Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00700666

  Virus:  

Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hiv1-miR-TAR-5p:           TMEM154:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hiv1-miR-TAR-5p TMEM154
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0006016 201799
Organism Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - -

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR TMEM154
chr4:153553024(-) A-I      intronic
chr4:153553030(-) A-I      intronic
chr4:153591648(-) A-I      intronic
chr4:153591543(-) A-I      intronic
chr4:153575153(-) A-I      intronic
chr4:153575128(-) A-I      intronic
chr4:153575024(-) A-I      intronic
chr4:153560299(-) A-I      intronic
chr4:153560247(-) A-I      intronic
chr4:153559350(-) A-I      intronic
chr4:153559335(-) A-I      intronic
chr4:153553033(-) A-I      intronic
chr4:153551244(-) A-I      intronic
chr4:153551249(-) A-I      intronic
chr4:153551261(-) A-I      intronic
chr4:153551281(-) A-I      intronic
chr4:153551298(-) A-I      intronic
chr4:153552740(-) A-I      intronic
chr4:153552779(-) A-I      intronic
chr4:153552796(-) A-I      intronic
chr4:153553105(-) A-I      intronic
chr4:153553149(-) A-I      intronic
chr4:153558650(-) A-I      intronic
chr4:153558534(-) A-I      intronic
chr4:153555124(-) A-I      intronic
chr4:153554866(-) A-I      intronic
chr4:153555000(-) A-I      intronic
chr4:153554982(-) A-I      intronic
chr4:153554908(-) A-I      intronic
chr4:153544915(-) A-I      3'UTR
chr4:153545658(-) A-I      3'UTR
chr4:153541763(-) A-I      3'UTR
chr4:153541754(-) A-I      3'UTR
chr4:153541748(-) A-I      3'UTR
chr4:153546805(-) A-I      3'UTR
chr4:153546834(-) A-I      3'UTR
chr4:153544869(-) A-I      3'UTR
chr4:153544883(-) A-I      3'UTR
chr4:153544840(-) A-I      3'UTR
chr4:153544829(-) A-I      3'UTR
chr4:153544899(-) A-I      3'UTR
chr4:153544828(-) A-I      3'UTR
chr4:153544827(-) A-I      3'UTR
chr4:153544797(-) A-I      3'UTR
chr4:153544775(-) A-I      3'UTR
chr4:153544759(-) A-I      3'UTR
chr4:153544900(-) A-I      3'UTR
chr4:153544934(-) A-I      3'UTR
chr4:153545621(-) A-I      3'UTR
chr4:153545001(-) A-I      3'UTR
chr4:153545605(-) A-I      3'UTR
chr4:153545666(-) A-I      3'UTR
chr4:153545671(-) A-I      3'UTR
chr4:153546632(-) A-I      3'UTR
chr4:153546692(-) A-I      3'UTR
chr4:153546719(-) A-I      3'UTR
chr4:153546723(-) A-I      3'UTR
chr4:153546727(-) A-I      3'UTR
chr4:153546760(-) A-I      3'UTR
chr4:153541812(-) A-I      3'UTR
chr4:153541819(-) A-I      3'UTR
chr4:153541821(-) A-I      3'UTR
chr4:153541823(-) A-I      3'UTR
chr4:153541827(-) A-I      3'UTR
chr4:153541835(-) A-I      3'UTR
chr4:153541846(-) A-I      3'UTR
chr4:153541869(-) A-I      3'UTR
chr4:153541871(-) A-I      3'UTR
chr4:153541880(-) A-I      3'UTR
chr4:153544078(-) A-I      3'UTR
chr4:153544095(-) A-I      3'UTR
chr4:153544168(-) A-I      3'UTR
chr4:153544170(-) A-I      3'UTR
chr4:153544864(-) A-I      3'UTR
chr4:153546714(-) A-I      3'UTR
chr4:153544887(-) A-I      3'UTR
chr4:153544890(-) A-I      3'UTR
chr4:153545677(-) A-I      3'UTR
chr4:153546630(-) A-I      3'UTR
chr4:153546631(-) A-I      3'UTR
chr4:153541831(-) A-I      3'UTR
chr4:153543085(-) A-I      3'UTR
chr4:153544220(-) A-I      3'UTR
chr4:153544159(-) A-I      3'UTR
chr4:153544158(-) A-I      3'UTR
chr4:153544156(-) A-I      3'UTR
chr4:153544149(-) A-I      3'UTR
chr4:153544135(-) A-I      3'UTR
chr4:153544098(-) A-I      3'UTR
chr4:153544094(-) A-I      3'UTR
chr4:153544071(-) A-I      3'UTR
chr4:153544065(-) A-I      3'UTR
chr4:153544019(-) A-I      3'UTR
chr4:153544000(-) A-I      3'UTR
chr4:153543999(-) A-I      3'UTR
chr4:153543108(-) A-I      3'UTR
chr4:153543107(-) A-I      3'UTR
chr4:153543036(-) A-I      3'UTR
chr4:153541828(-) A-I      3'UTR
chr4:153541780(-) A-I      3'UTR
chr4:153549927(-) A-I      intronic
chr4:153554954(-) A-I      intronic
chr4:153551263(-) A-I      intronic
chr4:153553068(-) A-I      intronic
chr4:153555098(-) A-I      intronic
chr4:153560903(-) A-I      intronic
chr4:153551332(-) A-I      intronic
chr4:153551351(-) A-I      intronic
chr4:153551209(-) A-I      intronic
chr4:153555129(-) A-I      intronic
chr4:153559318(-) A-I      intronic
chr4:153555150(-) A-I      intronic
chr4:153559392(-) A-I      intronic
chr4:153552756(-) A-I      intronic
chr4:153555058(-) A-I      intronic
chr4:153560393(-) A-I      intronic
chr4:153552662(-) A-I      intronic
chr4:153555113(-) A-I      intronic
chr4:153551274(-) A-I      intronic
chr4:153560888(-) A-I      intronic
chr4:153552791(-) A-I      intronic
chr4:153544212(-) A-I      3'UTR
chr4:153544866(-) A-I      3'UTR
chr4:153544091(-) A-I      3'UTR
chr4:153544153(-) A-I      3'UTR
chr4:153545541(-) A-I      3'UTR
chr4:153544057(-) A-I      3'UTR
chr4:153544126(-) A-I      3'UTR
chr4:153543075(-) A-I      3'UTR
chr4:153544157(-) A-I      3'UTR
chr4:153544001(-) A-I      3'UTR
chr4:153544839(-) A-I      3'UTR
chr4:153546687(-) A-I      3'UTR
chr4:153545714(-) A-I      3'UTR
chr4:153544922(-) A-I      3'UTR
chr4:153544061(-) A-I      3'UTR
chr4:153543202(-) A-I      3'UTR
chr4:153544056(-) A-I      3'UTR
chr4:153544018(-) A-I      3'UTR
chr4:153544140(-) A-I      3'UTR
chr4:153544860(-) A-I      3'UTR
chr4:153544191(-) A-I      3'UTR
chr4:153544183(-) A-I      3'UTR
chr4:153544958(-) A-I      3'UTR
chr4:153544925(-) A-I      3'UTR
chr4:153545032(-) A-I      3'UTR
chr4:153546750(-) A-I      3'UTR
chr4:153543994(-) A-I      3'UTR
chr4:153544137(-) A-I      3'UTR
chr4:153544204(-) A-I      3'UTR
chr4:153544206(-) A-I      3'UTR
chr4:153544952(-) A-I      3'UTR
chr4:153543194(-) A-I      3'UTR
chr4:153544133(-) A-I      3'UTR
chr4:153546749(-) A-I      3'UTR
chr4:153546688(-) A-I      3'UTR
chr4:153544024(-) A-I      3'UTR
chr4:153544182(-) A-I      3'UTR
chr4:153545645(-) A-I      3'UTR
chr4:153544977(-) A-I      3'UTR
chr4:153543164(-) A-I      3'UTR
chr4:153544167(-) A-I      3'UTR
chr4:153544117(-) A-I      3'UTR
chr4:153545580(-) A-I      3'UTR
chr4:153544181(-) A-I      3'UTR
chr4:153544081(-) A-I      3'UTR
chr4:153544176(-) A-I      3'UTR
chr4:153544902(-) A-I      3'UTR
chr4:153546617(-) A-I      3'UTR
chr4:153544912(-) A-I      3'UTR
chr4:153544085(-) A-I      3'UTR
chr4:153544201(-) A-I      3'UTR
chr4:153541925(-) A-I      3'UTR
chr4:153544006(-) A-I      3'UTR
chr4:153546670(-) A-I      3'UTR
chr4:153544104(-) A-I      3'UTR
chr4:153544884(-) A-I      3'UTR
chr4:153545522(-) A-I      3'UTR
chr4:153544835(-) A-I      3'UTR
chr4:153545631(-) A-I      3'UTR
chr4:153551221(-) A-I      intronic
chr4:153574760(-) A-I      intronic
chr4:153574814(-) A-I      intronic
chr4:153575152(-) A-I      intronic
chr4:153560841(-) A-I      intronic
chr4:153552653(-) A-I      intronic
chr4:153594635(-) A-I      intronic
chr4:153559168(-) A-I      intronic
chr4:153551302(-) A-I      intronic
chr4:153591580(-) A-I      intronic
chr4:153554873(-) A-I      intronic
chr4:153575025(-) A-I      intronic
chr4:153549856(-) A-I      intronic
chr4:153555004(-) A-I      intronic
chr4:153560375(-) A-I      intronic
chr4:153554854(-) A-I      intronic
chr4:153552654(-) A-I      intronic
chr4:153551404(-) A-I      intronic
chr4:153552864(-) A-I      intronic
chr4:153553232(-) A-I      intronic
chr4:153586331(-) A-I      intronic
