Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00575136

  Virus:  

Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hbv-miR-B14RC-3p:           ADGRL3:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hbv-miR-B14RC-3p ADGRL3
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0031772 23284
Organism Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - CIRL3//CL3//LEC3//LPHN3

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR ADGRL3
chr4:62465168(+) A-I      intronic
chr4:62364189(+) A-I      intronic
chr4:62627329(+) A-I      intronic
chr4:62627328(+) A-I      intronic
chr4:62608876(+) A-I      intronic
chr4:62608861(+) A-I      intronic
chr4:62465190(+) A-I      intronic
chr4:62465192(+) A-I      intronic
chr4:62890426(+) A-I      intronic
chr4:62890432(+) A-I      intronic
chr4:62890463(+) A-I      intronic
chr4:62890471(+) A-I      intronic
chr4:62890485(+) A-I      intronic
chr4:62465217(+) A-I      intronic
chr4:62608805(+) A-I      intronic
chr4:62608789(+) A-I      intronic
chr4:62465839(+) A-I      intronic
chr4:62364188(+) A-I      intronic
chr4:62465816(+) A-I      intronic
chr4:62465234(+) A-I      intronic
chr4:62465231(+) A-I      intronic
chr4:62627322(+) A-I      intronic
chr4:62375122(+) A-I      intronic
chr4:62375120(+) A-I      intronic
chr4:62375098(+) A-I      intronic
chr4:62609030(+) A-I      intronic
chr4:62609027(+) A-I      intronic
chr4:62609025(+) A-I      intronic
chr4:62826452(+) A-I      intronic
chr4:62826448(+) A-I      intronic
chr4:62627333(+) A-I      intronic
chr4:62364202(+) A-I      intronic
chr4:62364187(+) A-I      intronic
chr4:62890501(+) A-I      intronic
chr4:62406146(+) A-I      intronic
chr4:62583672(+) A-I      intronic
chr4:62548964(+) A-I      intronic
chr4:62363516(+) A-I      intronic
chr4:62406124(+) A-I      intronic
chr4:62717290(+) A-I      intronic
chr4:62497552(+) A-I      intronic
chr4:62722915(+) A-I      intronic
chr4:62817512(+) A-I      intronic
chr4:62815240(+) A-I      intronic
chr4:62709680(+) A-I      intronic
chr4:62583696(+) A-I      intronic
chr4:62770050(+) A-I      intronic
chr4:62484592(+) A-I      intronic
chr4:62644682(+) A-I      intronic
chr4:62627408(+) A-I      intronic
chr4:62627500(+) A-I      intronic
chr4:62773941(+) A-I      intronic
chr4:62687220(+) A-I      intronic
chr4:62795737(+) A-I      intronic
chr4:62711202(+) A-I      intronic
chr4:62465772(+) A-I      intronic
chr4:62735350(+) A-I      intronic
chr4:62571496(+) A-I      intronic
chr4:62735536(+) A-I      intronic
chr4:62735535(+) A-I      intronic
chr4:62556071(+) A-I      intronic
chr4:62571490(+) A-I      intronic
chr4:62710215(+) A-I      intronic
chr4:62705153(+) A-I      intronic
chr4:62661018(+) A-I      intronic
chr4:62608205(+) A-I      intronic
chr4:62462496(+) A-I      intronic
chr4:62864394(+) A-I      intronic
chr4:62406216(+) A-I      intronic
chr4:62773934(+) A-I      intronic
chr4:62734822(+) A-I      intronic
chr4:62753310(+) A-I      intronic
chr4:62709595(+) A-I      intronic
chr4:62883666(+) A-I      intronic
chr4:62462435(+) A-I      intronic
chr4:62722855(+) A-I      intronic
chr4:62562519(+) A-I      intronic
chr4:62645245(+) A-I      intronic
chr4:62709615(+) A-I      intronic
chr4:62608891(+) A-I      intronic
chr4:62627270(+) A-I      intronic
chr4:62705042(+) A-I      intronic
chr4:62583673(+) A-I      intronic
chr4:62734773(+) A-I      intronic
chr4:62484698(+) A-I      intronic
chr4:62774059(+) A-I      intronic
chr4:62627422(+) A-I      intronic
chr4:62563158(+) A-I      intronic
chr4:62406163(+) A-I      intronic
chr4:62465850(+) A-I      intronic
chr4:62769269(+) A-I      intronic
chr4:62773851(+) A-I      intronic
chr4:62495234(+) A-I      intronic
chr4:62734761(+) A-I      intronic
chr4:62608963(+) A-I      intronic
chr4:62735562(+) A-I      intronic
chr4:62608259(+) A-I      intronic
chr4:62644629(+) A-I      intronic
chr4:62629110(+) A-I      intronic
chr4:62773874(+) A-I      intronic
chr4:62645290(+) A-I      intronic
chr4:62627334(+) A-I      intronic
chr4:62556064(+) A-I      intronic
chr4:62734897(+) A-I      intronic
chr4:62904580(+) A-I      intronic
chr4:62627496(+) A-I      intronic
chr4:62711266(+) A-I      intronic
chr4:62696003(+) A-I      intronic
chr4:62645232(+) A-I      intronic
chr4:62774258(+) A-I      intronic
chr4:62735577(+) A-I      intronic
chr4:62711855(+) A-I      intronic
chr4:62608792(+) A-I      intronic
chr4:62465840(+) A-I      intronic
chr4:62735553(+) A-I      intronic
chr4:62562578(+) A-I      intronic
chr4:62660939(+) A-I      intronic
chr4:62608272(+) A-I      intronic
chr4:62722886(+) A-I      intronic
chr4:62465216(+) A-I      intronic
chr4:62883655(+) A-I      intronic
chr4:62879107(+) A-I      intronic
chr4:62679005(+) A-I      intronic
chr4:62735062(+) A-I      intronic
chr4:62735408(+) A-I      intronic
chr4:62705402(+) A-I      intronic
chr4:62734844(+) A-I      intronic

