Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00698232

  Virus:  

Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hiv1-miR-TAR-5p:           MDN1:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hiv1-miR-TAR-5p MDN1
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0006016 23195
Organism Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - Rea1

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR MDN1
chr6:90515829(-) A-I      intronic
chr6:90518691(-) A-I      intronic
chr6:90374929(-) A-I      intronic
chr6:90473746(-) A-I      intronic
chr6:90374937(-) A-I      intronic
chr6:90473731(-) A-I      intronic
chr6:90357646(-) A-I      intronic
chr6:90473717(-) A-I      intronic
chr6:90515870(-) A-I      intronic
chr6:90357542(-) A-I      intronic
chr6:90515825(-) A-I      intronic
chr6:90480420(-) A-I      intronic
chr6:90473762(-) A-I      intronic
chr6:90520482(-) A-I      intronic
chr6:90518903(-) A-I      intronic
chr6:90518836(-) A-I      intronic
chr6:90518788(-) A-I      intronic
chr6:90518733(-) A-I      intronic
chr6:90518731(-) A-I      intronic
chr6:90517022(-) A-I      intronic
chr6:90485473(-) A-I      intronic
chr6:90481594(-) A-I      intronic
chr6:90516984(-) A-I      intronic
chr6:90480416(-) A-I      intronic
chr6:90480410(-) A-I      intronic
chr6:90480291(-) A-I      intronic
chr6:90480090(-) A-I      intronic
chr6:90479954(-) A-I      intronic
chr6:90472605(-) A-I      intronic
chr6:90472602(-) A-I      intronic
chr6:90469210(-) A-I      intronic
chr6:90460535(-) A-I      intronic
chr6:90460501(-) A-I      intronic
chr6:90460498(-) A-I      intronic
chr6:90460495(-) A-I      intronic
chr6:90454597(-) A-I      intronic
chr6:90454587(-) A-I      intronic
chr6:90454233(-) A-I      intronic
chr6:90454227(-) A-I      intronic
chr6:90453740(-) A-I      intronic
chr6:90453739(-) A-I      intronic
chr6:90369776(-) A-I      intronic
chr6:90357572(-) A-I      intronic
chr6:90357456(-) A-I      intronic
chr6:90356724(-) A-I      intronic
chr6:90356651(-) A-I      intronic
chr6:90453722(-) A-I      intronic
chr6:90453706(-) A-I      intronic
chr6:90445559(-) A-I      intronic
chr6:90516934(-) A-I      intronic
chr6:90516385(-) A-I      intronic
chr6:90516311(-) A-I      intronic
chr6:90445244(-) A-I      intronic
chr6:90444779(-) A-I      intronic
chr6:90436175(-) A-I      intronic
chr6:90436126(-) A-I      intronic
chr6:90435552(-) A-I      intronic
chr6:90435499(-) A-I      intronic
chr6:90434099(-) A-I      intronic
chr6:90433724(-) A-I      intronic
chr6:90433718(-) A-I      intronic
chr6:90433699(-) A-I      intronic
chr6:90432398(-) A-I      intronic
chr6:90516233(-) A-I      intronic
chr6:90516191(-) A-I      intronic
chr6:90515884(-) A-I      intronic
chr6:90515794(-) A-I      intronic
chr6:90515772(-) A-I      intronic
chr6:90414519(-) A-I      intronic
chr6:90515209(-) A-I      intronic
chr6:90514998(-) A-I      intronic
chr6:90514696(-) A-I      intronic
chr6:90523328(-) A-I      intronic
chr6:90522757(-) A-I      intronic
chr6:90414494(-) A-I      intronic
chr6:90414460(-) A-I      intronic
chr6:90522756(-) A-I      intronic
chr6:90522626(-) A-I      intronic
chr6:90521904(-) A-I      intronic
chr6:90521898(-) A-I      intronic
chr6:90523248(-) A-I      intronic
chr6:90523151(-) A-I      intronic
chr6:90523121(-) A-I      intronic
chr6:90523106(-) A-I      intronic
chr6:90522929(-) A-I      intronic
chr6:90522901(-) A-I      intronic
chr6:90514554(-) A-I      intronic
chr6:90513749(-) A-I      intronic
chr6:90513689(-) A-I      intronic
chr6:90513687(-) A-I      intronic
chr6:90513465(-) A-I      intronic
chr6:90513401(-) A-I      intronic
chr6:90513377(-) A-I      intronic
chr6:90502616(-) A-I      intronic
chr6:90502590(-) A-I      intronic
chr6:90501790(-) A-I      intronic
chr6:90501762(-) A-I      intronic
chr6:90501756(-) A-I      intronic
chr6:90501519(-) A-I      intronic
chr6:90501426(-) A-I      intronic
chr6:90492514(-) A-I      intronic
chr6:90492486(-) A-I      intronic
chr6:90488583(-) A-I      intronic
chr6:90486141(-) A-I      intronic
chr6:90522862(-) A-I      intronic
chr6:90522824(-) A-I      intronic
chr6:90481593(-) A-I      intronic
chr6:90515217(-) A-I      intronic
chr6:90486120(-) A-I      intronic
chr6:90404868(-) A-I      intronic
chr6:90485672(-) A-I      intronic
chr6:90357550(-) A-I      intronic
chr6:90357494(-) A-I      intronic
chr6:90526665(-) A-I      intronic
chr6:90526522(-) A-I      intronic
chr6:90522792(-) A-I      intronic
chr6:90414398(-) A-I      intronic
chr6:90413610(-) A-I      intronic
chr6:90413597(-) A-I      intronic
chr6:90413548(-) A-I      intronic
chr6:90413512(-) A-I      intronic
chr6:90412818(-) A-I      intronic
chr6:90404365(-) A-I      intronic
chr6:90380069(-) A-I      intronic
chr6:90380064(-) A-I      intronic
chr6:90379774(-) A-I      intronic
chr6:90379773(-) A-I      intronic
chr6:90376525(-) A-I      intronic
chr6:90376480(-) A-I      intronic
chr6:90376302(-) A-I      intronic
chr6:90375702(-) A-I      intronic
chr6:90375659(-) A-I      intronic
chr6:90375524(-) A-I      intronic
chr6:90375374(-) A-I      intronic
chr6:90375340(-) A-I      intronic
chr6:90375246(-) A-I      intronic
chr6:90369878(-) A-I      intronic
chr6:90369824(-) A-I      intronic
chr6:90369801(-) A-I      intronic
chr6:90369800(-) A-I      intronic
chr6:90369783(-) A-I      intronic
chr6:90369782(-) A-I      intronic
chr6:90369781(-) A-I      intronic
chr6:90526490(-) A-I      intronic
chr6:90525971(-) A-I      intronic
chr6:90521887(-) A-I      intronic
chr6:90521881(-) A-I      intronic
chr6:90521826(-) A-I      intronic
chr6:90521358(-) A-I      intronic
chr6:90521329(-) A-I      intronic
chr6:90520551(-) A-I      intronic
chr6:90413988(-) A-I      intronic
chr6:90356683(-) A-I      intronic
chr6:90446431(-) A-I      intronic
chr6:90435528(-) A-I      intronic
chr6:90380073(-) A-I      intronic
chr6:90412883(-) A-I      intronic
chr6:90379800(-) A-I      intronic
chr6:90375302(-) A-I      intronic
chr6:90413623(-) A-I      intronic
chr6:90522837(-) A-I      intronic
chr6:90515858(-) A-I      intronic
chr6:90478592(-) A-I      intronic
chr6:90375336(-) A-I      intronic
chr6:90475757(-) A-I      intronic
chr6:90486058(-) A-I      intronic
chr6:90412778(-) A-I      intronic
chr6:90375596(-) A-I      intronic
chr6:90520532(-) A-I      intronic
chr6:90475285(-) A-I      intronic
chr6:90479748(-) A-I      intronic
chr6:90522838(-) A-I      intronic
chr6:90480394(-) A-I      intronic
chr6:90374914(-) A-I      intronic
chr6:90375366(-) A-I      intronic
chr6:90523552(-) A-I      intronic
chr6:90414464(-) A-I      intronic
chr6:90526563(-) A-I      intronic
chr6:90376061(-) A-I      intronic
chr6:90376116(-) A-I      intronic
chr6:90516944(-) A-I      intronic
chr6:90412744(-) A-I      intronic
chr6:90523414(-) A-I      intronic
chr6:90375278(-) A-I      intronic
chr6:90436169(-) A-I      intronic
chr6:90375395(-) A-I      intronic
chr6:90374992(-) A-I      intronic
chr6:90374824(-) A-I      intronic
chr6:90517052(-) A-I      intronic
chr6:90374862(-) A-I      intronic
chr6:90515004(-) A-I      intronic
chr6:90523381(-) A-I      intronic
chr6:90516983(-) A-I      intronic
chr6:90376527(-) A-I      intronic
chr6:90376408(-) A-I      intronic
chr6:90515139(-) A-I      intronic
chr6:90444874(-) A-I      intronic
chr6:90516090(-) A-I      intronic
chr6:90375385(-) A-I      intronic
chr6:90380067(-) A-I      intronic
chr6:90356569(-) A-I      intronic
chr6:90454372(-) A-I      intronic
chr6:90520656(-) A-I      intronic
chr6:90513754(-) A-I      intronic
chr6:90434140(-) A-I      intronic
chr6:90502567(-) A-I      intronic
chr6:90435533(-) A-I      intronic
chr6:90485543(-) A-I      intronic
chr6:90526526(-) A-I      intronic
chr6:90523064(-) A-I      intronic
chr6:90513837(-) A-I      intronic
chr6:90475322(-) A-I      intronic
chr6:90485569(-) A-I      intronic
chr6:90413670(-) A-I      intronic
chr6:90523760(-) A-I      intronic
chr6:90356707(-) A-I      intronic
chr6:90513361(-) A-I      intronic
chr6:90481829(-) A-I      intronic
chr6:90376096(-) A-I      intronic
chr6:90474202(-) A-I      intronic
chr6:90436120(-) A-I      intronic
chr6:90480345(-) A-I      intronic
chr6:90375165(-) A-I      intronic
chr6:90357560(-) A-I      intronic
chr6:90502662(-) A-I      intronic
chr6:90513469(-) A-I      intronic
chr6:90356701(-) A-I      intronic
chr6:90376052(-) A-I      intronic
chr6:90444792(-) A-I      intronic
chr6:90374895(-) A-I      intronic
chr6:90502562(-) A-I      intronic
chr6:90514506(-) A-I      intronic
chr6:90517077(-) A-I      intronic
chr6:90460460(-) A-I      intronic
chr6:90435454(-) A-I      intronic
chr6:90521778(-) A-I      intronic
chr6:90445171(-) A-I      intronic
chr6:90480385(-) A-I      intronic
chr6:90480517(-) A-I      intronic
chr6:90444295(-) A-I      intronic
chr6:90526573(-) A-I      intronic
chr6:90526037(-) A-I      intronic
chr6:90516957(-) A-I      intronic
chr6:90369873(-) A-I      intronic
chr6:90379710(-) A-I      intronic
chr6:90485611(-) A-I      intronic
chr6:90516894(-) A-I      intronic
chr6:90376430(-) A-I      intronic
chr6:90522600(-) A-I      intronic
chr6:90521221(-) A-I      intronic
chr6:90475284(-) A-I      intronic
chr6:90523126(-) A-I      intronic
chr6:90380120(-) A-I      intronic
chr6:90357633(-) A-I      intronic
chr6:90374875(-) A-I      intronic
chr6:90420170(-) A-I      intronic
chr6:90357452(-) A-I      intronic
chr6:90413559(-) A-I      intronic
chr6:90489528(-) A-I      intronic
chr6:90513439(-) A-I      intronic
chr6:90525874(-) A-I      intronic
chr6:90516903(-) A-I      intronic
chr6:90392171(-) A-I      intronic
chr6:90375554(-) A-I      intronic
chr6:90374845(-) A-I      intronic
chr6:90376496(-) A-I      intronic
chr6:90414456(-) A-I      intronic
chr6:90521391(-) A-I      intronic
chr6:90514633(-) A-I      intronic
chr6:90414024(-) A-I      intronic
chr6:90412932(-) A-I      intronic
chr6:90453800(-) A-I      intronic
chr6:90376161(-) A-I      intronic
chr6:90526574(-) A-I      intronic
chr6:90481862(-) A-I      intronic
chr6:90375696(-) A-I      intronic
chr6:90485481(-) A-I      intronic
chr6:90375019(-) A-I      intronic
chr6:90479960(-) A-I      intronic
chr6:90513781(-) A-I      intronic
chr6:90515827(-) A-I      intronic
chr6:90357670(-) A-I      intronic
chr6:90480401(-) A-I      intronic
chr6:90435589(-) A-I      intronic
chr6:90374942(-) A-I      intronic
chr6:90376433(-) A-I      intronic
chr6:90516218(-) A-I      intronic
chr6:90454219(-) A-I      intronic
chr6:90435497(-) A-I      intronic
chr6:90357556(-) A-I      intronic
chr6:90517033(-) A-I      intronic
chr6:90515781(-) A-I      intronic
chr6:90526577(-) A-I      intronic
chr6:90376333(-) A-I      intronic
chr6:90521438(-) A-I      intronic
chr6:90488414(-) A-I      intronic
chr6:90524170(-) A-I      intronic
chr6:90376418(-) A-I      intronic
chr6:90391165(-) A-I      intronic
chr6:90436017(-) A-I      intronic
chr6:90517056(-) A-I      intronic
chr6:90478727(-) A-I      intronic
chr6:90381370(-) A-I      intronic
chr6:90374858(-) A-I      intronic
chr6:90375258(-) A-I      intronic
chr6:90479951(-) A-I      intronic
chr6:90454386(-) A-I      intronic
chr6:90526036(-) A-I      intronic
chr6:90522836(-) A-I      intronic
chr6:90523170(-) A-I      intronic
chr6:90445155(-) A-I      intronic
chr6:90523158(-) A-I      intronic
chr6:90368861(-) A-I      intronic
chr6:90474211(-) A-I      intronic
chr6:90480041(-) A-I      intronic
chr6:90514725(-) A-I      intronic
chr6:90404468(-) A-I      intronic
chr6:90454230(-) A-I      intronic
chr6:90479957(-) A-I      intronic
chr6:90376251(-) A-I      intronic
chr6:90502589(-) A-I      intronic
chr6:90526066(-) A-I      intronic
chr6:90356705(-) A-I      intronic
chr6:90480014(-) A-I      intronic
chr6:90513712(-) A-I      intronic
chr6:90523148(-) A-I      intronic
chr6:90370077(-) A-I      intronic
chr6:90454207(-) A-I      intronic
chr6:90379679(-) A-I      intronic
chr6:90356633(-) A-I      intronic
chr6:90376325(-) A-I      intronic
chr6:90522800(-) A-I      intronic
chr6:90375637(-) A-I      intronic
chr6:90522745(-) A-I      intronic
chr6:90523409(-) A-I      intronic
chr6:90526599(-) A-I      intronic
chr6:90413514(-) A-I      intronic
chr6:90357612(-) A-I      intronic
chr6:90521777(-) A-I      intronic
chr6:90515001(-) A-I      intronic
chr6:90435551(-) A-I      intronic
chr6:90503197(-) A-I      intronic
chr6:90404786(-) A-I      intronic
chr6:90516231(-) A-I      intronic
chr6:90436054(-) A-I      intronic
chr6:90404735(-) A-I      intronic
chr6:90523103(-) A-I      intronic
chr6:90520554(-) A-I      intronic
chr6:90526454(-) A-I      intronic
chr6:90515754(-) A-I      intronic
chr6:90516917(-) A-I      intronic
chr6:90513784(-) A-I      intronic
chr6:90516966(-) A-I      intronic
chr6:90485687(-) A-I      intronic
chr6:90526451(-) A-I      intronic
chr6:90524189(-) A-I      intronic
chr6:90524199(-) A-I      intronic
chr6:90356709(-) A-I      intronic
chr6:90513688(-) A-I      intronic
chr6:90436181(-) A-I      intronic
chr6:90356613(-) A-I      intronic
chr6:90375651(-) A-I      intronic
chr6:90356649(-) A-I      intronic
chr6:90526532(-) A-I      intronic
chr6:90513412(-) A-I      intronic
chr6:90481585(-) A-I      intronic
chr6:90525862(-) A-I      intronic
chr6:90413669(-) A-I      intronic
chr6:90376121(-) A-I      intronic
chr6:90524142(-) A-I      intronic
chr6:90515017(-) A-I      intronic
chr6:90520569(-) A-I      intronic
chr6:90522896(-) A-I      intronic
chr6:90518884(-) A-I      intronic
chr6:90374911(-) A-I      intronic
chr6:90357517(-) A-I      intronic
chr6:90375566(-) A-I      intronic
chr6:90524236(-) A-I      intronic
chr6:90404789(-) A-I      intronic
chr6:90380082(-) A-I      intronic
chr6:90414388(-) A-I      intronic
chr6:90525953(-) A-I      intronic
chr6:90435494(-) A-I      intronic
chr6:90516097(-) A-I      intronic
chr6:90404377(-) A-I      intronic
chr6:90515078(-) A-I      intronic
chr6:90376112(-) A-I      intronic
chr6:90523594(-) A-I      intronic
chr6:90357641(-) A-I      intronic
chr6:90480397(-) A-I      intronic
chr6:90380058(-) A-I      intronic
chr6:90480478(-) A-I      intronic
chr6:90435997(-) A-I      intronic
chr6:90356606(-) A-I      intronic
chr6:90433740(-) A-I      intronic
chr6:90444249(-) A-I      intronic
chr6:90525853(-) A-I      intronic
chr6:90374879(-) A-I      intronic
chr6:90515856(-) A-I      intronic
chr6:90523686(-) A-I      intronic
chr6:90516993(-) A-I      intronic
chr6:90454394(-) A-I      intronic
chr6:90526558(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED MDN1
chr6:90356606(-) A-G intron -    22484847
chr6:90356643(-) A-G intron -    22484847
chr6:90356649(-) A-G intron -    22484847
chr6:90356701(-) A-G intron -    22484847
chr6:90356705(-) A-G intron -    22484847
chr6:90356709(-) A-G intron -    22484847
chr6:90357517(-) A-G intron -    22484847
chr6:90357538(-) T-C intron -    22484847
chr6:90357551(-) T-C intron -    22484847
chr6:90357633(-) A-G intron -    22484847
chr6:90368861(-) A-G intron -    22484847
chr6:90369732(-) T-C intron -    22484847
chr6:90369733(-) T-C intron -    22484847
chr6:90369873(-) A-G intron -    22484847
chr6:90369879(-) A-G intron -    22484847
chr6:90369881(-) A-G intron -    22484847
chr6:90370036(-) A-G intron -    22484847
chr6:90374973(-) A-G intron -    22484847
chr6:90375025(-) A-G intron -    22484847
chr6:90375178(-) T-C intron -    22484847
chr6:90375385(-) A-G intron -    22484847
chr6:90375596(-) A-G intron -    22484847
chr6:90375696(-) A-G intron -    22484847
chr6:90376102(-) T-C intron -    22484847
chr6:90376116(-) A-G intron -    22484847
chr6:90376298(-) A-G intron -    22484847
chr6:90376303(-) A-G intron -    22484847
chr6:90376408(-) A-G intron -    22484847
chr6:90376418(-) A-G intron -    22484847
chr6:90376430(-) A-G intron -    22484847
chr6:90376433(-) A-G intron -    22484847
chr6:90376447(-) A-G intron -    22484847
chr6:90376496(-) A-G intron -    22484847
chr6:90376527(-) A-G intron -    22484847
chr6:90380058(-) A-G intron -    22484847
chr6:90380124(-) A-G intron -    22484847
chr6:90404465(-) A-G intron -    22484847
chr6:90404812(-) G-A intron -    22484847
chr6:90404840(-) A-G intron -    22484847
chr6:90404872(-) T-C intron -    22484847
chr6:90412778(-) A-G intron -    22484847
chr6:90412883(-) A-G intron -    22484847
chr6:90413514(-) A-G intron -    22484847
chr6:90413519(-) A-G intron -    22484847
chr6:90413624(-) A-G intron -    22484847
chr6:90413669(-) A-G intron -    22484847
chr6:90413670(-) A-G intron -    22484847
chr6:90413704(-) A-G intron -    22484847
chr6:90413988(-) A-G intron -    22484847
chr6:90414388(-) A-G intron -    22484847
chr6:90414456(-) A-G intron -    22484847
chr6:90414464(-) A-G intron -    22484847
chr6:90414535(-) C-A intron -    22484847
chr6:90431435(-) T-C intron -    22484847
chr6:90433690(-) A-G intron -    22484847
chr6:90433740(-) A-G intron -    22484847
chr6:90433750(-) A-G intron -    22484847
chr6:90433869(-) C-T intron -    22484847
chr6:90434139(-) A-G intron -    22484847
chr6:90434140(-) A-G intron -    22484847
chr6:90435494(-) A-G intron -    22484847
chr6:90435495(-) A-G intron -    22484847
chr6:90435497(-) A-G intron -    22484847
chr6:90435528(-) A-G intron -    22484847
chr6:90435997(-) A-G intron -    22484847
chr6:90436017(-) A-G intron -    22484847
chr6:90436169(-) A-G intron -    22484847
chr6:90444295(-) A-G intron -    22484847
chr6:90444792(-) A-G intron -    22484847
chr6:90454207(-) A-G intron -    22484847
chr6:90454230(-) A-G intron -    22484847
chr6:90454372(-) A-G intron -    22484847
chr6:90454386(-) A-G intron -    22484847
chr6:90454394(-) A-G intron -    22484847
chr6:90456091(-) G-C intron -    22484847
