Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00696711

  Virus:  

Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hiv1-miR-TAR-5p:  MIMAT0006016          ATXN3:  NR_028467     

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Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hiv1-miR-TAR-5p	ATXN3
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0006016	4287
Organism	Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	AT3//ATX3//JOS//MJD//MJD1//SCA3

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	ATXN3	chr14:92528519(-) A-I      3'UTR chr14:92528538(-) A-I      3'UTR chr14:92531861(-) A-I      intronic chr14:92531856(-) A-I      intronic chr14:92531969(-) A-I      intronic chr14:92535512(-) A-I      intronic chr14:92541748(-) A-I      intronic chr14:92541738(-) A-I      intronic chr14:92526522(-) A-I      3'UTR chr14:92535983(-) A-I      intronic chr14:92535949(-) A-I      intronic chr14:92535944(-) A-I      intronic chr14:92535921(-) A-I      intronic chr14:92535920(-) A-I      intronic chr14:92535912(-) A-I      intronic chr14:92535911(-) A-I      intronic chr14:92525993(-) A-I      3'UTR chr14:92526054(-) A-I      3'UTR chr14:92526062(-) A-I      3'UTR chr14:92526124(-) A-I      3'UTR chr14:92526024(-) A-I      3'UTR chr14:92526136(-) A-I      3'UTR chr14:92526361(-) A-I      3'UTR chr14:92526412(-) A-I      3'UTR chr14:92526414(-) A-I      3'UTR chr14:92526417(-) A-I      3'UTR chr14:92535559(-) A-I      intronic chr14:92531960(-) A-I      intronic chr14:92526418(-) 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RNA Localization:

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Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hiv1-miR-TAR-5p
Interactor2: ATXN3

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg