Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00668950

  Virus:  

JC polyomavirus (JCPyV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      jcv-miR-J1-5p:           CYCS:      

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Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol jcv-miR-J1-5p CYCS
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0009147 54205
Organism JC polyomavirus (JCPyV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - CYC//HCS//THC4

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR CYCS
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Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED CYCS
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RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase CYCS
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RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate jcv-miR-J1-5p
Nucleus PML tissue     32324824
CYCS
Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841
Nucleus K562 cells     -
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: jcv-miR-J1-5p
Interactor2: CYCS

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda//PITA//Rep//Targetscan
Support Database RepTar//VmiReg

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