Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00699784

  Virus:  

Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hiv1-miR-TAR-5p:           CCM2:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hiv1-miR-TAR-5p CCM2
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0006016 83605
Organism Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - C7orf22//OSM//PP10187

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR CCM2
chr7:45070422(+) A-I      intronic
chr7:45070452(+) A-I      intronic
chr7:45070520(+) A-I      intronic
chr7:45070732(+) A-I      intronic
chr7:45070762(+) A-I      intronic
chr7:45070772(+) A-I      intronic
chr7:45070804(+) A-I      intronic
chr7:45070838(+) A-I      intronic
chr7:45070887(+) A-I      intronic
chr7:45070893(+) A-I      intronic
chr7:45070971(+) A-I      intronic
chr7:45048144(+) A-I      intronic
chr7:45098723(+) A-I      intronic
chr7:45098743(+) A-I      intronic
chr7:45099094(+) A-I      intronic
chr7:45099319(+) A-I      intronic
chr7:45101167(+) A-I      intronic
chr7:45101212(+) A-I      intronic
chr7:45101293(+) A-I      intronic
chr7:45101318(+) A-I      intronic
chr7:45101346(+) A-I      intronic
chr7:45101376(+) A-I      intronic
chr7:45102170(+) A-I      intronic
chr7:45102187(+) A-I      intronic
chr7:45102749(+) A-I      intronic
chr7:45102772(+) A-I      intronic
chr7:45102775(+) A-I      intronic
chr7:45102789(+) A-I      intronic
chr7:45049613(+) A-I      intronic
chr7:45071117(+) A-I      intronic
chr7:45071250(+) A-I      intronic
chr7:45071256(+) A-I      intronic
chr7:45071274(+) A-I      intronic
chr7:45071286(+) A-I      intronic
chr7:45071296(+) A-I      intronic
chr7:45071298(+) A-I      intronic
chr7:45071394(+) A-I      intronic
chr7:45071406(+) A-I      intronic
chr7:45071410(+) A-I      intronic
chr7:45071432(+) A-I      intronic
chr7:45072385(+) A-I      intronic
chr7:45072420(+) A-I      intronic
chr7:45072464(+) A-I      intronic
chr7:45072493(+) A-I      intronic
chr7:45072520(+) A-I      intronic
chr7:45072534(+) A-I      intronic
chr7:45073867(+) A-I      intronic
chr7:45073880(+) A-I      intronic
chr7:45073891(+) A-I      intronic
chr7:45073906(+) A-I      intronic
chr7:45073986(+) A-I      intronic
chr7:45096025(+) A-I      intronic
chr7:45079476(+) A-I      intronic
chr7:45079495(+) A-I      intronic
chr7:45079505(+) A-I      intronic
chr7:45079506(+) A-I      intronic
chr7:45096004(+) A-I      intronic
chr7:45080425(+) A-I      intronic
chr7:45080478(+) A-I      intronic
chr7:45080546(+) A-I      intronic
chr7:45080564(+) A-I      intronic
chr7:45082672(+) A-I      intronic
chr7:45082803(+) A-I      intronic
chr7:45082815(+) A-I      intronic
chr7:45088186(+) A-I      intronic
chr7:45088191(+) A-I      intronic
chr7:45088202(+) A-I      intronic
chr7:45088247(+) A-I      intronic
chr7:45088264(+) A-I      intronic
chr7:45088629(+) A-I      intronic
chr7:45088655(+) A-I      intronic
chr7:45088668(+) A-I      intronic
chr7:45088791(+) A-I      intronic
chr7:45095100(+) A-I      intronic
chr7:45095110(+) A-I      intronic
chr7:45095262(+) A-I      intronic
chr7:45043268(+) A-I      intronic
chr7:45043277(+) A-I      intronic
chr7:45072536(+) A-I      intronic
chr7:45072542(+) A-I      intronic
chr7:45072546(+) A-I      intronic
chr7:45072552(+) A-I      intronic
chr7:45072579(+) A-I      intronic
chr7:45072580(+) A-I      intronic
chr7:45072588(+) A-I      intronic
chr7:45101134(+) A-I      intronic
chr7:45101152(+) A-I      intronic
chr7:45101153(+) A-I      intronic
chr7:45102178(+) A-I      intronic
chr7:45102195(+) A-I      intronic
chr7:45102206(+) A-I      intronic
