Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hiv1-miR-TAR-5p | GIT2 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0006016 | 9815 |
Organism | Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1) | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | CAT-2//CAT2//PKL |
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | GIT2 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | GIT2 |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | GIT2 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||||||||
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RNALocate | GIT2 |
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Interactor1: hiv1-miR-TAR-5p | Interactor2: GIT2 |
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Strong-Evidence | Luciferase reporter assay//Western blot | |
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Weak-Evidence | Microarray | |
Support Database | ViRBase//VmiReg |
[1]PMID | 21133815 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | 293T cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | Microarray analysis of RNA isolated from TAR transfected cells using an Affymetrix human focus array identified 18 human genes that were downregulated and 14 genes that were upregulated. Further validation of four of these genes showed possible links to apoptosis and cell survival including ERCC1 (excision repair cross complementing-group 1), PIASg (protein inhibitor of acti-vated STATg), GIT2 (GPCR interacting protein) and IER3 (intermediate early response 3). |
[2]PMID | 19220914 | Target region | None |
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Source | ViRBase//VmiReg | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | 293T cells | Interactor2 expression | None |
Description | While there was no change in the expression level between mock and TAR D transfections, ERCC1, PIAS-gama, GIT2 and IER3 were all down-regulated in the presence of TAR-WT when normalized to actin. This suggests that the TAR 5'miRNA is more likely the function. |