Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00582407

  Virus:  

Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hbv-miR-B22-3p:           RASGRP3:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hbv-miR-B22-3p RASGRP3
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0031773 25780
Organism Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - GRP3

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR RASGRP3
chr2:33694688(+) A-I      intronic
chr2:33694661(+) A-I      intronic
chr2:33694656(+) A-I      intronic
chr2:33694626(+) A-I      intronic
chr2:33694627(+) A-I      intronic
chr2:33776102(+) A-I      intronic
chr2:33732323(+) A-I      intronic
chr2:33778906(+) A-I      intronic
chr2:33779669(+) A-I      intronic
chr2:33779716(+) A-I      intronic
chr2:33779739(+) A-I      intronic
chr2:33779744(+) A-I      intronic
chr2:33778880(+) A-I      intronic
chr2:33711247(+) A-I      intronic
chr2:33777009(+) A-I      intronic
chr2:33732414(+) A-I      intronic
chr2:33776194(+) A-I      intronic
chr2:33685694(+) A-I      intronic
chr2:33711295(+) A-I      intronic
chr2:33711335(+) A-I      intronic
chr2:33711360(+) A-I      intronic
chr2:33711370(+) A-I      intronic
chr2:33710151(+) A-I      intronic
chr2:33759670(+) A-I      intronic
chr2:33759695(+) A-I      intronic
chr2:33761145(+) A-I      intronic
chr2:33761284(+) A-I      intronic
chr2:33762449(+) A-I      intronic
chr2:33762481(+) A-I      intronic
chr2:33708595(+) A-I      intronic
chr2:33714791(+) A-I      intronic
chr2:33762648(+) A-I      intronic
chr2:33762662(+) A-I      intronic
chr2:33762688(+) A-I      intronic
chr2:33770916(+) A-I      intronic
chr2:33771077(+) A-I      intronic
chr2:33771311(+) A-I      intronic
chr2:33771338(+) A-I      intronic
chr2:33776882(+) A-I      intronic
chr2:33776881(+) A-I      intronic
chr2:33732422(+) A-I      intronic
chr2:33710267(+) A-I      intronic
chr2:33710175(+) A-I      intronic
chr2:33776953(+) A-I      intronic
chr2:33710037(+) A-I      intronic
chr2:33708762(+) A-I      intronic
chr2:33708722(+) A-I      intronic
chr2:33776803(+) A-I      intronic
chr2:33776259(+) A-I      intronic
chr2:33776204(+) A-I      intronic
chr2:33776193(+) A-I      intronic
chr2:33714815(+) A-I      intronic
chr2:33711482(+) A-I      intronic
chr2:33716136(+) A-I      intronic
chr2:33721721(+) A-I      intronic
chr2:33721803(+) A-I      intronic
chr2:33761301(+) A-I      intronic
chr2:33762448(+) A-I      intronic
chr2:33776913(+) A-I      intronic
chr2:33776909(+) A-I      intronic
chr2:33685682(+) A-I      intronic
chr2:33708673(+) A-I      intronic
chr2:33685699(+) A-I      intronic
chr2:33687465(+) A-I      intronic
chr2:33687642(+) A-I      intronic
chr2:33687647(+) A-I      intronic
chr2:33694700(+) A-I      intronic
chr2:33712911(+) A-I      intronic
chr2:33708587(+) A-I      intronic
chr2:33721817(+) A-I      intronic
chr2:33721839(+) A-I      intronic
chr2:33721889(+) A-I      intronic
chr2:33721894(+) A-I      intronic
chr2:33732276(+) A-I      intronic
chr2:33732291(+) A-I      intronic
chr2:33712926(+) A-I      intronic
chr2:33716346(+) A-I      intronic
chr2:33732315(+) A-I      intronic
chr2:33708619(+) A-I      intronic
chr2:33732394(+) A-I      intronic
chr2:33694775(+) A-I      intronic
chr2:33727680(+) A-I      intronic
chr2:33759722(+) A-I      intronic
chr2:33761092(+) A-I      intronic
chr2:33708721(+) A-I      intronic
chr2:33767048(+) A-I      intronic
chr2:33710180(+) A-I      intronic
chr2:33771244(+) A-I      intronic
chr2:33710190(+) A-I      intronic
chr2:33710210(+) A-I      intronic
chr2:33761098(+) A-I      intronic
chr2:33721661(+) A-I      intronic
chr2:33732275(+) A-I      intronic
chr2:33774024(+) A-I      intronic
chr2:33771060(+) A-I      intronic
chr2:33714833(+) A-I      intronic
chr2:33694750(+) A-I      intronic
chr2:33712738(+) A-I      intronic
chr2:33708575(+) A-I      intronic
chr2:33732351(+) A-I      intronic
chr2:33779722(+) A-I      intronic
chr2:33732310(+) A-I      intronic
chr2:33714702(+) A-I      intronic
chr2:33774030(+) A-I      intronic
chr2:33732201(+) A-I      intronic
chr2:33779747(+) A-I      intronic
chr2:33708611(+) A-I      intronic
chr2:33776196(+) A-I      intronic
chr2:33774018(+) A-I      intronic
chr2:33759784(+) A-I      intronic
chr2:33768219(+) A-I      intronic
chr2:33762529(+) A-I      intronic
chr2:33771139(+) A-I      intronic
chr2:33732776(+) A-I      intronic
chr2:33711293(+) A-I      intronic
chr2:33689343(+) A-I      intronic
chr2:33771975(+) A-I      intronic
chr2:33770933(+) A-I      intronic
chr2:33778945(+) A-I      intronic
chr2:33776945(+) A-I      intronic
chr2:33732384(+) A-I      intronic
chr2:33710160(+) A-I      intronic
chr2:33716221(+) A-I      intronic
chr2:33716184(+) A-I      intronic
chr2:33721881(+) A-I      intronic
chr2:33710106(+) A-I      intronic
chr2:33776260(+) A-I      intronic
chr2:33762525(+) A-I      intronic
chr2:33710004(+) A-I      intronic
chr2:33771063(+) A-I      intronic
chr2:33708685(+) A-I      intronic
chr2:33732718(+) A-I      intronic
chr2:33711285(+) A-I      intronic
chr2:33716222(+) A-I      intronic
chr2:33714748(+) A-I      intronic
chr2:33768145(+) A-I      intronic
chr2:33767051(+) A-I      intronic
chr2:33732692(+) A-I      intronic
chr2:33759660(+) A-I      intronic
chr2:33727714(+) A-I      intronic
chr2:33734349(+) A-I      intronic
chr2:33724464(+) A-I      intronic
chr2:33734261(+) A-I      intronic
chr2:33770935(+) A-I      intronic
chr2:33711418(+) A-I      intronic
chr2:33711330(+) A-I      intronic
chr2:33711444(+) A-I      intronic
chr2:33710118(+) A-I      intronic
chr2:33716260(+) A-I      intronic
chr2:33708708(+) A-I      intronic
chr2:33769219(+) A-I      intronic
chr2:33763452(+) A-I      intronic
chr2:33734317(+) A-I      intronic
chr2:33779666(+) A-I      intronic
chr2:33708656(+) A-I      intronic
chr2:33714804(+) A-I      intronic
chr2:33764015(+) A-I      intronic
chr2:33710123(+) A-I      intronic
chr2:33720726(+) A-I      intronic
chr2:33732411(+) A-I      intronic
chr2:33711470(+) A-I      intronic
chr2:33710161(+) A-I      intronic
chr2:33721856(+) A-I      intronic
chr2:33762526(+) A-I      intronic
chr2:33767098(+) A-I      intronic
chr2:33732191(+) A-I      intronic
chr2:33710011(+) A-I      intronic
chr2:33759652(+) A-I      intronic
chr2:33763944(+) A-I      intronic
chr2:33732342(+) A-I      intronic
chr2:33716218(+) A-I      intronic
chr2:33724467(+) A-I      intronic
chr2:33711331(+) A-I      intronic
chr2:33708655(+) A-I      intronic
chr2:33776147(+) A-I      intronic
chr2:33710142(+) A-I      intronic
chr2:33705205(+) A-I      intronic
chr2:33712912(+) A-I      intronic
chr2:33732257(+) A-I      intronic
chr2:33776329(+) A-I      intronic
chr2:33771327(+) A-I      intronic
chr2:33725748(+) A-I      intronic
