24209618 chr1:156209352-156209353(+) m6A 3'UTR//CDS       24209618 chr1:156209396-156209397(+) m6A 3'UTR       24209618 chr1:156209529-156209530(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22575960 chr1:156209585-156209586(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22575960 chr1:156209812-156209813(+) m6A 3'UTR       24284625

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	PMF1	Chromatin K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells     - Ribosome HEK-293 cells     22199352 Ribosome Colon cancer cells     24393600

Related Drug Information:

Resource	Symbol	Drug Name	PubChem ID
RNAactDrug	hiv1-miR-TAR-3p	l-685,458       5479543 Pha-665752       10461815

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hiv1-miR-TAR-3p
Interactor2: PMF1

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg