Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00669936

  Virus:  

JC polyomavirus (JCPyV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      jcv-miR-J1-5p:  MIMAT0009147          ATCAY:  NM_033064     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	jcv-miR-J1-5p	ATCAY
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0009147	85300
Organism	JC polyomavirus (JCPyV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	BNIP-H//CLAC

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	ATCAY	chr19:3906094(+) A-I      intronic chr19:3907291(+) A-I      intronic chr19:3905987(+) A-I      intronic chr19:3899373(+) A-I      intronic chr19:3907290(+) A-I      intronic chr19:3899368(+) A-I      intronic chr19:3917230(+) A-I      intronic chr19:3917472(+) A-I      intronic chr19:3917371(+) A-I      intronic chr19:3917195(+) A-I      intronic chr19:3917065(+) A-I      intronic chr19:3907289(+) A-I      intronic chr19:3907292(+) A-I      intronic chr19:3917066(+) A-I      intronic chr19:3906975(+) A-I      intronic chr19:3922762(+) A-I      intronic chr19:3925924(+) A-I      3'UTR chr19:3925885(+) A-I      3'UTR chr19:3895856(+) A-I      intronic chr19:3898247(+) A-I      intronic chr19:3891324(+) A-I      intronic chr19:3892419(+) A-I      intronic chr19:3888549(+) A-I      intronic chr19:3894756(+) A-I      intronic chr19:3890300(+) A-I      intronic chr19:3886841(+) A-I      intronic chr19:3893437(+) A-I      intronic chr19:3904302(+) A-I      intronic chr19:3922928(+) A-I      intronic chr19:3897540(+) A-I      intronic chr19:3894872(+) A-I      intronic chr19:3898780(+) A-I      intronic chr19:3895915(+) A-I      intronic chr19:3889261(+) A-I      intronic chr19:3900302(+) A-I      intronic chr19:3882925(+) A-I      intronic chr19:3886773(+) A-I      intronic chr19:3916933(+) A-I      intronic chr19:3889034(+) A-I      intronic chr19:3894876(+) A-I      intronic chr19:3886457(+) A-I      intronic chr19:3887993(+) A-I      intronic chr19:3907034(+) A-I      intronic chr19:3887329(+) A-I      intronic chr19:3894531(+) A-I      intronic chr19:3922942(+) A-I      intronic chr19:3886904(+) A-I      intronic chr19:3906880(+) A-I      intronic chr19:3890081(+) A-I      intronic chr19:3917272(+) A-I      intronic chr19:3906048(+) A-I      intronic chr19:3886431(+) A-I      intronic chr19:3893375(+) A-I      intronic chr19:3897545(+) A-I      intronic chr19:3916750(+) A-I      intronic chr19:3898206(+) A-I      intronic chr19:3912692(+) A-I      intronic chr19:3886438(+) A-I      intronic chr19:3887966(+) A-I      intronic chr19:3906473(+) A-I      intronic chr19:3892388(+) A-I      intronic chr19:3896448(+) A-I      intronic chr19:3891981(+) A-I      intronic chr19:3892650(+) A-I      intronic chr19:3885464(+) A-I      intronic chr19:3893349(+) A-I      intronic chr19:3917328(+) A-I      intronic chr19:3894541(+) A-I      intronic chr19:3894718(+) A-I      intronic chr19:3895943(+) A-I      intronic chr19:3898383(+) A-I      intronic chr19:3894601(+) A-I      intronic chr19:3892022(+) A-I      intronic chr19:3889332(+) A-I      intronic chr19:3900369(+) A-I      intronic chr19:3917327(+) A-I      intronic chr19:3894896(+) A-I      intronic chr19:3897365(+) A-I      intronic chr19:3902129(+) A-I      intronic chr19:3915393(+) A-I      intronic chr19:3901859(+) A-I      intronic chr19:3917425(+) A-I      intronic chr19:3917026(+) A-I      intronic chr19:3894546(+) A-I      intronic chr19:3886857(+) A-I      intronic chr19:3883266(+) A-I      intronic chr19:3896450(+) A-I      intronic chr19:3903608(+) A-I      intronic chr19:3889308(+) A-I      intronic chr19:3889236(+) A-I      intronic chr19:3922950(+) A-I      intronic chr19:3897825(+) A-I      intronic chr19:3896033(+) A-I      intronic chr19:3915962(+) A-I      intronic chr19:3894836(+) A-I      intronic chr19:3892473(+) A-I      intronic chr19:3896030(+) A-I      intronic chr19:3895293(+) A-I      intronic chr19:3900375(+) A-I      intronic chr19:3895843(+) A-I      intronic chr19:3888379(+) A-I      intronic chr19:3892809(+) A-I      intronic chr19:3915968(+) A-I      intronic chr19:3898277(+) A-I      intronic chr19:3890103(+) A-I      intronic chr19:3925750(+) A-I      3'UTR chr19:3888477(+) A-I      intronic chr19:3901739(+) A-I      intronic chr19:3891154(+) A-I      intronic chr19:3907228(+) A-I      intronic chr19:3899574(+) A-I      intronic chr19:3892037(+) A-I      intronic chr19:3898214(+) A-I      intronic chr19:3884194(+) A-I      intronic chr19:3895929(+) A-I      intronic chr19:3892435(+) A-I      intronic chr19:3889317(+) A-I      intronic chr19:3926961(+) A-I      3'UTR chr19:3897554(+) A-I      intronic chr19:3916728(+) A-I      intronic chr19:3916862(+) A-I      intronic chr19:3887256(+) A-I      intronic chr19:3882368(+) A-I      intronic chr19:3904301(+) A-I      intronic chr19:3894705(+) A-I      intronic chr19:3891195(+) A-I      intronic chr19:3887181(+) A-I      intronic chr19:3902061(+) A-I      intronic chr19:3917168(+) A-I      intronic chr19:3907148(+) A-I      intronic chr19:3887270(+) A-I      intronic chr19:3892408(+) A-I      intronic chr19:3920199(+) A-I      intronic chr19:3897629(+) A-I      intronic chr19:3886781(+) A-I      intronic chr19:3887306(+) A-I      intronic chr19:3887274(+) A-I      intronic chr19:3889501(+) A-I      intronic chr19:3896975(+) A-I      intronic chr19:3914531(+) A-I      intronic chr19:3907187(+) A-I      intronic chr19:3894824(+) A-I      intronic chr19:3891312(+) A-I      intronic chr19:3892831(+) A-I      intronic chr19:3914527(+) A-I      intronic chr19:3897528(+) A-I      intronic chr19:3917271(+) A-I      intronic chr19:3888578(+) A-I      intronic chr19:3891179(+) A-I      intronic chr19:3921640(+) A-I      intronic chr19:3921847(+) A-I      intronic chr19:3893450(+) A-I      intronic chr19:3897855(+) A-I      intronic chr19:3899412(+) A-I      intronic chr19:3896022(+) A-I      intronic chr19:3894800(+) A-I      intronic chr19:3895778(+) A-I      intronic chr19:3895814(+) A-I      intronic chr19:3917067(+) A-I      intronic chr19:3892714(+) A-I      intronic chr19:3894709(+) A-I      intronic chr19:3892434(+) A-I      intronic chr19:3894233(+) A-I      intronic chr19:3889474(+) A-I      intronic chr19:3898286(+) A-I      intronic chr19:3886269(+) A-I      intronic chr19:3898342(+) A-I      intronic chr19:3886851(+) A-I      intronic chr19:3898704(+) A-I      intronic chr19:3922882(+) A-I      intronic chr19:3897513(+) A-I      intronic chr19:3917213(+) A-I      intronic

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	ATCAY	chr19:3895152-3895153(+) m6A CDS//intron       - chr19:3895187-3895188(+) m6A CDS//intron       - chr19:3902511-3902512(+) m6A CDS       - chr19:3902534-3902535(+) m6A CDS       - chr19:3924735-3924736(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:3924763-3924764(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:3924852-3924853(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr19:3924959-3924960(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:3925291-3925292(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863 chr19:3925335-3925336(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863 chr19:3925374-3925375(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863 chr19:3925409-3925410(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863 chr19:3925435-3925436(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863 chr19:3925452-3925453(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863 chr19:3925472-3925473(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863 chr19:3925579-3925580(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863 chr19:3925626-3925627(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863 chr19:3925672-3925673(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863 chr19:3925757-3925758(+) m6A 3'UTR//intron       25456834//24981863 chr19:3925806-3925807(+) m6A 3'UTR//intron       25456834//24981863 chr19:3925828-3925829(+) m6A 3'UTR//intron       25456834//24981863 chr19:3926294-3926295(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863 chr19:3926330-3926331(+) m6A 3'UTR       24981863 chr19:3926494-3926495(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:3926546-3926547(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:3926593-3926594(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:3926647-3926648(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:3927139-3927140(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr19:3927198-3927199(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr19:3927208-3927209(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr19:3927250-3927251(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr19:3927264-3927265(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr19:3927373-3927374(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22575960 chr19:3927400-3927401(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22575960 chr19:3927424-3927425(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22575960 chr19:3927437-3927438(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22575960 chr19:3927447-3927448(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22575960 chr19:3927466-3927467(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22575960 chr19:3927547-3927548(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr19:3927567-3927568(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr19:3927633-3927634(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:3927649-3927650(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:3927656-3927657(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:3927677-3927678(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:3927738-3927739(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:3927848-3927849(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr19:3927913-3927914(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr19:3927977-3927978(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	jcv-miR-J1-5p	Nucleus PML tissue     32324824
	ATCAY	Nucleus HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: jcv-miR-J1-5p
Interactor2: ATCAY

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PITA//Rep//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg