Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00683091

  Virus:  

Merkel cell polyomavirus

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      mcpv-miR-P1-3p:  MIMAT0010151          IBA57:  NM_001010867     

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Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	mcpv-miR-P1-3p	IBA57
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0010151	200205
Organism	Merkel cell polyomavirus	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	C1orf69//MMDS3//SPG74

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	IBA57	chr1:228368624(+) A-I      3'UTR chr1:228368621(+) A-I      3'UTR chr1:228368449(+) A-I      3'UTR chr1:228368413(+) A-I      3'UTR chr1:228367705(+) A-I      3'UTR chr1:228367692(+) A-I      3'UTR chr1:228366202(+) A-I      3'UTR chr1:228366055(+) A-I      3'UTR chr1:228367655(+) A-I      3'UTR chr1:228367782(+) A-I      3'UTR chr1:228367624(+) A-I      3'UTR chr1:228368489(+) A-I      3'UTR chr1:228368371(+) A-I      3'UTR chr1:228368375(+) A-I      3'UTR chr1:228368562(+) A-I      3'UTR chr1:228367789(+) A-I      3'UTR chr1:228365241(+) A-I      3'UTR chr1:228367623(+) A-I      3'UTR chr1:228367777(+) A-I      3'UTR chr1:228367798(+) A-I      3'UTR chr1:228365252(+) A-I      3'UTR chr1:228367772(+) A-I      3'UTR chr1:228368484(+) A-I      3'UTR chr1:228367673(+) A-I      3'UTR chr1:228368452(+) A-I      3'UTR chr1:228365295(+) A-I      3'UTR chr1:228366227(+) A-I      3'UTR chr1:228366223(+) A-I      3'UTR chr1:228366252(+) A-I      3'UTR chr1:228367763(+) A-I      3'UTR chr1:228367802(+) A-I      3'UTR chr1:228366291(+) A-I      3'UTR chr1:228366122(+) A-I      3'UTR chr1:228365330(+) A-I      3'UTR chr1:228368412(+) A-I      3'UTR chr1:228368505(+) A-I      3'UTR chr1:228367681(+) A-I      3'UTR chr1:228367845(+) A-I      3'UTR chr1:228365291(+) A-I      3'UTR chr1:228367879(+) A-I      3'UTR chr1:228368487(+) A-I      3'UTR chr1:228367759(+) A-I      3'UTR chr1:228365271(+) A-I      3'UTR chr1:228368480(+) A-I      3'UTR chr1:228367706(+) A-I      3'UTR chr1:228366051(+) A-I      3'UTR chr1:228366121(+) A-I      3'UTR chr1:228368477(+) A-I      3'UTR chr1:228365284(+) A-I      3'UTR chr1:228365373(+) A-I      3'UTR chr1:228368594(+) A-I      3'UTR chr1:228365355(+) A-I      3'UTR chr1:228366135(+) A-I      3'UTR chr1:228367842(+) A-I      3'UTR chr1:228365554(+) A-I      3'UTR chr1:228368569(+) A-I      3'UTR chr1:228368496(+) A-I      3'UTR chr1:228367746(+) A-I      3'UTR chr1:228366185(+) A-I      3'UTR chr1:228368434(+) A-I      3'UTR chr1:228366270(+) A-I      3'UTR chr1:228367742(+) A-I      3'UTR chr1:228366124(+) A-I      3'UTR chr1:228365308(+) A-I      3'UTR chr1:228365255(+) A-I      3'UTR chr1:228367839(+) A-I      3'UTR chr1:228368465(+) A-I      3'UTR chr1:228366197(+) A-I      3'UTR chr1:228366123(+) A-I      3'UTR chr1:228366074(+) A-I      3'UTR chr1:228367778(+) A-I      3'UTR chr1:228368425(+) A-I      3'UTR chr1:228365387(+) A-I      3'UTR chr1:228366207(+) A-I      3'UTR chr1:228365996(+) A-I      3'UTR chr1:228367728(+) A-I      3'UTR chr1:228367736(+) A-I      3'UTR chr1:228367841(+) A-I      3'UTR chr1:228366171(+) A-I      3'UTR chr1:228365992(+) A-I      3'UTR chr1:228368447(+) A-I      3'UTR chr1:228368427(+) A-I      3'UTR chr1:228365332(+) A-I      3'UTR chr1:228365320(+) A-I      3'UTR chr1:228365254(+) A-I      3'UTR chr1:228367768(+) A-I      3'UTR chr1:228367737(+) A-I      3'UTR chr1:228365370(+) A-I      3'UTR chr1:228366139(+) A-I      3'UTR chr1:228368542(+) A-I      3'UTR chr1:228366106(+) A-I      3'UTR chr1:228367656(+) A-I      3'UTR chr1:228365270(+) A-I      3'UTR chr1:228366293(+) A-I      3'UTR chr1:228368612(+) A-I      3'UTR chr1:228366120(+) A-I      3'UTR chr1:228366184(+) A-I      3'UTR chr1:228368607(+) A-I      3'UTR chr1:228366191(+) A-I      3'UTR chr1:228367710(+) A-I      3'UTR

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	IBA57	chr1:228367710(+) A-I intron -    21960545 chr1:228367702(+) T-C intron -    21725310 chr1:228365255(+) A-G intron -    22484847 chr1:228365270(+) A-G intron -    22484847 chr1:228365284(+) A-G intron -    22484847 chr1:228365308(+) A-G intron -    22484847 chr1:228365373(+) A-G intron -    22484847 chr1:228366051(+) A-G intron -    22484847 chr1:228366123(+) A-G intron -    22484847 chr1:228366185(+) A-G intron -    22484847 chr1:228366197(+) A-G intron -    22484847 chr1:228367710(+) A-G intron -    22484847 chr1:228368425(+) A-G intron -    22484847 chr1:228368477(+) A-G intron -    22484847 chr1:228368480(+) A-G intron -    22484847 chr1:228368487(+) A-G intron -    22484847 chr1:228368612(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	IBA57	chr1:228362621-228362622(+) m6A CDS//exon       24284625//22608085 chr1:228362694-228362695(+) m6A CDS//exon       24284625//22608085 chr1:228362843-228362844(+) m6A CDS//exon       24284625//22608085 chr1:228362999-228363000(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr1:228363054-228363055(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr1:228363188-228363189(+) m6A CDS//exon       24284625//25456834//24981863//22608085 chr1:228363354-228363355(+) Y 3'UTR//exon       26075521 chr1:228363419-228363420(+) m6A 3'UTR//exon       24284625 chr1:228366933-228366934(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085 chr1:228366975-228366976(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085 chr1:228367000-228367001(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085 chr1:228367035-228367036(+) m6A 3'UTR//exon       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	IBA57	Chromatin K562 cells     - Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Exosome Blood     - Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: mcpv-miR-P1-3p
Interactor2: IBA57

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PITA//Rep//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg