Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00691903

  Virus:  

Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hiv1-miR-H1:  MIMAT0004480          CYFIP2:  NM_014376     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hiv1-miR-H1	CYFIP2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0004480	26999
Organism	Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	DEE65//EIEE65//PIR121

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	CYFIP2	chr5:156714975(+) A-I      intronic chr5:156732761(+) A-I      intronic chr5:156739906(+) A-I      intronic chr5:156739972(+) A-I      intronic chr5:156774256(+) A-I      intronic chr5:156774267(+) A-I      intronic chr5:156775383(+) A-I      intronic chr5:156813265(+) A-I      intronic chr5:156813293(+) A-I      intronic chr5:156813742(+) A-I      intronic chr5:156813834(+) A-I      intronic chr5:156701002(+) A-I      intronic chr5:156700110(+) A-I      intronic chr5:156700138(+) A-I      intronic chr5:156701006(+) A-I      intronic chr5:156701034(+) A-I      intronic chr5:156701090(+) A-I      intronic chr5:156704137(+) A-I      intronic chr5:156719414(+) A-I      intronic chr5:156720116(+) A-I      intronic chr5:156720182(+) A-I      intronic chr5:156720245(+) A-I      intronic chr5:156720265(+) A-I      intronic chr5:156720274(+) A-I      intronic chr5:156720348(+) A-I      intronic chr5:156725534(+) A-I      intronic chr5:156725537(+) A-I      intronic chr5:156726653(+) A-I      intronic chr5:156726654(+) A-I      intronic chr5:156726684(+) A-I      intronic chr5:156726723(+) A-I      intronic chr5:156726771(+) A-I      intronic chr5:156726790(+) A-I      intronic chr5:156726795(+) A-I      intronic chr5:156813409(+) A-I      intronic chr5:156813821(+) A-I      intronic chr5:156739920(+) A-I      intronic chr5:156813355(+) A-I      intronic chr5:156725404(+) A-I      intronic chr5:156733810(+) A-I      intronic chr5:156813325(+) A-I      intronic chr5:156813781(+) A-I      intronic chr5:156720333(+) A-I      intronic chr5:156813367(+) A-I      intronic chr5:156714903(+) A-I      intronic chr5:156739905(+) A-I      intronic chr5:156776036(+) A-I      intronic chr5:156813872(+) A-I      intronic chr5:156725576(+) A-I      intronic chr5:156723431(+) A-I      intronic chr5:156813249(+) A-I      intronic chr5:156700062(+) A-I      intronic chr5:156726750(+) A-I      intronic chr5:156732538(+) A-I      intronic chr5:156720121(+) A-I      intronic chr5:156739907(+) A-I      intronic chr5:156813418(+) A-I      intronic chr5:156719462(+) A-I      intronic chr5:156813330(+) A-I      intronic chr5:156726631(+) A-I      intronic chr5:156714833(+) A-I      intronic chr5:156725628(+) A-I      intronic chr5:156725588(+) A-I      intronic chr5:156726903(+) A-I      intronic chr5:156813326(+) A-I      intronic chr5:156719374(+) A-I      intronic chr5:156719292(+) A-I      intronic chr5:156733797(+) A-I      intronic chr5:156813319(+) A-I      intronic chr5:156733769(+) A-I      intronic chr5:156725444(+) A-I      intronic chr5:156733845(+) A-I      intronic chr5:156732732(+) A-I      intronic chr5:156733847(+) A-I      intronic chr5:156732612(+) A-I      intronic chr5:156714892(+) A-I      intronic chr5:156728714(+) A-I      intronic chr5:156732803(+) A-I      intronic chr5:156813411(+) A-I      intronic chr5:156720134(+) A-I      intronic chr5:156775904(+) A-I      intronic chr5:156813808(+) A-I      intronic chr5:156813873(+) A-I      intronic chr5:156733680(+) A-I      intronic chr5:156720169(+) A-I      intronic chr5:156774220(+) A-I      intronic chr5:156725483(+) A-I      intronic chr5:156714941(+) A-I      intronic chr5:156813300(+) A-I      intronic chr5:156720194(+) A-I      intronic chr5:156726789(+) A-I      intronic chr5:156720341(+) A-I      intronic chr5:156776054(+) A-I      intronic chr5:156739904(+) A-I      intronic chr5:156725477(+) A-I      intronic chr5:156720084(+) A-I      intronic chr5:156732569(+) A-I      intronic chr5:156733740(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	CYFIP2	chr5:156736808(+) A-I exon CDS    19478186 chr5:156813325(+) A-I intron -    22327324 chr5:156813821(+) A-I intron -    22327324 chr5:156714833(+) A-G intron -    22484847 chr5:156714848(+) C-T intron -    22484847 chr5:156714892(+) A-G intron -    22484847 chr5:156714901(+) A-G intron -    22484847 chr5:156719309(+) A-G