Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00678161

  Virus:  

Merkel cell polyomavirus

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      mcpv-miR-P1-5p:  MIMAT0010150          MACROD2:  NM_001351664     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	mcpv-miR-P1-5p	MACROD2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0010150	140733
Organism	Merkel cell polyomavirus	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	C20orf133//C2orf133

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	MACROD2	chr20:14121989(+) A-I      intronic chr20:15739670(+) A-I      intronic chr20:15739615(+) A-I      intronic chr20:14121965(+) A-I      intronic chr20:15536339(+) A-I      intronic chr20:15536359(+) A-I      intronic chr20:15536401(+) A-I      intronic chr20:15739686(+) A-I      intronic chr20:15739633(+) A-I      intronic chr20:15739578(+) A-I      intronic chr20:14121964(+) A-I      intronic chr20:15536370(+) A-I      intronic chr20:15739637(+) A-I      intronic chr20:14121933(+) A-I      intronic chr20:15739592(+) A-I      intronic chr20:15739628(+) A-I      intronic chr20:15739614(+) A-I      intronic chr20:14121987(+) A-I      intronic chr20:14121986(+) A-I      intronic chr20:15739672(+) A-I      intronic chr20:14307153(+) A-I      intronic chr20:15739662(+) A-I      intronic chr20:14429122(+) A-I      intronic chr20:14429139(+) A-I      intronic chr20:14429141(+) A-I      intronic chr20:14429152(+) A-I      intronic chr20:14429167(+) A-I      intronic chr20:14855896(+) A-I      intronic chr20:14855906(+) A-I      intronic chr20:14855913(+) A-I      intronic chr20:14855959(+) A-I      intronic chr20:16002853(+) A-I      intronic chr20:16002898(+) A-I      intronic chr20:16002903(+) A-I      intronic chr20:16002943(+) A-I      intronic chr20:15953232(+) A-I      intronic chr20:15953215(+) A-I      intronic chr20:15751959(+) A-I      intronic chr20:15751949(+) A-I      intronic chr20:15751919(+) A-I      intronic chr20:15751844(+) A-I      intronic chr20:15735694(+) A-I      intronic chr20:15735026(+) A-I      intronic chr20:15705580(+) A-I      intronic chr20:15705550(+) A-I      intronic chr20:15688253(+) A-I      intronic chr20:15688252(+) A-I      intronic chr20:15588291(+) A-I      intronic chr20:15588240(+) A-I      intronic chr20:15566017(+) A-I      intronic chr20:15566003(+) A-I      intronic chr20:15562509(+) A-I      intronic chr20:15562505(+) A-I      intronic chr20:15547114(+) A-I      intronic chr20:15547103(+) A-I      intronic chr20:15547064(+) A-I      intronic chr20:15541297(+) A-I      intronic chr20:15539761(+) A-I      intronic chr20:15536395(+) A-I      intronic chr20:15536329(+) A-I      intronic chr20:15163955(+) A-I      intronic chr20:14942976(+) A-I      intronic chr20:14942237(+) A-I      intronic chr20:14912527(+) A-I      intronic chr20:14911561(+) A-I      intronic chr20:14910687(+) A-I      intronic chr20:14910620(+) A-I      intronic chr20:14910619(+) A-I      intronic chr20:14910596(+) A-I      intronic chr20:14910552(+) A-I      intronic chr20:14876889(+) A-I      intronic chr20:14876886(+) A-I      intronic chr20:14876873(+) A-I      intronic chr20:14871301(+) A-I      intronic chr20:14871297(+) A-I      intronic chr20:14769157(+) A-I      intronic chr20:14761087(+) A-I      intronic chr20:14016694(+) A-I      intronic chr20:14761023(+) A-I      intronic chr20:14760947(+) A-I      intronic chr20:14699842(+) A-I      intronic chr20:14699763(+) A-I      intronic chr20:14699757(+) A-I      intronic chr20:14698835(+) A-I      intronic chr20:14686707(+) A-I      intronic chr20:14686706(+) A-I      intronic chr20:14016667(+) A-I      intronic chr20:16002835(+) A-I      intronic chr20:14466093(+) A-I      intronic chr20:14423481(+) A-I      intronic chr20:14377913(+) A-I      intronic chr20:14377901(+) A-I      intronic chr20:14377843(+) A-I      intronic chr20:14377841(+) A-I      intronic chr20:14339591(+) A-I      intronic chr20:14339586(+) A-I      intronic chr20:14328712(+) A-I      intronic chr20:16002837(+) A-I      intronic chr20:15953284(+) A-I      intronic chr20:14326513(+) A-I      intronic chr20:14322192(+) A-I      intronic chr20:14246552(+) A-I      intronic chr20:14209611(+) A-I      intronic chr20:14209605(+) A-I      intronic chr20:14209601(+) A-I      intronic chr20:14183499(+) A-I      intronic chr20:14161731(+) A-I      intronic chr20:14139899(+) A-I      intronic chr20:14139628(+) A-I      intronic chr20:14111150(+) A-I      intronic chr20:14079879(+) A-I      intronic chr20:14079873(+) A-I      intronic chr20:14946964(+) A-I      intronic chr20:15659866(+) A-I      intronic chr20:14059219(+) A-I      intronic chr20:14922569(+) A-I      intronic chr20:14241241(+) A-I      intronic chr20:14183684(+) A-I      intronic chr20:14701333(+) A-I      intronic chr20:14113450(+) A-I      intronic chr20:14116108(+) A-I      intronic chr20:13995503(+) A-I      intronic chr20:15579948(+) A-I      intronic chr20:15536353(+) A-I      intronic chr20:15751906(+) A-I      intronic chr20:14100653(+) A-I      intronic chr20:14377355(+) A-I      intronic chr20:14241211(+) A-I      intronic chr20:15518150(+) A-I      intronic chr20:14111700(+) A-I      intronic chr20:14183683(+) A-I      intronic chr20:16004040(+) A-I      intronic chr20:14701790(+) A-I      intronic chr20:14920900(+) A-I      intronic chr20:14913235(+) A-I      intronic chr20:14699625(+) A-I      intronic chr20:14968942(+) A-I      intronic chr20:14318893(+) A-I      intronic chr20:14769532(+) A-I      intronic chr20:14698899(+) A-I      intronic chr20:14920881(+) A-I      intronic chr20:15758473(+) A-I      intronic chr20:15688281(+) A-I      intronic chr20:14112486(+) A-I      intronic chr20:14699731(+) A-I      intronic chr20:15526779(+) A-I      intronic chr20:15751965(+) A-I      intronic chr20:14100108(+) A-I      intronic chr20:14030131(+) A-I      intronic chr20:14363235(+) A-I      intronic chr20:14770343(+) A-I      intronic chr20:14132674(+) A-I      intronic chr20:14363259(+) A-I      intronic chr20:14838520(+) A-I      intronic chr20:14112929(+) A-I      intronic chr20:15689556(+) A-I      intronic chr20:15534245(+) A-I      intronic chr20:14761088(+) A-I      intronic chr20:14133214(+) A-I      intronic chr20:15739471(+) A-I      intronic chr20:14257822(+) A-I      intronic chr20:14699798(+) A-I      intronic chr20:14968931(+) A-I      intronic chr20:14914088(+) A-I      intronic chr20:14708101(+) A-I      intronic chr20:14328752(+) A-I      intronic chr20:14686881(+) A-I      intronic chr20:13995511(+) A-I      intronic chr20:15541150(+) A-I      intronic chr20:14635036(+) A-I      intronic chr20:14698824(+) A-I      intronic chr20:14295385(+) A-I      intronic chr20:14770327(+) A-I      intronic chr20:15588362(+) A-I      intronic chr20:14099548(+) A-I      intronic chr20:15547057(+) A-I      intronic chr20:15765779(+) A-I      intronic chr20:15536363(+) A-I      intronic chr20:15022145(+) A-I      intronic chr20:15571381(+) A-I      intronic chr20:14369902(+) A-I      intronic chr20:15534181(+) A-I      intronic chr20:15532311(+) A-I      intronic chr20:14122227(+) A-I      intronic chr20:14100712(+) A-I      intronic chr20:15536310(+) A-I      intronic chr20:15690264(+) A-I      intronic chr20:15048176(+) A-I      intronic chr20:14912389(+) A-I      intronic chr20:14914196(+) A-I      intronic chr20:14449297(+) A-I      intronic chr20:15047381(+) A-I      intronic chr20:14698685(+) A-I      intronic chr20:13996046(+) A-I      intronic chr20:15520583(+) A-I      intronic chr20:14244562(+) A-I      intronic chr20:15444133(+) A-I      intronic chr20:15534118(+) A-I      intronic chr20:15571387(+) A-I      intronic chr20:14112698(+) A-I      intronic chr20:15758464(+) A-I      intronic chr20:15739741(+) A-I      intronic chr20:14701740(+) A-I      intronic chr20:15534274(+) A-I      intronic chr20:15098938(+) A-I      intronic chr20:14826970(+) A-I      intronic chr20:14369877(+) A-I      intronic chr20:15616566(+) A-I      intronic chr20:14053772(+) A-I      intronic chr20:14770305(+) A-I      intronic chr20:14812371(+) A-I      intronic chr20:14111074(+) A-I      intronic chr20:15536325(+) A-I      intronic chr20:15541261(+) A-I      intronic chr20:14326278(+) A-I      intronic chr20:15686292(+) A-I      intronic chr20:13995559(+) A-I      intronic chr20:15587500(+) A-I      intronic chr20:15564423(+) A-I      intronic chr20:14912495(+) A-I      intronic chr20:15564428(+) A-I      intronic chr20:15048196(+) A-I      intronic chr20:14077225(+) A-I      intronic chr20:14701420(+) A-I      intronic chr20:15564328(+) A-I      intronic chr20:14030673(+) A-I      intronic chr20:14684584(+) A-I      intronic chr20:15752543(+) A-I      intronic chr20:14699725(+) A-I      intronic chr20:15698914(+) A-I      intronic chr20:15194611(+) A-I      intronic chr20:14769548(+) A-I      intronic chr20:14911569(+) A-I      intronic chr20:15534248(+) A-I      intronic chr20:14769160(+) A-I      intronic chr20:14142456(+) A-I      intronic chr20:14914071(+) A-I      intronic chr20:14122332(+) A-I      intronic chr20:15536380(+) A-I      intronic chr20:14635032(+) A-I      intronic chr20:15534176(+) A-I      intronic chr20:15347213(+) A-I      intronic chr20:14968958(+) A-I      intronic chr20:14698708(+) A-I      intronic chr20:15174207(+) A-I      intronic chr20:14945164(+) A-I      intronic chr20:15534145(+) A-I      intronic chr20:14187771(+) A-I      intronic chr20:14975201(+) A-I      intronic chr20:14769133(+) A-I      intronic chr20:15739462(+) A-I      intronic chr20:15751839(+) A-I      intronic chr20:14914217(+) A-I      intronic chr20:14112955(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	MACROD2	chr20:15879542(+) A-I intron -    22327324 chr20:15879581(+) A-I intron -    22327324 chr20:15879583(+) A-I intron -    22327324 chr20:15879648(+) A-I intron -    22327324 chr20:15879676(+) A-I intron -    22327324 chr20:15879962(+) A-I intron -    22327324 chr20:15879970(+) A-I intron -    22327324 chr20:15916724(+) A-I intron -    22327324 chr20:15916751(+) A-I intron -    22327324 chr20:15916784(+) A-I intron -    22327324 chr20:15916823(+) A-I intron -    22327324 chr20:15536310(+) A-G intron -    22484847 chr20:15536343(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	MACROD2	chr20:13982984-13982985(+) m6A CDS//exon       24209618 chr20:13982999-13983000(+) m6A CDS//exon       24209618 chr20:14738398-14738399(+) m6A intron       - chr20:15967412-15967413(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       - chr20:15967439-15967440(+) m6A CDS//exon       - chr20:15967722-15967723(+) m6A CDS//exon       - chr20:15967776-15967777(+) m6A CDS//exon       - chr20:16021857-16021858(+) m6A CDS//exon       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	MACROD2	Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: mcpv-miR-P1-5p
Interactor2: MACROD2

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg