Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00692559

  Virus:  

Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hiv1-miR-H1:  MIMAT0004480          MSTO1:  NR_046294     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hiv1-miR-H1	MSTO1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0004480	55154
Organism	Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	LST005//MMYAT//MST

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	MSTO1	chr1:155587613(+) A-I      intronic chr1:155587597(+) A-I      intronic chr1:155587596(+) A-I      intronic chr1:155590920(+) A-I      intronic chr1:155589858(+) A-I      intronic chr1:155710877(+) A-I      intronic chr1:155710094(+) A-I      intronic chr1:155710092(+) A-I      intronic chr1:155709713(+) A-I      intronic chr1:155610936(+) A-I      intronic chr1:155709711(+) A-I      intronic chr1:155590755(+) A-I      intronic chr1:155610928(+) A-I      intronic chr1:155609937(+) A-I      intronic chr1:155609848(+) A-I      intronic chr1:155591485(+) A-I      intronic chr1:155710871(+) A-I      intronic chr1:155591465(+) A-I      intronic chr1:155591394(+) A-I      intronic chr1:155591003(+) A-I      intronic chr1:155590880(+) A-I      intronic chr1:155710977(+) A-I      intronic chr1:155710143(+) A-I      intronic chr1:155590756(+) A-I      intronic chr1:155590751(+) A-I      intronic chr1:155590731(+) A-I      intronic chr1:155590583(+) A-I      intronic chr1:155590374(+) A-I      intronic chr1:155589718(+) A-I      intronic chr1:155589539(+) A-I      intronic chr1:155589538(+) A-I      intronic chr1:155710137(+) A-I      intronic chr1:155710944(+) A-I      intronic chr1:155589405(+) A-I      intronic chr1:155589394(+) A-I      intronic chr1:155589274(+) A-I      intronic chr1:155589173(+) A-I      intronic chr1:155588226(+) A-I      intronic chr1:155588201(+) A-I      intronic chr1:155710134(+) A-I      intronic chr1:155588181(+) A-I      intronic chr1:155587719(+) A-I      intronic chr1:155587671(+) A-I      intronic chr1:155587670(+) A-I      intronic chr1:155587653(+) A-I      intronic chr1:155587393(+) A-I      intronic chr1:155586724(+) A-I      intronic chr1:155588073(+) A-I      intronic chr1:155587699(+) A-I      intronic chr1:155586727(+) A-I      intronic chr1:155587724(+) A-I      intronic chr1:155590921(+) A-I      intronic chr1:155587520(+) A-I      intronic chr1:155590522(+) A-I      intronic chr1:155712977(+) A-I      intronic chr1:155586698(+) A-I      intronic chr1:155589554(+) A-I      intronic chr1:155589252(+) A-I      intronic chr1:155590482(+) A-I      intronic chr1:155589967(+) A-I      intronic chr1:155590692(+) A-I      intronic chr1:155709772(+) A-I      intronic chr1:155589258(+) A-I      intronic chr1:155710963(+) A-I      intronic chr1:155590592(+) A-I      intronic chr1:155591416(+) A-I      intronic chr1:155590294(+) A-I      intronic chr1:155589199(+) A-I      intronic chr1:155590752(+) A-I      intronic chr1:155587583(+) A-I      intronic chr1:155590139(+) A-I      intronic chr1:155712987(+) A-I      intronic chr1:155587385(+) A-I      intronic chr1:155590791(+) A-I      intronic chr1:155590512(+) A-I      intronic chr1:155589267(+) A-I      intronic chr1:155587368(+) A-I      intronic chr1:155590950(+) A-I      intronic chr1:155588043(+) A-I      intronic chr1:155586881(+) A-I      intronic chr1:155710819(+) A-I      intronic chr1:155587477(+) A-I      intronic chr1:155587598(+) A-I      intronic chr1:155591299(+) A-I      intronic chr1:155711278(+) A-I      intronic chr1:155589388(+) A-I      intronic chr1:155711425(+) A-I      intronic chr1:155589320(+) A-I      intronic chr1:155589362(+) A-I      intronic chr1:155589620(+) A-I      intronic chr1:155587795(+) A-I      intronic chr1:155587438(+) A-I      intronic chr1:155588244(+) A-I      intronic chr1:155586410(+) A-I      intronic chr1:155590206(+) A-I      intronic chr1:155591000(+) A-I      intronic chr1:155590951(+) A-I      intronic chr1:155589541(+) A-I      intronic chr1:155588110(+) A-I      intronic chr1:155590214(+) A-I      intronic