Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hiv1-miR-TAR-3p | CASP8 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0006017 | 841 |
Organism | Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1) | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | ALPS2B//CAP4//Casp-8//FLICE//MACH//MCH5 |
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | CASP8 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | CASP8 |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | CASP8 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | CASP8 |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
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RNAactDrug | hiv1-miR-TAR-3p |
Interactor1: hiv1-miR-TAR-3p | Interactor2: CASP8 |
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Strong-Evidence | Dual luciferase reporter assay//IP//Northern blot//RT-PCR//Western blot | |
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Prediction-Evidence | cRep//miRanda//PITA//RNAHybrid | |
Support Database | RepTar//VmiReg |
PMID | 23938024 | Target region | 3'UTR |
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Source | RepTar//VmiReg | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | HEK293 cells | Interactor2 expression | None |
Description | Bioinformatic predictions and reporter gene activity assays identified regulatory elements complementary and responsive to miR-TAR-5p and miR-TAR-3p in the 3' untranslated region (UTR) of several candidate genes involved in apoptosis and cell survival. These include Caspase 8, Aiolos, Ikaros and Nucleophosmin (NPM)/B23. |