Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00564908

  Virus:  

Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hbv-miR-B19-5p:  MIMAT0031769          DFFB:  NR_135150     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hbv-miR-B19-5p	DFFB
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0031769	1677
Organism	Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	CAD//CPAN//DFF-40//DFF2//DFF40

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	DFFB	chr1:3777002(+) A-I      NonSyn:Gln->Arg chr1:3777638(+) A-I      intronic chr1:3783064(+) A-I      intronic chr1:3798237(+) A-I      intronic chr1:3798177(+) A-I      intronic chr1:3783070(+) A-I      intronic chr1:3777627(+) A-I      intronic chr1:3798239(+) A-I      intronic chr1:3777013(+) A-I      NonSyn:Thr->Ala chr1:3798693(+) A-I      intronic chr1:3779489(+) A-I      intronic chr1:3778226(+) A-I      intronic chr1:3780631(+) A-I      intronic chr1:3780648(+) A-I      intronic chr1:3784162(+) A-I      intronic chr1:3781396(+) A-I      intronic chr1:3780672(+) A-I      intronic chr1:3798758(+) A-I      intronic chr1:3777643(+) A-I      intronic chr1:3798222(+) A-I      intronic chr1:3798186(+) A-I      intronic chr1:3794936(+) A-I      intronic chr1:3788053(+) A-I      intronic chr1:3788034(+) A-I      intronic chr1:3788016(+) A-I      intronic chr1:3779557(+) A-I      intronic chr1:3781334(+) A-I      intronic chr1:3781229(+) A-I      intronic chr1:3777572(+) A-I      intronic chr1:3779566(+) A-I      intronic chr1:3781215(+) A-I      intronic chr1:3798713(+) A-I      intronic chr1:3779483(+) A-I      intronic chr1:3799203(+) A-I      intronic chr1:3781259(+) A-I      intronic chr1:3777457(+) A-I      intronic chr1:3776727(+) A-I      intronic chr1:3798718(+) A-I      intronic chr1:3781387(+) A-I      intronic chr1:3780714(+) A-I      intronic chr1:3799151(+) A-I      intronic chr1:3798714(+) A-I      intronic chr1:3780803(+) A-I      intronic chr1:3798819(+) A-I      intronic chr1:3781333(+) A-I      intronic chr1:3781190(+) A-I      intronic chr1:3778231(+) A-I      intronic chr1:3778014(+) A-I      intronic chr1:3783078(+) A-I      intronic chr1:3778227(+) A-I      intronic chr1:3784235(+) A-I      intronic chr1:3784153(+) A-I      intronic chr1:3776772(+) A-I      intronic chr1:3798313(+) A-I      intronic chr1:3784161(+) A-I      intronic chr1:3778067(+) A-I      intronic chr1:3776976(+) A-I      intronic chr1:3799068(+) A-I      intronic chr1:3784226(+) A-I      intronic chr1:3779451(+) A-I      intronic chr1:3777464(+) A-I      intronic chr1:3798336(+) A-I      intronic chr1:3777563(+) A-I      intronic chr1:3778105(+) A-I      intronic chr1:3777028(+) A-I      NonSyn:Ser->Gly chr1:3777007(+) A-I      NonSyn:Ser->Gly chr1:3777027(+) A-I      Syn:Ser->Ser chr1:3777053(+) A-I      Syn:Stp->Stp chr1:3777054(+) A-I      Syn:Stp->Stp chr1:3778158(+) A-I      intronic chr1:3784216(+) A-I      intronic chr1:3798894(+) A-I      intronic chr1:3780676(+) A-I      intronic chr1:3798373(+) A-I      intronic chr1:3778093(+) A-I      intronic chr1:3783054(+) A-I      intronic chr1:3788114(+) A-I      intronic chr1:3784283(+) A-I      intronic chr1:3798886(+) A-I      intronic chr1:3783599(+) A-I      intronic chr1:3784296(+) A-I      intronic chr1:3777463(+) A-I      intronic chr1:3779458(+) A-I      intronic chr1:3781207(+) A-I      intronic chr1:3780584(+) A-I      intronic chr1:3784231(+) A-I      intronic chr1:3798782(+) A-I      intronic chr1:3777668(+) A-I      intronic chr1:3777543(+) A-I      intronic chr1:3798756(+) A-I      intronic chr1:3781115(+) A-I      intronic chr1:3778179(+) A-I      intronic chr1:3778133(+) A-I      intronic chr1:3778016(+) A-I      intronic chr1:3776956(+) A-I      intronic chr1:3779552(+) A-I      intronic chr1:3780670(+) A-I      intronic chr1:3778062(+) A-I      intronic chr1:3778166(+) A-I      intronic chr1:3777624(+) A-I      intronic chr1:3779459(+) A-I      intronic chr1:3783589(+) A-I      intronic chr1:3778253(+) A-I      intronic chr1:3778175(+) A-I      intronic chr1:3778266(+) A-I      intronic chr1:3781348(+) A-I      intronic chr1:3778121(+) A-I      intronic chr1:3776916(+) A-I      intronic chr1:3778178(+) A-I      intronic chr1:3784234(+) A-I      intronic chr1:3776855(+) A-I      intronic chr1:3799074(+) A-I      intronic chr1:3781111(+) A-I      intronic chr1:3778141(+) A-I      intronic chr1:3778181(+) A-I      intronic chr1:3790319(+) A-I      intronic chr1:3798665(+) A-I      intronic chr1:3776967(+) A-I      intronic chr1:3779548(+) A-I      intronic chr1:3792434(+) A-I      intronic chr1:3778131(+) A-I      intronic chr1:3781375(+) A-I      intronic chr1:3781219(+) A-I      intronic chr1:3798247(+) A-I      intronic chr1:3784159(+) A-I      intronic chr1:3779517(+) A-I      intronic chr1:3781202(+) A-I      intronic chr1:3776930(+) A-I      intronic chr1:3776891(+) A-I      intronic chr1:3784362(+) A-I      intronic chr1:3779602(+) A-I      intronic chr1:3798185(+) A-I      intronic chr1:3784313(+) A-I      intronic chr1:3777480(+) A-I      intronic chr1:3778220(+) A-I      intronic chr1:3777630(+) A-I      intronic chr1:3780705(+) A-I      intronic chr1:3798221(+) A-I      intronic chr1:3798236(+) A-I      intronic chr1:3779619(+) A-I      intronic chr1:3777441(+) A-I      intronic chr1:3777598(+) A-I      intronic chr1:3781409(+) A-I      intronic chr1:3779553(+) A-I      intronic chr1:3778235(+) A-I      intronic chr1:3776890(+) A-I      intronic chr1:3778057(+) A-I      intronic chr1:3781256(+) A-I      intronic chr1:3784350(+) A-I      intronic chr1:3779593(+) A-I      intronic chr1:3799129(+) A-I      intronic chr1:3798183(+) A-I      intronic chr1:3784387(+) A-I      intronic chr1:3776856(+) A-I      intronic chr1:3776982(+) A-I      intronic chr1:3779551(+) A-I      intronic chr1:3798892(+) A-I      intronic chr1:3778284(+) A-I      intronic chr1:3784155(+) A-I      intronic chr1:3777599(+) A-I      intronic chr1:3798648(+) A-I      intronic chr1:3784306(+) A-I      intronic chr1:3798287(+) A-I      intronic chr1:3780711(+) A-I      intronic chr1:3798662(+) A-I      intronic chr1:3798314(+) A-I      intronic chr1:3784361(+) A-I      intronic chr1:3798746(+) A-I      intronic chr1:3778048(+) A-I      intronic chr1:3778230(+) A-I      intronic chr1:3781216(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	DFFB	chr1:3800616(+) G-T intron -    21725310 chr1:3800721(+) G-T intron -    21725310 chr1:3776976(+) A-G intron -    22484847 chr1:3777028(+) A-G intron -    22484847 chr1:3777067(+) A-G intron -    22484847 chr1:3777441(+) A-G intron -    22484847 chr1:3777457(+) A-G intron -    22484847 chr1:3777464(+) A-G intron -    22484847 chr1:3777480(+) A-G intron -    22484847 chr1:3777624(+) A-G intron -    22484847 chr1:3778016(+) A-G intron -    22484847 chr1:3778105(+) A-G intron -    22484847 chr1:3778133(+) A-G intron -    22484847 chr1:3778166(+) A-G intron -    22484847 chr1:3778178(+) A-G intron -    22484847 chr1:3778181(+) A-G intron -    22484847 chr1:3779548(+) A-G intron -    22484847 chr1:3779553(+) A-G intron -    22484847 chr1:3779593(+) A-G intron -    22484847 chr1:3780584(+) A-G intron -    22484847 chr1:3780670(+) A-G intron -    22484847 chr1:3780714(+) A-G intron -    22484847 chr1:3781409(+) A-G intron -    22484847 chr1:3783010(+) A-G intron -    22484847 chr1:3783054(+) A-G intron -    22484847 chr1:3783589(+) A-G intron -    22484847 chr1:3783599(+) A-G intron -    22484847 chr1:3784155(+) A-G intron -    22484847 chr1:3784159(+) A-G intron -    22484847 chr1:3784161(+) A-G intron -    22484847 chr1:3784226(+) A-G intron -    22484847 chr1:3784296(+) A-G intron -    22484847 chr1:3784361(+) A-G intron -    22484847 chr1:3784362(+) A-G intron -    22484847 chr1:3798221(+) A-G intron -    22484847 chr1:3798718(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	DFFB	chr1:3774078-3774079(+) m6A 5'UTR       25456834//24981863 chr1:3774141-3774142(+) m6A 5'UTR       25456834 chr1:3774158-3774159(+) m6A 5'UTR       25456834 chr1:3789694-3789695(+) m6A 3'UTR//intron       22608085 chr1:3800121-3800122(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863//22608085 chr1:3800141-3800142(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863//22608085 chr1:3800180-3800181(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863//22608085 chr1:3800187-3800188(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863//22608085 chr1:3800215-3800216(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863//22608085 chr1:3800256-3800257(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863//22608085 chr1:3800263-3800264(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863//22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	DFFB	Chromatin K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleoplasm K562 cells     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hbv-miR-B19-5p
Interactor2: DFFB

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	VmiReg