intron -    22484847 chr5:156719374(+) A-G intron -    22484847 chr5:156720121(+) A-G intron -    22484847 chr5:156720134(+) A-G intron -    22484847 chr5:156720169(+) A-G intron -    22484847 chr5:156720210(+) A-C intron -    22484847 chr5:156725439(+) A-G intron -    22484847 chr5:156725477(+) A-G intron -    22484847 chr5:156725483(+) A-G intron -    22484847 chr5:156725576(+) A-G intron -    22484847 chr5:156725588(+) A-G intron -    22484847 chr5:156725589(+) A-G intron -    22484847 chr5:156726631(+) A-G intron -    22484847 chr5:156726750(+) A-G intron -    22484847 chr5:156726789(+) A-G intron -    22484847 chr5:156726811(+) T-G intron -    22484847 chr5:156726836(+) A-G intron -    22484847 chr5:156732612(+) A-G intron -    22484847 chr5:156732723(+) A-G intron -    22484847 chr5:156732732(+) A-G intron -    22484847 chr5:156733680(+) A-G intron -    22484847 chr5:156739904(+) A-G intron -    22484847 chr5:156739905(+) A-G intron -    22484847 chr5:156739907(+) A-G intron -    22484847 chr5:156739920(+) A-G intron -    22484847 chr5:156742990(+) C-T intron -    22484847 chr5:156774220(+) A-G intron -    22484847 chr5:156813249(+) A-G intron -    22484847 chr5:156813295(+) A-G intron -    22484847 chr5:156813300(+) A-G intron -    22484847 chr5:156813319(+) A-G intron -    22484847 chr5:156813325(+) A-G intron -    22484847 chr5:156813330(+) A-G intron -    22484847 chr5:156813367(+) A-G intron -    22484847 chr5:156813781(+) A-G intron -    22484847 chr5:156813821(+) A-G intron -    22484847 chr5:156813872(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	CYFIP2	chr5:156693188-156693189(+) m6A 5'UTR//exon       24981863//27371828 chr5:156693242-156693243(+) m6A 5'UTR//intron       24981863 chr5:156704176-156704177(+) m6A 5'UTR//intron       24981863 chr5:156712362-156712363(+) m6A 5'UTR//exon       24981863 chr5:156712414-156712415(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       24981863 chr5:156714043-156714044(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       24981863 chr5:156714052-156714053(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       24981863 chr5:156721811-156721812(+) m6A 3'UTR//5'UTR//CDS//exon//intron       - chr5:156766131-156766132(+) m6A CDS//exon       - chr5:156766213-156766214(+) m6A CDS//exon       - chr5:156766218-156766219(+) m6A CDS//exon       - chr5:156768087-156768088(+) m6A CDS//exon       24981863 chr5:156768110-156768111(+) m6A CDS       24981863 chr5:156768121-156768122(+) m6A CDS       24981863 chr5:156786138-156786139(+) Am CDS       - chr5:156819886-156819887(+) m6A CDS//exon       24209618//24981863//26404942//22608085 chr5:156819910-156819911(+) m6A CDS//exon       24209618//24981863//26404942//22608085 chr5:156819933-156819934(+) m6A CDS//exon       24209618//24981863//26404942//22608085 chr5:156819937-156819938(+) m6A CDS//exon       - chr5:156820024-156820025(+) m6A 3'UTR//exon       24209618//25456834//24981863//26404942//22608085 chr5:156820095-156820096(+) m6A 3'UTR//exon       24209618//25456834//24981863//26404942//22608085 chr5:156820111-156820112(+) m6A 3'UTR//exon       24209618//25456834//24981863//26404942//22608085 chr5:156820119-156820120(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863//26404942//22608085 chr5:156820135-156820136(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863//26404942//22608085 chr5:156820236-156820237(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863//22608085 chr5:156820285-156820286(+) m6A 3'UTR       24209618//24981863 chr5:156820345-156820346(+) m6A 3'UTR       24209618//24981863//22608085 chr5:156820362-156820363(+) m6A 3'UTR       24209618//25456834//24981863//22608085 chr5:156820397-156820398(+) m6A 3'UTR       24209618//25456834//24981863 chr5:156820410-156820411(+) m6A 3'UTR       24209618//25456834//24981863 chr5:156820417-156820418(+) m6A 3'UTR       24209618//25456834//24981863 chr5:156820912-156820913(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hiv1-miR-H1	Exosome Jurkat-derived T cell line (J77cl20)     21505438
	CYFIP2	Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells     - Ribosome HEK-293 cells     22199352 Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hiv1-miR-H1
Interactor2: CYFIP2

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PITA//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg