Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00617505

  Virus:  

Murid betaherpesvirus 1

  Host:  

Mus musculus

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      mcmv-miR-m88-1-3p:  MIMAT0005552          Zc3h12d:  NM_172785     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	mcmv-miR-m88-1-3p	Zc3h12d
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0005552	237256
Organism	Murid betaherpesvirus 1	Mus musculus
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	D730019B10Rik//TF//TFL

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	Zc3h12d	chr10:7839869-7839870(+) m6A CDS       24981863 chr10:7839911-7839912(+) m6A CDS       24981863 chr10:7839960-7839961(+) m6A CDS       24981863 chr10:7840045-7840046(+) m6A CDS       24981863 chr10:7840067-7840068(+) m6A CDS       24981863 chr10:7866263-7866264(+) m6A CDS       24981863 chr10:7867312-7867313(+) m6A CDS       24981863 chr10:7867345-7867346(+) m6A CDS       24981863 chr10:7867397-7867398(+) m6A CDS       24981863 chr10:7867575-7867576(+) m6A CDS       24981863 chr10:7867673-7867674(+) m6A CDS       24981863//22575960 chr10:7867680-7867681(+) m6A CDS       24981863//22575960 chr10:7867744-7867745(+) m6A CDS       25456834//24981863//22575960 chr10:7867758-7867759(+) m6A CDS       25456834//24981863//22575960 chr10:7867789-7867790(+) m6A CDS       25456834//24981863//22575960 chr10:7867839-7867840(+) m6A CDS       25456834//24981863 chr10:7867875-7867876(+) m6A CDS       24981863 chr10:7867888-7867889(+) m6A CDS       24981863 chr10:7867928-7867929(+) m6A CDS       24981863 chr10:7867968-7867969(+) m6A CDS       24981863 chr10:7868042-7868043(+) m6A CDS       24981863 chr10:7868072-7868073(+) m6A 3'UTR       24981863 chr10:7868205-7868206(+) m6A 3'UTR       24981863 chr10:7868242-7868243(+) m6A 3'UTR       24981863 chr10:7868269-7868270(+) m6A 3'UTR       24981863 chr10:7868282-7868283(+) m6A 3'UTR       24981863

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: mcmv-miR-m88-1-3p
Interactor2: Zc3h12d

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//Rep
Support Database	RepTar