Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00579503

  Virus:  

Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hbv-miR-B14RC-3p:  MIMAT0031772          ARPC4-TTLL3:  NM_001198793     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hbv-miR-B14RC-3p	ARPC4-TTLL3
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0031772	100526693
Organism	Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	ARC20//ARPC4//p20-ARC

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	ARPC4-TTLL3	chr3:9856877(+) A-I      intronic chr3:9856830(+) A-I      intronic chr3:9856675(+) A-I      intronic chr3:9856181(+) A-I      intronic chr3:9856170(+) A-I      intronic chr3:9856314(+) A-I      intronic chr3:9856875(+) A-I      intronic chr3:9858930(+) A-I      intronic chr3:9875665(+) A-I      intronic chr3:9875609(+) A-I      intronic chr3:9875594(+) A-I      intronic chr3:9859010(+) A-I      intronic chr3:9858946(+) A-I      intronic chr3:9875730(+) A-I      intronic chr3:9858821(+) A-I      intronic chr3:9863485(+) A-I      intronic chr3:9854335(+) A-I      intronic chr3:9854336(+) A-I      intronic chr3:9854338(+) A-I      intronic chr3:9855955(+) A-I      intronic chr3:9856097(+) A-I      intronic chr3:9856171(+) A-I      intronic chr3:9856277(+) A-I      intronic chr3:9856358(+) A-I      intronic chr3:9856683(+) A-I      intronic chr3:9856762(+) A-I      intronic chr3:9858281(+) A-I      intronic chr3:9858294(+) A-I      intronic chr3:9858299(+) A-I      intronic chr3:9858304(+) A-I      intronic chr3:9858680(+) A-I      intronic chr3:9858757(+) A-I      intronic chr3:9858845(+) A-I      intronic chr3:9858854(+) A-I      intronic chr3:9858880(+) A-I      intronic chr3:9858897(+) A-I      intronic chr3:9859014(+) A-I      intronic chr3:9859040(+) A-I      intronic chr3:9863431(+) A-I      intronic chr3:9863440(+) A-I      intronic chr3:9863462(+) A-I      intronic chr3:9863477(+) A-I      intronic chr3:9875640(+) A-I      intronic chr3:9863572(+) A-I      intronic chr3:9863580(+) A-I      intronic chr3:9863693(+) A-I      intronic chr3:9864347(+) A-I      intronic chr3:9864493(+) A-I      intronic chr3:9864680(+) A-I      intronic chr3:9864718(+) A-I      intronic chr3:9864843(+) A-I      intronic chr3:9864910(+) A-I      intronic chr3:9866174(+) A-I      intronic chr3:9866175(+) A-I      intronic chr3:9866224(+) A-I      intronic chr3:9866234(+) A-I      intronic chr3:9866354(+) A-I      intronic chr3:9866525(+) A-I      intronic chr3:9866551(+) A-I      intronic chr3:9866686(+) A-I      intronic chr3:9866712(+) A-I      intronic chr3:9875619(+) A-I      intronic chr3:9875624(+) A-I      intronic chr3:9875638(+) A-I      intronic chr3:9875643(+) A-I      intronic chr3:9875692(+) A-I      intronic chr3:9875659(+) A-I      intronic chr3:9875646(+) A-I      intronic chr3:9875644(+) A-I      intronic chr3:9875642(+) A-I      intronic chr3:9875721(+) A-I      intronic chr3:9875725(+) A-I      intronic chr3:9875741(+) A-I      intronic chr3:9875779(+) A-I      intronic chr3:9875784(+) A-I      intronic chr3:9875637(+) A-I      intronic chr3:9875617(+) A-I      intronic chr3:9858835(+) A-I      intronic chr3:9856921(+) A-I      intronic chr3:9856914(+) A-I      intronic chr3:9866159(+) A-I      intronic chr3:9877765(+) A-I      3'UTR chr3:9877794(+) A-I      3'UTR chr3:9877809(+) A-I      3'UTR chr3:9877828(+) A-I      3'UTR chr3:9877753(+) A-I      3'UTR chr3:9877797(+) A-I      3'UTR chr3:9877852(+) A-I      3'UTR chr3:9877833(+) A-I      3'UTR chr3:9877786(+) A-I      3'UTR chr3:9866505(+) A-I      intronic chr3:9873823(+) A-I      intronic chr3:9855188(+) A-I      intronic chr3:9863657(+) A-I      intronic chr3:9856265(+) A-I      intronic chr3:9875649(+) A-I      intronic chr3:9856385(+) A-I      intronic chr3:9873994(+) A-I      intronic chr3:9866979(+) A-I      intronic chr3:9865050(+) A-I      intronic chr3:9864320(+) A-I      intronic chr3:9859047(+) A-I      intronic chr3:9866834(+) A-I      intronic chr3:9856394(+) A-I      intronic chr3:9856169(+) A-I      intronic chr3:9859058(+) A-I      intronic chr3:9864013(+) A-I      intronic chr3:9866172(+) A-I      intronic chr3:9856845(+) A-I      intronic chr3:9858264(+) A-I      intronic chr3:9856769(+) A-I      intronic chr3:9858771(+) A-I      intronic chr3:9855905(+) A-I      intronic chr3:9858384(+) A-I      intronic chr3:9856666(+) A-I      intronic chr3:9866919(+) A-I      