chr4:153551212(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED TMEM154
chr4:153549927(-) A-G intron -    22484847
chr4:153551221(-) A-G intron -    22484847
chr4:153551222(-) A-G intron -    22484847
chr4:153551248(-) A-G intron -    22484847
chr4:153551302(-) A-G intron -    22484847
chr4:153551342(-) A-G intron -    22484847
chr4:153552653(-) A-G intron -    22484847
chr4:153552654(-) A-G intron -    22484847
chr4:153552662(-) A-G intron -    22484847
chr4:153552791(-) A-G intron -    22484847
chr4:153553068(-) A-G intron -    22484847
chr4:153553139(-) A-G intron -    22484847
chr4:153554854(-) A-G intron -    22484847
chr4:153554873(-) A-G intron -    22484847
chr4:153554934(-) A-G intron -    22484847
chr4:153554954(-) A-G intron -    22484847
chr4:153554960(-) A-G intron -    22484847
chr4:153555004(-) A-G intron -    22484847
chr4:153555098(-) A-G intron -    22484847
chr4:153555129(-) A-G intron -    22484847
chr4:153555150(-) A-G intron -    22484847
chr4:153559168(-) A-G intron -    22484847
chr4:153560376(-) A-G intron -    22484847
chr4:153560393(-) A-G intron -    22484847
chr4:153560888(-) A-G intron -    22484847
chr4:153575025(-) A-G intron -    22484847
chr4:153575091(-) A-G intron -    22484847
chr4:153575129(-) A-G intron -    22484847
chr4:153575152(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase TMEM154
chr4:153547806-153547807(-) m6A 3'UTR       -
chr4:153547836-153547837(-) m6A 3'UTR       -
chr4:153547879-153547880(-) m6A 3'UTR       27773535
chr4:153548167-153548168(-) m6A 3'UTR       24209618//24981863//28052920//27773535//27371828//22608085
chr4:153548180-153548181(-) m6A 3'UTR       24209618//24981863//28052920//27773535//22608085
chr4:153548190-153548191(-) m6A 3'UTR       24209618//24981863//28052920//27773535//22608085
chr4:153548267-153548268(-) m6A 3'UTR       24209618//24981863//28052920//27773535
chr4:153548300-153548301(-) m6A 3'UTR       24209618//24981863//28052920//27773535
chr4:153548352-153548353(-) m6A 3'UTR       24209618//24981863//27773535
chr4:153548411-153548412(-) m6A 3'UTR       24209618//24981863//27773535
chr4:153548420-153548421(-) m6A 3'UTR       24209618//24981863//27773535
chr4:153548436-153548437(-) m6A 3'UTR       24209618//24981863//27773535
chr4:153548478-153548479(-) m6A 3'UTR       27773535
chr4:153548820-153548821(-) m6A 3'UTR       -
chr4:153548986-153548987(-) m6A 3'UTR       24981863
chr4:153549008-153549009(-) m6A 3'UTR       24981863
chr4:153549021-153549022(-) m6A 3'UTR       24981863
chr4:153549055-153549056(-) m6A 3'UTR       24209618//24981863//27773535
chr4:153549108-153549109(-) m6A 3'UTR       24209618//24981863//27773535
chr4:153549172-153549173(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr4:153549179-153549180(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr4:153549212-153549213(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr4:153549228-153549229(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr4:153549236-153549237(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr4:153549577-153549578(-) m6A 3'UTR//exon       24981863
chr4:153549585-153549586(-) m6A 3'UTR//exon       24981863
chr4:153567818-153567819(-) m6A 3'UTR//intron       -
chr4:153567832-153567833(-) m6A 3'UTR//intron       -
chr4:153567909-153567910(-) m6A 3'UTR//intron       -
chr4:153573974-153573975(-) m6A CDS       24209618

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate TMEM154
Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hiv1-miR-TAR-5p
Interactor2: TMEM154

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda//PITA//Rep//Targetscan
Support Database RepTar//VmiReg

Starting a new search, please wait ...