Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hiv1-miR-H1 | AATF |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0004480 | 26574 |
Organism | Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1) | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | BFR2//CHE-1//CHE1//DED |
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | AATF |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | AATF |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | AATF |
|
Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID |
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RNALocate | hiv1-miR-H1 | |||
AATF |
Interactor1: hiv1-miR-H1 | Interactor2: AATF |
---|
Strong-Evidence | RT-PCR//Western blot | |
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Support Database | ViRBase |
[1]PMID | 19082544 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | Human blood mononuclear cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | The results of these experiments revealed that: (a) HIV-1 genome-encoded matured miRNA was able to suppress selectively and specifically cellular AATF protein expression by about 80% as compared to the corresponding control (Fig.1). |
[2]PMID | 21133815 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | Human blood mononuclear cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | MiR-H1 has been demonstrated to degrade the apoptosis antagonizing transcription factor (AATF) gene product[41]. |
[3]PMID | 22936931 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | Human blood mononuclear cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | Table 1 includes the RNAi pathway related gene products that are targeted by HIV-1 microRNAs. List of published HIV-1 microRNAs and their target HIV-1 and cellular gene products.The target interactions of HIV-1 microRNAs with its mRNA seem to function as viral genome regulators. |