Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00686429

  Virus:  

Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hiv1-miR-N367:           FNDC3B:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hiv1-miR-N367 FNDC3B
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0004478 64778
Organism Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - FAD104//PRO4979//YVTM2421

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR FNDC3B
chr3:172096177(+) A-I      Syn:Ser->Ser
chr3:172096162(+) A-I      Syn:Gly->Gly
chr3:172096151(+) A-I      NonSyn:Ser->Gly
chr3:172096203(+) A-I      NonSyn:Lys->Arg
chr3:172033033(+) A-I      intronic
chr3:172033028(+) A-I      intronic
chr3:171768379(+) A-I      intronic
chr3:171768930(+) A-I      intronic
chr3:171768991(+) A-I      intronic
chr3:171768992(+) A-I      intronic
chr3:171769013(+) A-I      intronic
chr3:171771333(+) A-I      intronic
chr3:171771397(+) A-I      intronic
chr3:171771400(+) A-I      intronic
chr3:171771402(+) A-I      intronic
chr3:171771441(+) A-I      intronic
chr3:171771442(+) A-I      intronic
chr3:171771473(+) A-I      intronic
chr3:171832434(+) A-I      intronic
chr3:171832444(+) A-I      intronic
chr3:171845550(+) A-I      intronic
chr3:172104802(+) A-I      intronic
chr3:172104805(+) A-I      intronic
chr3:172104927(+) A-I      intronic
chr3:172104990(+) A-I      intronic
chr3:172033006(+) A-I      intronic
chr3:172032960(+) A-I      intronic
chr3:172032903(+) A-I      intronic
chr3:171999116(+) A-I      intronic
chr3:171999115(+) A-I      intronic
chr3:171999105(+) A-I      intronic
chr3:171999097(+) A-I      intronic
chr3:171997902(+) A-I      intronic
chr3:171997844(+) A-I      intronic
chr3:171997834(+) A-I      intronic
chr3:171997817(+) A-I      intronic
chr3:171997773(+) A-I      intronic
chr3:171845585(+) A-I      intronic
chr3:171848956(+) A-I      intronic
chr3:171848960(+) A-I      intronic
chr3:171849024(+) A-I      intronic
chr3:171849030(+) A-I      intronic
chr3:171849089(+) A-I      intronic
chr3:171854590(+) A-I      intronic
chr3:171865017(+) A-I      intronic
chr3:171997754(+) A-I      intronic
chr3:171996602(+) A-I      intronic
chr3:171996596(+) A-I      intronic
chr3:171854627(+) A-I      intronic
chr3:171854709(+) A-I      intronic
chr3:171854718(+) A-I      intronic
chr3:171855178(+) A-I      intronic
chr3:171855280(+) A-I      intronic
chr3:171855285(+) A-I      intronic
chr3:171855341(+) A-I      intronic
chr3:171855361(+) A-I      intronic
chr3:171855391(+) A-I      intronic
chr3:171857624(+) A-I      intronic
chr3:171857685(+) A-I      intronic
chr3:171861445(+) A-I      intronic
chr3:171861523(+) A-I      intronic
chr3:171861538(+) A-I      intronic
chr3:171861541(+) A-I      intronic
chr3:171863743(+) A-I      intronic
chr3:171863749(+) A-I      intronic
chr3:172057262(+) A-I      intronic
chr3:172057253(+) A-I      intronic
chr3:172057247(+) A-I      intronic
chr3:172033963(+) A-I      intronic
chr3:172033955(+) A-I      intronic
chr3:171864820(+) A-I      intronic
chr3:171864846(+) A-I      intronic
chr3:171864862(+) A-I      intronic
chr3:171864867(+) A-I      intronic
chr3:171865049(+) A-I      intronic
chr3:171867809(+) A-I      intronic
chr3:171867811(+) A-I      intronic
chr3:171867881(+) A-I      intronic
chr3:171876798(+) A-I      intronic
chr3:171876948(+) A-I      intronic
chr3:171876949(+) A-I      intronic
chr3:171882835(+) A-I      intronic
chr3:171882854(+) A-I      intronic
chr3:171882940(+) A-I      intronic
chr3:171882983(+) A-I      intronic
chr3:171883000(+) A-I      intronic
chr3:171855317(+) A-I      intronic
chr3:171883038(+) A-I      intronic
chr3:171883047(+) A-I      intronic
chr3:171883096(+) A-I      intronic
chr3:171884402(+) A-I      intronic
chr3:172033950(+) A-I      intronic
chr3:172033020(+) A-I      intronic
chr3:172033017(+) A-I      intronic
chr3:171980483(+) A-I      intronic
chr3:171948107(+) A-I      intronic
chr3:171948106(+) A-I      intronic
chr3:171948076(+) A-I      intronic
chr3:171948063(+) A-I      intronic
chr3:171884408(+) A-I      intronic
chr3:171884430(+) A-I      intronic
chr3:171897485(+) A-I      intronic
chr3:172111888(+) A-I      intronic
chr3:172111853(+) A-I      intronic
chr3:172111823(+) A-I      intronic
chr3:171884930(+) A-I      intronic
chr3:171884931(+) A-I      intronic
chr3:171885111(+) A-I      intronic
chr3:171891335(+) A-I      intronic
chr3:171891338(+) A-I      intronic
chr3:171891474(+) A-I      intronic
chr3:171896895(+) A-I      intronic
chr3:171896969(+) A-I      intronic
chr3:171897511(+) A-I      intronic
chr3:171943103(+) A-I      intronic
chr3:171883021(+) A-I      intronic
chr3:172058155(+) A-I      intronic
chr3:172057278(+) A-I      intronic
chr3:172057107(+) A-I      intronic
chr3:172057092(+) A-I      intronic
chr3:172057090(+) A-I      intronic
chr3:172056734(+) A-I      intronic
chr3:172056663(+) A-I      intronic
chr3:172056591(+) A-I      intronic
chr3:172041137(+) A-I      intronic
chr3:172041135(+) A-I      intronic
chr3:171897623(+) A-I      intronic
chr3:172105116(+) A-I      intronic
chr3:172105123(+) A-I      intronic
chr3:171897630(+) A-I      intronic
chr3:171906255(+) A-I      intronic
chr3:171906300(+) A-I      intronic
chr3:171906313(+) A-I      intronic
chr3:171908538(+) A-I      intronic
chr3:171908559(+) A-I      intronic
chr3:171908563(+) A-I      intronic
chr3:171908624(+) A-I      intronic
chr3:171908625(+) A-I      intronic
chr3:171909361(+) A-I      intronic
chr3:172039646(+) A-I      intronic
chr3:172039374(+) A-I      intronic
chr3:172035248(+) A-I      intronic
chr3:172035236(+) A-I      intronic
chr3:171764241(+) A-I      intronic
chr3:172035157(+) A-I      intronic
chr3:172035150(+) A-I      intronic
chr3:172035126(+) A-I      intronic
chr3:171996580(+) A-I      intronic
chr3:171909484(+) A-I      intronic
chr3:171910006(+) A-I      intronic
chr3:171910080(+) A-I      intronic
chr3:171910182(+) A-I      intronic
chr3:171910249(+) A-I      intronic
chr3:171911761(+) A-I      intronic
chr3:172035103(+) A-I      intronic
chr3:171911772(+) A-I      intronic
chr3:171911844(+) A-I      intronic
chr3:171911850(+) A-I      intronic
chr3:171911889(+) A-I      intronic
chr3:171911895(+) A-I      intronic
chr3:172033897(+) A-I      intronic
chr3:171996570(+) A-I      intronic
chr3:171996564(+) A-I      intronic
chr3:171996561(+) A-I      intronic
chr3:171980584(+) A-I      intronic
chr3:172111807(+) A-I      intronic
chr3:172111804(+) A-I      intronic
chr3:172111777(+) A-I      intronic
chr3:172111751(+) A-I      intronic
chr3:172033862(+) A-I      intronic
chr3:172033112(+) A-I      intronic
chr3:171768273(+) A-I      intronic
chr3:172111736(+) A-I      intronic
chr3:172111719(+) A-I      intronic
chr3:172111687(+) A-I      intronic
chr3:172105008(+) A-I      intronic
chr3:172104382(+) A-I      intronic
chr3:172057264(+) A-I      intronic
chr3:171980514(+) A-I      intronic
chr3:171980511(+) A-I      intronic
chr3:171980492(+) A-I      intronic
chr3:171980491(+) A-I      intronic
chr3:172107438(+) A-I      intronic
chr3:172107498(+) A-I      intronic
chr3:172107519(+) A-I      intronic
chr3:172110773(+) A-I      intronic
chr3:172111637(+) A-I      intronic
chr3:172111644(+) A-I      intronic
chr3:172111649(+) A-I      intronic
chr3:172111674(+) A-I      intronic
chr3:171955995(+) A-I      intronic
chr3:171914734(+) A-I      intronic
chr3:171911764(+) A-I      intronic
chr3:171914118(+) A-I      intronic
chr3:171914034(+) A-I      intronic
chr3:171914029(+) A-I      intronic
chr3:171911997(+) A-I      intronic
chr3:171911899(+) A-I      intronic
chr3:172111679(+) A-I      intronic
chr3:172111688(+) A-I      intronic
chr3:172111718(+) A-I      intronic
chr3:172111748(+) A-I      intronic
chr3:172104982(+) A-I      intronic
chr3:172033056(+) A-I      intronic
chr3:172033046(+) A-I      intronic
chr3:172058176(+) A-I      intronic
chr3:172058215(+) A-I      intronic
chr3:172058217(+) A-I      intronic
chr3:172067027(+) A-I      intronic
chr3:172068558(+) A-I      intronic
chr3:172068572(+) A-I      intronic
chr3:172068575(+) A-I      intronic
chr3:172068587(+) A-I      intronic
chr3:172104321(+) A-I      intronic
chr3:172104345(+) A-I      intronic
chr3:172104366(+) A-I      intronic
chr3:172104378(+) A-I      intronic
chr3:172104380(+) A-I      intronic
chr3:172104401(+) A-I      intronic
chr3:172104405(+) A-I      intronic
chr3:172104506(+) A-I      intronic
chr3:171846549(+) A-I      intronic
chr3:172102642(+) A-I      intronic
chr3:171885059(+) A-I      intronic
chr3:171817714(+) A-I      intronic
chr3:171768303(+) A-I      intronic
chr3:171769898(+) A-I      intronic
chr3:171828687(+) A-I      intronic
chr3:171840898(+) A-I      intronic
chr3:171840903(+) A-I      intronic
chr3:171850273(+) A-I      intronic
chr3:172118896(+) A-I      3'UTR
chr3:172118923(+) A-I      3'UTR
chr3:172104381(+) A-I      intronic
chr3:172110660(+) A-I      intronic
chr3:172104349(+) A-I      intronic
chr3:171863703(+) A-I      intronic
chr3:171880981(+) A-I      intronic
chr3:171855244(+) A-I      intronic
chr3:172104944(+) A-I      intronic
chr3:172057287(+) A-I      intronic
chr3:171910243(+) A-I      intronic
chr3:171867632(+) A-I      intronic
chr3:172057259(+) A-I      intronic
chr3:171828739(+) A-I      intronic
chr3:172035156(+) A-I      intronic
chr3:172104411(+) A-I      intronic
chr3:172058276(+) A-I      intronic
chr3:171864843(+) A-I      intronic
chr3:172041183(+) A-I      intronic
chr3:171872279(+) A-I      intronic
chr3:171863769(+) A-I      intronic
chr3:171855348(+) A-I      intronic
chr3:171980620(+) A-I      intronic
chr3:172104421(+) A-I      intronic
chr3:171849022(+) A-I      intronic
chr3:171914709(+) A-I      intronic
chr3:171884446(+) A-I      intronic
chr3:171905493(+) A-I      intronic
chr3:171897126(+) A-I      intronic
chr3:171899540(+) A-I      intronic
chr3:171897438(+) A-I      intronic
chr3:171854626(+) A-I      intronic
chr3:171883052(+) A-I      intronic
chr3:171997914(+) A-I      intronic
chr3:172104278(+) A-I      intronic
chr3:172057188(+) A-I      intronic
chr3:171880849(+) A-I      intronic
chr3:171884424(+) A-I      intronic
chr3:172103622(+) A-I      intronic
chr3:172104385(+) A-I      intronic
chr3:172056666(+) A-I      intronic
chr3:172086807(+) A-I      intronic
chr3:171897423(+) A-I      intronic
chr3:172105026(+) A-I      intronic
chr3:171802143(+) A-I      intronic
chr3:171771557(+) A-I      intronic
chr3:171882933(+) A-I      intronic
chr3:171768354(+) A-I      intronic
chr3:172057233(+) A-I      intronic
chr3:171914091(+) A-I      intronic
chr3:171914718(+) A-I      intronic
chr3:171864985(+) A-I      intronic
chr3:171896979(+) A-I      intronic
chr3:171996597(+) A-I      intronic
chr3:171855296(+) A-I      intronic
chr3:171855260(+) A-I      intronic
chr3:171896888(+) A-I      intronic
chr3:171768205(+) A-I      intronic
chr3:171855342(+) A-I      intronic
chr3:171906296(+) A-I      intronic
chr3:172104876(+) A-I      intronic
chr3:171928274(+) A-I      intronic
chr3:171943974(+) A-I      intronic
chr3:171980662(+) A-I      intronic
chr3:171924328(+) A-I      intronic
chr3:171861446(+) A-I      intronic
chr3:172104766(+) A-I      intronic
chr3:171864886(+) A-I      intronic
chr3:171850300(+) A-I      intronic
chr3:172045401(+) A-I      intronic
chr3:171943943(+) A-I      intronic
chr3:171883022(+) A-I      intronic
chr3:171910092(+) A-I      intronic
chr3:172033927(+) A-I      intronic
chr3:172066967(+) A-I      intronic
chr3:172104846(+) A-I      intronic
chr3:171768974(+) A-I      intronic
chr3:171883034(+) A-I      intronic
chr3:171855189(+) A-I      intronic
chr3:171910063(+) A-I      intronic
chr3:171854692(+) A-I      intronic
chr3:172057206(+) A-I      intronic
chr3:172056743(+) A-I      intronic
chr3:171884928(+) A-I      intronic
chr3:171897486(+) A-I      intronic
chr3:171996674(+) A-I      intronic
chr3:171863684(+) A-I      intronic
chr3:171882921(+) A-I      intronic
chr3:171883009(+) A-I      intronic
chr3:172041180(+) A-I      intronic
chr3:171897434(+) A-I      intronic
chr3:171909318(+) A-I      intronic
chr3:171897439(+) A-I      intronic
chr3:171880986(+) A-I      intronic
chr3:172054681(+) A-I      intronic
chr3:171768357(+) A-I      intronic
chr3:171864920(+) A-I      intronic
chr3:171896875(+) A-I      intronic
chr3:172056692(+) A-I      intronic
chr3:171906299(+) A-I      intronic
chr3:171879806(+) A-I      intronic
chr3:172057200(+) A-I      intronic
chr3:172057242(+) A-I      intronic
chr3:172056607(+) A-I      intronic
chr3:172037908(+) A-I      intronic
chr3:171897562(+) A-I      intronic
chr3:171897032(+) A-I      intronic
chr3:171910174(+) A-I      intronic
chr3:172104912(+) A-I      intronic
chr3:172104873(+) A-I      intronic
chr3:171828768(+) A-I      intronic
chr3:171854651(+) A-I      intronic
chr3:171928271(+) A-I      intronic
chr3:171882889(+) A-I      intronic
chr3:172033891(+) A-I      intronic
chr3:171999122(+) A-I      intronic
chr3:171771542(+) A-I      intronic
chr3:172056691(+) A-I      intronic
chr3:172107445(+) A-I      intronic
chr3:171854657(+) A-I      intronic
chr3:172045217(+) A-I      intronic
chr3:171855284(+) A-I      intronic
chr3:171916893(+) A-I      intronic
chr3:171768192(+) A-I      intronic
chr3:171879867(+) A-I      intronic
chr3:171771556(+) A-I      intronic
chr3:171896869(+) A-I      intronic
chr3:171896991(+) A-I      intronic
chr3:172057255(+) A-I      intronic
chr3:171771482(+) A-I      intronic
chr3:172057197(+) A-I      intronic
chr3:172045271(+) A-I      intronic
chr3:171865022(+) A-I      intronic
chr3:171855325(+) A-I      intronic
chr3:172057232(+) A-I      intronic
chr3:171914892(+) A-I      intronic
chr3:171883035(+) A-I      intronic
chr3:171899508(+) A-I      intronic
chr3:171863704(+) A-I      intronic
chr3:171827036(+) A-I      intronic
chr3:171883039(+) A-I      intronic
chr3:171876816(+) A-I      intronic
chr3:171907461(+) A-I      intronic
chr3:171828782(+) A-I      intronic
chr3:172104373(+) A-I      intronic
chr3:172033867(+) A-I      intronic
chr3:172104947(+) A-I      intronic
chr3:171896952(+) A-I      intronic
chr3:171781919(+) A-I      intronic
chr3:172056788(+) A-I      intronic
chr3:171996590(+) A-I      intronic
chr3:171882878(+) A-I      intronic
chr3:172033859(+) A-I      intronic
chr3:172057175(+) A-I      intronic
chr3:171854649(+) A-I      intronic
chr3:172105088(+) A-I      intronic
chr3:171768319(+) A-I      intronic
chr3:171914860(+) A-I      intronic
chr3:172057112(+) A-I      intronic
chr3:171980576(+) A-I      intronic
chr3:171768904(+) A-I      intronic
chr3:171884447(+) A-I      intronic
chr3:172056656(+) A-I      intronic
chr3:172045376(+) A-I      intronic
chr3:172056787(+) A-I      intronic
chr3:171980622(+) A-I      intronic
chr3:171849019(+) A-I      intronic
chr3:172110683(+) A-I      intronic
chr3:172058350(+) A-I      intronic
chr3:171885075(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED FNDC3B
chr3:172104847(+) A-I intron -    22327324
chr3:172057112(+) A-I intron -    21960545
chr3:172115474(+) A-I intron -    21960545
chr3:171897552(+) A-I intron -    21960545
chr3:172104846(+) A-I intron -    21960545
chr3:171760968(+) G-A intron -    22484847
chr3:171761155(+) A-G intron -    22484847
chr3:171767364(+) G-C intron -    22484847
chr3:171767437(+) T-C intron -    22484847
chr3:171768192(+) A-G intron -    22484847
chr3:171768205(+) A-G intron -    22484847
chr3:171768291(+) A-G intron -    22484847
chr3:171768319(+) A-G intron -    22484847
chr3:171768354(+) A-G intron -    22484847
chr3:171768357(+) A-G intron -    22484847
chr3:171768904(+) A-G intron -    22484847
chr3:171768973(+) A-G intron -    22484847
chr3:171768974(+) A-G intron -    22484847
chr3:171771482(+) A-G intron -    22484847
chr3:171771542(+) A-G intron -    22484847
chr3:171771557(+) A-G intron -    22484847
chr3:171781919(+) A-G intron -    22484847
chr3:171783011(+) A-G intron -    22484847
chr3:171783036(+) T-C intron -    22484847
chr3:171827036(+) A-G intron -    22484847
chr3:171828702(+) A-G intron -    22484847
chr3:171828739(+) A-G intron -    22484847
chr3:171828782(+) A-G intron -    22484847
chr3:171849019(+) A-G intron -    22484847
chr3:171849022(+) A-G intron -    22484847
chr3:171854626(+) A-G intron -    22484847
chr3:171854649(+) A-G intron -    22484847
chr3:171854651(+) A-G intron -    22484847
chr3:171854657(+) A-G intron -    22484847
chr3:171854692(+) A-G intron -    22484847
chr3:171854717(+) A-G intron -    22484847
chr3:171855185(+) A-G intron -    22484847
chr3:171855189(+) A-G intron -    22484847
chr3:171855192(+) A-G intron -    22484847
chr3:171855284(+) A-G intron -    22484847
chr3:171859545(+) A-G intron -    22484847
chr3:171861443(+) A-G intron -    22484847
chr3:171861446(+) A-G intron -    22484847
chr3:171861578(+) A-G intron -    22484847
chr3:171863684(+) A-G intron -    22484847
chr3:171863703(+) A-G intron -    22484847
chr3:171863704(+) A-G intron -    22484847
chr3:171863733(+) A-G intron -    22484847
chr3:171863837(+) A-G intron -    22484847
chr3:171864834(+) A-G intron -    22484847
chr3:171864843(+) A-G intron -    22484847
chr3:171864886(+) A-G intron -    22484847
chr3:171864920(+) A-G intron -    22484847
chr3:171876816(+) A-G intron -    22484847
chr3:171876914(+) T-C intron -    22484847
chr3:171879806(+) A-G intron -    22484847
chr3:171880834(+) A-G intron -    22484847
chr3:171880849(+) A-G intron -    22484847
chr3:171880940(+) A-G intron -    22484847
chr3:171882878(+) A-G intron -    22484847
chr3:171882904(+) A-G intron -    22484847
chr3:171882921(+) A-G intron -    22484847
chr3:171882933(+) A-G intron -    22484847
chr3:171882997(+) A-G intron -    22484847
chr3:171883009(+) A-G intron -    22484847
chr3:171883022(+) A-G intron -    22484847
chr3:171883034(+) A-G intron -    22484847
chr3:171883039(+) A-G intron -    22484847
chr3:171883052(+) A-G intron -    22484847
chr3:171883068(+) A-G intron -    22484847
chr3:171884424(+) A-G intron -    22484847
chr3:171884446(+) A-G intron -    22484847
chr3:171884447(+) A-G intron -    22484847
chr3:171884928(+) A-G intron -    22484847
chr3:171884937(+) G-A intron -    22484847
chr3:171885031(+) A-G intron -    22484847
chr3:171885065(+) A-G intron -    22484847
chr3:171885078(+) C-T intron -    22484847
chr3:171896869(+) A-G intron -    22484847
chr3:171896875(+) A-G intron -    22484847
chr3:171896991(+) A-G intron -    22484847
chr3:171897434(+) A-G intron -    22484847
chr3:171897438(+) A-G intron -    22484847
chr3:171897526(+) A-G intron -    22484847
chr3:171897552(+) A-G intron -    22484847
chr3:171906296(+) A-G intron -    22484847
chr3:171906299(+) A-G intron -    22484847
chr3:171906377(+) G-A intron -    22484847
chr3:171909318(+) A-G intron -    22484847
chr3:171910174(+) A-G intron -    22484847
chr3:171910243(+) A-G intron -    22484847
chr3:171911756(+) A-G intron -    22484847
chr3:171914091(+) A-G intron -    22484847
chr3:171914113(+) A-G intron -    22484847
chr3:171914709(+) A-G intron -    22484847
chr3:171914718(+) A-G intron -    22484847
chr3:171916893(+) A-G intron -    22484847
chr3:171928274(+) A-G intron -    22484847
chr3:171934338(+) G-A intron -    22484847
chr3:171943943(+) A-G intron -    22484847
chr3:171943974(+) A-G intron -    22484847
chr3:171964442(+) T-C intron -    22484847
chr3:171996590(+) A-G intron -    22484847
chr3:171996597(+) A-G intron -    22484847
chr3:171996632(+) G-T intron -    22484847
chr3:171996674(+) A-G intron -    22484847
chr3:171997850(+) A-G intron -    22484847
chr3:172033116(+) A-G intron -    22484847
chr3:172033859(+) A-G intron -    22484847
chr3:172033867(+) A-G intron -    22484847
chr3:172033891(+) A-G intron -    22484847
chr3:172035043(+) A-G intron -    22484847
chr3:172035156(+) A-G intron -    22484847
chr3:172035181(+) A-G intron -    22484847
chr3:172055539(+) A-G intron -    22484847
chr3:172055540(+) A-G intron -    22484847
chr3:172055716(+) A-G intron -    22484847
chr3:172055860(+) A-G intron -    22484847
chr3:172055895(+) A-G intron -    22484847
chr3:172055933(+) G-A intron -    22484847
chr3:172056606(+) A-G intron -    22484847
chr3:172056607(+) A-G intron -    22484847
chr3:172056691(+) A-G intron -    22484847
chr3:172056692(+) A-G intron -    22484847
chr3:172056787(+) A-G intron -    22484847
chr3:172056788(+) A-G intron -    22484847
chr3:172057112(+) A-G intron -    22484847
chr3:172057206(+) A-G intron -    22484847
chr3:172057232(+) A-G intron -    22484847
chr3:172057233(+) A-G intron -    22484847
chr3:172057259(+) A-G intron -    22484847
chr3:172057298(+) A-G intron -    22484847
chr3:172058276(+) A-G intron -    22484847
chr3:172064546(+) G-T intron -    22484847
chr3:172079717(+) T-C intron -    22484847
chr3:172079720(+) T-C intron -    22484847
chr3:172086646(+) C-T intron -    22484847
chr3:172104349(+) A-G intron -    22484847
chr3:172104385(+) A-G intron -    22484847
chr3:172104411(+) A-G intron -    22484847
chr3:172104800(+) A-G intron -    22484847
chr3:172104816(+) A-G intron -    22484847
chr3:172104846(+) A-G intron -    22484847
chr3:172104847(+) A-G intron -    22484847
chr3:172104876(+) A-G intron -    22484847
chr3:172104888(+) A-G intron -    22484847
chr3:172104912(+) A-G intron -    22484847
chr3:172104944(+) A-G intron -    22484847
chr3:172104947(+) A-G intron -    22484847
chr3:172105088(+) A-G intron -    22484847
chr3:172110660(+) A-G intron -    22484847
chr3:172110683(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase FNDC3B
chr3:171764717-171764718(+) m6A 5'UTR//intron       24209618
chr3:171965498-171965499(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//26404942//27773535
chr3:171969094-171969095(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//26404942//27773535
chr3:171969122-171969123(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//26404942//27773535
chr3:171969130-171969131(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//26404942//27773535
chr3:171969151-171969152(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22575960
chr3:171969279-171969280(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22575960
chr3:171969322-171969323(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22575960
chr3:172003745-172003746(+) m6A CDS//exon       24981863//22575960
chr3:172060874-172060875(+) m6A CDS       22575960
chr3:172070627-172070628(+) m6A CDS//exon       24284625
chr3:172070743-172070744(+) m6A CDS       24284625
chr3:172070803-172070804(+) m6A CDS       27773535
chr3:172070862-172070863(+) m6A CDS       27773535
chr3:172080458-172080459(+) m6A CDS       27773535
chr3:172080486-172080487(+) m6A CDS       27773535
chr3:172080595-172080596(+) m6A CDS       26404942
chr3:172080622-172080623(+) m6A CDS       26404942//27773535
chr3:172080628-172080629(+) m6A CDS       26404942//27773535
chr3:172096080-172096081(+) m6A CDS       27773535
chr3:172096107-172096108(+) m6A CDS       27773535
chr3:172096180-172096181(+) m6A CDS       27773535
chr3:172115047-172115048(+) m6A CDS       24981863
chr3:172115128-172115129(+) m6A CDS       24981863//26404942//27773535
chr3:172115180-172115181(+) m6A CDS       24981863//26404942//27773535
chr3:172115770-172115771(+) m6A 3'UTR       26404942
chr3:172115780-172115781(+) m6A 3'UTR       26404942

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate FNDC3B
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus Colon cancer cells     24393600
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Related Drug Information:


Resource Symbol Drug Name PubChem ID
RNAactDrug hiv1-miR-N367
Topotecan       60700

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hiv1-miR-N367
Interactor2: FNDC3B

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//Rep//Targetscan
Support Database RepTar//VmiReg

Starting a new search, please wait ...