Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00563696

  Virus:  

Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hbv-miR-B8-3p:           ZNF512:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hbv-miR-B8-3p ZNF512
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0031768 84450
Organism Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - -

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR ZNF512
chr2:27842090(+) A-I      intronic
chr2:27809226(+) A-I      intronic
chr2:27818358(+) A-I      intronic
chr2:27842865(+) A-I      intronic
chr2:27816307(+) A-I      intronic
chr2:27818344(+) A-I      intronic
chr2:27842081(+) A-I      intronic
chr2:27842075(+) A-I      intronic
chr2:27816337(+) A-I      intronic
chr2:27816326(+) A-I      intronic
chr2:27817771(+) A-I      intronic
chr2:27817741(+) A-I      intronic
chr2:27815141(+) A-I      intronic
chr2:27815384(+) A-I      intronic
chr2:27815442(+) A-I      intronic
chr2:27815443(+) A-I      intronic
chr2:27815444(+) A-I      intronic
chr2:27815472(+) A-I      intronic
chr2:27815762(+) A-I      intronic
chr2:27815978(+) A-I      intronic
chr2:27815989(+) A-I      intronic
chr2:27816158(+) A-I      intronic
chr2:27816429(+) A-I      intronic
chr2:27816472(+) A-I      intronic
chr2:27818285(+) A-I      intronic
chr2:27818403(+) A-I      intronic
chr2:27818416(+) A-I      intronic
chr2:27821330(+) A-I      intronic
chr2:27821478(+) A-I      intronic
chr2:27821930(+) A-I      intronic
chr2:27826592(+) A-I      intronic
chr2:27826897(+) A-I      intronic
chr2:27826911(+) A-I      intronic
chr2:27827384(+) A-I      intronic
chr2:27827497(+) A-I      intronic
chr2:27827498(+) A-I      intronic
chr2:27827533(+) A-I      intronic
chr2:27828495(+) A-I      intronic
chr2:27828603(+) A-I      intronic
chr2:27834665(+) A-I      intronic
chr2:27834668(+) A-I      intronic
chr2:27834682(+) A-I      intronic
chr2:27834706(+) A-I      intronic
chr2:27834714(+) A-I      intronic
chr2:27834731(+) A-I      intronic
chr2:27836216(+) A-I      intronic
chr2:27836242(+) A-I      intronic
chr2:27836252(+) A-I      intronic
chr2:27840685(+) A-I      intronic
chr2:27840700(+) A-I      intronic
chr2:27842076(+) A-I      intronic
chr2:27815041(+) A-I      intronic
chr2:27814986(+) A-I      intronic
chr2:27814030(+) A-I      intronic
chr2:27810727(+) A-I      intronic
chr2:27810719(+) A-I      intronic
chr2:27810612(+) A-I      intronic
chr2:27840873(+) A-I      intronic
chr2:27827563(+) A-I      intronic
chr2:27811156(+) A-I      intronic
chr2:27841048(+) A-I      intronic
chr2:27818374(+) A-I      intronic
chr2:27814004(+) A-I      intronic
chr2:27816403(+) A-I      intronic
chr2:27840704(+) A-I      intronic
chr2:27814879(+) A-I      intronic
chr2:27840786(+) A-I      intronic
chr2:27816189(+) A-I      intronic
chr2:27842021(+) A-I      intronic
chr2:27813642(+) A-I      intronic
chr2:27826563(+) A-I      intronic
chr2:27816265(+) A-I      intronic
chr2:27842093(+) A-I      intronic
chr2:27840694(+) A-I      intronic
chr2:27816376(+) A-I      intronic
chr2:27818452(+) A-I      intronic
chr2:27842022(+) A-I      intronic
chr2:27815826(+) A-I      intronic
chr2:27842143(+) A-I      intronic
chr2:27814461(+) A-I      intronic
chr2:27816046(+) A-I      intronic
chr2:27816351(+) A-I      intronic
chr2:27814475(+) A-I      intronic
chr2:27814305(+) A-I      intronic
chr2:27818454(+) A-I      intronic
chr2:27818326(+) A-I      intronic
chr2:27813973(+) A-I      intronic
chr2:27818187(+) A-I      intronic
chr2:27815335(+) A-I      intronic
chr2:27842101(+) A-I      intronic
chr2:27826507(+) A-I      intronic
chr2:27815682(+) A-I      intronic
chr2:27833151(+) A-I      intronic
chr2:27842062(+) A-I      intronic
chr2:27814593(+) A-I      intronic
chr2:27816188(+) A-I      intronic
chr2:27827410(+) A-I      intronic
chr2:27840659(+) A-I      intronic
chr2:27814411(+) A-I      intronic
chr2:27828455(+) A-I      intronic
chr2:27841009(+) A-I      intronic
chr2:27815954(+) A-I      intronic
chr2:27831983(+) A-I      intronic
chr2:27827545(+) A-I      intronic
chr2:27814382(+) A-I      intronic
chr2:27840778(+) A-I      intronic
chr2:27815675(+) A-I      intronic
chr2:27816142(+) A-I      intronic
chr2:27842123(+) A-I      intronic
chr2:27840921(+) A-I      intronic
chr2:27814619(+) A-I      intronic
chr2:27816018(+) A-I      intronic
chr2:27818331(+) A-I      intronic
chr2:27840879(+) A-I      intronic
chr2:27826700(+) A-I      intronic
chr2:27840902(+) A-I      intronic
chr2:27818465(+) A-I      intronic
chr2:27816222(+) A-I      intronic
chr2:27810237(+) A-I      intronic
chr2:27816162(+) A-I      intronic
chr2:27840878(+) A-I      intronic
chr2:27828577(+) A-I      intronic
chr2:27827466(+) A-I      intronic
chr2:27816224(+) A-I      intronic
chr2:27826687(+) A-I      intronic
chr2:27816341(+) A-I      intronic
chr2:27818391(+) A-I      intronic
chr2:27824777(+) A-I      intronic
chr2:27828576(+) A-I      intronic
chr2:27840926(+) A-I      intronic
chr2:27809200(+) A-I      intronic
chr2:27816130(+) A-I      intronic
chr2:27818321(+) A-I      intronic
chr2:27840650(+) A-I      intronic
chr2:27833713(+) A-I      intronic
chr2:27813643(+) A-I      intronic
chr2:27841049(+) A-I      intronic
chr2:27815995(+) A-I      intronic
chr2:27826699(+) A-I      intronic
chr2:27816042(+) A-I      intronic
chr2:27818256(+) A-I      intronic
chr2:27821417(+) A-I      intronic
chr2:27826558(+) A-I      intronic
chr2:27840681(+) A-I      intronic
chr2:27827452(+) A-I      intronic
chr2:27815973(+) A-I      intronic
chr2:27814610(+) A-I      intronic
chr2:27814381(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED ZNF512
chr2:27815973(+) A-I intron -    22327324
chr2:27816188(+) A-I intron -    22327324
chr2:27809115(+) G-T intron -    22484847
chr2:27809200(+) A-G intron -    22484847
chr2:27811141(+) A-G intron -    22484847
chr2:27813617(+) A-G intron -    22484847
chr2:27813643(+) A-G intron -    22484847
chr2:27814029(+) A-G intron -    22484847
chr2:27814033(+) A-G intron -    22484847
chr2:27814305(+) A-G intron -    22484847
chr2:27814307(+) A-G intron -    22484847
chr2:27814381(+) A-G intron -    22484847
chr2:27814382(+) A-G intron -    22484847
chr2:27814386(+) T-A intron -    22484847
chr2:27814411(+) A-G intron -    22484847
chr2:27814458(+) A-G intron -    22484847
chr2:27814475(+) A-G intron -    22484847
chr2:27814593(+) A-G intron -    22484847
chr2:27814600(+) A-G intron -    22484847
chr2:27814610(+) A-G intron -    22484847
chr2:27814619(+) A-G intron -    22484847
chr2:27815954(+) A-G intron -    22484847
chr2:27815972(+) A-G intron -    22484847
chr2:27815973(+) A-G intron -    22484847
chr2:27815995(+) A-G intron -    22484847
chr2:27815999(+) A-G intron -    22484847
chr2:27816003(+) A-G intron -    22484847
chr2:27816018(+) A-G intron -    22484847
chr2:27816042(+) A-G intron -    22484847
chr2:27816045(+) A-G intron -    22484847
chr2:27816046(+) A-G intron -    22484847
chr2:27816142(+) A-G intron -    22484847
chr2:27816162(+) A-G intron -    22484847
chr2:27816188(+) A-G intron -    22484847
chr2:27816222(+) A-G intron -    22484847
chr2:27816224(+) A-G intron -    22484847
chr2:27816304(+) A-G intron -    22484847
chr2:27816348(+) A-G intron -    22484847
chr2:27816351(+) A-G intron -    22484847
chr2:27816403(+) A-G intron -    22484847
chr2:27818256(+) A-G intron -    22484847
chr2:27818326(+) A-G intron -    22484847
chr2:27818331(+) A-G intron -    22484847
chr2:27818374(+) A-G intron -    22484847
chr2:27818377(+) A-G intron -    22484847
chr2:27818391(+) A-G intron -    22484847
chr2:27826598(+) A-G intron -    22484847
chr2:27826687(+) A-G intron -    22484847
chr2:27826700(+) A-G intron -    22484847
chr2:27827452(+) A-G intron -    22484847
chr2:27827462(+) A-G intron -    22484847
chr2:27827545(+) A-G intron -    22484847
chr2:27828155(+) A-G intron -    22484847
chr2:27828455(+) A-G intron -    22484847
chr2:27840921(+) A-G intron -    22484847
chr2:27840926(+) A-G intron -    22484847
chr2:27840932(+) A-G intron -    22484847
chr2:27840996(+) A-G intron -    22484847
chr2:27841055(+) A-G intron -    22484847
chr2:27842093(+) A-G intron -    22484847
chr2:27842143(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase ZNF512
chr2:27805990-27805991(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       25456834//24981863
chr2:27820940-27820941(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       24981863
chr2:27822856-27822857(+) m6A CDS//exon//intron       24981863
chr2:27822900-27822901(+) m6A CDS//exon//intron       24981863
chr2:27826125-27826126(+) Tm CDS       -
chr2:27830734-27830735(+) m6A CDS       24981863
chr2:27830760-27830761(+) m6A CDS       24981863
chr2:27830845-27830846(+) m6A CDS       24981863
chr2:27830883-27830884(+) m6A CDS       24981863
chr2:27844035-27844036(+) m6A CDS//exon       24981863
chr2:27844172-27844173(+) m6A CDS//exon       24209618//24981863//22608085
chr2:27844222-27844223(+) m6A CDS//exon       24209618//24981863//22608085
chr2:27844249-27844250(+) m6A CDS//exon       24209618//24981863//22608085
chr2:27844301-27844302(+) m6A CDS//exon       24209618//24981863//22608085
chr2:27844383-27844384(+) m6A 3'UTR//exon       24981863
chr2:27844398-27844399(+) m6A 3'UTR//exon       24981863
chr2:27844975-27844976(+) m6A 3'UTR//exon       24981863
chr2:27844983-27844984(+) m6A 3'UTR//exon       24981863
chr2:27845018-27845019(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//26404942
chr2:27845223-27845224(+) m6A 3'UTR//exon       -
chr2:27845912-27845913(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//27773535

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate ZNF512
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol HCC cell line (HepG2)     -
Exosome Blood     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hbv-miR-B8-3p
Interactor2: ZNF512

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//PITA//RNAHybrid//Targetscan
Support Database VmiReg

Starting a new search, please wait ...