Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00553038

  Virus:  

Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hbv-miR-B7-5p:  MIMAT0031766          GATC:  NR_033684     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hbv-miR-B7-5p	GATC
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0031766	283459
Organism	Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	15E1.2//COXPD42

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	GATC	chr12:120891552(+) A-I      intronic chr12:120899054(+) A-I      3'UTR chr12:120899548(+) A-I      3'UTR chr12:120899543(+) A-I      3'UTR chr12:120899530(+) A-I      3'UTR chr12:120899526(+) A-I      3'UTR chr12:120899520(+) A-I      3'UTR chr12:120892880(+) A-I      intronic chr12:120892871(+) A-I      intronic chr12:120891565(+) A-I      intronic chr12:120891559(+) A-I      intronic chr12:120899477(+) A-I      3'UTR chr12:120899491(+) A-I      3'UTR chr12:120899493(+) A-I      3'UTR chr12:120899501(+) A-I      3'UTR chr12:120889389(+) A-I      intronic chr12:120896793(+) A-I      intronic chr12:120889416(+) A-I      intronic chr12:120887812(+) A-I      intronic chr12:120889030(+) A-I      intronic chr12:120889108(+) A-I      intronic chr12:120889196(+) A-I      intronic chr12:120889197(+) A-I      intronic chr12:120889212(+) A-I      intronic chr12:120889361(+) A-I      intronic chr12:120889385(+) A-I      intronic chr12:120889392(+) A-I      intronic chr12:120889477(+) A-I      intronic chr12:120889527(+) A-I      intronic chr12:120889860(+) A-I      intronic chr12:120889882(+) A-I      intronic chr12:120897404(+) A-I      intronic chr12:120897405(+) A-I      intronic chr12:120897480(+) A-I      intronic chr12:120884980(+) A-I      intronic chr12:120884984(+) A-I      intronic chr12:120885139(+) A-I      intronic chr12:120886830(+) A-I      intronic chr12:120886846(+) A-I      intronic chr12:120887643(+) A-I      intronic chr12:120886931(+) A-I      intronic chr12:120887009(+) A-I      intronic chr12:120887317(+) A-I      intronic chr12:120887416(+) A-I      intronic chr12:120889700(+) A-I      intronic chr12:120896938(+) A-I      intronic chr12:120888673(+) A-I      intronic chr12:120896750(+) A-I      intronic chr12:120887447(+) A-I      intronic chr12:120887502(+) A-I      intronic chr12:120889136(+) A-I      intronic chr12:120896874(+) A-I      intronic chr12:120889127(+) A-I      intronic chr12:120889942(+) A-I      intronic chr12:120896797(+) A-I      intronic chr12:120896708(+) A-I      intronic chr12:120885018(+) A-I      intronic chr12:120890598(+) A-I      intronic chr12:120888827(+) A-I      intronic chr12:120885985(+) A-I      intronic chr12:120889088(+) A-I      intronic chr12:120891547(+) A-I      intronic chr12:120897512(+) A-I      intronic chr12:120896818(+) A-I      intronic chr12:120889451(+) A-I      intronic chr12:120892285(+) A-I      intronic chr12:120885607(+) A-I      intronic chr12:120889457(+) A-I      intronic chr12:120888826(+) A-I      intronic chr12:120890561(+) A-I      intronic chr12:120889089(+) A-I      intronic chr12:120896790(+) A-I      intronic chr12:120889086(+) A-I      intronic chr12:120889100(+) A-I      intronic chr12:120892310(+) A-I      intronic chr12:120888995(+) A-I      intronic chr12:120887285(+) A-I      intronic chr12:120887332(+) A-I      intronic chr12:120889941(+) A-I      intronic chr12:120889845(+) A-I      intronic chr12:120892865(+) A-I      intronic chr12:120886098(+) A-I      intronic chr12:120898646(+) A-I      3'UTR chr12:120899561(+) A-I      3'UTR chr12:120899722(+) A-I      3'UTR chr12:120898710(+) A-I      3'UTR chr12:120898717(+) A-I      3'UTR chr12:120899730(+) A-I      3'UTR chr12:120899502(+) A-I      3'UTR chr12:120899645(+) A-I      3'UTR chr12:120899731(+) A-I      3'UTR chr12:120898559(+) A-I      3'UTR chr12:120898642(+) A-I      3'UTR chr12:120899599(+) A-I      3'UTR chr12:120899529(+) A-I      3'UTR chr12:120899537(+) A-I      3'UTR chr12:120899712(+) A-I      3'UTR chr12:120898998(+) A-I      3'UTR chr12:120899503(+) A-I      3'UTR chr12:120898752(+) A-I      3'UTR chr12:120899162(+) A-I      3'UTR chr12:120899754(+) A-I      3'UTR chr12:120899718(+) A-I      3'UTR chr12:120899738(+) A-I      3'UTR chr12:120898720(+) A-I      3'UTR chr12:120899075(+) A-I      3'UTR chr12:120898719(+) A-I      3'UTR chr12:120898592(+) A-I      3'UTR chr12:120898985(+) A-I      3'UTR chr12:120898913(+) A-I      3'UTR chr12:120899507(+) A-I      3'UTR chr12:120898658(+) A-I      3'UTR chr12:120899707(+) A-I      3'UTR chr12:120899508(+) A-I      3'UTR chr12:120899003(+) A-I      3'UTR chr12:120899025(+) A-I      3'UTR chr12:120899626(+) A-I      3'UTR chr12:120899632(+) A-I      3'UTR chr12:120899562(+) A-I      3'UTR chr12:120899160(+) A-I      3'UTR chr12:120899569(+) A-I      3'UTR chr12:120899076(+) A-I      3'UTR chr12:120899545(+) A-I      3'UTR chr12:120899011(+) A-I      3'UTR chr12:120899675(+) A-I      3'UTR chr12:120899711(+) A-I      3'UTR chr12:120899758(+) A-I      3'UTR chr12:120892768(+) A-I      ncRNA chr12:120892784(+) A-I      ncRNA chr12:120889960(+) A-I      intronic chr12:120885079(+) A-I      intronic chr12:120887705(+) A-I      intronic chr12:120891603(+) A-I      intronic chr12:120889465(+) A-I      intronic chr12:120891530(+) A-I      intronic chr12:120885953(+) A-I      intronic chr12:120889290(+) A-I      intronic chr12:120888690(+) A-I      intronic chr12:120896936(+) A-I      intronic chr12:120889398(+) A-I      intronic chr12:120887692(+) A-I      intronic chr12:120888836(+) A-I      intronic chr12:120884979(+) A-I      intronic chr12:120889179(+) A-I      intronic chr12:120885628(+) A-I      intronic chr12:120889316(+) A-I      intronic chr12:120890562(+) A-I      intronic chr12:120889380(+) A-I      intronic chr12:120890679(+) A-I      intronic chr12:120897612(+) A-I      intronic chr12:120889863(+) A-I      intronic chr12:120892282(+) A-I      intronic chr12:120889784(+) A-I      intronic chr12:120890708(+) A-I      intronic chr12:120889092(+) A-I      intronic chr12:120888994(+) A-I      intronic chr12:120890286(+) A-I      intronic chr12:120885091(+) A-I      intronic chr12:120887839(+) A-I      intronic chr12:120889749(+) A-I      intronic chr12:120885595(+) A-I      intronic chr12:120890643(+) A-I      intronic chr12:120889500(+) A-I      intronic chr12:120889126(+) A-I      intronic chr12:120896744(+) A-I      intronic chr12:120889109(+) A-I      intronic chr12:120892243(+) A-I      intronic chr12:120886969(+) A-I      intronic chr12:120888902(+) A-I      intronic chr12:120887695(+) A-I      intronic chr12:120890761(+) A-I      intronic chr12:120888899(+) A-I      intronic chr12:120897548(+) A-I      intronic chr12:120890699(+) A-I      intronic chr12:120885008(+) A-I      intronic chr12:120889012(+) A-I      intronic chr12:120889779(+) A-I      intronic chr12:120889254(+) A-I      intronic chr12:120885925(+) A-I      intronic chr12:120888791(+) A-I      intronic chr12:120886964(+) A-I      intronic chr12:120896870(+) A-I      intronic chr12:120887014(+) A-I      intronic chr12:120888868(+) A-I      intronic chr12:120896789(+) A-I      intronic chr12:120888689(+) A-I      intronic chr12:120885140(+) A-I      intronic chr12:120891594(+) A-I      intronic chr12:120890771(+) A-I      intronic chr12:120891507(+) A-I      intronic chr12:120891529(+) A-I      intronic chr12:120886329(+) A-I      intronic chr12:120887024(+) A-I      intronic chr12:120889846(+) A-I      intronic chr12:120889841(+) A-I      intronic chr12:120892863(+) A-I      intronic chr12:120896845(+) A-I      intronic chr12:120889454(+) A-I      intronic chr12:120888788(+) A-I      intronic chr12:120889424(+) A-I      intronic chr12:120889077(+) A-I      intronic chr12:120889490(+) A-I      intronic chr12:120891551(+) A-I      intronic chr12:120890696(+) A-I      intronic chr12:120887622(+) A-I      intronic chr12:120889046(+) A-I      intronic chr12:120886974(+) A-I      intronic chr12:120887434(+) A-I      intronic chr12:120891511(+) A-I      intronic chr12:120885831(+) A-I      intronic chr12:120889383(+) A-I      intronic chr12:120886941(+) A-I      intronic chr12:120887390(+) A-I      intronic chr12:120889532(+) A-I      intronic chr12:120899174(+) A-I      3'UTR chr12:120898657(+) A-I      3'UTR chr12:120898605(+) A-I      3'UTR chr12:120898729(+) A-I      3'UTR chr12:120899118(+) A-I      3'UTR chr12:120898978(+) A-I      3'UTR chr12:120899029(+) A-I      3'UTR chr12:120899079(+) A-I      3'UTR chr12:120898645(+) A-I      3'UTR chr12:120898999(+) A-I      3'UTR chr12:120898606(+) A-I      3'UTR chr12:120898922(+) A-I      3'UTR chr12:120899028(+) A-I      3'UTR chr12:120899038(+) A-I      3'UTR chr12:120898697(+) A-I      3'UTR chr12:120898687(+) A-I      3'UTR chr12:120898661(+) A-I      3'UTR chr12:120898813(+) A-I      3'UTR chr12:120899064(+) A-I      3'UTR chr12:120899065(+) A-I      3'UTR chr12:120898714(+) A-I      3'UTR chr12:120899168(+) A-I      3'UTR chr12:120898553(+) A-I      3'UTR chr12:120899161(+) A-I      3'UTR chr12:120898554(+) A-I      3'UTR chr12:120898693(+) A-I      3'UTR chr12:120898656(+) A-I      3'UTR chr12:120898631(+) A-I      3'UTR chr12:120898728(+) A-I      3'UTR

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	GATC	chr12:120898605(+) A-I exon 5'UTR    15258596 chr12:120898656(+) A-I exon 5'UTR    15342557   //15258596 chr12:120898657(+) A-I exon 5'UTR    15342557   //15258596   //22327324 chr12:120898687(+) A-I exon 5'UTR    15342557   //15258596 chr12:120898714(+) A-I exon 5'UTR    15342557   //15258596 chr12:120898720(+) A-I exon 5'UTR    15342557   //15258596 chr12:120898943(+) A-I exon 5'UTR    15342557   //22327324 chr12:120899011(+) A-I exon 5'UTR    15342557 chr12:120899029(+) A-I exon 5'UTR    15342557 chr12:120899075(+) A-I exon 5'UTR    15342557   //22327324 chr12:120899076(+) A-I exon 5'UTR    15342557 chr12:120899079(+) A-I exon 5'UTR    15342557   //22327324 chr12:120899161(+) A-I exon 5'UTR    15342557 chr12:120898658(+) A-I intron -    22327324 chr12:120898661(+) A-I intron -    22327324 chr12:120898998(+) A-I intron -    22327324 chr12:120898999(+) A-I intron -    22327324 chr12:120899502(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899503(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899507(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899508(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899529(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899537(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899545(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899561(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899562(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899569(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899599(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899626(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899632(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899645(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899675(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899707(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899711(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899712(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899718(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899722(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899730(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899731(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899738(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899754(+) A-I intron -    22028664 chr12:120899758(+) A-I intron -    22028664 chr12:120898553(+) A-G intron -    21725310   //22484847 