Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00569044

  Virus:  

Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hbv-miR-B26-5p:           ARSD:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hbv-miR-B26-5p ARSD
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0031771 414
Organism Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - ASD

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR ARSD
chrX:2831118(-) A-I      intronic
chrX:2830292(-) A-I      intronic
chrX:2830284(-) A-I      intronic
chrX:2830281(-) A-I      intronic
chrX:2827334(-) A-I      intronic
chrX:2827357(-) A-I      intronic
chrX:2830276(-) A-I      intronic
chrX:2830275(-) A-I      intronic
chrX:2830274(-) A-I      intronic
chrX:2827296(-) A-I      intronic
chrX:2827298(-) A-I      intronic
chrX:2833133(-) A-I      intronic
chrX:2836659(-) A-I      intronic
chrX:2830272(-) A-I      intronic
chrX:2830271(-) A-I      intronic
chrX:2830264(-) A-I      intronic
chrX:2830260(-) A-I      intronic
chrX:2830257(-) A-I      intronic
chrX:2830250(-) A-I      intronic
chrX:2834051(-) A-I      intronic
chrX:2830248(-) A-I      intronic
chrX:2830241(-) A-I      intronic
chrX:2831533(-) A-I      intronic
chrX:2831532(-) A-I      intronic
chrX:2831529(-) A-I      intronic
chrX:2831528(-) A-I      intronic
chrX:2831511(-) A-I      intronic
chrX:2831501(-) A-I      intronic
chrX:2831360(-) A-I      intronic
chrX:2831352(-) A-I      intronic
chrX:2831337(-) A-I      intronic
chrX:2831315(-) A-I      intronic
chrX:2831306(-) A-I      intronic
chrX:2831302(-) A-I      intronic
chrX:2831287(-) A-I      intronic
chrX:2831265(-) A-I      intronic
chrX:2831130(-) A-I      intronic
chrX:2831129(-) A-I      intronic
chrX:2831121(-) A-I      intronic
chrX:2831120(-) A-I      intronic
chrX:2831115(-) A-I      intronic
chrX:2831114(-) A-I      intronic
chrX:2831103(-) A-I      intronic
chrX:2830333(-) A-I      intronic
chrX:2830325(-) A-I      intronic
chrX:2830314(-) A-I      intronic
chrX:2830311(-) A-I      intronic
chrX:2830309(-) A-I      intronic
chrX:2830308(-) A-I      intronic
chrX:2834065(-) A-I      intronic
chrX:2834064(-) A-I      intronic
chrX:2830233(-) A-I      intronic
chrX:2829084(-) A-I      intronic
chrX:2829074(-) A-I      intronic
chrX:2830105(-) A-I      intronic
chrX:2830099(-) A-I      intronic
chrX:2830234(-) A-I      intronic
chrX:2830095(-) A-I      intronic
chrX:2827361(-) A-I      intronic
chrX:2827344(-) A-I      intronic
chrX:2841367(-) A-I      intronic
chrX:2841323(-) A-I      intronic
chrX:2831540(-) A-I      intronic
chrX:2831365(-) A-I      intronic
chrX:2831364(-) A-I      intronic
chrX:2831354(-) A-I      intronic
chrX:2831347(-) A-I      intronic
chrX:2831336(-) A-I      intronic
chrX:2831324(-) A-I      intronic
chrX:2831304(-) A-I      intronic
chrX:2831303(-) A-I      intronic
chrX:2831301(-) A-I      intronic
chrX:2831286(-) A-I      intronic
chrX:2831276(-) A-I      intronic
chrX:2831274(-) A-I      intronic
chrX:2831273(-) A-I      intronic
chrX:2830335(-) A-I      intronic
chrX:2830330(-) A-I      intronic
chrX:2831535(-) A-I      intronic
chrX:2831539(-) A-I      intronic
chrX:2834110(-) A-I      intronic
chrX:2834091(-) A-I      intronic
chrX:2834090(-) A-I      intronic
chrX:2834078(-) A-I      intronic
chrX:2831546(-) A-I      intronic
chrX:2829031(-) A-I      intronic
chrX:2831548(-) A-I      intronic
chrX:2836705(-) A-I      intronic
chrX:2825016(-) A-I      3'UTR
chrX:2824994(-) A-I      3'UTR
chrX:2824464(-) A-I      3'UTR
chrX:2825071(-) A-I      3'UTR
chrX:2824276(-) A-I      3'UTR
chrX:2824294(-) A-I      3'UTR
chrX:2832513(-) A-I      3'UTR
chrX:2824450(-) A-I      3'UTR
chrX:2832523(-) A-I      3'UTR
chrX:2832531(-) A-I      3'UTR
chrX:2824423(-) A-I      3'UTR
chrX:2824420(-) A-I      3'UTR
chrX:2824337(-) A-I      3'UTR
chrX:2832500(-) A-I      3'UTR
chrX:2824371(-) A-I      3'UTR
chrX:2824346(-) A-I      3'UTR
chrX:2824179(-) A-I      3'UTR
chrX:2824208(-) A-I      3'UTR
chrX:2824244(-) A-I      3'UTR
chrX:2824247(-) A-I      3'UTR
chrX:2824255(-) A-I      3'UTR
chrX:2824351(-) A-I      3'UTR
chrX:2824358(-) A-I      3'UTR
chrX:2824373(-) A-I      3'UTR
chrX:2824426(-) A-I      3'UTR
chrX:2824439(-) A-I      3'UTR
chrX:2824892(-) A-I      3'UTR
chrX:2824894(-) A-I      3'UTR
chrX:2824971(-) A-I      3'UTR
chrX:2825002(-) A-I      3'UTR
chrX:2825036(-) A-I      3'UTR
chrX:2829563(-) A-I      intronic
chrX:2833070(-) A-I      intronic
chrX:2827681(-) A-I      intronic
chrX:2833469(-) A-I      intronic
chrX:2835731(-) A-I      intronic
chrX:2824933(-) A-I      3'UTR
chrX:2824239(-) A-I      3'UTR
chrX:2824433(-) A-I      3'UTR
chrX:2824377(-) A-I      3'UTR
chrX:2824447(-) A-I      3'UTR
chrX:2825132(-) A-I      3'UTR
chrX:2824307(-) A-I      3'UTR
chrX:2824311(-) A-I      3'UTR
chrX:2824934(-) A-I      3'UTR
chrX:2824251(-) A-I      3'UTR
chrX:2824339(-) A-I      3'UTR
chrX:2824988(-) A-I      3'UTR
chrX:2824983(-) A-I      3'UTR
chrX:2824281(-) A-I      3'UTR
chrX:2824209(-) A-I      3'UTR
chrX:2824985(-) A-I      3'UTR
chrX:2824979(-) A-I      3'UTR
chrX:2824303(-) A-I      3'UTR
chrX:2824906(-) A-I      3'UTR
chrX:2824907(-) A-I      3'UTR
chrX:2824434(-) A-I      3'UTR
chrX:2825119(-) A-I      3'UTR
chrX:2824214(-) A-I      3'UTR
chrX:2832537(-) A-I      3'UTR
chrX:2824355(-) A-I      3'UTR
chrX:2824354(-) A-I      3'UTR
chrX:2824360(-) A-I      3'UTR
chrX:2825114(-) A-I      3'UTR
chrX:2824462(-) A-I      3'UTR
chrX:2824357(-) A-I      3'UTR
chrX:2824381(-) A-I      3'UTR
chrX:2824456(-) A-I      3'UTR
chrX:2824300(-) A-I      3'UTR
chrX:2824287(-) A-I      3'UTR
chrX:2824343(-) A-I      3'UTR
chrX:2825076(-) A-I      3'UTR
chrX:2824356(-) A-I      3'UTR
chrX:2832508(-) A-I      3'UTR
chrX:2824246(-) A-I      3'UTR
chrX:2835244(-) A-I      intronic
chrX:2833468(-) A-I      intronic
chrX:2827353(-) A-I      intronic
chrX:2834376(-) A-I      intronic
chrX:2830065(-) A-I      intronic
chrX:2827303(-) A-I      intronic
chrX:2830011(-) A-I      intronic
chrX:2827613(-) A-I      intronic
chrX:2827306(-) A-I      intronic
chrX:2835209(-) A-I      intronic
chrX:2835014(-) A-I      intronic
chrX:2830094(-) A-I      intronic
chrX:2833113(-) A-I      intronic
chrX:2835176(-) A-I      intronic
chrX:2833131(-) A-I      intronic
chrX:2827316(-) A-I      intronic
chrX:2835170(-) A-I      intronic
chrX:2827331(-) A-I      intronic
chrX:2835261(-) A-I      intronic
chrX:2833261(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED ARSD
chrX:2824317(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //22028664
chrX:2824343(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //22028664
chrX:2824385(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //22028664   //22327324
chrX:2824433(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //22028664
chrX:2824434(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //22028664
chrX:2824455(-) A-I exon 3'UTR    15258596   //22028664
chrX:2824456(-) A-I exon 3'UTR    15258596
chrX:2824462(-) A-I exon 3'UTR    15258596   //22028664
chrX:2824906(-) A-I exon 3'UTR    15258596
chrX:2824907(-) A-I exon 3'UTR    15258596
chrX:2824916(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chrX:2824934(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chrX:2824979(-) A-I exon 3'UTR    15258596
chrX:2824985(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chrX:2824988(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596   //22327324
chrX:2825075(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //22327324
chrX:2825119(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chrX:2825124(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chrX:2824311(-) A-I exon 3'UTR    22028664   //22327324
chrX:2824209(-) A-I exon 3'UTR    22028664
chrX:2824239(-) A-I exon 3'UTR    22028664
chrX:2824246(-) A-I exon 3'UTR    22028664
chrX:2824254(-) A-I exon 3'UTR    22028664
chrX:2824287(-) A-I exon 3'UTR    22028664
chrX:2824300(-) A-I exon 3'UTR    22028664
chrX:2824339(-) A-I exon 3'UTR    22028664
chrX:2824354(-) A-I exon 3'UTR    22028664
chrX:2824366(-) A-I exon 3'UTR    22028664
chrX:2824377(-) A-I exon 3'UTR    22028664
chrX:2824447(-) A-I exon 3'UTR    22028664
chrX:2824317(-) A-G exon 3'UTR    21725310   //22484847
chrX:2831351(-) A-G intron -    22484847
chrX:2824189(-) A-T exon 3'UTR    22484847
chrX:2824239(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824246(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824251(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824254(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824311(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824343(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824360(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824366(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824377(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824385(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824433(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824434(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824455(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824456(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824462(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824916(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824968(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824979(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824985(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2824988(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2825075(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2825114(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2825119(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chrX:2827316(-) A-G intron -    22484847
chrX:2827367(-) A-G intron -    22484847
chrX:2838472(-) A-G intron -    22484847
chrX:2838474(-) A-G intron -    22484847
chrX:2827303(-) A-G intron -    22484847
chrX:2827331(-) A-G intron -    22484847
chrX:2827353(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase ARSD
chrX:2822095-2822096(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chrX:2822272-2822273(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chrX:2822312-2822313(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chrX:2822505-2822506(-) m6A 3'UTR       25456834//24981863//27773535
chrX:2822549-2822550(-) m6A 3'UTR       25456834//24981863//27773535
chrX:2822638-2822639(-) m6A 3'UTR       25456834//24981863//27773535
chrX:2822831-2822832(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chrX:2822922-2822923(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chrX:2822940-2822941(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chrX:2822986-2822987(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chrX:2822997-2822998(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chrX:2823085-2823086(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863//27773535
chrX:2823601-2823602(-) m6A 3'UTR//intron       24981863//27773535
chrX:2823609-2823610(-) m6A 3'UTR//intron       24981863//27773535
chrX:2823621-2823622(-) m6A 3'UTR//intron       24981863//27773535
chrX:2823709-2823710(-) m6A 3'UTR//intron       24981863
chrX:2823735-2823736(-) m6A 3'UTR//intron       24981863
chrX:2825153-2825154(-) m6A 3'UTR//exon//intron       24981863
chrX:2825201-2825202(-) m6A 3'UTR//exon//intron       24981863
chrX:2825212-2825213(-) m6A 3'UTR//exon//intron       24981863
chrX:2825262-2825263(-) m6A 3'UTR//exon//intron       25456834//24981863
chrX:2825302-2825303(-) m6A 3'UTR//exon//intron       25456834//24981863
chrX:2825359-2825360(-) m6A CDS//exon//intron       25456834//24981863
chrX:2825433-2825434(-) m6A CDS//exon//intron       25456834//24981863
chrX:2825528-2825529(-) m6A CDS//exon       24981863
chrX:2825557-2825558(-) m6A CDS//exon       24981863
chrX:2825804-2825805(-) m6A exon//intron       25456834
chrX:2825965-2825966(-) m6A exon//intron       27773535
chrX:2826002-2826003(-) m6A exon//intron       27773535
chrX:2828736-2828737(-) m6A CDS//intron       27773535
chrX:2828757-2828758(-) m6A CDS//intron       27773535
chrX:2828794-2828795(-) m6A CDS//intron       27773535
chrX:2828809-2828810(-) m6A CDS//intron       27773535
chrX:2831662-2831663(-) m6A exon//intron       27773535
chrX:2831783-2831784(-) m6A exon//intron       24981863
chrX:2831795-2831796(-) m6A exon//intron       24981863
chrX:2831880-2831881(-) m6A exon//intron       24981863//27773535
chrX:2831952-2831953(-) m6A exon//intron       25456834//24981863//27773535
chrX:2831987-2831988(-) m6A exon//intron       25456834//24981863//27773535
chrX:2832053-2832054(-) m6A exon//intron       25456834//24981863//27773535
chrX:2832141-2832142(-) m6A exon//intron       24981863
chrX:2832297-2832298(-) m6A exon//intron       24981863
chrX:2832322-2832323(-) m6A exon//intron       24981863
chrX:2832625-2832626(-) m6A exon//intron       24981863//27773535
chrX:2832664-2832665(-) m6A exon//intron       24981863//27773535
chrX:2832698-2832699(-) m6A exon//intron       24981863
chrX:2832710-2832711(-) m6A exon//intron       24981863
chrX:2832742-2832743(-) m6A exon//intron       24981863
chrX:2832751-2832752(-) m6A exon//intron       24981863
chrX:2836052-2836053(-) m6A CDS//exon//intron       24981863
chrX:2836207-2836208(-) m6A CDS//exon//intron       24981863//27773535
chrX:2838438-2838439(-) m6A exon//intron       27773535
chrX:2843754-2843755(-) m6A CDS//exon//intron       -
chrX:2843803-2843804(-) m6A CDS//exon//intron       -

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate ARSD
Exosome Blood     -
Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)     -
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hbv-miR-B26-5p
Interactor2: ARSD

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//Targetscan
Support Database VmiReg

Starting a new search, please wait ...