Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00684383

  Virus:  

Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hiv1-miR-N367:  MIMAT0004478          PLS3:  NM_001172335     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hiv1-miR-N367	PLS3
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0004478	5358
Organism	Human immunodeficiency virus 1 (HIV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	BMND18//T-plastin

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	PLS3	chrX:114841407(+) A-I      intronic chrX:114807320(+) A-I      intronic chrX:114807297(+) A-I      intronic chrX:114807288(+) A-I      intronic chrX:114807287(+) A-I      intronic chrX:114807284(+) A-I      intronic chrX:114807283(+) A-I      intronic chrX:114807278(+) A-I      intronic chrX:114807277(+) A-I      intronic chrX:114807258(+) A-I      intronic chrX:114807257(+) A-I      intronic chrX:114807255(+) A-I      intronic chrX:114807249(+) A-I      intronic chrX:114807222(+) A-I      intronic chrX:114807221(+) A-I      intronic chrX:114807212(+) A-I      intronic chrX:114807188(+) A-I      intronic chrX:114807181(+) A-I      intronic chrX:114807180(+) A-I      intronic chrX:114807166(+) A-I      intronic chrX:114805775(+) A-I      intronic chrX:114805740(+) A-I      intronic chrX:114839842(+) A-I      intronic chrX:114839893(+) A-I      intronic chrX:114839959(+) A-I      intronic chrX:114839985(+) A-I      intronic chrX:114839997(+) A-I      intronic chrX:114840574(+) A-I      intronic chrX:114841351(+) A-I      intronic chrX:114841359(+) A-I      intronic chrX:114841404(+) A-I      intronic chrX:114841409(+) A-I      intronic chrX:114841413(+) A-I      intronic chrX:114841885(+) A-I      intronic chrX:114858333(+) A-I      intronic chrX:114858389(+) A-I      intronic chrX:114858394(+) A-I      intronic chrX:114858491(+) A-I      intronic chrX:114860627(+) A-I      intronic chrX:114860645(+) A-I      intronic chrX:114860697(+) A-I      intronic chrX:114860726(+) A-I      intronic chrX:114860843(+) A-I      intronic chrX:114861300(+) A-I      intronic chrX:114861411(+) A-I      intronic chrX:114861426(+) A-I      intronic chrX:114866209(+) A-I      intronic chrX:114866216(+) A-I      intronic chrX:114866219(+) A-I      intronic chrX:114867205(+) A-I      intronic chrX:114867286(+) A-I      intronic chrX:114868002(+) A-I      intronic chrX:114805705(+) A-I      intronic chrX:114868005(+) A-I      intronic chrX:114868039(+) A-I      intronic chrX:114868040(+) A-I      intronic chrX:114869806(+) A-I      intronic chrX:114869816(+) A-I      intronic chrX:114870052(+) A-I      intronic chrX:114870063(+) A-I      intronic chrX:114805683(+) A-I      intronic chrX:114805681(+) A-I      intronic chrX:114805678(+) A-I      intronic chrX:114805669(+) A-I      intronic chrX:114870191(+) A-I      intronic chrX:114870574(+) A-I      intronic chrX:114801792(+) A-I      intronic chrX:114801759(+) A-I      intronic chrX:114801756(+) A-I      intronic chrX:114801752(+) A-I      intronic chrX:114801717(+) A-I      intronic chrX:114804353(+) A-I      intronic chrX:114810763(+) A-I      intronic chrX:114811807(+) A-I      intronic chrX:114823392(+) A-I      intronic chrX:114823473(+) A-I      intronic chrX:114831314(+) A-I      intronic chrX:114841363(+) A-I      intronic chrX:114841405(+) A-I      intronic chrX:114841442(+) A-I      intronic chrX:114841462(+) A-I      intronic chrX:114841904(+) A-I      intronic chrX:114866692(+) A-I      intronic chrX:114878815(+) A-I      intronic chrX:114878812(+) A-I      intronic chrX:114878790(+) A-I      intronic chrX:114878783(+) A-I      intronic chrX:114878763(+) A-I      intronic chrX:114878758(+) A-I      intronic chrX:114800872(+) A-I      intronic chrX:114800893(+) A-I      intronic chrX:114801150(+) A-I      intronic chrX:114801181(+) A-I      intronic chrX:114801184(+) A-I      intronic chrX:114801187(+) A-I      intronic chrX:114801188(+) A-I      intronic chrX:114801686(+) A-I      intronic chrX:114805281(+) A-I      intronic chrX:114805395(+) A-I      intronic chrX:114805409(+) A-I      intronic chrX:114805421(+) A-I      intronic chrX:114805656(+) A-I      intronic chrX:114805684(+) A-I      intronic chrX:114805687(+) A-I      intronic chrX:114805742(+) A-I      intronic chrX:114805784(+) A-I      intronic chrX:114807198(+) A-I      intronic chrX:114807232(+) A-I      intronic chrX:114807243(+) A-I      intronic chrX:114807315(+) A-I      intronic chrX:114807336(+) A-I      intronic chrX:114807340(+) A-I      intronic chrX:114807349(+) A-I      intronic chrX:114807368(+) A-I      intronic chrX:114809083(+) A-I      intronic chrX:114810702(+) A-I      intronic chrX:114811992(+) A-I      intronic chrX:114812785(+) A-I      intronic chrX:114812811(+) A-I      intronic chrX:114812878(+) A-I      intronic chrX:114812879(+) A-I      intronic chrX:114812928(+) A-I      intronic chrX:114812945(+) A-I      intronic chrX:114812960(+) A-I      intronic chrX:114817111(+) A-I      intronic chrX:114817133(+) A-I      intronic chrX:114817143(+) A-I      intronic chrX:114817152(+) A-I      intronic chrX:114869875(+) A-I      intronic chrX:114820872(+) A-I      intronic chrX:114821968(+) A-I      intronic chrX:114830033(+) A-I      intronic chrX:114830076(+) A-I      intronic chrX:114830130(+) A-I      intronic chrX:114830203(+) A-I      intronic chrX:114831070(+) A-I      intronic chrX:114831074(+) A-I      intronic chrX:114832384(+) A-I      intronic chrX:114832491(+) A-I      intronic chrX:114832505(+) A-I      intronic chrX:114832513(+) A-I      intronic chrX:114832514(+) A-I      intronic chrX:114832537(+) A-I      intronic chrX:114832622(+) A-I      intronic chrX:114833544(+) A-I      intronic chrX:114833550(+) A-I      intronic chrX:114833566(+) A-I      intronic chrX:114833584(+) A-I      intronic chrX:114833587(+) A-I      intronic chrX:114833630(+) A-I      intronic chrX:114833848(+) A-I      intronic chrX:114834677(+) A-I      intronic chrX:114878753(+) A-I      intronic chrX:114878747(+) A-I      intronic chrX:114870208(+) A-I      intronic chrX:114861438(+) A-I      intronic chrX:114861425(+) A-I      intronic chrX:114861399(+) A-I      intronic chrX:114841556(+) A-I      intronic chrX:114841554(+) A-I      intronic chrX:114841515(+) A-I      intronic chrX:114841507(+) A-I      intronic chrX:114841450(+) A-I      intronic chrX:114841444(+) A-I      intronic chrX:114841426(+) A-I      intronic chrX:114841422(+) A-I      intronic chrX:114841414(+) A-I      intronic chrX:114841403(+) A-I      intronic chrX:114841400(+) A-I      intronic chrX:114834701(+) A-I      intronic chrX:114838021(+) A-I      intronic chrX:114834661(+) A-I      intronic chrX:114834659(+) A-I      intronic chrX:114834648(+) A-I      intronic chrX:114832522(+) A-I      intronic chrX:114830104(+) A-I      intronic chrX:114810713(+) A-I      intronic chrX:114810688(+) A-I      intronic chrX:114810674(+) A-I      intronic chrX:114810664(+) A-I      intronic chrX:114810655(+) A-I      intronic chrX:114810637(+) A-I      intronic chrX:114866282(+) A-I      intronic chrX:114870181(+) A-I      intronic chrX:114805715(+) A-I      intronic chrX:114841518(+) A-I      intronic chrX:114865895(+) A-I      intronic chrX:114809155(+) A-I      intronic chrX:114805417(+) A-I      intronic chrX:114833743(+) A-I      intronic chrX:114801852(+) A-I      intronic chrX:114805762(+) A-I      intronic chrX:114865960(+) A-I      intronic chrX:114804960(+) A-I      intronic chrX:114865951(+) A-I      intronic chrX:114807154(+) A-I      intronic chrX:114833774(+) A-I      intronic chrX:114805648(+) A-I      intronic chrX:114868043(+) A-I      intronic chrX:114820889(+) A-I      intronic chrX:114805652(+) A-I      intronic chrX:114823468(+) A-I      intronic chrX:114820943(+) A-I      intronic chrX:114804513(+) A-I      intronic chrX:114834573(+) A-I      intronic chrX:114878169(+) A-I      intronic chrX:114804450(+) A-I      intronic chrX:114858420(+) A-I      intronic chrX:114823561(+) A-I      intronic chrX:114807256(+) A-I      intronic chrX:114865994(+) A-I      intronic chrX:114865820(+) A-I      intronic chrX:114811818(+) A-I      intronic chrX:114870092(+) A-I      intronic chrX:114824858(+) A-I      intronic chrX:114858287(+) A-I      intronic chrX:114804276(+) A-I      intronic chrX:114840639(+) A-I      intronic chrX:114840568(+) A-I      intronic chrX:114861344(+) A-I      intronic chrX:114805754(+) A-I      intronic chrX:114808254(+) A-I      intronic chrX:114805822(+) A-I      intronic chrX:114865821(+) A-I      intronic chrX:114809128(+) A-I      intronic chrX:114808241(+) A-I      intronic chrX:114801737(+) A-I      intronic chrX:114870046(+) A-I      intronic chrX:114833742(+) A-I      intronic chrX:114870333(+) A-I      intronic chrX:114858364(+) A-I      intronic chrX:114841561(+) A-I      intronic chrX:114840624(+) A-I      intronic chrX:114867705(+) A-I      intronic chrX:114820942(+) A-I      intronic chrX:114812066(+) A-I      intronic chrX:114843291(+) A-I      intronic chrX:114811885(+) A-I      intronic chrX:114807252(+) A-I      intronic chrX:114833666(+) A-I      intronic chrX:114804418(+) A-I      intronic chrX:114852260(+) A-I      intronic chrX:114811813(+) A-I      intronic chrX:114807153(+) A-I      intronic chrX:114810642(+) A-I      intronic chrX:114817177(+) A-I      intronic chrX:114870151(+) A-I      intronic chrX:114839950(+) A-I      intronic chrX:114870137(+) A-I      intronic chrX:114841303(+) A-I      intronic chrX:114870288(+) A-I      intronic chrX:114837993(+) A-I      intronic chrX:114841519(+) A-I      intronic chrX:114812892(+) A-I      intronic chrX:114858355(+) A-I      intronic chrX:114805743(+) A-I      intronic chrX:114841989(+) A-I      intronic chrX:114800727(+) A-I      intronic chrX:114867283(+) A-I      intronic chrX:114805672(+) A-I      intronic chrX:114834686(+) A-I      intronic chrX:114811909(+) A-I      intronic chrX:114839880(+) A-I      intronic chrX:114867177(+) A-I      intronic chrX:114870087(+) A-I      intronic chrX:114820377(+) A-I      intronic chrX:114801140(+) A-I      intronic chrX:114858286(+) A-I      intronic chrX:114801751(+) A-I      intronic chrX:114803237(+) A-I      intronic chrX:114870116(+) A-I      intronic chrX:114858332(+) A-I      intronic chrX:114807261(+) A-I      intronic chrX:114833746(+) A-I      intronic chrX:114805746(+) A-I      intronic chrX:114840036(+) A-I      intronic chrX:114869775(+) A-I      intronic chrX:114869908(+) A-I      intronic chrX:114841503(+) A-I      intronic

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	PLS3	chrX:114795565-114795566(+) m6A 5'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chrX:114795572-114795573(+) m6A 5'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chrX:114827925-114827926(+) m6A 5'UTR//intron       24284625//24981863 chrX:114844609-114844610(+) m6A 5'UTR//CDS       24981863 chrX:114848634-114848635(+) m6A 3'UTR//intron       - chrX:114848662-114848663(+) m6A 3'UTR//intron       - chrX:114848670-114848671(+) m6A 3'UTR//intron       - chrX:114848701-114848702(+) m6A 3'UTR//intron       - chrX:114869315-114869316(+) Am 3'UTR//CDS       - chrX:114874766-114874767(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       22575960 chrX:114874781-114874782(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       22575960 chrX:114874789-114874790(+) Tm 3'UTR//CDS//exon       - chrX:114877686-114877687(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942 chrX:114877721-114877722(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942 chrX:114877728-114877729(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942 chrX:114880797-114880798(+) m6A 3'UTR//CDS       26404942 chrX:114880812-114880813(+) m6A 3'UTR//CDS       26404942 chrX:114880817-114880818(+) m6A 3'UTR//CDS       26404942 chrX:114881934-114881935(+) m6A 3'UTR//CDS       26404942 chrX:114881943-114881944(+) m6A 3'UTR//CDS       26404942 chrX:114882279-114882280(+) m6A 3'UTR//CDS       26404942//27773535 chrX:114883804-114883805(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863//26404942//27773535 chrX:114883900-114883901(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085 chrX:114883969-114883970(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085 chrX:114883988-114883989(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chrX:114884010-114884011(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22575960//22608085 chrX:114884054-114884055(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22575960//22608085 chrX:114884121-114884122(+) m6A 3'UTR       24284625//26404942//22575960 chrX:114884502-114884503(+) m6A 3'UTR       26404942 chrX:114884507-114884508(+) m6A 3'UTR       26404942 chrX:114884553-114884554(+) m6A 3'UTR       26404942 chrX:114884621-114884622(+) m6A 3'UTR       26404942 chrX:114884679-114884680(+) m6A 3'UTR       26404942 chrX:114884693-114884694(+) m6A 3'UTR       26404942 chrX:114884758-114884759(+) Tm 3'UTR       - chrX:114884823-114884824(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	PLS3	Exosome Blood     - Nucleus Colon cancer cells     24393600

Related Drug Information:

Resource	Symbol	Drug Name	PubChem ID
RNAactDrug	hiv1-miR-N367	Topotecan       60700

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hiv1-miR-N367
Interactor2: PLS3

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg