Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00683349

  Virus:  

Merkel cell polyomavirus

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      mcpv-miR-P1-3p:           GATD1:      

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Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol mcpv-miR-P1-3p GATD1
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0010151 347862
Organism Merkel cell polyomavirus Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - PDDC1

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR GATD1
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RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate GATD1
Chromatin K562 cells     -
Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841
Nucleus K562 cells     -
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: mcpv-miR-P1-3p
Interactor2: GATD1

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda//PITA//Rep//Targetscan
Support Database RepTar//VmiReg

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