Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00570253

  Virus:  

Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hbv-miR-B26-5p:           CDKAL1:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hbv-miR-B26-5p CDKAL1
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0031771 54901
Organism Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - -

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR CDKAL1
chr6:21174159(+) A-I      intronic
chr6:21174099(+) A-I      intronic
chr6:21171650(+) A-I      intronic
chr6:21171645(+) A-I      intronic
chr6:21171585(+) A-I      intronic
chr6:21171583(+) A-I      intronic
chr6:21171545(+) A-I      intronic
chr6:21171537(+) A-I      intronic
chr6:21171508(+) A-I      intronic
chr6:21171494(+) A-I      intronic
chr6:21171493(+) A-I      intronic
chr6:21169716(+) A-I      intronic
chr6:20899425(+) A-I      intronic
chr6:20958044(+) A-I      intronic
chr6:20958046(+) A-I      intronic
chr6:20958055(+) A-I      intronic
chr6:21089511(+) A-I      intronic
chr6:21089521(+) A-I      intronic
chr6:20899453(+) A-I      intronic
chr6:20899470(+) A-I      intronic
chr6:20899516(+) A-I      intronic
chr6:20899525(+) A-I      intronic
chr6:20924132(+) A-I      intronic
chr6:20849734(+) A-I      intronic
chr6:20924146(+) A-I      intronic
chr6:20934845(+) A-I      intronic
chr6:20934847(+) A-I      intronic
chr6:20935024(+) A-I      intronic
chr6:20935025(+) A-I      intronic
chr6:20935227(+) A-I      intronic
chr6:20935244(+) A-I      intronic
chr6:20935263(+) A-I      intronic
chr6:20935272(+) A-I      intronic
chr6:20935307(+) A-I      intronic
chr6:20937378(+) A-I      intronic
chr6:20937504(+) A-I      intronic
chr6:20942699(+) A-I      intronic
chr6:20942778(+) A-I      intronic
chr6:20942803(+) A-I      intronic
chr6:20942938(+) A-I      intronic
chr6:20943128(+) A-I      intronic
chr6:20943141(+) A-I      intronic
chr6:20946722(+) A-I      intronic
chr6:20946735(+) A-I      intronic
chr6:20947646(+) A-I      intronic
chr6:20947670(+) A-I      intronic
chr6:20947671(+) A-I      intronic
chr6:21169701(+) A-I      intronic
chr6:21157604(+) A-I      intronic
chr6:21157581(+) A-I      intronic
chr6:21149651(+) A-I      intronic
chr6:21144946(+) A-I      intronic
chr6:21144937(+) A-I      intronic
chr6:21144856(+) A-I      intronic
chr6:21125862(+) A-I      intronic
chr6:21125859(+) A-I      intronic
chr6:21123521(+) A-I      intronic
chr6:21123157(+) A-I      intronic
chr6:21123137(+) A-I      intronic
chr6:20947718(+) A-I      intronic
chr6:20948381(+) A-I      intronic
chr6:20948482(+) A-I      intronic
chr6:20948511(+) A-I      intronic
chr6:20951031(+) A-I      intronic
chr6:20951034(+) A-I      intronic
chr6:21174160(+) A-I      intronic
chr6:20951094(+) A-I      intronic
chr6:20958082(+) A-I      intronic
chr6:20973915(+) A-I      intronic
chr6:20973936(+) A-I      intronic
chr6:20977988(+) A-I      intronic
chr6:20978007(+) A-I      intronic
chr6:20980034(+) A-I      intronic
chr6:20981984(+) A-I      intronic
chr6:20899555(+) A-I      intronic
chr6:20849693(+) A-I      intronic
chr6:20849691(+) A-I      intronic
chr6:20849635(+) A-I      intronic
chr6:20849623(+) A-I      intronic
chr6:20849622(+) A-I      intronic
chr6:20849560(+) A-I      intronic
chr6:20849559(+) A-I      intronic
chr6:20981993(+) A-I      intronic
chr6:20982552(+) A-I      intronic
chr6:20983829(+) A-I      intronic
chr6:20983832(+) A-I      intronic
chr6:20983873(+) A-I      intronic
chr6:20985889(+) A-I      intronic
chr6:20988123(+) A-I      intronic
chr6:20990210(+) A-I      intronic
chr6:20990295(+) A-I      intronic
chr6:20990353(+) A-I      intronic
chr6:21089525(+) A-I      intronic
chr6:21089531(+) A-I      intronic
chr6:21089543(+) A-I      intronic
chr6:21089546(+) A-I      intronic
chr6:20899556(+) A-I      intronic
chr6:21089553(+) A-I      intronic
chr6:21089556(+) A-I      intronic
chr6:21089558(+) A-I      intronic
chr6:21089565(+) A-I      intronic
chr6:21207517(+) A-I      intronic
chr6:20849233(+) A-I      intronic
chr6:20849163(+) A-I      intronic
chr6:21207525(+) A-I      intronic
chr6:21207530(+) A-I      intronic
chr6:21207560(+) A-I      intronic
chr6:20899863(+) A-I      intronic
chr6:20899916(+) A-I      intronic
chr6:20899917(+) A-I      intronic
chr6:20537583(+) A-I      intronic
chr6:20537605(+) A-I      intronic
chr6:20537609(+) A-I      intronic
chr6:20537716(+) A-I      intronic
chr6:20537717(+) A-I      intronic
chr6:20546924(+) A-I      intronic
chr6:20548618(+) A-I      intronic
chr6:20548649(+) A-I      intronic
chr6:20548653(+) A-I      intronic
chr6:20549938(+) A-I      intronic
chr6:20549942(+) A-I      intronic
chr6:20550471(+) A-I      intronic
chr6:20550483(+) A-I      intronic
chr6:20551663(+) A-I      intronic
chr6:20849123(+) A-I      intronic
chr6:20849091(+) A-I      intronic
chr6:20839059(+) A-I      intronic
chr6:20838949(+) A-I      intronic
chr6:20551716(+) A-I      intronic
chr6:20802435(+) A-I      intronic
chr6:20802414(+) A-I      intronic
chr6:20802408(+) A-I      intronic
chr6:20802275(+) A-I      intronic
chr6:20800966(+) A-I      intronic
chr6:20786936(+) A-I      intronic
chr6:21204045(+) A-I      intronic
chr6:20551808(+) A-I      intronic
chr6:20557013(+) A-I      intronic
chr6:20557057(+) A-I      intronic
chr6:20557066(+) A-I      intronic
chr6:20557119(+) A-I      intronic
chr6:20557148(+) A-I      intronic
chr6:20557175(+) A-I      intronic
chr6:20557190(+) A-I      intronic
chr6:20562852(+) A-I      intronic
chr6:20562862(+) A-I      intronic
chr6:20562922(+) A-I      intronic
chr6:20562936(+) A-I      intronic
chr6:20562943(+) A-I      intronic
chr6:20568187(+) A-I      intronic
chr6:20568802(+) A-I      intronic
chr6:20990453(+) A-I      intronic
chr6:20991859(+) A-I      intronic
chr6:20992511(+) A-I      intronic
chr6:21005078(+) A-I      intronic
chr6:21005082(+) A-I      intronic
chr6:21019204(+) A-I      intronic
chr6:21019283(+) A-I      intronic
chr6:21019345(+) A-I      intronic
chr6:20786932(+) A-I      intronic
chr6:20786833(+) A-I      intronic
chr6:20786829(+) A-I      intronic
chr6:20786828(+) A-I      intronic
chr6:20786798(+) A-I      intronic
chr6:20786792(+) A-I      intronic
chr6:20786381(+) A-I      intronic
chr6:20786358(+) A-I      intronic
chr6:20552134(+) A-I      intronic
chr6:20552180(+) A-I      intronic
chr6:20553515(+) A-I      intronic
chr6:20553530(+) A-I      intronic
chr6:20553533(+) A-I      intronic
chr6:20553544(+) A-I      intronic
chr6:20553564(+) A-I      intronic
chr6:20553578(+) A-I      intronic
chr6:20553579(+) A-I      intronic
chr6:20935058(+) A-I      intronic
chr6:20786294(+) A-I      intronic
chr6:20785746(+) A-I      intronic
chr6:20785724(+) A-I      intronic
chr6:20785664(+) A-I      intronic
chr6:20785651(+) A-I      intronic
chr6:20785627(+) A-I      intronic
chr6:20784813(+) A-I      intronic
chr6:20784341(+) A-I      intronic
chr6:20784333(+) A-I      intronic
chr6:20784324(+) A-I      intronic
chr6:20784323(+) A-I      intronic
chr6:20784297(+) A-I      intronic
chr6:20784294(+) A-I      intronic
chr6:20784288(+) A-I      intronic
chr6:20784261(+) A-I      intronic
chr6:20784260(+) A-I      intronic
chr6:20780016(+) A-I      intronic
chr6:20780006(+) A-I      intronic
chr6:20779855(+) A-I      intronic
chr6:20694536(+) A-I      intronic
chr6:20777739(+) A-I      intronic
chr6:20677553(+) A-I      intronic
chr6:20679329(+) A-I      intronic
chr6:20679354(+) A-I      intronic
chr6:20777688(+) A-I      intronic
chr6:20777611(+) A-I      intronic
chr6:20751084(+) A-I      intronic
chr6:20751043(+) A-I      intronic
chr6:20553580(+) A-I      intronic
chr6:20553581(+) A-I      intronic
chr6:20553593(+) A-I      intronic
chr6:20553625(+) A-I      intronic
chr6:20553642(+) A-I      intronic
chr6:20553665(+) A-I      intronic
chr6:20553722(+) A-I      intronic
chr6:20553992(+) A-I      intronic
chr6:20554043(+) A-I      intronic
chr6:20555681(+) A-I      intronic
chr6:20555933(+) A-I      intronic
chr6:20556060(+) A-I      intronic
chr6:20556434(+) A-I      intronic
chr6:20901728(+) A-I      intronic
chr6:20679365(+) A-I      intronic
chr6:20679367(+) A-I      intronic
chr6:20680588(+) A-I      intronic
chr6:20680590(+) A-I      intronic
chr6:20901810(+) A-I      intronic
chr6:20902108(+) A-I      intronic
chr6:20556460(+) A-I      intronic
chr6:20902133(+) A-I      intronic
chr6:20568805(+) A-I      intronic
chr6:20568815(+) A-I      intronic
chr6:20586722(+) A-I      intronic
chr6:20586726(+) A-I      intronic
chr6:20587318(+) A-I      intronic
chr6:20587383(+) A-I      intronic
chr6:20587913(+) A-I      intronic
chr6:20597430(+) A-I      intronic
chr6:20635023(+) A-I      intronic
chr6:20684511(+) A-I      intronic
chr6:20693108(+) A-I      intronic
chr6:20694122(+) A-I      intronic
chr6:20635025(+) A-I      intronic
chr6:20635165(+) A-I      intronic
chr6:20637532(+) A-I      intronic
chr6:20637538(+) A-I      intronic
chr6:20637595(+) A-I      intronic
chr6:20639045(+) A-I      intronic
chr6:20644645(+) A-I      intronic
chr6:21197295(+) A-I      intronic
chr6:21197269(+) A-I      intronic
chr6:21197260(+) A-I      intronic
chr6:21197231(+) A-I      intronic
chr6:21197160(+) A-I      intronic
chr6:21195519(+) A-I      intronic
chr6:20694512(+) A-I      intronic
chr6:21195433(+) A-I      intronic
chr6:21193148(+) A-I      intronic
chr6:20875409(+) A-I      intronic
chr6:21193115(+) A-I      intronic
chr6:20902144(+) A-I      intronic
chr6:20902149(+) A-I      intronic
chr6:21193097(+) A-I      intronic
chr6:21174293(+) A-I      intronic
chr6:20556481(+) A-I      intronic
chr6:20556492(+) A-I      intronic
chr6:20556510(+) A-I      intronic
chr6:20556566(+) A-I      intronic
chr6:20556991(+) A-I      intronic
chr6:20749859(+) A-I      intronic
chr6:20734370(+) A-I      intronic
chr6:20734351(+) A-I      intronic
chr6:20734345(+) A-I      intronic
chr6:20734259(+) A-I      intronic
chr6:20734237(+) A-I      intronic
chr6:20734230(+) A-I      intronic
chr6:20730996(+) A-I      intronic
chr6:20644670(+) A-I      intronic
chr6:20644790(+) A-I      intronic
chr6:20644796(+) A-I      intronic
chr6:20645708(+) A-I      intronic
chr6:20730995(+) A-I      intronic
chr6:20730956(+) A-I      intronic
chr6:21019346(+) A-I      intronic
chr6:21019360(+) A-I      intronic
chr6:21019363(+) A-I      intronic
chr6:21019418(+) A-I      intronic
chr6:20645783(+) A-I      intronic
chr6:20646352(+) A-I      intronic
chr6:20646381(+) A-I      intronic
chr6:20646388(+) A-I      intronic
chr6:20646391(+) A-I      intronic
chr6:20874890(+) A-I      intronic
chr6:20874943(+) A-I      intronic
chr6:20874839(+) A-I      intronic
chr6:20677428(+) A-I      intronic
chr6:20677431(+) A-I      intronic
chr6:20874660(+) A-I      intronic
chr6:20874634(+) A-I      intronic
chr6:20677443(+) A-I      intronic
chr6:20958071(+) A-I      intronic
chr6:20724871(+) A-I      intronic
chr6:20724293(+) A-I      intronic
chr6:20722184(+) A-I      intronic
chr6:20722156(+) A-I      intronic
chr6:20958041(+) A-I      intronic
chr6:20879163(+) A-I      intronic
chr6:20879157(+) A-I      intronic
chr6:20879109(+) A-I      intronic
chr6:20860379(+) A-I      intronic
chr6:20677445(+) A-I      intronic
chr6:21020773(+) A-I      intronic
chr6:20552145(+) A-I      intronic
chr6:21123073(+) A-I      intronic
chr6:21113682(+) A-I      intronic
chr6:21111139(+) A-I      intronic
chr6:21111135(+) A-I      intronic
chr6:21089019(+) A-I      intronic
chr6:21088972(+) A-I      intronic
chr6:21088971(+) A-I      intronic
chr6:21088934(+) A-I      intronic
chr6:20850786(+) A-I      intronic
chr6:21020792(+) A-I      intronic
chr6:21020838(+) A-I      intronic
chr6:21020844(+) A-I      intronic
chr6:21021031(+) A-I      intronic
chr6:21021077(+) A-I      intronic
chr6:21052692(+) A-I      intronic
chr6:21052789(+) A-I      intronic
chr6:21052878(+) A-I      intronic
chr6:21052991(+) A-I      intronic
chr6:21067749(+) A-I      intronic
chr6:21067764(+) A-I      intronic
chr6:21087660(+) A-I      intronic
chr6:21087678(+) A-I      intronic
chr6:21088923(+) A-I      intronic
chr6:20850834(+) A-I      intronic
chr6:20850773(+) A-I      intronic
chr6:20944052(+) A-I      intronic
chr6:21089548(+) A-I      intronic
chr6:20850858(+) A-I      intronic
chr6:20850869(+) A-I      intronic
chr6:20855464(+) A-I      intronic
chr6:20550052(+) A-I      intronic
chr6:20551214(+) A-I      intronic
chr6:20551303(+) A-I      intronic
chr6:20849290(+) A-I      intronic
chr6:20875343(+) A-I      intronic
chr6:20875346(+) A-I      intronic
chr6:20875353(+) A-I      intronic
chr6:21221673(+) A-I      intronic
chr6:20879108(+) A-I      intronic
chr6:20734340(+) A-I      intronic
chr6:21221659(+) A-I      intronic
chr6:21221633(+) A-I      intronic
chr6:21221589(+) A-I      intronic
chr6:20734335(+) A-I      intronic
chr6:20924086(+) A-I      intronic
chr6:20734321(+) A-I      intronic
chr6:20556446(+) A-I      intronic
chr6:20554251(+) A-I      intronic
chr6:20554235(+) A-I      intronic
chr6:20554225(+) A-I      intronic
chr6:20554217(+) A-I      intronic
chr6:20554213(+) A-I      intronic
chr6:20553494(+) A-I      intronic
chr6:20553486(+) A-I      intronic
chr6:20924116(+) A-I      intronic
chr6:21221318(+) A-I      intronic
chr6:21221313(+) A-I      intronic
chr6:21207682(+) A-I      intronic
chr6:21207396(+) A-I      intronic
chr6:21207305(+) A-I      intronic
chr6:21207283(+) A-I      intronic
chr6:20875376(+) A-I      intronic
chr6:20875436(+) A-I      intronic
chr6:20899395(+) A-I      intronic
chr6:20899413(+) A-I      intronic
chr6:20941268(+) A-I      intronic
chr6:20973254(+) A-I      intronic
chr6:21139974(+) A-I      intronic
chr6:20552159(+) A-I      intronic
chr6:20982564(+) A-I      intronic
chr6:20874931(+) A-I      intronic
chr6:21123631(+) A-I      intronic
chr6:20556409(+) A-I      intronic
chr6:20899479(+) A-I      intronic
chr6:20677830(+) A-I      intronic
chr6:20934850(+) A-I      intronic
chr6:20550233(+) A-I      intronic
chr6:20937538(+) A-I      intronic
chr6:20556485(+) A-I      intronic
chr6:21230486(+) A-I      intronic
chr6:20588350(+) A-I      intronic
chr6:20982490(+) A-I      intronic
chr6:20552459(+) A-I      intronic
chr6:20587708(+) A-I      intronic
chr6:21207261(+) A-I      intronic
chr6:20680363(+) A-I      intronic
chr6:20874674(+) A-I      intronic
chr6:20989014(+) A-I      intronic
chr6:20983727(+) A-I      intronic
chr6:20551673(+) A-I      intronic
chr6:21007605(+) A-I      intronic
chr6:20586746(+) A-I      intronic
chr6:20557929(+) A-I      intronic
chr6:20732636(+) A-I      intronic
chr6:21029424(+) A-I      intronic
chr6:21123601(+) A-I      intronic
chr6:21169611(+) A-I      intronic
chr6:20556579(+) A-I      intronic
chr6:21123571(+) A-I      intronic
chr6:20557081(+) A-I      intronic
chr6:20849212(+) A-I      intronic
chr6:20841256(+) A-I      intronic
chr6:20552512(+) A-I      intronic
chr6:20536979(+) A-I      intronic
chr6:21114763(+) A-I      intronic
chr6:20645701(+) A-I      intronic
chr6:20554117(+) A-I      intronic
chr6:20841891(+) A-I      intronic
chr6:20552500(+) A-I      intronic
chr6:20679275(+) A-I      intronic
chr6:20802276(+) A-I      intronic
chr6:20553463(+) A-I      intronic
chr6:20556443(+) A-I      intronic
chr6:20991674(+) A-I      intronic
chr6:20732701(+) A-I      intronic
chr6:20552314(+) A-I      intronic
chr6:20546914(+) A-I      intronic
chr6:20553900(+) A-I      intronic
chr6:20551738(+) A-I      intronic
chr6:21149471(+) A-I      intronic
chr6:20557007(+) A-I      intronic
chr6:20557105(+) A-I      intronic
chr6:20550376(+) A-I      intronic
chr6:20975089(+) A-I      intronic
chr6:20555971(+) A-I      intronic
chr6:20562885(+) A-I      intronic
chr6:21221539(+) A-I      intronic
chr6:20993018(+) A-I      intronic
chr6:20553525(+) A-I      intronic
chr6:21207630(+) A-I      intronic
chr6:20556528(+) A-I      intronic
chr6:20750401(+) A-I      intronic
chr6:20550310(+) A-I      intronic
chr6:20983702(+) A-I      intronic
chr6:21207556(+) A-I      intronic
chr6:20550452(+) A-I      intronic
chr6:20553498(+) A-I      intronic
chr6:20637783(+) A-I      intronic
chr6:20553629(+) A-I      intronic
chr6:20975130(+) A-I      intronic
chr6:21221599(+) A-I      intronic
chr6:20587292(+) A-I      intronic
chr6:20844817(+) A-I      intronic
chr6:20554180(+) A-I      intronic
chr6:20841901(+) A-I      intronic
chr6:20879328(+) A-I      intronic
chr6:21113864(+) A-I      intronic
chr6:20557080(+) A-I      intronic
chr6:20617205(+) A-I      intronic
chr6:20554310(+) A-I      intronic
chr6:20950538(+) A-I      intronic
chr6:20556341(+) A-I      intronic
chr6:21207244(+) A-I      intronic
chr6:20901791(+) A-I      intronic
chr6:21231845(+) A-I      3'UTR
chr6:20568307(+) A-I      intronic
chr6:21221607(+) A-I      intronic
chr6:20983688(+) A-I      intronic
chr6:20554004(+) A-I      intronic
chr6:20568246(+) A-I      intronic
chr6:20568233(+) A-I      intronic
chr6:20551618(+) A-I      intronic
chr6:20814702(+) A-I      intronic
chr6:20934818(+) A-I      intronic
chr6:21122971(+) A-I      intronic
chr6:20552417(+) A-I      intronic
chr6:20974088(+) A-I      intronic
chr6:20568014(+) A-I      intronic
chr6:21114302(+) A-I      intronic
chr6:20549817(+) A-I      intronic
chr6:20563839(+) A-I      intronic
chr6:20637539(+) A-I      intronic
chr6:20786336(+) A-I      intronic
chr6:20557214(+) A-I      intronic
chr6:20556475(+) A-I      intronic
chr6:21094105(+) A-I      intronic
chr6:20981913(+) A-I      intronic
chr6:20568339(+) A-I      intronic
chr6:20644075(+) A-I      intronic
chr6:20549971(+) A-I      intronic
chr6:20934821(+) A-I      intronic
chr6:20637225(+) A-I      intronic
chr6:21089652(+) A-I      intronic
chr6:20940902(+) A-I      intronic
chr6:20980106(+) A-I      intronic
chr6:20878699(+) A-I      intronic
chr6:21029418(+) A-I      intronic
chr6:20552422(+) A-I      intronic
chr6:21123626(+) A-I      intronic
chr6:20786376(+) A-I      intronic
chr6:20554077(+) A-I      intronic
chr6:21221602(+) A-I      intronic
chr6:20749827(+) A-I      intronic
chr6:20975103(+) A-I      intronic
chr6:20942781(+) A-I      intronic
chr6:20786935(+) A-I      intronic
chr6:20759544(+) A-I      intronic
chr6:20553620(+) A-I      intronic
chr6:20724879(+) A-I      intronic
chr6:21007396(+) A-I      intronic
chr6:20550339(+) A-I      intronic
chr6:20947701(+) A-I      intronic
chr6:20901651(+) A-I      intronic
chr6:21207418(+) A-I      intronic
chr6:20885102(+) A-I      intronic
chr6:20975119(+) A-I      intronic
chr6:20849735(+) A-I      intronic
chr6:20779957(+) A-I      intronic
chr6:20948329(+) A-I      intronic
chr6:20551679(+) A-I      intronic
chr6:20555652(+) A-I      intronic
chr6:20849165(+) A-I      intronic
chr6:20863245(+) A-I      intronic
chr6:20947737(+) A-I      intronic
chr6:20645868(+) A-I      intronic
chr6:20554234(+) A-I      intronic
chr6:21052787(+) A-I      intronic
chr6:20724306(+) A-I      intronic
chr6:20947566(+) A-I      intronic
chr6:20554271(+) A-I      intronic
chr6:20849063(+) A-I      intronic
chr6:20724750(+) A-I      intronic
chr6:20786197(+) A-I      intronic
chr6:20934941(+) A-I      intronic
chr6:21221572(+) A-I      intronic
chr6:20853493(+) A-I      intronic
chr6:20551728(+) A-I      intronic
chr6:20551178(+) A-I      intronic
chr6:20639048(+) A-I      intronic
chr6:20557108(+) A-I      intronic
chr6:20732356(+) A-I      intronic
chr6:20993077(+) A-I      intronic
chr6:20555626(+) A-I      intronic
chr6:20948318(+) A-I      intronic
chr6:20552420(+) A-I      intronic
chr6:21156397(+) A-I      intronic
chr6:20950090(+) A-I      intronic
chr6:20555902(+) A-I      intronic
chr6:20554231(+) A-I      intronic
chr6:20902147(+) A-I      intronic
chr6:20557903(+) A-I      intronic
chr6:20934957(+) A-I      intronic
chr6:20850781(+) A-I      intronic
chr6:21089053(+) A-I      intronic
chr6:20644079(+) A-I      intronic
chr6:20553619(+) A-I      intronic
chr6:20786291(+) A-I      intronic
chr6:20554022(+) A-I      intronic
chr6:20724692(+) A-I      intronic
chr6:21020828(+) A-I      intronic
chr6:20555918(+) A-I      intronic
chr6:20555749(+) A-I      intronic
chr6:21195961(+) A-I      intronic
chr6:20786290(+) A-I      intronic
chr6:20548683(+) A-I      intronic
chr6:20552169(+) A-I      intronic
chr6:20555772(+) A-I      intronic
chr6:20841301(+) A-I      intronic
chr6:20982461(+) A-I      intronic
chr6:20902227(+) A-I      intronic
chr6:20951036(+) A-I      intronic
chr6:20899864(+) A-I      intronic
chr6:20554284(+) A-I      intronic
chr6:21174156(+) A-I      intronic
chr6:20554190(+) A-I      intronic
chr6:20563825(+) A-I      intronic
chr6:20553981(+) A-I      intronic
chr6:20553971(+) A-I      intronic
chr6:20975010(+) A-I      intronic
chr6:20730435(+) A-I      intronic
chr6:20554311(+) A-I      intronic
chr6:20552181(+) A-I      intronic
chr6:21172936(+) A-I      intronic
chr6:20899396(+) A-I      intronic
chr6:21122890(+) A-I      intronic
chr6:21206091(+) A-I      intronic
chr6:21221136(+) A-I      intronic
chr6:21146961(+) A-I      intronic
chr6:20585465(+) A-I      intronic
chr6:20554168(+) A-I      intronic
chr6:20974050(+) A-I      intronic
chr6:21052793(+) A-I      intronic
chr6:20934894(+) A-I      intronic
chr6:21052788(+) A-I      intronic
chr6:21091165(+) A-I      intronic
chr6:20556476(+) A-I      intronic
chr6:21047415(+) A-I      intronic
chr6:20724686(+) A-I      intronic
chr6:20975079(+) A-I      intronic
chr6:20548582(+) A-I      intronic
chr6:20557107(+) A-I      intronic
chr6:20556367(+) A-I      intronic
chr6:20991724(+) A-I      intronic
chr6:20553943(+) A-I      intronic
chr6:20975050(+) A-I      intronic
chr6:21091230(+) A-I      intronic
chr6:20693240(+) A-I      intronic
chr6:20551278(+) A-I      intronic
chr6:20801344(+) A-I      intronic
chr6:20554078(+) A-I      intronic
chr6:21114050(+) A-I      intronic
chr6:20645841(+) A-I      intronic
chr6:20880626(+) A-I      intronic
chr6:21067696(+) A-I      intronic
chr6:20901801(+) A-I      intronic
chr6:20554123(+) A-I      intronic
chr6:20550073(+) A-I      intronic
chr6:20684584(+) A-I      intronic
chr6:20550428(+) A-I      intronic
chr6:20637014(+) A-I      intronic
chr6:20849205(+) A-I      intronic
chr6:20556436(+) A-I      intronic
chr6:21207289(+) A-I      intronic
chr6:20874552(+) A-I      intronic
chr6:20551272(+) A-I      intronic
chr6:20553539(+) A-I      intronic
chr6:21122997(+) A-I      intronic
chr6:20902077(+) A-I      intronic
chr6:21011626(+) A-I      intronic
chr6:20556488(+) A-I      intronic
chr6:20874888(+) A-I      intronic
chr6:20943039(+) A-I      intronic
chr6:20551226(+) A-I      intronic
chr6:21067722(+) A-I      intronic
chr6:20943088(+) A-I      intronic
chr6:20951020(+) A-I      intronic
chr6:21171561(+) A-I      intronic
chr6:20880677(+) A-I      intronic
chr6:20732378(+) A-I      intronic
chr6:20645912(+) A-I      intronic
chr6:20688025(+) A-I      intronic
chr6:20935266(+) A-I      intronic
chr6:20992951(+) A-I      intronic
chr6:20899909(+) A-I      intronic
chr6:20981818(+) A-I      intronic
chr6:20644653(+) A-I      intronic
chr6:20557224(+) A-I      intronic
chr6:20637744(+) A-I      intronic
chr6:20568502(+) A-I      intronic
chr6:20639143(+) A-I      intronic
chr6:20588145(+) A-I      intronic
chr6:20677827(+) A-I      intronic
chr6:20639065(+) A-I      intronic
chr6:20902112(+) A-I      intronic
chr6:20750165(+) A-I      intronic
chr6:21156396(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED CDKAL1
chr6:20552315(+) A-I intron -    22327324
chr6:21232239(+) T-G intron -    21725310
chr6:21181108(+) A-G intron -    22484847
chr6:20546914(+) A-G intron -    22484847
chr6:20548582(+) A-G intron -    22484847
chr6:20548683(+) A-G intron -    22484847
chr6:20549907(+) A-G intron -    22484847
chr6:20549955(+) A-G intron -    22484847
chr6:20549971(+) A-G intron -    22484847
chr6:20550229(+) A-G intron -    22484847
chr6:20550310(+) A-G intron -    22484847
chr6:20550327(+) A-G intron -    22484847
chr6:20550339(+) A-G intron -    22484847
chr6:20550349(+) A-G intron -    22484847
chr6:20551226(+) A-G intron -    22484847
chr6:20551618(+) A-G intron -    22484847
chr6:20551679(+) A-G intron -    22484847
chr6:20552169(+) A-G intron -    22484847
chr6:20552181(+) A-G intron -    22484847
chr6:20552212(+) A-G intron -    22484847
chr6:20552314(+) A-G intron -    22484847
chr6:20552315(+) A-G intron -    22484847
chr6:20552417(+) A-G intron -    22484847
chr6:20552422(+) A-G intron -    22484847
chr6:20552459(+) A-G intron -    22484847
chr6:20552500(+) A-G intron -    22484847
chr6:20552508(+) A-G intron -    22484847
chr6:20553463(+) A-G intron -    22484847
chr6:20553498(+) A-G intron -    22484847
chr6:20553619(+) A-G intron -    22484847
chr6:20553900(+) A-G intron -    22484847
chr6:20553971(+) A-G intron -    22484847
chr6:20553993(+) T-C intron -    22484847
chr6:20554022(+) A-G intron -    22484847
chr6:20554025(+) A-G intron -    22484847
chr6:20554077(+) A-G intron -    22484847
chr6:20554078(+) A-G intron -    22484847
chr6:20554168(+) A-G intron -    22484847
chr6:20554180(+) A-G intron -    22484847
chr6:20554190(+) A-G intron -    22484847
chr6:20554234(+) A-G intron -    22484847
chr6:20554283(+) A-G intron -    22484847
chr6:20554284(+) A-G intron -    22484847
chr6:20554310(+) A-G intron -    22484847
chr6:20554311(+) A-G intron -    22484847
chr6:20555669(+) A-G intron -    22484847
chr6:20555902(+) A-G intron -    22484847
chr6:20555947(+) A-G intron -    22484847
chr6:20555971(+) A-G intron -    22484847
chr6:20556340(+) A-G intron -    22484847
chr6:20556341(+) A-G intron -    22484847
chr6:20556367(+) A-G intron -    22484847
chr6:20556419(+) A-G intron -    22484847
chr6:20556431(+) A-G intron -    22484847
chr6:20556436(+) A-G intron -    22484847
chr6:20556462(+) A-G intron -    22484847
chr6:20556476(+) A-G intron -    22484847
chr6:20556485(+) A-G intron -    22484847
chr6:20557007(+) A-G intron -    22484847
chr6:20557014(+) A-G intron -    22484847
chr6:20557080(+) A-G intron -    22484847
chr6:20557081(+) A-G intron -    22484847
chr6:20561677(+) G-A intron -    22484847
chr6:20562853(+) A-G intron -    22484847
chr6:20568181(+) A-G intron -    22484847
chr6:20568224(+) A-G intron -    22484847
chr6:20568246(+) A-G intron -    22484847
chr6:20585465(+) A-G intron -    22484847
chr6:20586693(+) A-G intron -    22484847
chr6:20586746(+) A-G intron -    22484847
chr6:20587292(+) A-G intron -    22484847
chr6:20587317(+) A-G intron -    22484847
chr6:20587708(+) A-G intron -    22484847
chr6:20587837(+) A-G intron -    22484847
chr6:20587843(+) A-G intron -    22484847
chr6:20588145(+) A-G intron -    22484847
chr6:20588342(+) T-C intron -    22484847
chr6:20637014(+) A-G intron -    22484847
chr6:20638912(+) A-G intron -    22484847
chr6:20638922(+) A-G intron -    22484847
chr6:20639007(+) A-G intron -    22484847
chr6:20639048(+) A-G intron -    22484847
chr6:20639065(+) A-G intron -    22484847
chr6:20639143(+) A-G intron -    22484847
chr6:20644075(+) A-G intron -    22484847
chr6:20644079(+) A-G intron -    22484847
chr6:20645701(+) A-G intron -    22484847
chr6:20645841(+) A-G intron -    22484847
chr6:20646357(+) A-G intron -    22484847
chr6:20677395(+) A-G intron -    22484847
chr6:20679269(+) A-G intron -    22484847
chr6:20679275(+) A-G intron -    22484847
chr6:20693238(+) A-G intron -    22484847
chr6:20693240(+) A-G intron -    22484847
chr6:20724306(+) A-G intron -    22484847
chr6:20724686(+) A-G intron -    22484847
chr6:20724692(+) A-G intron -    22484847
chr6:20724879(+) A-G intron -    22484847
chr6:20749827(+) A-G intron -    22484847
chr6:20750401(+) A-G intron -    22484847
chr6:20801261(+) A-G intron -    22484847
chr6:20801344(+) A-G intron -    22484847
chr6:20814702(+) A-G intron -    22484847
chr6:20841301(+) A-G intron -    22484847
chr6:20841334(+) A-G intron -    22484847
chr6:20849063(+) A-G intron -    22484847
chr6:20849213(+) A-G intron -    22484847
chr6:20849735(+) A-G intron -    22484847
chr6:20850781(+) A-G intron -    22484847
chr6:20850878(+) A-G intron -    22484847
chr6:20874552(+) A-G intron -    22484847
chr6:20874888(+) A-G intron -    22484847
chr6:20874931(+) A-G intron -    22484847
chr6:20874996(+) A-G intron -    22484847
chr6:20875008(+) A-G intron -    22484847
chr6:20880626(+) A-G intron -    22484847
chr6:20899396(+) A-G intron -    22484847
chr6:20899479(+) A-G intron -    22484847
chr6:20899864(+) A-G intron -    22484847
chr6:20899909(+) A-G intron -    22484847
chr6:20901650(+) A-G intron -    22484847
chr6:20901791(+) A-G intron -    22484847
chr6:20901801(+) A-G intron -    22484847
chr6:20902077(+) A-G intron -    22484847
chr6:20902112(+) A-G intron -    22484847
chr6:20902137(+) A-G intron -    22484847
chr6:20902147(+) A-G intron -    22484847
chr6:20905023(+) G-A intron -    22484847
chr6:20914337(+) A-G intron -    22484847
chr6:20934818(+) A-G intron -    22484847
chr6:20934820(+) A-G intron -    22484847
chr6:20934821(+) A-G intron -    22484847
chr6:20934850(+) A-G intron -    22484847
chr6:20934890(+) A-G intron -    22484847
chr6:20934894(+) A-G intron -    22484847
chr6:20935266(+) A-G intron -    22484847
chr6:20937538(+) A-G intron -    22484847
chr6:20940902(+) A-G intron -    22484847
chr6:20943039(+) A-G intron -    22484847
chr6:20943088(+) A-G intron -    22484847
chr6:20947566(+) A-G intron -    22484847
chr6:20948318(+) A-G intron -    22484847
chr6:20948329(+) A-G intron -    22484847
chr6:20948374(+) A-G intron -    22484847
chr6:20973254(+) A-G intron -    22484847
chr6:20980106(+) A-G intron -    22484847
chr6:20981818(+) A-G intron -    22484847
chr6:20985549(+) A-G intron -    22484847
chr6:20985709(+) A-G intron -    22484847
chr6:20988174(+) C-T intron -    22484847
chr6:20989014(+) A-G intron -    22484847
chr6:20992502(+) A-G intron -    22484847
chr6:21011144(+) T-C intron -    22484847
chr6:21020828(+) A-G intron -    22484847
chr6:21029329(+) A-G intron -    22484847
chr6:21052610(+) A-G intron -    22484847
chr6:21052787(+) A-G intron -    22484847
chr6:21052788(+) A-G intron -    22484847
chr6:21052793(+) A-G intron -    22484847
chr6:21067763(+) A-G intron -    22484847
chr6:21067771(+) A-G intron -    22484847
chr6:21089053(+) A-G intron -    22484847
chr6:21091053(+) G-T intron -    22484847
chr6:21114302(+) A-G intron -    22484847
chr6:21122890(+) A-G intron -    22484847
chr6:21122942(+) A-G intron -    22484847
chr6:21122971(+) A-G intron -    22484847
chr6:21122994(+) A-G intron -    22484847
chr6:21122997(+) A-G intron -    22484847
chr6:21123001(+) A-G intron -    22484847
chr6:21123571(+) A-G intron -    22484847
chr6:21123601(+) A-G intron -    22484847
chr6:21144791(+) A-G intron -    22484847
chr6:21146961(+) A-G intron -    22484847
chr6:21149471(+) A-G intron -    22484847
chr6:21169611(+) A-G intron -    22484847
chr6:21171505(+) A-G intron -    22484847
chr6:21171561(+) A-G intron -    22484847
chr6:21195961(+) A-G intron -    22484847
chr6:21195988(+) A-G intron -    22484847
chr6:21207261(+) A-G intron -    22484847
chr6:21207289(+) A-G intron -    22484847
chr6:21207404(+) A-G intron -    22484847
chr6:21207556(+) A-G intron -    22484847
chr6:21221251(+) A-G intron -    22484847
chr6:21221539(+) A-G intron -    22484847
chr6:21221572(+) A-G intron -    22484847
chr6:21221642(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase CDKAL1
chr6:20534779-20534780(+) m6A 5'UTR       24981863
chr6:20758864-20758865(+) m6A CDS       24981863
chr6:21201098-21201099(+) m6A exon//intron       -
chr6:21201109-21201110(+) m6A exon//intron       -
chr6:21201356-21201357(+) m6A CDS//exon       -
chr6:21201389-21201390(+) m6A CDS//exon       -
chr6:21201408-21201409(+) m6A CDS//exon       -

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate CDKAL1
Chromatin K562 cells     -
Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hbv-miR-B26-5p
Interactor2: CDKAL1

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//PITA//RNAHybrid//Targetscan
Support Database VmiReg

Starting a new search, please wait ...