Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00570651

  Virus:  

Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hbv-miR-B26-5p:  MIMAT0031771          PCBD2:  NM_032151     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hbv-miR-B26-5p	PCBD2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0031771	84105
Organism	Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	DCOH2//DCOHM//PHS2

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	PCBD2	chr5:134265002(+) A-I      intronic chr5:134265058(+) A-I      intronic chr5:134265481(+) A-I      intronic chr5:134265511(+) A-I      intronic chr5:134265527(+) A-I      intronic chr5:134266682(+) A-I      intronic chr5:134266720(+) A-I      intronic chr5:134266797(+) A-I      intronic chr5:134266799(+) A-I      intronic chr5:134266847(+) A-I      intronic chr5:134269055(+) A-I      intronic chr5:134269126(+) A-I      intronic chr5:134269128(+) A-I      intronic chr5:134289301(+) A-I      intronic chr5:134289370(+) A-I      intronic chr5:134289376(+) A-I      intronic chr5:134289412(+) A-I      intronic chr5:134251845(+) A-I      intronic chr5:134263026(+) A-I      intronic chr5:134263049(+) A-I      intronic chr5:134263053(+) A-I      intronic chr5:134264499(+) A-I      intronic chr5:134264446(+) A-I      intronic chr5:134264445(+) A-I      intronic chr5:134264437(+) A-I      intronic chr5:134250528(+) A-I      intronic chr5:134250501(+) A-I      intronic chr5:134250486(+) A-I      intronic chr5:134245558(+) A-I      intronic chr5:134244193(+) A-I      intronic chr5:134244189(+) A-I      intronic chr5:134244168(+) A-I      intronic chr5:134244148(+) A-I      intronic chr5:134244116(+) A-I      intronic chr5:134244091(+) A-I      intronic chr5:134243727(+) A-I      intronic chr5:134243714(+) A-I      intronic chr5:134251833(+) A-I      intronic chr5:134251797(+) A-I      intronic chr5:134251768(+) A-I      intronic chr5:134251350(+) A-I      intronic chr5:134250884(+) A-I      intronic chr5:134250818(+) A-I      intronic chr5:134250809(+) A-I      intronic chr5:134250625(+) A-I      intronic chr5:134250563(+) A-I      intronic chr5:134250546(+) A-I      intronic chr5:134250498(+) A-I      intronic chr5:134250479(+) A-I      intronic chr5:134250462(+) A-I      intronic chr5:134250455(+) A-I      intronic chr5:134250448(+) A-I      intronic chr5:134250442(+) A-I      intronic chr5:134250441(+) A-I      intronic chr5:134245594(+) A-I      intronic chr5:134245557(+) A-I      intronic chr5:134245553(+) A-I      intronic chr5:134245534(+) A-I      intronic chr5:134241692(+) A-I      intronic chr5:134245509(+) A-I      intronic chr5:134251892(+) A-I      intronic chr5:134251905(+) A-I      intronic chr5:134245178(+) A-I      intronic chr5:134245199(+) A-I      intronic chr5:134245200(+) A-I      intronic chr5:134245202(+) A-I      intronic chr5:134245203(+) A-I      intronic chr5:134254045(+) A-I      intronic chr5:134254048(+) A-I      intronic chr5:134254061(+) A-I      intronic chr5:134254064(+) A-I      intronic chr5:134254140(+) A-I      intronic chr5:134258577(+) A-I      intronic chr5:134245165(+) A-I      intronic chr5:134245166(+) A-I      intronic chr5:134245167(+) A-I      intronic chr5:134245182(+) A-I      intronic chr5:134259180(+) A-I      intronic chr5:134259181(+) A-I      intronic chr5:134259231(+) A-I      intronic chr5:134259612(+) A-I      intronic chr5:134259618(+) A-I      intronic chr5:134259622(+) A-I      intronic chr5:134259633(+) A-I      intronic chr5:134264270(+) A-I      intronic chr5:134264327(+) A-I      intronic chr5:134264347(+) A-I      intronic chr5:134241949(+) A-I      intronic chr5:134242023(+) A-I      intronic chr5:134242093(+) A-I      intronic chr5:134243014(+) A-I      intronic chr5:134243033(+) A-I      intronic chr5:134264367(+) A-I      intronic chr5:134264378(+) A-I      intronic chr5:134264404(+) A-I      intronic chr5:134243051(+) A-I      intronic chr5:134243099(+) A-I      intronic chr5:134243192(+) A-I      intronic chr5:134243205(+) A-I      intronic chr5:134243497(+) A-I      intronic chr5:134243523(+) A-I      intronic chr5:134243573(+) A-I      intronic chr5:134243629(+) A-I      intronic chr5:134243735(+) A-I      intronic chr5:134244244(+) A-I      intronic chr5:134244275(+) A-I      intronic chr5:134244276(+) A-I      intronic chr5:134244300(+) A-I      intronic chr5:134244310(+) A-I      intronic chr5:134244312(+) A-I      intronic chr5:134244320(+) A-I      intronic chr5:134244342(+) A-I      intronic chr5:134245487(+) A-I      intronic chr5:134264431(+) A-I      intronic chr5:134264495(+) A-I      intronic chr5:134276634(+) A-I      intronic chr5:134276626(+) A-I      intronic chr5:134276565(+) A-I      intronic chr5:134269025(+) A-I      intronic chr5:134254033(+) A-I      intronic chr5:134254030(+) A-I      intronic chr5:134244178(+) A-I      intronic chr5:134244169(+) A-I      intronic chr5:134259688(+) A-I      intronic chr5:134261470(+) A-I      intronic chr5:134261686(+) A-I      intronic chr5:134261695(+) A-I      intronic chr5:134262945(+) A-I      intronic chr5:134262946(+) A-I      intronic chr5:134289789(+) A-I      intronic chr5:134289834(+) A-I      intronic chr5:134289872(+) A-I      intronic chr5:134289765(+) A-I      intronic chr5:134262969(+) A-I      intronic chr5:134262978(+) A-I      intronic chr5:134262981(+) A-I      intronic chr5:134262984(+) A-I      intronic chr5:134262990(+) A-I      intronic chr5:134262996(+) A-I      intronic chr5:134289759(+) A-I      intronic chr5:134289419(+) A-I      intronic chr5:134262999(+) A-I      intronic chr5:134263004(+) A-I      intronic chr5:134263006(+) A-I      intronic chr5:134263014(+) A-I      intronic chr5:134263020(+) A-I      intronic chr5:134263021(+) A-I      intronic chr5:134263023(+) A-I      intronic chr5:134297569(+) A-I      3'UTR chr5:134297050(+) A-I      3'UTR chr5:134297069(+) A-I      3'UTR chr5:134297075(+) A-I      3'UTR chr5:134296715(+) A-I      3'UTR chr5:134297593(+) A-I      3'UTR chr5:134297598(+) A-I      3'UTR chr5:134297617(+) A-I      3'UTR chr5:134298044(+) A-I      3'UTR chr5:134298046(+) A-I      3'UTR chr5:134297618(+) A-I      3'UTR chr5:134297624(+) A-I      3'UTR chr5:134297881(+) A-I      3'UTR chr5:134297911(+) A-I      3'UTR chr5:134298047(+) A-I      3'UTR chr5:134298140(+) A-I      3'UTR chr5:134298152(+) A-I      3'UTR chr5:134298179(+) A-I      3'UTR chr5:134296476(+) A-I      3'UTR chr5:134296622(+) A-I      3'UTR chr5:134296637(+) A-I      3'UTR chr5:134296707(+) A-I      3'UTR chr5:134296717(+) A-I      3'UTR chr5:134296586(+) A-I      3'UTR chr5:134296735(+) A-I      3'UTR chr5:134297019(+) A-I      3'UTR chr5:134297077(+) A-I      3'UTR chr5:134297093(+) A-I      3'UTR chr5:134243452(+) A-I      intronic chr5:134258452(+) A-I      intronic chr5:134244203(+) A-I      intronic chr5:134250791(+) A-I      intronic chr5:134264261(+) A-I      intronic chr5:134250885(+) A-I      intronic chr5:134243845(+) A-I      intronic chr5:134265595(+) A-I      intronic chr5:134277732(+) A-I      intronic chr5:134288210(+) A-I      intronic chr5:134253978(+) A-I      intronic chr5:134243413(+) A-I      intronic chr5:134264933(+) A-I      intronic chr5:134276685(+) A-I      intronic chr5:134289840(+) A-I      intronic chr5:134245573(+) A-I      intronic chr5:134250543(+) A-I      intronic chr5:134269206(+) A-I      intronic chr5:134257916(+) A-I      intronic chr5:134244208(+) A-I      intronic chr5:134243821(+) A-I      intronic chr5:134251834(+) A-I      intronic chr5:134289925(+) A-I      intronic chr5:134289848(+) A-I      intronic chr5:134241958(+) A-I      intronic chr5:134264336(+) A-I      intronic chr5:134251402(+) A-I      intronic chr5:134250955(+) A-I      intronic chr5:134266694(+) A-I      intronic chr5:134264939(+) A-I      intronic chr5:134244164(+) A-I      intronic chr5:134258548(+) A-I      intronic chr5:134266846(+) A-I      intronic chr5:134250541(+) A-I      intronic chr5:134251925(+) A-I      intronic chr5:134250960(+) A-I      intronic chr5:134250798(+) A-I      intronic chr5:134243663(+) A-I      intronic chr5:134250491(+) A-I      intronic chr5:134244121(+) A-I      intronic chr5:134264916(+) A-I      intronic chr5:134264475(+) A-I      intronic chr5:134242985(+) A-I      intronic chr5:134264300(+) A-I      intronic chr5:134244100(+) A-I      intronic chr5:134242011(+) A-I      intronic chr5:134250392(+) A-I      intronic chr5:134241736(+) A-I      intronic chr5:134245599(+) A-I      intronic chr5:134243063(+) A-I      intronic chr5:134289368(+) A-I      intronic chr5:134250933(+) A-I      intronic chr5:134251769(+) A-I      intronic chr5:134250819(+) A-I      intronic chr5:134251393(+) A-I      intronic chr5:134241618(+) A-I      intronic chr5:134289787(+) A-I      intronic chr5:134243414(+) A-I      intronic chr5:134264457(+) A-I      intronic chr5:134297473(+) A-I      3'UTR chr5:134297056(+) A-I      3'UTR chr5:134297882(+) A-I      3'UTR chr5:134297837(+) A-I      3'UTR chr5:134297105(+) A-I      3'UTR chr5:134297725(+) A-I      3'UTR chr5:134298022(+) A-I      3'UTR chr5:134297531(+) A-I      3'UTR chr5:134297537(+) A-I      3'UTR chr5:134297921(+) A-I      3'UTR chr5:134297894(+) A-I      3'UTR chr5:134297248(+) A-I      3'UTR chr5:134297973(+) A-I      3'UTR chr5:134297660(+) A-I      3'UTR chr5:134296518(+) A-I      3'UTR chr5:134296475(+) A-I      3'UTR chr5:134297142(+) A-I      3'UTR chr5:134245669(+) A-I      intronic chr5:134243142(+) A-I      intronic chr5:134258640(+) A-I      intronic chr5:134245613(+) A-I      intronic chr5:134250639(+) A-I      intronic chr5:134244343(+) A-I      intronic chr5:134245705(+) A-I      intronic chr5:134250769(+) A-I      intronic chr5:134243846(+) A-I      intronic chr5:134245633(+) A-I      intronic chr5:134243555(+) A-I      intronic chr5:134244198(+) A-I      intronic chr5:134265451(+) A-I      intronic chr5:134257969(+) A-I      intronic chr5:134253980(+) A-I      intronic chr5:134264938(+) A-I      intronic chr5:134250962(+) A-I      intronic chr5:134265646(+) A-I      intronic chr5:134289223(+) A-I      intronic chr5:134269065(+) A-I      intronic chr5:134243709(+) A-I      intronic chr5:134258573(+) A-I      intronic chr5:134244105(+) A-I      intronic chr5:134251724(+) A-I      intronic chr5:134269083(+) A-I      intronic chr5:134251327(+) A-I      intronic chr5:134242101(+) A-I      intronic chr5:134250862(+) A-I      intronic chr5:134264917(+) A-I      intronic chr5:134251267(+) A-I      intronic chr5:134251403(+) A-I      intronic chr5:134250624(+) A-I      intronic chr5:134245685(+) A-I      intronic chr5:134276829(+) A-I      intronic chr5:134242035(+) A-I      intronic chr5:134242076(+) A-I      intronic chr5:134243710(+) A-I      intronic chr5:134258580(+) A-I      intronic chr5:134244235(+) A-I      intronic chr5:134265435(+) A-I      intronic chr5:134251943(+) A-I      intronic chr5:134250858(+) A-I      intronic chr5:134288440(+) A-I      intronic chr5:134243034(+) A-I      intronic chr5:134264305(+) A-I      intronic chr5:134257987(+) A-I      intronic chr5:134250752(+) A-I      intronic chr5:134264957(+) A-I      intronic chr5:134250815(+) A-I      intronic chr5:134241974(+) A-I      intronic chr5:134268946(+) A-I      intronic chr5:134243344(+) A-I      intronic chr5:134242105(+) A-I      intronic chr5:134243442(+) A-I      intronic chr5:134241744(+) A-I      intronic chr5:134265645(+) A-I      intronic chr5:134243795(+) A-I      intronic chr5:134251751(+) A-I      intronic chr5:134276690(+) A-I      intronic chr5:134245598(+) A-I      intronic chr5:134243117(+) A-I      intronic chr5:134265499(+) A-I      intronic chr5:134265482(+) A-I      intronic chr5:134245639(+) A-I      intronic chr5:134244234(+) A-I      intronic chr5:134243722(+) A-I      intronic chr5:134251826(+) A-I      intronic chr5:134264469(+) A-I      intronic chr5:134243886(+) A-I      intronic chr5:134251881(+) A-I      intronic chr5:134265456(+) A-I      intronic chr5:134244099(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	PCBD2	chr5:134241974(+) A-G intron -    22484847 chr5:134242076(+) A-G intron -    22484847 chr5:134242101(+) A-G intron -    22484847 chr5:134242105(+) A-G intron -    22484847 chr5:134243034(+) A-G intron -    22484847 chr5:134243063(+) A-G intron -    22484847 chr5:134243068(+) A-G intron -    22484847 chr5:134243073(+) A-G intron -    22484847 chr5:134243193(+) A-G intron -    22484847 chr5:134243328(+) A-T intron -    22484847 chr5:134243413(+) A-G intron -    22484847 chr5:134243414(+) A-G intron -    22484847 chr5:134243457(+) C-T intron -    22484847 chr5:134243555(+) A-G intron -    22484847 chr5:134243709(+) A-G intron -    22484847 chr5:134243710(+) A-G intron -    22484847 chr5:134243739(+) A-G intron -    22484847 chr5:134244105(+) A-G intron -    22484847 chr5:134244164(+) A-G intron -    22484847 chr5:134244234(+) A-G intron -    22484847 chr5:134244235(+) A-G intron -    22484847 chr5:134245597(+) A-G intron -    22484847 chr5:134245598(+) A-G intron -    22484847 chr5:134245603(+) A-G intron -    22484847 chr5:134245633(+) A-G intron -    22484847 chr5:134245639(+) A-G intron -    22484847 chr5:134245685(+) A-G intron -    22484847 chr5:134250491(+) A-G intron -    22484847 chr5:134250541(+) A-G intron -    22484847 chr5:134250543(+) A-G intron -    22484847 chr5:134250791(+) A-G intron -    22484847 chr5:134250815(+) A-G intron -    22484847 chr5:134250819(+) A-G intron -    22484847 chr5:134250858(+) A-G intron -    22484847 chr5:134250862(+) A-G intron -    22484847 chr5:134250885(+) A-G intron -    22484847 chr5:134250933(+) A-G intron -    22484847 chr5:134251237(+) A-G intron -    22484847 chr5:134251255(+) A-G intron -    22484847 chr5:134251277(+) A-G intron -    22484847 chr5:134251393(+) A-G intron -    22484847 chr5:134251402(+) A-G intron -    22484847 chr5:134251403(+) A-G intron -    22484847 chr5:134251751(+) A-G intron -    22484847 chr5:134251769(+) A-G intron -    22484847 chr5:134251829(+) A-G intron -    22484847 chr5:134251834(+) A-G intron -    22484847 chr5:134251881(+) A-G intron -    22484847 chr5:134257916(+) A-G intron -    22484847 chr5:134257970(+) A-G intron -    22484847 chr5:134257987(+) A-G intron -    22484847 chr5:134258452(+) A-G intron -    22484847 chr5:134258573(+) A-G intron -    22484847 chr5:134264300(+) A-G intron -    22484847 chr5:134264939(+) A-G intron -    22484847 chr5:134264957(+) A-G intron -    22484847 chr5:134265435(+) A-G intron -    22484847 chr5:134265521(+) A-G intron -    22484847 chr5:134265575(+) A-G intron -    22484847 chr5:134265595(+) A-G intron -    22484847 chr5:134265645(+) A-G intron -    22484847 chr5:134265646(+) A-G intron -    22484847 chr5:134266688(+) A-G intron -    22484847 chr5:134266694(+) A-G intron -    22484847 chr5:134266701(+) A-G intron -    22484847 chr5:134266815(+) A-G intron -    22484847 chr5:134266846(+) A-G intron -    22484847 chr5:134269038(+) A-G intron -    22484847 chr5:134289223(+) A-G intron -    22484847 chr5:134289368(+) A-G intron -    22484847 chr5:134289787(+) A-G intron -    22484847 chr5:134245851(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	PCBD2	chr5:134240989-134240990(+) m6A intron       - chr5:134240998-134240999(+) m6A intron       - chr5:134241008-134241009(+) m6A intron       - chr5:134241061-134241062(+) m6A intron       - chr5:134241092-134241093(+) m6A intron       - chr5:134241154-134241155(+) m6A intron       - chr5:134241169-134241170(+) m6A intron       - chr5:134241230-134241231(+) m6A intron       - chr5:134260286-134260287(+) m6A intron       24981863//28052920//27773535//22575960//22608085 chr5:134296342-134296343(+) Y CDS       26075521 chr5:134332120-134332121(+) m6A 3'UTR       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	PCBD2	Chromatin K562 cells     - Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Cytosol K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Nucleus HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hbv-miR-B26-5p
Interactor2: PCBD2

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	VmiReg