intronic chr3:9866780(+) A-I      intronic chr3:9874007(+) A-I      intronic chr3:9856433(+) A-I      intronic chr3:9858442(+) A-I      intronic chr3:9858958(+) A-I      intronic chr3:9873935(+) A-I      intronic chr3:9858948(+) A-I      intronic chr3:9855218(+) A-I      intronic chr3:9866699(+) A-I      intronic chr3:9866480(+) A-I      intronic chr3:9873981(+) A-I      intronic chr3:9856417(+) A-I      intronic chr3:9855384(+) A-I      intronic chr3:9856667(+) A-I      intronic chr3:9875673(+) A-I      intronic chr3:9856738(+) A-I      intronic chr3:9856777(+) A-I      intronic chr3:9875363(+) A-I      intronic chr3:9855456(+) A-I      intronic chr3:9856221(+) A-I      intronic chr3:9855797(+) A-I      intronic chr3:9855348(+) A-I      intronic chr3:9858987(+) A-I      intronic chr3:9856129(+) A-I      intronic chr3:9858381(+) A-I      intronic chr3:9866767(+) A-I      intronic chr3:9873850(+) A-I      intronic chr3:9855900(+) A-I      intronic chr3:9866885(+) A-I      intronic chr3:9855265(+) A-I      intronic chr3:9858690(+) A-I      intronic chr3:9855452(+) A-I      intronic chr3:9856168(+) A-I      intronic chr3:9855917(+) A-I      intronic chr3:9873909(+) A-I      intronic chr3:9856510(+) A-I      intronic chr3:9877760(+) A-I      3'UTR chr3:9877836(+) A-I      3'UTR chr3:9877732(+) A-I      3'UTR chr3:9877872(+) A-I      3'UTR chr3:9877791(+) A-I      3'UTR chr3:9877862(+) A-I      3'UTR chr3:9877885(+) A-I      3'UTR chr3:9877898(+) A-I      3'UTR chr3:9877856(+) A-I      3'UTR chr3:9866647(+) A-I      intronic chr3:9864812(+) A-I      intronic chr3:9855448(+) A-I      intronic chr3:9866872(+) A-I      intronic chr3:9866605(+) A-I      intronic chr3:9858744(+) A-I      intronic chr3:9856804(+) A-I      intronic chr3:9866804(+) A-I      intronic chr3:9856450(+) A-I      intronic chr3:9858317(+) A-I      intronic chr3:9858443(+) A-I      intronic chr3:9875513(+) A-I      intronic chr3:9856165(+) A-I      intronic chr3:9873596(+) A-I      intronic chr3:9855278(+) A-I      intronic chr3:9858300(+) A-I      intronic chr3:9856689(+) A-I      intronic chr3:9855371(+) A-I      intronic chr3:9856874(+) A-I      intronic chr3:9866687(+) A-I      intronic chr3:9856195(+) A-I      intronic chr3:9858945(+) A-I      intronic chr3:9866881(+) A-I      intronic chr3:9855262(+) A-I      intronic chr3:9858993(+) A-I      intronic chr3:9866297(+) A-I      intronic chr3:9855873(+) A-I      intronic chr3:9858951(+) A-I      intronic chr3:9864301(+) A-I      intronic chr3:9875585(+) A-I      intronic chr3:9856760(+) A-I      intronic chr3:9864252(+) A-I      intronic chr3:9856809(+) A-I      intronic chr3:9864350(+) A-I      intronic chr3:9866833(+) A-I      intronic chr3:9858415(+) A-I      intronic chr3:9855720(+) A-I      intronic chr3:9866151(+) A-I      intronic chr3:9864957(+) A-I      intronic chr3:9858270(+) A-I      intronic chr3:9858853(+) A-I      intronic chr3:9856456(+) A-I      intronic chr3:9863916(+) A-I      intronic chr3:9855726(+) A-I      intronic chr3:9855727(+) A-I      intronic chr3:9856384(+) A-I      intronic chr3:9875708(+) A-I      intronic chr3:9864947(+) A-I      intronic chr3:9850098(+) A-I      intronic chr3:9863615(+) A-I      intronic chr3:9858921(+) A-I      intronic chr3:9858386(+) A-I      intronic chr3:9856833(+) A-I      intronic chr3:9864675(+) A-I      intronic chr3:9864727(+) A-I      intronic chr3:9875382(+) A-I      intronic chr3:9864239(+) A-I      intronic chr3:9856347(+) A-I      intronic chr3:9859053(+) A-I      intronic chr3:9856211(+) A-I      intronic chr3:9866820(+) A-I      intronic chr3:9856176(+) A-I      intronic chr3:9855440(+) A-I      intronic chr3:9856746(+) A-I      intronic chr3:9866781(+) A-I      intronic chr3:9858265(+) A-I      intronic chr3:9856803(+) A-I      intronic chr3:9856282(+) A-I      intronic chr3:9866315(+) A-I      intronic chr3:9858749(+) A-I      intronic chr3:9854319(+) A-I      intronic chr3:9858401(+) A-I      intronic chr3:9858920(+) A-I      intronic chr3:9856772(+) A-I      intronic chr3:9863564(+) A-I      intronic chr3:9875580(+) A-I      intronic chr3:9855285(+) A-I      intronic chr3:9858947(+) A-I      intronic chr3:9856172(+) A-I      intronic chr3:9866194(+) A-I      intronic chr3:9866554(+) A-I      intronic chr3:9855426(+) A-I      intronic chr3:9853998(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	ARPC4-TTLL3	chr3:9876395(+) A-I exon CDS    15342557