chr6:90479951(-) A-G intron -    22484847
chr6:90479957(-) A-G intron -    22484847
chr6:90479960(-) A-G intron -    22484847
chr6:90480001(-) A-G intron -    22484847
chr6:90480041(-) A-G intron -    22484847
chr6:90480352(-) A-G intron -    22484847
chr6:90480397(-) A-G intron -    22484847
chr6:90480401(-) A-G intron -    22484847
chr6:90480404(-) A-G intron -    22484847
chr6:90481525(-) A-G intron -    22484847
chr6:90481585(-) A-G intron -    22484847
chr6:90485481(-) A-G intron -    22484847
chr6:90485543(-) A-G intron -    22484847
chr6:90485569(-) A-G intron -    22484847
chr6:90485611(-) A-G intron -    22484847
chr6:90485687(-) A-G intron -    22484847
chr6:90486058(-) A-G intron -    22484847
chr6:90491048(-) A-G intron -    22484847
chr6:90493715(-) C-T intron -    22484847
chr6:90502562(-) A-G intron -    22484847
chr6:90502589(-) A-G intron -    22484847
chr6:90502626(-) A-G intron -    22484847
chr6:90506070(-) G-T intron -    22484847
chr6:90511684(-) C-T intron -    22484847
chr6:90514506(-) A-G intron -    22484847
chr6:90514633(-) A-G intron -    22484847
chr6:90514725(-) A-G intron -    22484847
chr6:90515856(-) A-G intron -    22484847
chr6:90515858(-) A-G intron -    22484847
chr6:90516090(-) A-G intron -    22484847
chr6:90516097(-) A-G intron -    22484847
chr6:90516116(-) A-G intron -    22484847
chr6:90516218(-) A-G intron -    22484847
chr6:90516337(-) A-G intron -    22484847
chr6:90516983(-) A-G intron -    22484847
chr6:90517033(-) A-G intron -    22484847
chr6:90517052(-) A-G intron -    22484847
chr6:90518884(-) A-G intron -    22484847
chr6:90520532(-) A-G intron -    22484847
chr6:90520554(-) A-G intron -    22484847
chr6:90520656(-) A-G intron -    22484847
chr6:90521391(-) A-G intron -    22484847
chr6:90521438(-) A-G intron -    22484847
chr6:90521962(-) A-G intron -    22484847
chr6:90522745(-) A-G intron -    22484847
chr6:90522797(-) A-G intron -    22484847
chr6:90522800(-) A-G intron -    22484847
chr6:90522836(-) A-G intron -    22484847
chr6:90522841(-) A-G intron -    22484847
chr6:90522896(-) A-G intron -    22484847
chr6:90523103(-) A-G intron -    22484847
chr6:90523126(-) A-G intron -    22484847
chr6:90523170(-) A-G intron -    22484847
chr6:90523552(-) A-G intron -    22484847
chr6:90523625(-) A-G intron -    22484847
chr6:90525874(-) A-G intron -    22484847
chr6:90525875(-) A-G intron -    22484847
chr6:90525953(-) A-G intron -    22484847
chr6:90526036(-) A-G intron -    22484847
chr6:90526233(-) A-G intron -    22484847
chr6:90526518(-) A-G intron -    22484847
chr6:90526526(-) A-G intron -    22484847
chr6:90526532(-) A-G intron -    22484847
chr6:90526558(-) A-G intron -    22484847
chr6:90526598(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase MDN1
chr6:90353246-90353247(-) m6A 3'UTR//intron       24284625
chr6:90353333-90353334(-) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863//22575960
chr6:90353358-90353359(-) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863//22575960
chr6:90353511-90353512(-) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085
chr6:90353537-90353538(-) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863//27773535//22608085
chr6:90353646-90353647(-) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863//28052920//27773535//22575960//22608085
chr6:90353697-90353698(-) m6A 3'UTR       24284625//24981863//28052920//27773535//22575960//22608085
chr6:90353721-90353722(-) m6A 3'UTR       24284625//24981863//28052920//27773535//22575960//22608085
chr6:90353762-90353763(-) m6A CDS       24284625//24981863//28052920//27773535//22575960//22608085
chr6:90353782-90353783(-) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085
chr6:90353873-90353874(-) m6A CDS       24284625
chr6:90353898-90353899(-) m6A CDS       24284625
chr6:90361955-90361956(-) m6A CDS       24981863
chr6:90361970-90361971(-) m6A CDS       24981863
chr6:90362723-90362724(-) m6A CDS       24981863
chr6:90362776-90362777(-) m6A CDS       24981863//27773535//27371828
chr6:90362790-90362791(-) m6A CDS       24981863//27773535//27371828
chr6:90362811-90362812(-) m6A CDS       24981863//27773535//27371828
chr6:90362819-90362820(-) m6A CDS       24981863//27773535//27371828
chr6:90362825-90362826(-) m6A CDS       24981863//27773535//27371828
chr6:90362835-90362836(-) m6A CDS       24981863//27773535//27371828
chr6:90362844-90362845(-) m6A CDS       24981863//27773535//27371828
chr6:90363968-90363969(-) m6A CDS       24209618//24981863//28052920//27773535//27371828//22575960//22608085
chr6:90363980-90363981(-) m6A CDS       24209618//24981863//28052920//27773535//27371828//22575960//22608085
chr6:90364007-90364008(-) Am CDS       -
chr6:90364016-90364017(-) m6A CDS       24209618//24981863//28052920//27773535//27371828//22575960
chr6:90364036-90364037(-) m6A CDS       24209618//24981863//28052920//27773535//27371828//22575960
chr6:90365488-90365489(-) m6A CDS       24209618//24981863//28052920//27773535//27371828//22575960
chr6:90365516-90365517(-) m6A CDS       24209618//24981863//28052920//27773535//27371828//22575960
chr6:90365592-90365593(-) m6A CDS       24981863//27773535//22575960
chr6:90365605-90365606(-) m6A CDS       24981863//27773535//22575960
chr6:90365672-90365673(-) m6A CDS       27773535//27371828//27773536
chr6:90366425-90366426(-) m6A CDS       27773535//27371828//27773536
chr6:90366491-90366492(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//27773536//22575960
chr6:90366517-90366518(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//27773536//22575960
chr6:90367982-90367983(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//27773536//22575960
chr6:90367991-90367992(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//27773536//22575960
chr6:90368004-90368005(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//27773536//22575960
chr6:90368069-90368070(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//27773536//22575960
chr6:90368081-90368082(-) m1A CDS       26863196
chr6:90368371-90368372(-) m1A CDS       26863196
chr6:90368389-90368390(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085
chr6:90368427-90368428(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085
chr6:90368476-90368477(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//27773536//22608085
chr6:90368561-90368562(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//27773536//22608085
chr6:90368567-90368568(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//27773536//22608085
chr6:90368599-90368600(-) m1A CDS       26863196
chr6:90368607-90368608(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//27773536//22608085
chr6:90371157-90371158(-) m1A CDS       26863196
chr6:90371172-90371173(-) m6A CDS       24284625//24981863//28052920//27773535//27371828
chr6:90371190-90371191(-) m6A CDS       24284625//24981863//27773535
chr6:90371205-90371206(-) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22608085