chr1:155591538(+) A-I      intronic chr1:155589174(+) A-I      intronic chr1:155589194(+) A-I      intronic chr1:155590947(+) A-I      intronic chr1:155590566(+) A-I      intronic chr1:155589556(+) A-I      intronic chr1:155588049(+) A-I      intronic chr1:155590388(+) A-I      intronic chr1:155591340(+) A-I      intronic chr1:155712022(+) A-I      intronic chr1:155590243(+) A-I      intronic chr1:155589579(+) A-I      intronic chr1:155586723(+) A-I      intronic chr1:155587627(+) A-I      intronic chr1:155587437(+) A-I      intronic chr1:155590423(+) A-I      intronic chr1:155713407(+) A-I      intronic chr1:155590297(+) A-I      intronic chr1:155587737(+) A-I      intronic chr1:155591042(+) A-I      intronic chr1:155587564(+) A-I      intronic chr1:155587457(+) A-I      intronic chr1:155590253(+) A-I      intronic chr1:155587879(+) A-I      intronic chr1:155587498(+) A-I      intronic chr1:155589253(+) A-I      intronic chr1:155591406(+) A-I      intronic chr1:155587514(+) A-I      intronic chr1:155591381(+) A-I      intronic chr1:155591094(+) A-I      intronic chr1:155587713(+) A-I      intronic chr1:155710159(+) A-I      intronic chr1:155589594(+) A-I      intronic chr1:155588093(+) A-I      intronic chr1:155588220(+) A-I      intronic chr1:155587373(+) A-I      intronic chr1:155709172(+) A-I      intronic chr1:155709161(+) A-I      intronic chr1:155589910(+) A-I      intronic chr1:155591370(+) A-I      intronic chr1:155591030(+) A-I      intronic chr1:155586656(+) A-I      intronic chr1:155589587(+) A-I      intronic chr1:155588166(+) A-I      intronic chr1:155587694(+) A-I      intronic chr1:155589196(+) A-I      intronic chr1:155589575(+) A-I      intronic chr1:155589984(+) A-I      intronic chr1:155588172(+) A-I      intronic chr1:155590463(+) A-I      intronic chr1:155587521(+) A-I      intronic chr1:155590046(+) A-I      intronic chr1:155588092(+) A-I      intronic chr1:155589862(+) A-I      intronic chr1:155590960(+) A-I      intronic chr1:155589212(+) A-I      intronic chr1:155588256(+) A-I      intronic chr1:155590528(+) A-I      intronic chr1:155710118(+) A-I      intronic chr1:155589923(+) A-I      intronic chr1:155587384(+) A-I      intronic chr1:155587695(+) A-I      intronic chr1:155590732(+) A-I      intronic chr1:155590646(+) A-I      intronic chr1:155588251(+) A-I      intronic chr1:155589590(+) A-I      intronic chr1:155589558(+) A-I      intronic

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	MSTO1	chr1:155582751-155582752(+) Y 3'UTR//CDS//exon//intron       26075521 chr1:155583577-155583578(+) m6A 3'UTR//intron       24284625 chr1:155583653-155583654(+) m6A 3'UTR//intron       27773535 chr1:155584158-155584159(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085 chr1:155584196-155584197(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085 chr1:155584209-155584210(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085 chr1:155584217-155584218(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085 chr1:155584238-155584239(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085 chr1:155584266-155584267(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//22608085 chr1:155584294-155584295(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//22608085 chr1:155584318-155584319(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//22608085 chr1:155584413-155584414(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085 chr1:155584426-155584427(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863 chr1:155584534-155584535(+) m6A 3'UTR//exon       24284625 chr1:155584555-155584556(+) m6A 3'UTR//exon       24284625 chr1:155584659-155584660(+) m6A 3'UTR//exon       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hiv1-miR-H1	Exosome Jurkat-derived T cell line (J77cl20)     21505438
	MSTO1	Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)     - Ribosome HEK-293 cells     22199352

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hiv1-miR-H1
Interactor2: MSTO1

Evidence Support:

Prediction-Evidence	PITA//RNAHybrid
Support Database	VmiReg