Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00689177

  Virus:  

Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hiv1-miR-H1:           MEF2D:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hiv1-miR-H1 MEF2D
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0004480 4209
Organism Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - -

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR MEF2D
chr1:156439610(-) A-I      intronic
chr1:156442987(-) A-I      intronic
chr1:156442986(-) A-I      intronic
chr1:156442981(-) A-I      intronic
chr1:156442974(-) A-I      intronic
chr1:156439602(-) A-I      intronic
chr1:156439621(-) A-I      intronic
chr1:156444141(-) A-I      intronic
chr1:156442942(-) A-I      intronic
chr1:156439565(-) A-I      intronic
chr1:156439592(-) A-I      intronic
chr1:156439595(-) A-I      intronic
chr1:156442915(-) A-I      intronic
chr1:156442921(-) A-I      intronic
chr1:156442927(-) A-I      intronic
chr1:156440886(-) A-I      intronic
chr1:156440135(-) A-I      intronic
chr1:156440129(-) A-I      intronic
chr1:156439246(-) A-I      intronic
chr1:156440124(-) A-I      intronic
chr1:156439634(-) A-I      intronic
chr1:156439282(-) A-I      intronic
chr1:156439217(-) A-I      intronic
chr1:156439662(-) A-I      intronic
chr1:156439317(-) A-I      intronic
chr1:156441099(-) A-I      intronic
chr1:156439628(-) A-I      intronic
chr1:156439063(-) A-I      intronic
chr1:156442989(-) A-I      intronic
chr1:156441060(-) A-I      intronic
chr1:156443035(-) A-I      intronic
chr1:156443041(-) A-I      intronic
chr1:156442912(-) A-I      intronic
chr1:156440905(-) A-I      intronic
chr1:156440125(-) A-I      intronic
chr1:156444036(-) A-I      intronic
chr1:156444075(-) A-I      intronic
chr1:156442895(-) A-I      intronic
chr1:156439616(-) A-I      intronic
chr1:156442870(-) A-I      intronic
chr1:156442630(-) A-I      intronic
chr1:156439438(-) A-I      intronic
chr1:156441043(-) A-I      intronic
chr1:156440883(-) A-I      intronic
chr1:156439139(-) A-I      intronic
chr1:156440924(-) A-I      intronic
chr1:156441142(-) A-I      intronic
chr1:156444078(-) A-I      intronic
chr1:156439596(-) A-I      intronic
chr1:156439048(-) A-I      intronic
chr1:156439135(-) A-I      intronic
chr1:156444428(-) A-I      intronic
chr1:156440944(-) A-I      intronic
chr1:156444228(-) A-I      intronic
chr1:156440953(-) A-I      intronic
chr1:156444037(-) A-I      intronic
chr1:156442774(-) A-I      intronic
chr1:156442569(-) A-I      intronic
chr1:156442703(-) A-I      intronic
chr1:156442790(-) A-I      intronic
chr1:156444184(-) A-I      intronic
chr1:156441093(-) A-I      intronic
chr1:156442973(-) A-I      intronic
chr1:156439556(-) A-I      intronic
chr1:156444129(-) A-I      intronic
chr1:156440142(-) A-I      intronic
chr1:156444010(-) A-I      intronic
chr1:156440055(-) A-I      intronic
chr1:156442505(-) A-I      intronic
chr1:156444117(-) A-I      intronic
chr1:156440032(-) A-I      intronic
chr1:156439182(-) A-I      intronic
chr1:156439263(-) A-I      intronic
chr1:156439591(-) A-I      intronic
chr1:156441087(-) A-I      intronic
chr1:156439117(-) A-I      intronic
chr1:156440110(-) A-I      intronic
chr1:156444406(-) A-I      intronic
chr1:156439188(-) A-I      intronic
chr1:156439514(-) A-I      intronic
chr1:156439322(-) A-I      intronic
chr1:156440913(-) A-I      intronic
chr1:156439249(-) A-I      intronic
chr1:156442948(-) A-I      intronic
chr1:156442964(-) A-I      intronic
chr1:156439147(-) A-I      intronic
chr1:156440149(-) A-I      intronic
chr1:156439578(-) A-I      intronic
chr1:156442640(-) A-I      intronic
chr1:156442479(-) A-I      intronic
chr1:156444001(-) A-I      intronic
chr1:156440015(-) A-I      intronic
chr1:156439218(-) A-I      intronic
chr1:156440014(-) A-I      intronic
chr1:156439187(-) A-I      intronic
chr1:156443992(-) A-I      intronic
chr1:156441006(-) A-I      intronic
chr1:156444566(-) A-I      intronic
chr1:156444197(-) A-I      intronic
chr1:156439437(-) A-I      intronic
chr1:156444023(-) A-I      intronic
chr1:156439436(-) A-I      intronic
chr1:156444588(-) A-I      intronic
chr1:156440049(-) A-I      intronic
chr1:156440064(-) A-I      intronic
chr1:156439112(-) A-I      intronic
chr1:156455649(-) A-I      intronic
chr1:156442639(-) A-I      intronic
chr1:156455370(-) A-I      intronic
chr1:156443080(-) A-I      intronic
chr1:156441716(-) A-I      intronic
chr1:156439110(-) A-I      intronic
chr1:156441141(-) A-I      intronic
chr1:156440089(-) A-I      intronic
chr1:156442954(-) A-I      intronic
chr1:156442931(-) A-I      intronic
chr1:156442978(-) A-I      intronic
chr1:156439214(-) A-I      intronic
chr1:156443998(-) A-I      intronic
chr1:156444058(-) A-I      intronic
chr1:156444474(-) A-I      intronic
chr1:156439174(-) A-I      intronic
chr1:156440111(-) A-I      intronic
chr1:156442775(-) A-I      intronic
chr1:156440976(-) A-I      intronic
chr1:156440208(-) A-I      intronic
chr1:156439626(-) A-I      intronic
chr1:156444093(-) A-I      intronic
chr1:156439171(-) A-I      intronic
chr1:156440046(-) A-I      intronic
chr1:156440065(-) A-I      intronic
chr1:156439178(-) A-I      intronic
chr1:156444215(-) A-I      intronic
chr1:156443017(-) A-I      intronic
chr1:156441019(-) A-I      intronic
chr1:156440923(-) A-I      intronic
chr1:156440959(-) A-I      intronic
chr1:156439645(-) A-I      intronic
chr1:156439566(-) A-I      intronic
chr1:156442992(-) A-I      intronic
chr1:156440205(-) A-I      intronic
chr1:156439661(-) A-I      intronic
chr1:156440048(-) A-I      intronic
chr1:156442958(-) A-I      intronic
chr1:156444154(-) A-I      intronic
chr1:156439244(-) A-I      intronic
chr1:156445613(-) A-I      intronic
chr1:156439609(-) A-I      intronic
chr1:156444178(-) A-I      intronic
chr1:156442882(-) A-I      intronic
chr1:156441063(-) A-I      intronic
chr1:156440885(-) A-I      intronic
chr1:156440087(-) A-I      intronic
chr1:156439464(-) A-I      intronic
chr1:156440699(-) A-I      intronic
chr1:156444038(-) A-I      intronic
chr1:156440154(-) A-I      intronic
chr1:156439161(-) A-I      intronic
chr1:156444092(-) A-I      intronic
chr1:156442650(-) A-I      intronic
chr1:156444069(-) A-I      intronic
chr1:156444550(-) A-I      intronic
chr1:156443079(-) A-I      intronic
chr1:156442351(-) A-I      intronic
chr1:156439118(-) A-I      intronic
chr1:156441030(-) A-I      intronic
chr1:156444159(-) A-I      intronic
chr1:156439463(-) A-I      intronic
chr1:156440173(-) A-I      intronic
chr1:156441119(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED MEF2D
chr1:156439187(-) A-I intron -    21960545   //22327324
chr1:156439578(-) A-I intron -    21960545   //22327324
chr1:156439556(-) A-I intron -    21960545
chr1:156444058(-) A-I intron -    21960545
chr1:156444159(-) A-I intron -    21960545
chr1:156439110(-) A-G intron -    22484847
chr1:156439112(-) A-G intron -    22484847
chr1:156439117(-) A-G intron -    22484847
chr1:156439118(-) A-G intron -    22484847
chr1:156439171(-) A-G intron -    22484847
chr1:156439178(-) A-G intron -    22484847
chr1:156439187(-) A-G intron -    22484847
chr1:156439188(-) A-G intron -    22484847
chr1:156439249(-) A-G intron -    22484847
chr1:156439263(-) A-G intron -    22484847
chr1:156439436(-) A-G intron -    22484847
chr1:156439437(-) A-G intron -    22484847
chr1:156439556(-) A-G intron -    22484847
chr1:156439566(-) A-G intron -    22484847
chr1:156439578(-) A-G intron -    22484847
chr1:156439591(-) A-G intron -    22484847
chr1:156439626(-) A-G intron -    22484847
chr1:156440046(-) A-G intron -    22484847
chr1:156440048(-) A-G intron -    22484847
chr1:156440049(-) A-G intron -    22484847
chr1:156440087(-) A-G intron -    22484847
chr1:156440111(-) A-G intron -    22484847
chr1:156440142(-) A-G intron -    22484847
chr1:156440154(-) A-G intron -    22484847
chr1:156440205(-) A-G intron -    22484847
chr1:156440208(-) A-G intron -    22484847
chr1:156440913(-) A-G intron -    22484847
chr1:156440923(-) A-G intron -    22484847
chr1:156440944(-) A-G intron -    22484847
chr1:156441019(-) A-G intron -    22484847
chr1:156441063(-) A-G intron -    22484847
chr1:156441093(-) A-G intron -    22484847
chr1:156441119(-) A-G intron -    22484847
chr1:156442790(-) A-G intron -    22484847
chr1:156442954(-) A-G intron -    22484847
chr1:156443079(-) A-G intron -    22484847
chr1:156443080(-) A-G intron -    22484847
chr1:156444058(-) A-G intron -    22484847
chr1:156444069(-) A-G intron -    22484847
chr1:156444093(-) A-G intron -    22484847
chr1:156444159(-) A-G intron -    22484847
chr1:156444228(-) A-G intron -    22484847
chr1:156444550(-) A-G intron -    22484847
chr1:156444566(-) A-G intron -    22484847
chr1:156444588(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase MEF2D
chr1:156434181-156434182(-) m6A 3'UTR       27773535
chr1:156434225-156434226(-) m6A 3'UTR       27773535
chr1:156434251-156434252(-) m6A 3'UTR       27773535
chr1:156434266-156434267(-) m6A 3'UTR       27773535
chr1:156434343-156434344(-) m6A 3'UTR       -
chr1:156434399-156434400(-) m6A 3'UTR       -
chr1:156434412-156434413(-) m6A 3'UTR       -
chr1:156435051-156435052(-) m6A 3'UTR       24284625
chr1:156435133-156435134(-) m6A 3'UTR       24284625//27773535
chr1:156435214-156435215(-) m6A 3'UTR       24284625//27773535
chr1:156436104-156436105(-) m6A 3'UTR       27773535
chr1:156436675-156436676(-) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:156436724-156436725(-) m6A 3'UTR//intron       27773535//22575960
chr1:156436978-156436979(-) m6A 3'UTR//intron       26404942
chr1:156436984-156436985(-) m6A 3'UTR//intron       26404942
chr1:156436997-156436998(-) m6A 3'UTR//intron       26404942
chr1:156437006-156437007(-) m6A 3'UTR//intron       26404942
chr1:156437014-156437015(-) m6A 3'UTR//intron       26404942
chr1:156437872-156437873(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27773535//27371828
chr1:156437893-156437894(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//27371828
chr1:156438015-156438016(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//27773535
chr1:156446298-156446299(-) m6A CDS//intron       27773535
chr1:156446735-156446736(-) m6A exon//intron       27773535
chr1:156446751-156446752(-) m6A exon//intron       27773535
chr1:156446927-156446928(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773535
chr1:156450677-156450678(-) m6A CDS//intron       27371828
chr1:156450697-156450698(-) m6A CDS//intron       27371828
chr1:156450707-156450708(-) m6A CDS//intron       27371828
chr1:156452298-156452299(-) m6A CDS       27773535//27371828
chr1:156453037-156453038(-) m6A CDS       27773535
chr1:156453096-156453097(-) m6A 5'UTR       27773535
chr1:156453137-156453138(-) m6A 5'UTR       27773535
chr1:156453170-156453171(-) m6A 5'UTR       24284625//27773535
chr1:156453188-156453189(-) m6A 5'UTR       24284625//27773535
chr1:156453195-156453196(-) m6A 5'UTR       24284625//27773535
chr1:156460332-156460333(-) m6A 5'UTR//intron       24284625//27773535
chr1:156460349-156460350(-) m6A 5'UTR//intron       24284625//27773535
chr1:156460380-156460381(-) m6A 5'UTR//intron       24284625

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hiv1-miR-H1
Exosome Jurkat-derived T cell line (J77cl20)     21505438
MEF2D
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hiv1-miR-H1
Interactor2: MEF2D

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda//PITA//Targetscan
Support Database RepTar//VmiReg

Starting a new search, please wait ...