Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00561710

  Virus:  

Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hbv-miR-B8-3p:           TTF2:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hbv-miR-B8-3p TTF2
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0031768 8458
Organism Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - F2//HuF2//ZGRF6

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR TTF2
chr1:117625701(+) A-I      ncRNA
chr1:117625709(+) A-I      ncRNA
chr1:117630043(+) A-I      intronic
chr1:117625710(+) A-I      ncRNA
chr1:117609553(+) A-I      intronic
chr1:117627918(+) A-I      intronic
chr1:117626461(+) A-I      intronic
chr1:117625397(+) A-I      intronic
chr1:117625388(+) A-I      intronic
chr1:117608661(+) A-I      intronic
chr1:117625785(+) A-I      ncRNA
chr1:117628140(+) A-I      intronic
chr1:117625632(+) A-I      ncRNA
chr1:117630982(+) A-I      intronic
chr1:117625686(+) A-I      ncRNA
chr1:117630910(+) A-I      intronic
chr1:117625704(+) A-I      ncRNA
chr1:117628138(+) A-I      intronic
chr1:117628130(+) A-I      intronic
chr1:117628125(+) A-I      intronic
chr1:117628024(+) A-I      intronic
chr1:117627977(+) A-I      intronic
chr1:117625609(+) A-I      intronic
chr1:117631055(+) A-I      intronic
chr1:117631002(+) A-I      intronic
chr1:117625000(+) A-I      intronic
chr1:117630943(+) A-I      intronic
chr1:117631005(+) A-I      intronic
chr1:117625109(+) A-I      intronic
chr1:117625337(+) A-I      intronic
chr1:117631061(+) A-I      intronic
chr1:117625019(+) A-I      intronic
chr1:117625111(+) A-I      intronic
chr1:117644635(+) A-I      3'UTR
chr1:117625433(+) A-I      intronic
chr1:117609944(+) A-I      intronic
chr1:117627956(+) A-I      intronic
chr1:117627975(+) A-I      intronic
chr1:117609921(+) A-I      intronic
chr1:117630920(+) A-I      intronic
chr1:117632088(+) A-I      intronic
chr1:117629946(+) A-I      intronic
chr1:117627999(+) A-I      intronic
chr1:117625069(+) A-I      intronic
chr1:117626460(+) A-I      intronic
chr1:117625713(+) A-I      ncRNA
chr1:117625698(+) A-I      ncRNA
chr1:117625722(+) A-I      ncRNA
chr1:117625714(+) A-I      ncRNA
chr1:117625712(+) A-I      ncRNA
chr1:117625743(+) A-I      ncRNA
chr1:117625721(+) A-I      ncRNA
chr1:117625770(+) A-I      ncRNA
chr1:117625389(+) A-I      intronic
chr1:117625383(+) A-I      intronic
chr1:117631071(+) A-I      intronic
chr1:117628014(+) A-I      intronic
chr1:117626500(+) A-I      intronic
chr1:117625055(+) A-I      intronic
chr1:117630039(+) A-I      intronic
chr1:117610076(+) A-I      intronic
chr1:117607327(+) A-I      intronic
chr1:117609920(+) A-I      intronic
chr1:117608153(+) A-I      intronic
chr1:117628010(+) A-I      intronic
chr1:117627921(+) A-I      intronic
chr1:117628054(+) A-I      intronic
chr1:117627920(+) A-I      intronic
chr1:117609486(+) A-I      intronic
chr1:117606880(+) A-I      intronic
chr1:117630014(+) A-I      intronic
chr1:117625073(+) A-I      intronic
chr1:117626501(+) A-I      intronic
chr1:117631065(+) A-I      intronic
chr1:117609480(+) A-I      intronic
chr1:117625001(+) A-I      intronic
chr1:117627947(+) A-I      intronic
chr1:117609577(+) A-I      intronic
chr1:117631009(+) A-I      intronic
chr1:117631079(+) A-I      intronic
chr1:117627985(+) A-I      intronic
chr1:117625036(+) A-I      intronic
chr1:117630080(+) A-I      intronic
chr1:117625359(+) A-I      intronic
chr1:117630115(+) A-I      intronic
chr1:117625056(+) A-I      intronic
chr1:117625610(+) A-I      intronic
chr1:117609546(+) A-I      intronic
chr1:117628103(+) A-I      intronic
chr1:117630189(+) A-I      intronic
chr1:117625333(+) A-I      intronic
chr1:117644630(+) A-I      3'UTR
chr1:117630079(+) A-I      intronic
chr1:117627992(+) A-I      intronic
chr1:117609394(+) A-I      intronic
chr1:117625087(+) A-I      intronic
chr1:117628015(+) A-I      intronic
chr1:117628028(+) A-I      intronic
chr1:117631012(+) A-I      intronic
chr1:117625392(+) A-I      intronic
chr1:117630905(+) A-I      intronic
chr1:117625070(+) A-I      intronic
chr1:117631004(+) A-I      intronic
chr1:117625025(+) A-I      intronic
chr1:117628023(+) A-I      intronic
chr1:117626514(+) A-I      intronic
chr1:117625057(+) A-I      intronic
chr1:117625008(+) A-I      intronic
chr1:117610013(+) A-I      intronic
chr1:117626505(+) A-I      intronic
chr1:117607966(+) A-I      intronic
chr1:117629941(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED TTF2
chr1:117628010(+) A-I intron -    15258596
chr1:117628015(+) A-I intron -    15258596
chr1:117628023(+) A-I intron -    15258596
chr1:117628054(+) A-I intron -    15258596   //22327324
chr1:117628103(+) A-I intron -    15258596
chr1:117624947(+) A-I intron -    22327324
chr1:117625025(+) A-I intron -    22327324
chr1:117625070(+) A-I intron -    22327324
chr1:117625073(+) A-I intron -    22327324
chr1:117625333(+) A-I intron -    22327324
chr1:117625392(+) A-I intron -    22327324
chr1:117625609(+) A-I intron -    22327324
chr1:117625610(+) A-I intron -    22327324
chr1:117626500(+) A-I intron -    22327324
chr1:117626505(+) A-I intron -    22327324
chr1:117624947(+) A-G intron -    21725310   //22484847
chr1:117606880(+) A-G intron -    22484847
chr1:117607966(+) A-G intron -    22484847
chr1:117609394(+) A-G intron -    22484847
chr1:117609486(+) A-G intron -    22484847
chr1:117609577(+) A-G intron -    22484847
chr1:117610013(+) A-G intron -    22484847
chr1:117610076(+) A-G intron -    22484847
chr1:117624859(+) A-G intron -    22484847
chr1:117624860(+) G-C intron -    22484847
chr1:117624904(+) A-G intron -    22484847
chr1:117624914(+) A-G intron -    22484847
chr1:117624934(+) A-G intron -    22484847
chr1:117624935(+) A-G intron -    22484847
chr1:117624939(+) A-G intron -    22484847
chr1:117624952(+) A-G intron -    22484847
chr1:117624960(+) A-G intron -    22484847
chr1:117624974(+) A-G intron -    22484847
chr1:117624976(+) A-G intron -    22484847
chr1:117624977(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625008(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625025(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625036(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625055(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625057(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625069(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625070(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625073(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625087(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625383(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625392(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625609(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625610(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625712(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625713(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625714(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625721(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625722(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625743(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625770(+) A-G intron -    22484847
chr1:117625785(+) A-G intron -    22484847
chr1:117626500(+) A-G intron -    22484847
chr1:117626501(+) A-G intron -    22484847
chr1:117626505(+) A-G intron -    22484847
chr1:117626508(+) A-T intron -    22484847
chr1:117627920(+) A-G intron -    22484847
chr1:117627921(+) A-G intron -    22484847
chr1:117627947(+) A-G intron -    22484847
chr1:117627975(+) A-G intron -    22484847
chr1:117628010(+) A-G intron -    22484847
chr1:117628054(+) A-G intron -    22484847
chr1:117629946(+) A-G intron -    22484847
chr1:117630039(+) A-G intron -    22484847
chr1:117630115(+) A-G intron -    22484847
chr1:117630905(+) A-G intron -    22484847
chr1:117630920(+) A-G intron -    22484847
chr1:117631004(+) A-G intron -    22484847
chr1:117631005(+) A-G intron -    22484847
chr1:117631009(+) A-G intron -    22484847
chr1:117631012(+) A-G intron -    22484847
chr1:117644664(+) T-C intron -    22484847
chr1:117625333(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase TTF2
chr1:117602949-117602950(+) m6A 5'UTR       24284625//24209618//24981863
chr1:117602958-117602959(+) m6A 5'UTR       24284625//24209618//24981863
chr1:117602975-117602976(+) m1A CDS       26863196//26863410
chr1:117603078-117603079(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863
chr1:117603096-117603097(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863
chr1:117603151-117603152(+) m6A CDS//exon       24209618
chr1:117617622-117617623(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085
chr1:117617709-117617710(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085
chr1:117617735-117617736(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085
chr1:117617766-117617767(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085
chr1:117617827-117617828(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr1:117617849-117617850(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr1:117617898-117617899(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr1:117617961-117617962(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//22608085
chr1:117618042-117618043(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//22608085
chr1:117618065-117618066(+) m6A CDS//exon       24284625//25456834//24981863//22608085
chr1:117618082-117618083(+) m6A CDS//exon       24284625//25456834//24981863//22608085
chr1:117618160-117618161(+) m6A CDS//exon       24284625//25456834//24981863//22575960//22608085
chr1:117618186-117618187(+) m6A CDS//exon       24284625//25456834//24981863//22575960//22608085
chr1:117618335-117618336(+) m6A CDS//exon       24284625//25456834//24981863//22608085
chr1:117618353-117618354(+) m6A CDS//exon       24284625//25456834//24981863//22608085
chr1:117618423-117618424(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863
chr1:117618431-117618432(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863
chr1:117618471-117618472(+) m6A CDS//exon       24284625
chr1:117618820-117618821(+) m6A CDS//exon       24284625
chr1:117619264-117619265(+) m6A CDS       24284625
chr1:117619315-117619316(+) m6A CDS       24981863
chr1:117624472-117624473(+) m6A CDS       24981863
chr1:117640781-117640782(+) Gm intron       -
chr1:117644229-117644230(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//24981863
chr1:117644377-117644378(+) m6A 3'UTR//intron       24981863
chr1:117644564-117644565(+) m6A 3'UTR//intron       -
chr1:117644587-117644588(+) m6A 3'UTR//intron       -
chr1:117648375-117648376(+) m6A 3'UTR       -

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate TTF2
Chromatin K562 cells     -
Cytosol K562 cells     -
Exosome Blood     -
Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus Colon cancer cells     24393600
Nucleus HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hbv-miR-B8-3p
Interactor2: TTF2

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//PITA//RNAHybrid//Targetscan
Support Database VmiReg

Starting a new search, please wait ...