chr2:33732867(+) A-I      intronic
chr2:33725950(+) A-I      intronic
chr2:33732185(+) A-I      intronic
chr2:33716236(+) A-I      intronic
chr2:33761294(+) A-I      intronic
chr2:33716109(+) A-I      intronic
chr2:33732618(+) A-I      intronic
chr2:33712721(+) A-I      intronic
chr2:33776233(+) A-I      intronic
chr2:33710114(+) A-I      intronic
chr2:33714729(+) A-I      intronic
chr2:33714856(+) A-I      intronic
chr2:33710010(+) A-I      intronic
chr2:33710083(+) A-I      intronic
chr2:33770972(+) A-I      intronic
chr2:33710115(+) A-I      intronic
chr2:33732341(+) A-I      intronic
chr2:33771339(+) A-I      intronic
chr2:33763903(+) A-I      intronic
chr2:33710150(+) A-I      intronic
chr2:33778839(+) A-I      intronic
chr2:33716127(+) A-I      intronic
chr2:33779665(+) A-I      intronic
chr2:33763828(+) A-I      intronic
chr2:33778989(+) A-I      intronic
chr2:33721768(+) A-I      intronic
chr2:33712795(+) A-I      intronic
chr2:33708791(+) A-I      intronic
chr2:33714838(+) A-I      intronic
chr2:33770895(+) A-I      intronic
chr2:33714742(+) A-I      intronic
chr2:33724574(+) A-I      intronic
chr2:33714786(+) A-I      intronic
chr2:33727784(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED RASGRP3
chr2:33711331(+) A-I intron -    22327324
chr2:33714669(+) A-I intron -    22327324
chr2:33714748(+) A-I intron -    22327324
chr2:33714839(+) A-I intron -    22327324
chr2:33714856(+) A-I intron -    22327324
chr2:33729980(+) A-I intron -    22327324
chr2:33666155(+) T-C intron -    22484847
chr2:33694728(+) A-G intron -    22484847
chr2:33694750(+) A-G intron -    22484847
chr2:33694775(+) A-G intron -    22484847
chr2:33705205(+) A-G intron -    22484847
chr2:33706260(+) A-G intron -    22484847
chr2:33706368(+) A-G intron -    22484847
chr2:33706370(+) A-G intron -    22484847
chr2:33706436(+) A-G intron -    22484847
chr2:33706471(+) A-G intron -    22484847
chr2:33706815(+) A-G intron -    22484847
chr2:33707288(+) A-G intron -    22484847
chr2:33708574(+) G-T intron -    22484847
chr2:33708575(+) A-G intron -    22484847
chr2:33708611(+) A-G intron -    22484847
chr2:33708619(+) A-G intron -    22484847
chr2:33708655(+) A-G intron -    22484847
chr2:33708656(+) A-G intron -    22484847
chr2:33708685(+) A-G intron -    22484847
chr2:33708765(+) A-G intron -    22484847
chr2:33708791(+) A-G intron -    22484847
chr2:33709994(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710004(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710010(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710011(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710051(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710083(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710105(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710106(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710114(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710115(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710118(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710123(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710132(+) G-A intron -    22484847
chr2:33710142(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710144(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710145(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710154(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710160(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710161(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710171(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710180(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710190(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710197(+) A-G intron -    22484847
