Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00683343

  Virus:  

Merkel cell polyomavirus

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      mcpv-miR-P1-3p:           MACC1:      

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Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol mcpv-miR-P1-3p MACC1
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0010151 346389
Organism Merkel cell polyomavirus Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - 7A5//SH3BP4L

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR MACC1
chr7:20220344(-) A-I      intronic
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chr7:20219983(-) A-I      intronic
chr7:20185579(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED MACC1
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chr7:20239815(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase MACC1
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chr7:20199626-20199627(-) m6A CDS       24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate MACC1
Chromatin K562 cells     -
Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol K562 cells     -
Exosome Blood     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841
Nucleus Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: mcpv-miR-P1-3p
Interactor2: MACC1

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda//PITA//Rep//Targetscan
Support Database RepTar//VmiReg

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