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	ARPC4-TTLL3	chr3:9834835-9834836(+) m6A intron       24284625//24981863 chr3:9839409-9839410(+) m6A CDS       24284625//24981863//22575960 chr3:9839471-9839472(+) m6A intron       24981863 chr3:9841668-9841669(+) m6A intron       - chr3:9841713-9841714(+) m6A intron       - chr3:9841976-9841977(+) m6A CDS//intron       - chr3:9843408-9843409(+) m6A CDS//intron       27773535 chr3:9845235-9845236(+) m6A intron       27773535 chr3:9845579-9845580(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       26404942//27773535 chr3:9845593-9845594(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       26404942//27773535 chr3:9848135-9848136(+) m6A intron       27773535 chr3:9848159-9848160(+) m6A intron       27773535 chr3:9848165-9848166(+) m6A intron       27773535 chr3:9852149-9852150(+) m6A intron       - chr3:9860448-9860449(+) m6A intron       - chr3:9860454-9860455(+) m6A intron       - chr3:9860508-9860509(+) m6A intron       - chr3:9861056-9861057(+) m6A intron       24981863//27773535 chr3:9862551-9862552(+) m6A intron       24284625 chr3:9862561-9862562(+) m6A intron       24284625 chr3:9862636-9862637(+) m6A intron       24981863 chr3:9862653-9862654(+) m6A intron       24981863 chr3:9868695-9868696(+) m6A CDS       - chr3:9870687-9870688(+) m6A CDS       - chr3:9870720-9870721(+) m6A CDS       - chr3:9870836-9870837(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22608085 chr3:9870846-9870847(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22608085 chr3:9870909-9870910(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22608085 chr3:9871035-9871036(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085 chr3:9876507-9876508(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085 chr3:9876547-9876548(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr3:9876623-9876624(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr3:9876735-9876736(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr3:9876848-9876849(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr3:9876901-9876902(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr3:9876911-9876912(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr3:9876956-9876957(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr3:9877076-9877077(+) m6A 3'UTR       24209618

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ARPC4-TTLL3	Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hbv-miR-B14RC-3p
Interactor2: ARPC4-TTLL3

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	VmiReg