chr2:33710210(+) A-G intron -    22484847
chr2:33711244(+) T-G intron -    22484847
chr2:33711245(+) T-A intron -    22484847
chr2:33711293(+) A-G intron -    22484847
chr2:33711325(+) A-G intron -    22484847
chr2:33711330(+) A-G intron -    22484847
chr2:33711331(+) A-G intron -    22484847
chr2:33711418(+) A-G intron -    22484847
chr2:33711437(+) A-G intron -    22484847
chr2:33711444(+) A-G intron -    22484847
chr2:33711470(+) A-G intron -    22484847
chr2:33712721(+) A-G intron -    22484847
chr2:33712731(+) A-G intron -    22484847
chr2:33712738(+) A-G intron -    22484847
chr2:33712767(+) A-G intron -    22484847
chr2:33712770(+) A-G intron -    22484847
chr2:33712926(+) A-G intron -    22484847
chr2:33714702(+) A-G intron -    22484847
chr2:33714729(+) A-G intron -    22484847
chr2:33714744(+) A-G intron -    22484847
chr2:33714748(+) A-G intron -    22484847
chr2:33714786(+) A-G intron -    22484847
chr2:33714804(+) A-G intron -    22484847
chr2:33714813(+) A-G intron -    22484847
chr2:33714833(+) A-G intron -    22484847
chr2:33714838(+) A-G intron -    22484847
chr2:33714839(+) A-G intron -    22484847
chr2:33714856(+) A-G intron -    22484847
chr2:33714878(+) A-G intron -    22484847
chr2:33716109(+) A-G intron -    22484847
chr2:33716127(+) A-G intron -    22484847
chr2:33716128(+) A-G intron -    22484847
chr2:33716184(+) A-G intron -    22484847
chr2:33716201(+) A-G intron -    22484847
chr2:33716218(+) A-G intron -    22484847
chr2:33716221(+) A-G intron -    22484847
chr2:33716222(+) A-G intron -    22484847
chr2:33716230(+) A-G intron -    22484847
chr2:33716259(+) T-C intron -    22484847
chr2:33716260(+) A-G intron -    22484847
chr2:33716279(+) G-A intron -    22484847
chr2:33716346(+) A-G intron -    22484847
chr2:33721856(+) A-G intron -    22484847
chr2:33721881(+) A-G intron -    22484847
chr2:33724464(+) A-G intron -    22484847
chr2:33724465(+) A-G intron -    22484847
chr2:33724467(+) A-G intron -    22484847
chr2:33724550(+) A-G intron -    22484847
chr2:33724574(+) A-G intron -    22484847
chr2:33725950(+) A-G intron -    22484847
chr2:33727583(+) G-T intron -    22484847
chr2:33727680(+) A-G intron -    22484847
chr2:33727714(+) A-G intron -    22484847
chr2:33727779(+) A-G intron -    22484847
chr2:33727784(+) A-G intron -    22484847
chr2:33732191(+) A-G intron -    22484847
chr2:33732201(+) A-G intron -    22484847
chr2:33732238(+) A-G intron -    22484847
chr2:33732257(+) A-G intron -    22484847
chr2:33732310(+) A-G intron -    22484847
chr2:33732315(+) A-G intron -    22484847
chr2:33732341(+) A-G intron -    22484847
chr2:33732351(+) A-G intron -    22484847
chr2:33732384(+) A-G intron -    22484847
chr2:33732394(+) A-G intron -    22484847
chr2:33732411(+) A-G intron -    22484847
chr2:33732718(+) A-G intron -    22484847
chr2:33734349(+) A-G intron -    22484847
chr2:33739597(+) C-A intron -    22484847
chr2:33744620(+) A-G intron -    22484847
chr2:33759652(+) A-G intron -    22484847
chr2:33759660(+) A-G intron -    22484847
chr2:33759729(+) A-G intron -    22484847
chr2:33759784(+) A-T intron -    22484847
