Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00579060

  Virus:  

Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hbv-miR-B14RC-3p:  MIMAT0031772          TSPAN33:  NM_178562     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hbv-miR-B14RC-3p	TSPAN33
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0031772	340348
Organism	Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	PEN//PEN.//TSPAN-33

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	TSPAN33	chr7:128795707(+) A-I      intronic chr7:128795711(+) A-I      intronic chr7:128789188(+) A-I      intronic chr7:128789189(+) A-I      intronic chr7:128795602(+) A-I      intronic chr7:128805544(+) A-I      intronic chr7:128795626(+) A-I      intronic chr7:128791071(+) A-I      intronic chr7:128795627(+) A-I      intronic chr7:128795691(+) A-I      intronic chr7:128795692(+) A-I      intronic chr7:128793580(+) A-I      intronic chr7:128791037(+) A-I      intronic chr7:128791068(+) A-I      intronic chr7:128795792(+) A-I      intronic chr7:128791023(+) A-I      intronic chr7:128792381(+) A-I      intronic chr7:128789288(+) A-I      intronic chr7:128789284(+) A-I      intronic chr7:128789237(+) A-I      intronic chr7:128805541(+) A-I      intronic chr7:128792448(+) A-I      intronic chr7:128805517(+) A-I      intronic chr7:128792478(+) A-I      intronic chr7:128799799(+) A-I      intronic chr7:128805990(+) A-I      intronic chr7:128805834(+) A-I      intronic chr7:128792756(+) A-I      intronic chr7:128792772(+) A-I      intronic chr7:128792768(+) A-I      intronic chr7:128801032(+) A-I      intronic chr7:128801016(+) A-I      intronic chr7:128793684(+) A-I      intronic chr7:128791042(+) A-I      intronic chr7:128805946(+) A-I      intronic chr7:128795586(+) A-I      intronic chr7:128803283(+) A-I      intronic chr7:128791226(+) A-I      intronic chr7:128799764(+) A-I      intronic chr7:128801141(+) A-I      intronic chr7:128791169(+) A-I      intronic chr7:128805947(+) A-I      intronic chr7:128789228(+) A-I      intronic chr7:128805983(+) A-I      intronic chr7:128801111(+) A-I      intronic chr7:128792473(+) A-I      intronic chr7:128805522(+) A-I      intronic chr7:128793605(+) A-I      intronic chr7:128799780(+) A-I      intronic chr7:128792337(+) A-I      intronic chr7:128792407(+) A-I      intronic chr7:128805905(+) A-I      intronic chr7:128805622(+) A-I      intronic chr7:128792408(+) A-I      intronic chr7:128805852(+) A-I      intronic chr7:128806042(+) A-I      intronic chr7:128794089(+) A-I      intronic chr7:128801044(+) A-I      intronic chr7:128789272(+) A-I      intronic chr7:128805965(+) A-I      intronic chr7:128805961(+) A-I      intronic chr7:128792463(+) A-I      intronic chr7:128801015(+) A-I      intronic chr7:128805624(+) A-I      intronic chr7:128805604(+) A-I      intronic chr7:128792449(+) A-I      intronic chr7:128795582(+) A-I      intronic chr7:128791144(+) A-I      intronic chr7:128805964(+) A-I      intronic chr7:128791027(+) A-I      intronic chr7:128806015(+) A-I      intronic chr7:128792491(+) A-I      intronic chr7:128805920(+) A-I      intronic chr7:128795649(+) A-I      intronic chr7:128805590(+) A-I      intronic chr7:128806043(+) A-I      intronic chr7:128795738(+) A-I      intronic chr7:128805589(+) A-I      intronic chr7:128805482(+) A-I      intronic chr7:128805586(+) A-I      intronic chr7:128795624(+) A-I      intronic chr7:128805858(+) A-I      intronic chr7:128805630(+) A-I      intronic chr7:128806055(+) A-I      intronic chr7:128805496(+) A-I      intronic chr7:128795637(+) A-I      intronic chr7:128795642(+) A-I      intronic chr7:128799785(+) A-I      intronic chr7:128805942(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	TSPAN33	chr7:128805482(+) A-I intron -    22327324 chr7:128805496(+) A-I intron -    22327324 chr7:128805630(+) A-I intron -    22327324 chr7:128805831(+) A-I intron -    22327324 chr7:128789228(+) A-G intron -    22484847 chr7:128789243(+) G-A intron -    22484847 chr7:128789272(+) A-G intron -    22484847 chr7:128791027(+) A-G intron -    22484847 chr7:128791042(+) A-G intron -    22484847 chr7:128791047(+) A-G intron -    22484847 chr7:128791107(+) A-G intron -    22484847 chr7:128791144(+) A-G intron -    22484847 chr7:128791169(+) A-G intron -    22484847 chr7:128791196(+) A-G intron -    22484847 chr7:128791226(+) A-G intron -    22484847 chr7:128792337(+) A-G intron -    22484847 chr7:128792407(+) A-G intron -    22484847 chr7:128792408(+) A-G intron -    22484847 chr7:128792463(+) A-G intron -    22484847 chr7:128792491(+) A-G intron -    22484847 chr7:128793971(+) A-G intron -    22484847 chr7:128794089(+) A-G intron -    22484847 chr7:128794120(+) A-G intron -    22484847 chr7:128794142(+) A-G intron -    22484847 chr7:128795582(+) A-G intron -    22484847 chr7:128795586(+) A-G intron -    22484847 chr7:128795624(+) A-G intron -    22484847 chr7:128795637(+) A-G intron -    22484847 chr7:128795642(+) A-G intron -    22484847 chr7:128795648(+) A-G intron -    22484847 chr7:128795695(+) A-G intron -    22484847 chr7:128799008(+) T-C intron -    22484847 chr7:128799764(+) A-G intron -    22484847 chr7:128801044(+) A-G intron -    22484847 chr7:128801111(+) A-G intron -    22484847 chr7:128803529(+) A-G intron -    22484847 chr7:128803538(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805482(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805496(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805518(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805522(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805536(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805586(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805590(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805599(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805622(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805624(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805630(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805681(+) T-G intron -    22484847 chr7:128805696(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805831(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805842(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805896(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805918(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805920(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805942(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805946(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805947(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805961(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805964(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805965(+) A-G intron -    22484847 chr7:128805983(+) A-G intron -    22484847 chr7:128806010(+) A-G intron -    22484847 chr7:128806015(+) A-G intron -    22484847 chr7:128806042(+) A-G intron -    22484847 chr7:128806043(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	TSPAN33	chr7:128807745-128807746(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085 chr7:128807766-128807767(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085 chr7:128807846-128807847(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//22608085 chr7:128808085-128808086(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//22608085 chr7:128808114-128808115(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863//22608085 chr7:128808152-128808153(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863//22608085 chr7:128808233-128808234(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	TSPAN33	Exosome Blood     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hbv-miR-B14RC-3p
Interactor2: TSPAN33

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	VmiReg