chr6:90371223-90371224(-) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr6:90371237-90371238(-) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr6:90371271-90371272(-) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr6:90371292-90371293(-) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr6:90371817-90371818(-) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr6:90371830-90371831(-) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr6:90371841-90371842(-) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr6:90371863-90371864(-) m1A CDS       26863196
chr6:90371905-90371906(-) m6A CDS       24209618//24981863//27773535//22608085
chr6:90371946-90371947(-) m6A CDS       24981863//28052920//27773535//22608085
chr6:90372525-90372526(-) m6A CDS       24981863//28052920//27773535//22608085
chr6:90372530-90372531(-) m6A CDS       24981863//28052920//27773535//22608085
chr6:90372539-90372540(-) m6A CDS       24981863//28052920//27773535//22608085
chr6:90372547-90372548(-) m6A CDS       24981863//28052920//27773535//22608085
chr6:90372550-90372551(-) m1A CDS       26863196
chr6:90372603-90372604(-) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr6:90372639-90372640(-) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr6:90372649-90372650(-) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr6:90374209-90374210(-) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr6:90374312-90374313(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr6:90377735-90377736(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr6:90382297-90382298(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr6:90382333-90382334(-) m6A CDS       24981863
chr6:90382984-90382985(-) m6A CDS       -
chr6:90383067-90383068(-) m6A CDS       -
chr6:90384020-90384021(-) m6A CDS       24284625//24981863
chr6:90384043-90384044(-) m6A CDS       24284625//24981863
chr6:90384055-90384056(-) m6A CDS       24284625//24981863
chr6:90384061-90384062(-) m6A CDS       24284625//24981863
chr6:90384210-90384211(-) m6A CDS       24284625
chr6:90399809-90399810(-) Cm CDS       -
chr6:90399813-90399814(-) m6A CDS       27371828
chr6:90399821-90399822(-) m6A CDS       27371828
chr6:90400412-90400413(-) m6A CDS       24981863//27371828
chr6:90400456-90400457(-) m6A CDS       24981863//27371828
chr6:90400464-90400465(-) m6A CDS       24981863//27371828
chr6:90402173-90402174(-) m6A CDS       27773535
chr6:90402198-90402199(-) m6A CDS       -
chr6:90402378-90402379(-) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//27371828//22575960//22608085
chr6:90402448-90402449(-) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chr6:90402459-90402460(-) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chr6:90405518-90405519(-) m6A CDS       25456834//27371828
chr6:90405549-90405550(-) m6A CDS       24284625//25456834//27371828//22608085
chr6:90405559-90405560(-) m6A CDS       24284625//25456834//27371828//22608085
chr6:90405612-90405613(-) m6A CDS       24284625//25456834//27371828//22608085
chr6:90466099-90466100(-) m6A CDS       24981863
chr6:90467976-90467977(-) m6A CDS       24981863
chr6:90471426-90471427(-) m6A CDS       22575960
chr6:90529398-90529399(-) m6A 5'UTR       24284625//27773536

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate MDN1
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Insoluble cytoplasm K562 cells     -
Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus Colon cancer cells     24393600
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hiv1-miR-TAR-5p
Interactor2: MDN1

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//PITA
Support Database VmiReg

Starting a new search, please wait ...