chr2:33761092(+) A-G intron -    22484847
chr2:33762495(+) A-G intron -    22484847
chr2:33763449(+) A-G intron -    22484847
chr2:33763828(+) A-G intron -    22484847
chr2:33763837(+) A-G intron -    22484847
chr2:33764015(+) A-G intron -    22484847
chr2:33765035(+) A-G intron -    22484847
chr2:33765068(+) G-A intron -    22484847
chr2:33765073(+) G-A intron -    22484847
chr2:33767051(+) A-G intron -    22484847
chr2:33768019(+) T-C intron -    22484847
chr2:33768145(+) A-G intron -    22484847
chr2:33770895(+) A-G intron -    22484847
chr2:33770933(+) A-G intron -    22484847
chr2:33770935(+) A-G intron -    22484847
chr2:33770972(+) A-G intron -    22484847
chr2:33771063(+) A-G intron -    22484847
chr2:33771139(+) A-G intron -    22484847
chr2:33771327(+) A-G intron -    22484847
chr2:33771339(+) A-G intron -    22484847
chr2:33771969(+) A-G intron -    22484847
chr2:33776196(+) A-G intron -    22484847
chr2:33776233(+) A-G intron -    22484847
chr2:33776260(+) A-G intron -    22484847
chr2:33776312(+) A-G intron -    22484847
chr2:33776329(+) A-G intron -    22484847
chr2:33776945(+) A-G intron -    22484847
chr2:33777057(+) C-A intron -    22484847
chr2:33777058(+) T-A intron -    22484847
chr2:33777059(+) C-A intron -    22484847
chr2:33777061(+) A-C intron -    22484847
chr2:33778839(+) A-G intron -    22484847
chr2:33778892(+) A-G intron -    22484847
chr2:33778933(+) A-G intron -    22484847
chr2:33778935(+) A-G intron -    22484847
chr2:33778945(+) A-G intron -    22484847
chr2:33778971(+) A-G intron -    22484847
chr2:33778986(+) A-G intron -    22484847
chr2:33778989(+) A-G intron -    22484847
chr2:33779665(+) A-G intron -    22484847
chr2:33779666(+) A-G intron -    22484847
chr2:33779679(+) A-G intron -    22484847
chr2:33779706(+) A-G intron -    22484847
chr2:33779722(+) A-G intron -    22484847
chr2:33779747(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase RASGRP3
chr2:33752318-33752319(+) m6A CDS//exon       -
chr2:33752348-33752349(+) m6A CDS//exon       -
chr2:33752353-33752354(+) m6A CDS//exon       -
chr2:33752363-33752364(+) m6A CDS//exon       -
chr2:33752372-33752373(+) m6A CDS//exon       -
chr2:33752412-33752413(+) m6A CDS//exon       -
chr2:33752448-33752449(+) m6A CDS//exon       -
chr2:33755945-33755946(+) m6A exon//intron       -
chr2:33783878-33783879(+) m6A CDS       -
chr2:33783883-33783884(+) m6A CDS       -
chr2:33783912-33783913(+) m6A CDS       -
chr2:33783972-33783973(+) m6A CDS       -
chr2:33784035-33784036(+) m6A CDS       -
chr2:33784054-33784055(+) m6A CDS       -
chr2:33784079-33784080(+) m6A CDS       -
chr2:33784084-33784085(+) m6A CDS       -
chr2:33787819-33787820(+) m6A 3'UTR       -
chr2:33787863-33787864(+) m6A 3'UTR       24981863
chr2:33787930-33787931(+) m6A 3'UTR       -
chr2:33787954-33787955(+) m6A 3'UTR       -
chr2:33787962-33787963(+) m6A 3'UTR       -
chr2:33787994-33787995(+) m6A 3'UTR       -
chr2:33788039-33788040(+) m6A 3'UTR       -
chr2:33788085-33788086(+) m6A 3'UTR       -
chr2:33788145-33788146(+) m6A 3'UTR       -
chr2:33788151-33788152(+) m6A 3'UTR       -

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate RASGRP3
Cytosol K562 cells     -
Exosome Blood     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hbv-miR-B22-3p
Interactor2: RASGRP3

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//Targetscan
Support Database VmiReg

Starting a new search, please wait ...