Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00561943

  Virus:  

Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hbv-miR-B8-3p:  MIMAT0031768          PCDHGA8:  NM_014004     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hbv-miR-B8-3p	PCDHGA8
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0031768	9708
Organism	Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	PCDH-GAMMA-A8

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	PCDHGA8	chr5:140769772-140769773(+) m6A 5'UTR       24981863 chr5:140769777-140769778(+) m6A 5'UTR       24981863 chr5:140771883-140771884(+) m6A 5'UTR       - chr5:140771975-140771976(+) m6A 5'UTR       - chr5:140772186-140772187(+) m6A 5'UTR       - chr5:140772212-140772213(+) m6A 5'UTR       - chr5:140772229-140772230(+) m6A 5'UTR       - chr5:140772241-140772242(+) m6A 5'UTR       - chr5:140772252-140772253(+) m6A 5'UTR       - chr5:140772374-140772375(+) m6A 5'UTR       - chr5:140772466-140772467(+) m6A CDS       25456834 chr5:140772498-140772499(+) m6A CDS       25456834 chr5:140772531-140772532(+) m6A CDS       - chr5:140772543-140772544(+) m6A CDS       - chr5:140772929-140772930(+) m6A CDS       25456834 chr5:140772936-140772937(+) m6A CDS       25456834 chr5:140772951-140772952(+) m6A CDS       25456834 chr5:140774040-140774041(+) m6A CDS       - chr5:140774163-140774164(+) m6A CDS       - chr5:140774169-140774170(+) m6A CDS       - chr5:140774224-140774225(+) m6A CDS       25456834 chr5:140774280-140774281(+) m6A CDS       25456834 chr5:140774322-140774323(+) m6A CDS       25456834 chr5:140776176-140776177(+) m6A 3'UTR//intron       - chr5:140776199-140776200(+) m6A 3'UTR//intron       - chr5:140777585-140777586(+) m6A intron       - chr5:140777591-140777592(+) m6A intron       - chr5:140777597-140777598(+) m6A intron       - chr5:140778037-140778038(+) m6A intron       - chr5:140778067-140778068(+) m6A intron       - chr5:140778187-140778188(+) m6A intron       - chr5:140778206-140778207(+) m6A intron       - chr5:140778248-140778249(+) m6A intron       - chr5:140778272-140778273(+) m6A intron       - chr5:140778288-140778289(+) m6A intron       - chr5:140778295-140778296(+) m6A intron       - chr5:140778302-140778303(+) m6A intron       - chr5:140778347-140778348(+) m6A intron       - chr5:140778543-140778544(+) m6A intron       - chr5:140778599-140778600(+) m6A intron       - chr5:140778615-140778616(+) m6A intron       - chr5:140778659-140778660(+) m6A intron       - chr5:140778771-140778772(+) m6A intron       - chr5:140778906-140778907(+) m6A intron       - chr5:140778913-140778914(+) m6A intron       - chr5:140778924-140778925(+) m6A intron       - chr5:140778958-140778959(+) m6A intron       - chr5:140779072-140779073(+) m6A intron       - chr5:140779114-140779115(+) m6A intron       - chr5:140779120-140779121(+) m6A intron       - chr5:140779268-140779269(+) m6A intron       - chr5:140779471-140779472(+) m6A intron       - chr5:140779478-140779479(+) m6A intron       - chr5:140779631-140779632(+) m6A intron       - chr5:140779889-140779890(+) m6A intron       - chr5:140779920-140779921(+) m6A intron       - chr5:140780009-140780010(+) m6A intron       - chr5:140780014-140780015(+) m6A intron       - chr5:140780152-140780153(+) m6A intron       - chr5:140782670-140782671(+) m6A intron       - chr5:140782751-140782752(+) m6A intron       - chr5:140782790-140782791(+) m6A intron       - chr5:140782832-140782833(+) m6A intron       - chr5:140782853-140782854(+) m6A intron       - chr5:140782863-140782864(+) m6A intron       - chr5:140783012-140783013(+) m6A intron       - chr5:140783068-140783069(+) m6A intron       - chr5:140783075-140783076(+) m6A intron       - chr5:140783090-140783091(+) m6A intron       - chr5:140783120-140783121(+) m6A intron       - chr5:140784165-140784166(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140784179-140784180(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140784302-140784303(+) m6A intron       25456834 chr5:140784308-140784309(+) m6A intron       25456834 chr5:140784435-140784436(+) m6A intron       - chr5:140784461-140784462(+) m6A intron       - chr5:140784527-140784528(+) m6A intron       - chr5:140785007-140785008(+) m6A intron       - chr5:140788256-140788257(+) m6A intron       24981863 chr5:140788262-140788263(+) m6A intron       24981863 chr5:140788286-140788287(+) m6A intron       24981863 chr5:140788362-140788363(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140788370-140788371(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140788380-140788381(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140788424-140788425(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140788601-140788602(+) m6A intron       24981863 chr5:140788879-140788880(+) m6A intron       24981863 chr5:140788930-140788931(+) m6A intron       24981863 chr5:140788977-140788978(+) m6A intron       24981863 chr5:140789000-140789001(+) m6A intron       24981863 chr5:140789011-140789012(+) m6A intron       24981863 chr5:140789565-140789566(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140789613-140789614(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140789718-140789719(+) m6A intron       25456834 chr5:140789765-140789766(+) m6A intron       25456834 chr5:140789789-140789790(+) m6A intron       25456834 chr5:140789829-140789830(+) m6A intron       25456834 chr5:140789942-140789943(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140789976-140789977(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140791571-140791572(+) m6A intron       - chr5:140791581-140791582(+) m6A intron       - chr5:140791610-140791611(+) m6A intron       - chr5:140791637-140791638(+) m6A intron       - chr5:140791683-140791684(+) m6A intron       - chr5:140791691-140791692(+) m6A intron       - chr5:140791710-140791711(+) m6A intron       - chr5:140792593-140792594(+) m6A intron       - chr5:140792652-140792653(+) m6A intron       - chr5:140792673-140792674(+) m6A intron       - chr5:140792681-140792682(+) m6A intron       - chr5:140792691-140792692(+) m6A intron       - chr5:140792713-140792714(+) m6A intron       - chr5:140792905-140792906(+) m6A intron       25456834 chr5:140792986-140792987(+) m6A intron       25456834 chr5:140793025-140793026(+) m6A intron       - chr5:140793088-140793089(+) m6A intron       - chr5:140793098-140793099(+) m6A intron       - chr5:140793247-140793248(+) m6A intron       24284625 chr5:140793843-140793844(+) m6A intron       - chr5:140793877-140793878(+) m6A intron       - chr5:140793893-140793894(+) m6A intron       - chr5:140794186-140794187(+) m6A intron       - chr5:140794192-140794193(+) m6A intron       - chr5:140794234-140794235(+) m6A intron       - chr5:140794282-140794283(+) m6A intron       - chr5:140794414-140794415(+) m6A intron       24284625//25456834 chr5:140794537-140794538(+) m6A intron       25456834 chr5:140794543-140794544(+) m6A intron       25456834//22608085 chr5:140794598-140794599(+) m6A intron       25456834//24981863//22608085 chr5:140794654-140794655(+) m6A intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr5:140794696-140794697(+) m6A intron       25456834//24981863//22608085 chr5:140794774-140794775(+) m6A intron       25456834 chr5:140794809-140794810(+) m6A intron       25456834 chr5:140794816-140794817(+) m6A intron       25456834 chr5:140795007-140795008(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140795038-140795039(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140795083-140795084(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140797673-140797674(+) m6A intron       24981863 chr5:140797688-140797689(+) m6A intron       24981863 chr5:140797697-140797698(+) m6A intron       24981863 chr5:140797879-140797880(+) m6A intron       24981863 chr5:140797976-140797977(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140798020-140798021(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140798027-140798028(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140798081-140798082(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140798378-140798379(+) m6A intron       24981863 chr5:140798393-140798394(+) m6A intron       24981863 chr5:140798536-140798537(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140798543-140798544(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140798549-140798550(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140798702-140798703(+) m6A intron       24981863 chr5:140798734-140798735(+) m6A intron       24981863 chr5:140798816-140798817(+) m6A intron       - chr5:140799215-140799216(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140799292-140799293(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140799332-140799333(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140799375-140799376(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140799599-140799600(+) m6A intron       - chr5:140799985-140799986(+) m6A intron       - chr5:140800666-140800667(+) m6A intron       - chr5:140800721-140800722(+) m6A intron       - chr5:140800766-140800767(+) m6A intron       - chr5:140800911-140800912(+) m6A intron       25456834//22608085 chr5:140801068-140801069(+) m6A intron       24981863 chr5:140801117-140801118(+) m6A intron       24981863//22608085 chr5:140801131-140801132(+) m6A intron       24981863//22608085 chr5:140801290-140801291(+) m6A intron       25456834//24981863//22608085 chr5:140801398-140801399(+) m6A intron       25456834//24981863//22608085 chr5:140801688-140801689(+) m6A intron       22608085 chr5:140801985-140801986(+) m6A intron       22608085 chr5:140802028-140802029(+) m6A intron       22608085 chr5:140802073-140802074(+) m6A intron       24981863//22608085 chr5:140802102-140802103(+) m6A intron       24981863//22608085 chr5:140802187-140802188(+) m6A intron       24981863//22608085 chr5:140802235-140802236(+) m6A intron       24981863//22608085 chr5:140802242-140802243(+) m6A intron       24981863//22608085 chr5:140802376-140802377(+) m6A intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr5:140802383-140802384(+) m6A intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr5:140802412-140802413(+) m6A intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr5:140802457-140802458(+) m6A intron       25456834//24981863//22608085 chr5:140802545-140802546(+) m6A intron       25456834//24981863//22608085 chr5:140802580-140802581(+) m6A intron       25456834//24981863//22608085 chr5:140802641-140802642(+) m6A intron       25456834//24981863//22608085 chr5:140802697-140802698(+) m6A intron       25456834//24981863//22608085 chr5:140802739-140802740(+) m6A intron       25456834//24981863//22608085 chr5:140802817-140802818(+) m6A intron       25456834//22608085 chr5:140802852-140802853(+) m6A intron       25456834//22608085 chr5:140802859-140802860(+) m6A intron       25456834//22608085 chr5:140803050-140803051(+) m6A intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr5:140803081-140803082(+) m6A intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr5:140803126-140803127(+) m6A intron       25456834//24981863//22608085 chr5:140803183-140803184(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140804219-140804220(+) m6A intron       - chr5:140804230-140804231(+) m6A intron       - chr5:140807641-140807642(+) m6A intron       25456834 chr5:140807717-140807718(+) m6A intron       25456834 chr5:140807745-140807746(+) m6A intron       25456834 chr5:140807791-140807792(+) m6A intron       25456834 chr5:140810193-140810194(+) m6A intron       24981863 chr5:140810216-140810217(+) m6A intron       24981863 chr5:140810266-140810267(+) m6A intron       24981863 chr5:140810351-140810352(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140810389-140810390(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140810401-140810402(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140810477-140810478(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140810645-140810646(+) m6A intron       24981863 chr5:140810699-140810700(+) m6A intron       24981863 chr5:140811204-140811205(+) m6A intron       24981863 chr5:140811223-140811224(+) m6A intron       24981863 chr5:140811248-140811249(+) m6A intron       24981863 chr5:140811401-140811402(+) m6A intron       24981863 chr5:140811415-140811416(+) m6A intron       24981863 chr5:140811465-140811466(+) m6A intron       24981863 chr5:140811545-140811546(+) m6A intron       24981863 chr5:140811905-140811906(+) m6A intron       - chr5:140811932-140811933(+) m6A intron       25456834 chr5:140811986-140811987(+) m6A intron       25456834 chr5:140812109-140812110(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140812115-140812116(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140812170-140812171(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140812226-140812227(+) m6A intron       25456834 chr5:140812268-140812269(+) m6A intron       25456834 chr5:140812346-140812347(+) m6A intron       25456834 chr5:140812381-140812382(+) m6A intron       25456834 chr5:140812388-140812389(+) m6A intron       25456834 chr5:140812579-140812580(+) m6A intron       - chr5:140812610-140812611(+) m6A intron       - chr5:140812655-140812656(+) m6A intron       - chr5:140812730-140812731(+) m6A intron       - chr5:140855536-140855537(+) m6A intron       - chr5:140855541-140855542(+) m6A intron       - chr5:140855584-140855585(+) m6A intron       24209618//25456834//24981863//22608085 chr5:140855652-140855653(+) m6A intron       24209618//25456834//24981863//22608085 chr5:140855667-140855668(+) m6A intron       24209618//25456834//24981863//22608085 chr5:140855709-140855710(+) m6A intron       24209618//25456834//24981863//22608085 chr5:140855762-140855763(+) m6A intron       24209618//25456834//24981863//22608085 chr5:140855840-140855841(+) m6A intron       24209618//25456834//24981863 chr5:140855921-140855922(+) m6A intron       24209618//25456834//24981863 chr5:140855929-140855930(+) m6A intron       24209618//25456834//24981863 chr5:140855980-140855981(+) m6A intron       24209618//25456834//24981863//22608085 chr5:140856023-140856024(+) m6A intron       24209618//24981863//22608085 chr5:140856062-140856063(+) m6A intron       24981863//22608085 chr5:140856193-140856194(+) m6A intron       25456834//24981863//22608085 chr5:140856248-140856249(+) m6A intron       25456834//24981863//22608085 chr5:140856290-140856291(+) m6A intron       25456834//24981863//22608085 chr5:140856343-140856344(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140856575-140856576(+) m6A intron       24981863 chr5:140856614-140856615(+) m6A intron       24981863 chr5:140856623-140856624(+) m6A intron       24981863 chr5:140856630-140856631(+) m6A intron       24981863 chr5:140856659-140856660(+) m6A intron       24981863 chr5:140856787-140856788(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140856913-140856914(+) m6A intron       24981863 chr5:140856923-140856924(+) m6A intron       24981863 chr5:140856937-140856938(+) m6A intron       24981863 chr5:140856982-140856983(+) m6A intron       24981863 chr5:140857088-140857089(+) m6A intron       24981863 chr5:140857115-140857116(+) m6A intron       24981863 chr5:140857130-140857131(+) m6A intron       24981863 chr5:140857189-140857190(+) m6A intron       24981863 chr5:140857259-140857260(+) m6A intron       24981863 chr5:140857343-140857344(+) m6A intron       24209618//24981863 chr5:140857589-140857590(+) m6A intron       24209618//25456834//24981863 chr5:140857609-140857610(+) m6A intron       24209618//25456834//24981863 chr5:140857631-140857632(+) m6A intron       24209618//25456834//24981863 chr5:140857688-140857689(+) m6A intron       24209618//25456834//24981863 chr5:140857856-140857857(+) m6A intron       24209618//25456834//24981863//22575960 chr5:140857891-140857892(+) m6A intron       24209618//25456834//24981863//22575960 chr5:140857976-140857977(+) m6A intron       24209618//25456834//24981863//22575960 chr5:140858007-140858008(+) m6A intron       24209618//25456834//24981863//22575960 chr5:140858042-140858043(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140858109-140858110(+) m6A intron       - chr5:140858342-140858343(+) m6A intron       - chr5:140864866-140864867(+) m6A intron       25456834 chr5:140864909-140864910(+) m6A intron       25456834 chr5:140864951-140864952(+) m6A intron       25456834 chr5:140864958-140864959(+) m6A intron       25456834 chr5:140864978-140864979(+) m6A intron       25456834 chr5:140865002-140865003(+) m6A intron       25456834 chr5:140865155-140865156(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140865186-140865187(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140865267-140865268(+) m6A intron       25456834//24981863 chr5:140865359-140865360(+) m6A intron       25456834 chr5:140865395-140865396(+) m6A intron       25456834 chr5:140865811-140865812(+) m6A intron       25456834//22608085 chr5:140865831-140865832(+) m6A intron       25456834 chr5:140865872-140865873(+) m6A intron       25456834 chr5:140865947-140865948(+) m6A intron       - chr5:140866271-140866272(+) m6A intron       25456834 chr5:140866279-140866280(+) m6A intron       25456834 chr5:140866321-140866322(+) m6A intron       - chr5:140866327-140866328(+) m6A intron       - chr5:140868713-140868714(+) m6A intron       - chr5:140868722-140868723(+) m6A intron       - chr5:140868763-140868764(+) m6A intron       - chr5:140868768-140868769(+) m6A intron       - chr5:140868777-140868778(+) m6A intron       - chr5:140868796-140868797(+) m6A intron       - chr5:140868819-140868820(+) m6A intron       - chr5:140869639-140869640(+) m6A intron       - chr5:140869654-140869655(+) m6A intron       - chr5:140869678-140869679(+) m6A intron       - chr5:140869693-140869694(+) m6A intron       - chr5:140869732-140869733(+) m6A intron       - chr5:140869784-140869785(+) m6A intron       24981863 chr5:140869933-140869934(+) m6A intron       - chr5:140869939-140869940(+) m6A intron       - chr5:140870657-140870658(+) m6A intron       - chr5:140870755-140870756(+) m6A intron       - chr5:140870815-140870816(+) m6A intron       - chr5:140870872-140870873(+) m6A intron       - chr5:140871010-140871011(+) m6A intron       - chr5:140871025-140871026(+) m6A intron       - chr5:140871109-140871110(+) m6A intron       - chr5:140871412-140871413(+) m6A intron       - chr5:140871426-140871427(+) m6A intron       - chr5:140874392-140874393(+) m6A CDS       25456834 chr5:140874417-140874418(+) m6A CDS       25456834 chr5:140886672-140886673(+) m6A intron       - chr5:140890954-140890955(+) m6A 3'UTR       24981863 chr5:140891005-140891006(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr5:140891014-140891015(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr5:140891047-140891048(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr5:140891313-140891314(+) m6A 3'UTR       24981863 chr5:140891398-140891399(+) m6A 3'UTR       24981863 chr5:140891472-140891473(+) m6A 3'UTR       24981863 chr5:140891479-140891480(+) m6A 3'UTR       24981863 chr5:140891499-140891500(+) m6A 3'UTR       24981863 chr5:140891559-140891560(+) m6A 3'UTR       24981863 chr5:140891619-140891620(+) m6A 3'UTR       24981863 chr5:140891650-140891651(+) m6A 3'UTR       24981863 chr5:140892123-140892124(+) m6A 3'UTR       - chr5:140892185-140892186(+) m6A 3'UTR       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	PCDHGA8	Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hbv-miR-B8-3p
Interactor2: PCDHGA8

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	VmiReg