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase ADGRL3
chr4:62067082-62067083(+) m6A 5'UTR       25456834//24981863//22608085
chr4:62067115-62067116(+) m6A 5'UTR       25456834//24981863//22608085
chr4:62067125-62067126(+) m6A 5'UTR       25456834//24981863//22608085
chr4:62067133-62067134(+) m6A 5'UTR       25456834//24981863//22608085
chr4:62067203-62067204(+) m6A 5'UTR       25456834//24981863//22608085
chr4:62067267-62067268(+) m6A 5'UTR       25456834//24981863//22608085
chr4:62598487-62598488(+) m6A CDS       22608085
chr4:62598514-62598515(+) m6A CDS       22608085
chr4:62598558-62598559(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr4:62598599-62598600(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr4:62598611-62598612(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr4:62598661-62598662(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr4:62598756-62598757(+) m6A CDS       24209618//24981863//22608085
chr4:62598779-62598780(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22608085
chr4:62598867-62598868(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22608085
chr4:62598913-62598914(+) m6A CDS       25456834//24981863//22608085
chr4:62598918-62598919(+) m6A CDS       25456834//24981863//22608085
chr4:62598948-62598949(+) m6A CDS       25456834//24981863//22575960//22608085
chr4:62598974-62598975(+) m6A CDS       25456834//24981863//22575960//22608085
chr4:62599194-62599195(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr4:62599252-62599253(+) m6A CDS       22608085
chr4:62935838-62935839(+) m6A CDS       22608085
chr4:62935949-62935950(+) m6A 3'UTR//CDS       24209618//24981863//22608085
chr4:62935972-62935973(+) m6A 3'UTR//CDS       24209618//24981863//22608085
chr4:62936001-62936002(+) m6A 3'UTR//CDS       24209618//24981863//22608085
chr4:62936033-62936034(+) m6A 3'UTR//CDS       24209618//24981863//22608085
chr4:62936055-62936056(+) m6A 3'UTR//CDS       24209618//24981863//22608085
chr4:62936060-62936061(+) m6A 3'UTR//CDS       24209618//24981863//22608085
chr4:62936075-62936076(+) m6A 3'UTR//CDS       24209618//24981863//22608085
chr4:62936172-62936173(+) m6A 3'UTR//CDS       24209618//24981863//22608085
chr4:62936231-62936232(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863//22608085
chr4:62936273-62936274(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863//22608085
chr4:62936342-62936343(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863//22608085
chr4:62936413-62936414(+) m6A 3'UTR//CDS       24209618//25456834//24981863//22608085
chr4:62936418-62936419(+) m6A 3'UTR//CDS       24209618//25456834//24981863//22608085
chr4:62936474-62936475(+) m6A 3'UTR//CDS       24209618//24981863//22608085
chr4:62936489-62936490(+) m6A 3'UTR//CDS       24209618//24981863//22608085
chr4:62936561-62936562(+) m6A 3'UTR//CDS       24209618//24981863//22608085
chr4:62936572-62936573(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863//22608085
chr4:62936598-62936599(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863//22608085
chr4:62936646-62936647(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr4:62936655-62936656(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr4:62936743-62936744(+) m6A 3'UTR       22608085
chr4:62936753-62936754(+) m6A 3'UTR       22608085
chr4:62936761-62936762(+) m6A 3'UTR       22608085
chr4:62936867-62936868(+) m6A 3'UTR       22608085
chr4:62936885-62936886(+) m6A 3'UTR       22608085
chr4:62936980-62936981(+) m6A 3'UTR       22608085
chr4:62937002-62937003(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr4:62937055-62937056(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr4:62937077-62937078(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr4:62937144-62937145(+) m6A 3'UTR       22608085
chr4:62937154-62937155(+) m6A 3'UTR       22608085

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate ADGRL3
Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hbv-miR-B14RC-3p
Interactor2: ADGRL3

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//PITA//RNAHybrid
Support Database VmiReg

Starting a new search, please wait ...