Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00583658

  Virus:  

Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hbv-miR-B22-3p:           SNX22:      

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Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hbv-miR-B22-3p SNX22
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0031773 79856
Organism Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - -

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR SNX22
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Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED SNX22
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RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase SNX22
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RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate SNX22
Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hbv-miR-B22-3p
Interactor2: SNX22

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//Targetscan
Support Database VmiReg

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