chr7:45102209(+) A-I      intronic
chr7:45098587(+) A-I      intronic
chr7:45098553(+) A-I      intronic
chr7:45098544(+) A-I      intronic
chr7:45098394(+) A-I      intronic
chr7:45097031(+) A-I      intronic
chr7:45096801(+) A-I      intronic
chr7:45096068(+) A-I      intronic
chr7:45096052(+) A-I      intronic
chr7:45041899(+) A-I      intronic
chr7:45041937(+) A-I      intronic
chr7:45041948(+) A-I      intronic
chr7:45041958(+) A-I      intronic
chr7:45041982(+) A-I      intronic
chr7:45041991(+) A-I      intronic
chr7:45042006(+) A-I      intronic
chr7:45042730(+) A-I      intronic
chr7:45042744(+) A-I      intronic
chr7:45042804(+) A-I      intronic
chr7:45042836(+) A-I      intronic
chr7:45102801(+) A-I      intronic
chr7:45102806(+) A-I      intronic
chr7:45102811(+) A-I      intronic
chr7:45102923(+) A-I      intronic
chr7:45102931(+) A-I      intronic
chr7:45102945(+) A-I      intronic
chr7:45042840(+) A-I      intronic
chr7:45042849(+) A-I      intronic
chr7:45042855(+) A-I      intronic
chr7:45042858(+) A-I      intronic
chr7:45043100(+) A-I      intronic
chr7:45043211(+) A-I      intronic
chr7:45043233(+) A-I      intronic
chr7:45043247(+) A-I      intronic
chr7:45043248(+) A-I      intronic
chr7:45043616(+) A-I      intronic
chr7:45043617(+) A-I      intronic
chr7:45043624(+) A-I      intronic
chr7:45043689(+) A-I      intronic
chr7:45043699(+) A-I      intronic
chr7:45043720(+) A-I      intronic
chr7:45044436(+) A-I      intronic
chr7:45044437(+) A-I      intronic
chr7:45044480(+) A-I      intronic
chr7:45047742(+) A-I      intronic
chr7:45047756(+) A-I      intronic
chr7:45048128(+) A-I      intronic
chr7:45048181(+) A-I      intronic
chr7:45048190(+) A-I      intronic
chr7:45048204(+) A-I      intronic
chr7:45048691(+) A-I      intronic
chr7:45048756(+) A-I      intronic
chr7:45048806(+) A-I      intronic
chr7:45048811(+) A-I      intronic
chr7:45048821(+) A-I      intronic
chr7:45048832(+) A-I      intronic
chr7:45049104(+) A-I      intronic
chr7:45049169(+) A-I      intronic
chr7:45049183(+) A-I      intronic
chr7:45049237(+) A-I      intronic
chr7:45049239(+) A-I      intronic
chr7:45049559(+) A-I      intronic
chr7:45049573(+) A-I      intronic
chr7:45049595(+) A-I      intronic
chr7:45049602(+) A-I      intronic
chr7:45049609(+) A-I      intronic
chr7:45049693(+) A-I      intronic
chr7:45050253(+) A-I      intronic
chr7:45050266(+) A-I      intronic
chr7:45050277(+) A-I      intronic
chr7:45050297(+) A-I      intronic
chr7:45050314(+) A-I      intronic
chr7:45050338(+) A-I      intronic
chr7:45050380(+) A-I      intronic
chr7:45051553(+) A-I      intronic
chr7:45051872(+) A-I      intronic
chr7:45051938(+) A-I      intronic
chr7:45051954(+) A-I      intronic
chr7:45051976(+) A-I      intronic
chr7:45054022(+) A-I      intronic
chr7:45058134(+) A-I      intronic
chr7:45058423(+) A-I      intronic
chr7:45058682(+) A-I      intronic
chr7:45058686(+) A-I      intronic
chr7:45058751(+) A-I      intronic
chr7:45058770(+) A-I      intronic
chr7:45058800(+) A-I      intronic
chr7:45059286(+) A-I      intronic
chr7:45059321(+) A-I      intronic
chr7:45059359(+) A-I      intronic
chr7:45060843(+) A-I      intronic
chr7:45061104(+) A-I      intronic
chr7:45061985(+) A-I      intronic
chr7:45062090(+) A-I      intronic
chr7:45062104(+) A-I      intronic
chr7:45062112(+) A-I      intronic
chr7:45062440(+) A-I      intronic
chr7:45062523(+) A-I      intronic
chr7:45062623(+) A-I      intronic
chr7:45062877(+) A-I      intronic
chr7:45062972(+) A-I      intronic
chr7:45063002(+) A-I      intronic
chr7:45066301(+) A-I      intronic
chr7:45066302(+) A-I      intronic
chr7:45066328(+) A-I      intronic
chr7:45066331(+) A-I      intronic
chr7:45066463(+) A-I      intronic
chr7:45066464(+) A-I      intronic
chr7:45068168(+) A-I      intronic
chr7:45070134(+) A-I      intronic
chr7:45070135(+) A-I      intronic
chr7:45070285(+) A-I      intronic
chr7:45050852(+) A-I      intronic
chr7:45041908(+) A-I      intronic
chr7:45070861(+) A-I      intronic
chr7:45060844(+) A-I      intronic
chr7:45044449(+) A-I      intronic
chr7:45070938(+) A-I      intronic
chr7:45062962(+) A-I      intronic
chr7:45099297(+) A-I      intronic
chr7:45059307(+) A-I      intronic
chr7:45082658(+) A-I      intronic
chr7:45062575(+) A-I      intronic
chr7:45079836(+) A-I      intronic
chr7:45080509(+) A-I      intronic
chr7:45048060(+) A-I      intronic
chr7:45050248(+) A-I      intronic
chr7:45058157(+) A-I      intronic
chr7:45082820(+) A-I      intronic
chr7:45041972(+) A-I      intronic
chr7:45049179(+) A-I      intronic
chr7:45042755(+) A-I      intronic
chr7:45079440(+) A-I      intronic
chr7:45088268(+) A-I      intronic
chr7:45042754(+) A-I      intronic
chr7:45061076(+) A-I      intronic
chr7:45072478(+) A-I      intronic
chr7:45085279(+) A-I      intronic
chr7:45061085(+) A-I      intronic
chr7:45070120(+) A-I      intronic
chr7:45044501(+) A-I      intronic
chr7:45095990(+) A-I      intronic
chr7:45098606(+) A-I      intronic
chr7:45058452(+) A-I      intronic
chr7:45081619(+) A-I      intronic
chr7:45070104(+) A-I      intronic
chr7:45070860(+) A-I      intronic
chr7:45098398(+) A-I      intronic
chr7:45048195(+) A-I      intronic
chr7:45082766(+) A-I      intronic
chr7:45043559(+) A-I      intronic
chr7:45102172(+) A-I      intronic
chr7:45099197(+) A-I      intronic
chr7:45070416(+) A-I      intronic
chr7:45070726(+) A-I      intronic
chr7:45058140(+) A-I      intronic
chr7:45041916(+) A-I      intronic
chr7:45062602(+) A-I      intronic
chr7:45102219(+) A-I      intronic
chr7:45059357(+) A-I      intronic
chr7:45070834(+) A-I      intronic
chr7:45070321(+) A-I      intronic
chr7:45071447(+) A-I      intronic
chr7:45099105(+) A-I      intronic
chr7:45101281(+) A-I      intronic
chr7:45102275(+) A-I      intronic
chr7:45079384(+) A-I      intronic
chr7:45049700(+) A-I      intronic
chr7:45051386(+) A-I      intronic
chr7:45041997(+) A-I      intronic
chr7:45102225(+) A-I      intronic
chr7:45073972(+) A-I      intronic
chr7:45049222(+) A-I      intronic
chr7:45049588(+) A-I      intronic
chr7:45102314(+) A-I      intronic
chr7:45085136(+) A-I      intronic
chr7:45049043(+) A-I      intronic
chr7:45048041(+) A-I      intronic
chr7:45096063(+) A-I      intronic
chr7:45049719(+) A-I      intronic
chr7:45062887(+) A-I      intronic
chr7:45068135(+) A-I      intronic
chr7:45068097(+) A-I      intronic
chr7:45081625(+) A-I      intronic
chr7:45098694(+) A-I      intronic
chr7:45080452(+) A-I      intronic
chr7:45054473(+) A-I      intronic
chr7:45071362(+) A-I      intronic
chr7:45068002(+) A-I      intronic
chr7:45097022(+) A-I      intronic
chr7:45105981(+) A-I      intronic
chr7:45050349(+) A-I      intronic
chr7:45062988(+) A-I      intronic
chr7:45066399(+) A-I      intronic
chr7:45070276(+) A-I      intronic
chr7:45102298(+) A-I      intronic
chr7:45057996(+) A-I      intronic
chr7:45085398(+) A-I      3'UTR
chr7:45079966(+) A-I      intronic
chr7:45062984(+) A-I      intronic
chr7:45081845(+) A-I      intronic
chr7:45102327(+) A-I      intronic
chr7:45063029(+) A-I      intronic
chr7:45070288(+) A-I      intronic
chr7:45042731(+) A-I      intronic
chr7:45049670(+) A-I      intronic
chr7:45102779(+) A-I      intronic
chr7:45049060(+) A-I      intronic
chr7:45048235(+) A-I      intronic
chr7:45043083(+) A-I      intronic
chr7:45043668(+) A-I      intronic
chr7:45062512(+) A-I      intronic
chr7:45088153(+) A-I      intronic
chr7:45049664(+) A-I      intronic
chr7:45102255(+) A-I      intronic
chr7:45101305(+) A-I      intronic
chr7:45071445(+) A-I      intronic
chr7:45098680(+) A-I      intronic
chr7:45102218(+) A-I      intronic
chr7:45048667(+) A-I      intronic
chr7:45074197(+) A-I      intronic
chr7:45091264(+) A-I      intronic
chr7:45088283(+) A-I      intronic
chr7:45062987(+) A-I      intronic
chr7:45083813(+) A-I      intronic
chr7:45048659(+) A-I      intronic
chr7:45082844(+) A-I      intronic
chr7:45048789(+) A-I      intronic
chr7:45070423(+) A-I      intronic
chr7:45042008(+) A-I      intronic
chr7:45042814(+) A-I      intronic
chr7:45042045(+) A-I      intronic
chr7:45074302(+) A-I      intronic
chr7:45059299(+) A-I      intronic
chr7:45080446(+) A-I      intronic
chr7:45048038(+) A-I      intronic
chr7:45058095(+) A-I      intronic
chr7:45098524(+) A-I      intronic
chr7:45063051(+) A-I      intronic
chr7:45102813(+) A-I      intronic
chr7:45042792(+) A-I      intronic
chr7:45102336(+) A-I      intronic
chr7:45102932(+) A-I      intronic
chr7:45059251(+) A-I      intronic
chr7:45095999(+) A-I      intronic
chr7:45101168(+) A-I      intronic
chr7:45062902(+) A-I      intronic
chr7:45062035(+) A-I      intronic
chr7:45049707(+) A-I      intronic
chr7:45043156(+) A-I      intronic
chr7:45062351(+) A-I      intronic
chr7:45099143(+) A-I      intronic
chr7:45056204(+) A-I      intronic
chr7:45072497(+) A-I      intronic
chr7:45088586(+) A-I      intronic
chr7:45098627(+) A-I      intronic
chr7:45097021(+) A-I      intronic
chr7:45097034(+) A-I      intronic
chr7:45072575(+) A-I      intronic
chr7:45081620(+) A-I      intronic
chr7:45043145(+) A-I      intronic
chr7:45082620(+) A-I      intronic
chr7:45065233(+) A-I      intronic
chr7:45070275(+) A-I      intronic
chr7:45063549(+) A-I      intronic
chr7:45066340(+) A-I      intronic
chr7:45043184(+) A-I      intronic
chr7:45043208(+) A-I      intronic
chr7:45041953(+) A-I      intronic
chr7:45081720(+) A-I      intronic
chr7:45082675(+) A-I      intronic
chr7:45102690(+) A-I      intronic
chr7:45061065(+) A-I      intronic
chr7:45102250(+) A-I      intronic
chr7:45072549(+) A-I      intronic
chr7:45079872(+) A-I      intronic
chr7:45059394(+) A-I      intronic
chr7:45063038(+) A-I      intronic
chr7:45070129(+) A-I      intronic
chr7:45049192(+) A-I      intronic
chr7:45051772(+) A-I      intronic
chr7:45042697(+) A-I      intronic
chr7:45095998(+) A-I      intronic
chr7:45048676(+) A-I      intronic
chr7:45088606(+) A-I      intronic
chr7:45070387(+) A-I      intronic
chr7:45049200(+) A-I      intronic
chr7:45101137(+) A-I      intronic
chr7:45060907(+) A-I      intronic
chr7:45041969(+) A-I      intronic
chr7:45048700(+) A-I      intronic
chr7:45088348(+) A-I      intronic
chr7:45079862(+) A-I      intronic
chr7:45041917(+) A-I      intronic
chr7:45048654(+) A-I      intronic
chr7:45081849(+) A-I      intronic
chr7:45059315(+) A-I      intronic
chr7:45070557(+) A-I      intronic
chr7:45042739(+) A-I      intronic
chr7:45065295(+) A-I      intronic
chr7:45072585(+) A-I      intronic
chr7:45096901(+) A-I      intronic
chr7:45041904(+) A-I      intronic
chr7:45070330(+) A-I      intronic
chr7:45080468(+) A-I      intronic
chr7:45095167(+) A-I      intronic
chr7:45082684(+) A-I      intronic
chr7:45070198(+) A-I      intronic
chr7:45059409(+) A-I      intronic
chr7:45058035(+) A-I      intronic
chr7:45071057(+) A-I      intronic
chr7:45051833(+) A-I      intronic
chr7:45074047(+) A-I      intronic
chr7:45099088(+) A-I      intronic
chr7:45102367(+) A-I      intronic
chr7:45102307(+) A-I      intronic
chr7:45081723(+) A-I      intronic
chr7:45042779(+) A-I      intronic
chr7:45101184(+) A-I      intronic
chr7:45070805(+) A-I      intronic
chr7:45088215(+) A-I      intronic
chr7:45102817(+) A-I      intronic
chr7:45043085(+) A-I      intronic
chr7:45048747(+) A-I      intronic
chr7:45070757(+) A-I      intronic
chr7:45061002(+) A-I      intronic
chr7:45057970(+) A-I      intronic
chr7:45099201(+) A-I      intronic
chr7:45067983(+) A-I      intronic
chr7:45102358(+) A-I      intronic
chr7:45060734(+) A-I      intronic
chr7:45071236(+) A-I      intronic
chr7:45063133(+) A-I      intronic
chr7:45041967(+) A-I      intronic
chr7:45049143(+) A-I      intronic
chr7:45042841(+) A-I      intronic
chr7:45099317(+) A-I      intronic
chr7:45066454(+) A-I      intronic
chr7:45048061(+) A-I      intronic
chr7:45070128(+) A-I      intronic
chr7:45068001(+) A-I      intronic
chr7:45102776(+) A-I      intronic
chr7:45070114(+) A-I      intronic
chr7:45081835(+) A-I      intronic
chr7:45070866(+) A-I      intronic
chr7:45070426(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED CCM2
chr7:45079384(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr7:45079836(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr7:45079862(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr7:45079872(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr7:45080446(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr7:45080460(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr7:45080469(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr7:45081625(+) A-I intron -    15342557
chr7:45081722(+) A-I intron -    15342557
chr7:45081726(+) A-I intron -    15342557
chr7:45081835(+) A-I intron -    15342557
chr7:45081845(+) A-I intron -    15342557
chr7:45041904(+) A-G intron -    22484847
chr7:45041908(+) A-G intron -    22484847
chr7:45041916(+) A-G intron -    22484847
chr7:45041917(+) A-G intron -    22484847
chr7:45041972(+) A-G intron -    22484847
chr7:45041989(+) A-G intron -    22484847
chr7:45041992(+) A-G intron -    22484847
chr7:45041997(+) A-G intron -    22484847
chr7:45042008(+) A-G intron -    22484847
chr7:45042045(+) A-G intron -    22484847
chr7:45042697(+) A-G intron -    22484847
chr7:45042731(+) A-G intron -    22484847
chr7:45042736(+) A-G intron -    22484847
chr7:45042739(+) A-G intron -    22484847
chr7:45042754(+) A-G intron -    22484847
chr7:45042755(+) A-G intron -    22484847
chr7:45042774(+) A-G intron -    22484847
chr7:45042779(+) A-G intron -    22484847
chr7:45042792(+) A-G intron -    22484847
chr7:45042814(+) A-G intron -    22484847
chr7:45042841(+) A-G intron -    22484847
chr7:45042889(+) A-G intron -    22484847
chr7:45043083(+) A-G intron -    22484847
chr7:45043085(+) A-G intron -    22484847
chr7:45043145(+) A-G intron -    22484847
chr7:45043156(+) A-G intron -    22484847
chr7:45043161(+) G-A intron -    22484847
chr7:45043176(+) A-G intron -    22484847
chr7:45043184(+) A-G intron -    22484847
chr7:45043208(+) A-G intron -    22484847
chr7:45043242(+) T-G intron -    22484847
chr7:45043559(+) A-G intron -    22484847
chr7:45043569(+) A-G intron -    22484847
chr7:45048038(+) A-G intron -    22484847
chr7:45048041(+) A-G intron -    22484847
chr7:45048047(+) A-G intron -    22484847
chr7:45048060(+) A-G intron -    22484847
chr7:45048061(+) A-G intron -    22484847
chr7:45048091(+) A-G intron -    22484847
chr7:45048195(+) A-G intron -    22484847
chr7:45048654(+) A-G intron -    22484847
chr7:45048659(+) A-G intron -    22484847
chr7:45048667(+) A-G intron -    22484847
chr7:45048676(+) A-G intron -    22484847
chr7:45048700(+) A-G intron -    22484847
chr7:45048747(+) A-G intron -    22484847
chr7:45048789(+) A-G intron -    22484847
chr7:45049001(+) G-T intron -    22484847
chr7:45049043(+) A-G intron -    22484847
chr7:45049060(+) A-G intron -    22484847
chr7:45049133(+) A-G intron -    22484847
chr7:45049143(+) A-G intron -    22484847
chr7:45049179(+) A-G intron -    22484847
chr7:45049186(+) A-G intron -    22484847
chr7:45049191(+) T-C intron -    22484847
chr7:45049192(+) A-G intron -    22484847
chr7:45049200(+) A-G intron -    22484847
chr7:45049222(+) A-G intron -    22484847
chr7:45049540(+) A-G intron -    22484847
chr7:45049588(+) A-G intron -    22484847
chr7:45049642(+) A-G intron -    22484847
chr7:45049670(+) A-G intron -    22484847
chr7:45049700(+) A-G intron -    22484847
chr7:45049707(+) A-G intron -    22484847
chr7:45049719(+) A-G intron -    22484847
chr7:45050248(+) A-G intron -    22484847
chr7:45050377(+) A-G intron -    22484847
chr7:45050693(+) T-C intron -    22484847
chr7:45050764(+) A-G intron -    22484847
chr7:45050852(+) A-G intron -    22484847
chr7:45051868(+) A-G intron -    22484847
chr7:45054366(+) G-A intron -    22484847
chr7:45054473(+) A-G intron -    22484847
chr7:45056196(+) T-G intron -    22484847
chr7:45056204(+) A-G intron -    22484847
chr7:45056500(+) A-G intron -    22484847
chr7:45057996(+) A-G intron -    22484847
chr7:45058095(+) A-G intron -    22484847
chr7:45058140(+) A-G intron -    22484847
chr7:45058157(+) A-G intron -    22484847
chr7:45058417(+) A-G intron -    22484847
chr7:45058452(+) A-G intron -    22484847
chr7:45059202(+) A-G intron -    22484847
chr7:45059230(+) A-G intron -    22484847
chr7:45059251(+) A-G intron -    22484847
chr7:45059299(+) A-G intron -    22484847
chr7:45059307(+) A-G intron -    22484847
chr7:45059308(+) A-G intron -    22484847
chr7:45059357(+) A-G intron -    22484847
chr7:45059360(+) A-G intron -    22484847
chr7:45059394(+) A-G intron -    22484847
chr7:45059409(+) A-G intron -    22484847
chr7:45060734(+) A-G intron -    22484847
chr7:45060844(+) A-G intron -    22484847
chr7:45060907(+) A-G intron -    22484847
chr7:45061002(+) A-G intron -    22484847
chr7:45062035(+) A-G intron -    22484847
chr7:45062045(+) A-G intron -    22484847
chr7:45062512(+) A-G intron -    22484847
chr7:45062537(+) A-G intron -    22484847
chr7:45062562(+) A-G intron -    22484847
chr7:45062575(+) A-G intron -    22484847
chr7:45062602(+) A-G intron -    22484847
chr7:45062887(+) A-G intron -    22484847
chr7:45062893(+) A-G intron -    22484847
chr7:45062939(+) A-G intron -    22484847
chr7:45062962(+) A-G intron -    22484847
chr7:45062978(+) A-G intron -    22484847
chr7:45062984(+) A-G intron -    22484847
chr7:45062987(+) A-G intron -    22484847
chr7:45062988(+) A-G intron -    22484847
chr7:45063029(+) A-G intron -    22484847
chr7:45063045(+) A-G intron -    22484847
chr7:45063051(+) A-G intron -    22484847
chr7:45063133(+) A-G intron -    22484847
chr7:45063173(+) C-A intron -    22484847
chr7:45063397(+) T-G intron -    22484847
chr7:45063408(+) T-G intron -    22484847
chr7:45066295(+) A-G intron -    22484847
chr7:45066340(+) A-G intron -    22484847
chr7:45066399(+) A-G intron -    22484847
chr7:45066436(+) A-G intron -    22484847
chr7:45066454(+) A-G intron -    22484847
chr7:45068002(+) A-G intron -    22484847
chr7:45068053(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070067(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070104(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070114(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070120(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070128(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070129(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070198(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070252(+) G-T intron -    22484847
chr7:45070275(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070276(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070288(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070321(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070326(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070330(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070416(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070423(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070426(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070462(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070597(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070720(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070726(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070727(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070757(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070805(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070834(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070860(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070861(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070866(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070901(+) A-G intron -    22484847
chr7:45070938(+) A-G intron -    22484847
chr7:45071057(+) A-G intron -    22484847
chr7:45071111(+) A-G intron -    22484847
chr7:45071257(+) A-G intron -    22484847
chr7:45071362(+) A-G intron -    22484847
chr7:45071433(+) A-G intron -    22484847
chr7:45071445(+) A-G intron -    22484847
chr7:45072425(+) A-G intron -    22484847
chr7:45072463(+) A-G intron -    22484847
chr7:45072486(+) T-A intron -    22484847
chr7:45072497(+) A-G intron -    22484847
chr7:45074034(+) A-G intron -    22484847
chr7:45074047(+) A-G intron -    22484847
chr7:45074111(+) C-T intron -    22484847
chr7:45074197(+) A-G intron -    22484847
chr7:45074302(+) A-G intron -    22484847
chr7:45074355(+) A-G intron -    22484847
chr7:45074394(+) A-G intron -    22484847
chr7:45074575(+) A-G intron -    22484847
chr7:45079384(+) A-G intron -    22484847
chr7:45079440(+) A-G intron -    22484847
chr7:45079455(+) G-A intron -    22484847
chr7:45079862(+) A-G intron -    22484847
chr7:45080468(+) A-G intron -    22484847
chr7:45081720(+) A-G intron -    22484847
chr7:45082595(+) A-G intron -    22484847
chr7:45082620(+) A-G intron -    22484847
chr7:45082639(+) A-G intron -    22484847
chr7:45082675(+) A-G intron -    22484847
chr7:45082711(+) A-G intron -    22484847
chr7:45082820(+) A-G intron -    22484847
chr7:45083148(+) A-G intron -    22484847
chr7:45083755(+) T-C intron -    22484847
chr7:45083925(+) T-C intron -    22484847
chr7:45085136(+) A-G intron -    22484847
chr7:45088153(+) A-G intron -    22484847
chr7:45088215(+) A-G intron -    22484847
chr7:45088241(+) A-G intron -    22484847
chr7:45088268(+) A-G intron -    22484847
chr7:45088283(+) A-G intron -    22484847
chr7:45088586(+) A-G intron -    22484847
chr7:45088606(+) A-G intron -    22484847
chr7:45088695(+) A-G intron -    22484847
chr7:45088785(+) T-G intron -    22484847
chr7:45095168(+) A-G intron -    22484847
chr7:45095990(+) A-G intron -    22484847
chr7:45095998(+) A-G intron -    22484847
chr7:45095999(+) A-G intron -    22484847
chr7:45096063(+) A-G intron -    22484847
chr7:45097021(+) A-G intron -    22484847
chr7:45097022(+) A-G intron -    22484847
chr7:45097028(+) A-G intron -    22484847
chr7:45098415(+) A-G intron -    22484847
chr7:45098680(+) A-G intron -    22484847
chr7:45098694(+) A-G intron -    22484847
chr7:45099143(+) A-G intron -    22484847
chr7:45099201(+) A-G intron -    22484847
chr7:45099316(+) A-G intron -    22484847
chr7:45099317(+) A-G intron -    22484847
chr7:45101060(+) T-C intron -    22484847
chr7:45101137(+) A-G intron -    22484847
chr7:45101168(+) A-G intron -    22484847
chr7:45101184(+) A-G intron -    22484847
chr7:45101191(+) T-C intron -    22484847
chr7:45101281(+) A-G intron -    22484847
chr7:45101304(+) A-G intron -    22484847
chr7:45102172(+) A-G intron -    22484847
chr7:45102196(+) A-G intron -    22484847
chr7:45102218(+) A-G intron -    22484847
chr7:45102219(+) A-G intron -    22484847
chr7:45102225(+) A-G intron -    22484847
chr7:45102298(+) A-G intron -    22484847
chr7:45102304(+) A-G intron -    22484847
chr7:45102307(+) A-G intron -    22484847
chr7:45102326(+) A-G intron -    22484847
chr7:45102337(+) A-G intron -    22484847
chr7:45102346(+) A-G intron -    22484847
chr7:45102358(+) A-G intron -    22484847
chr7:45102776(+) A-G intron -    22484847
chr7:45102779(+) A-G intron -    22484847
chr7:45102813(+) A-G intron -    22484847
chr7:45102817(+) A-G intron -    22484847
chr7:45102932(+) A-G intron -    22484847
chr7:45106950(+) T-C intron -    22484847
chr7:45110293(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase CCM2
chr7:45039803-45039804(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24981863
chr7:45066628-45066629(+) m1A 5'UTR//exon//intron       26863196//26863410
chr7:45103567-45103568(+) m6A CDS//exon//intron       -
chr7:45103589-45103590(+) m6A CDS//exon//intron       -
chr7:45104081-45104082(+) m6A CDS//exon//intron       -
chr7:45109503-45109504(+) m6A CDS//exon//intron       24284625
chr7:45112345-45112346(+) m6A CDS//exon//intron       24284625
chr7:45112356-45112357(+) m6A CDS//exon//intron       24284625
chr7:45112415-45112416(+) m6A exon//intron       24284625
chr7:45112503-45112504(+) m6A exon//intron       24284625
chr7:45113107-45113108(+) m6A CDS//exon       24284625
chr7:45113156-45113157(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625
chr7:45113983-45113984(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625
chr7:45115402-45115403(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625
chr7:45115420-45115421(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//22575960//22608085
chr7:45115431-45115432(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//22575960//22608085
chr7:45115528-45115529(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr7:45115585-45115586(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr7:45115600-45115601(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr7:45115639-45115640(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr7:45115645-45115646(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr7:45115659-45115660(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr7:45115728-45115729(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr7:45115832-45115833(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr7:45116014-45116015(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate CCM2
Chromatin K562 cells     -
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hiv1-miR-TAR-5p
Interactor2: CCM2

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda//PITA//RNAHybrid
Support Database RepTar//VmiReg

Starting a new search, please wait ...