chr12:120888788(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889088(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889089(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889784(+) A-G intron -    22484847 chr12:120890561(+) A-G intron -    22484847 chr12:120890598(+) A-G intron -    22484847 chr12:120890674(+) T-C intron -    22484847 chr12:120890699(+) A-G intron -    22484847 chr12:120891529(+) A-G intron -    22484847 chr12:120891594(+) A-G intron -    22484847 chr12:120893165(+) T-C intron -    22484847 chr12:120893166(+) T-C intron -    22484847 chr12:120896731(+) T-C intron -    22484847 chr12:120896790(+) A-G intron -    22484847 chr12:120898631(+) A-G intron -    22484847 chr12:120898645(+) A-G intron -    22484847 chr12:120898657(+) A-G intron -    22484847 chr12:120898658(+) A-G intron -    22484847 chr12:120898661(+) A-G intron -    22484847 chr12:120898697(+) A-G intron -    22484847 chr12:120898714(+) A-G intron -    22484847 chr12:120898978(+) A-G intron -    22484847 chr12:120898998(+) A-G intron -    22484847 chr12:120898999(+) A-G intron -    22484847 chr12:120899011(+) A-G intron -    22484847 chr12:120899029(+) A-G intron -    22484847 chr12:120899064(+) A-G intron -    22484847 chr12:120899065(+) A-G intron -    22484847 chr12:120899075(+) A-G intron -    22484847 chr12:120899079(+) A-G intron -    22484847 chr12:120899168(+) A-G intron -    22484847 chr12:120884979(+) A-G intron -    22484847 chr12:120885008(+) A-G intron -    22484847 chr12:120885018(+) A-G intron -    22484847 chr12:120885595(+) A-G intron -    22484847 chr12:120885607(+) A-G intron -    22484847 chr12:120885628(+) A-G intron -    22484847 chr12:120886417(+) T-C intron -    22484847 chr12:120886969(+) A-G intron -    22484847 chr12:120886974(+) A-G intron -    22484847 chr12:120887285(+) A-G intron -    22484847 chr12:120887390(+) A-G intron -    22484847 chr12:120887447(+) A-G intron -    22484847 chr12:120887692(+) A-G intron -    22484847 chr12:120888776(+) T-C intron -    22484847 chr12:120888995(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889012(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889046(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889077(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889086(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889100(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889290(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889316(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889383(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889398(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889424(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889429(+) T-C intron -    22484847 chr12:120889445(+) T-C intron -    22484847 chr12:120889465(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889490(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889532(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889749(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889779(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889841(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889845(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889846(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889863(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889941(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889942(+) A-G intron -    22484847 chr12:120889960(+) A-G intron -    22484847 chr12:120890537(+) G-A intron -    22484847 chr12:120890547(+) C-G intron -    22484847 chr12:120890687(+) T-C intron -    22484847 chr12:120890708(+) A-G intron -    22484847 chr12:120890789(+) T-C intron -    22484847 chr12:120891511(+) A-G intron -    22484847 chr12:120891530(+) A-G intron -    22484847 chr12:120891547(+) A-G intron -    22484847 chr12:120891551(+) A-G intron -    22484847 chr12:120891603(+) A-G intron -    22484847 chr12:120892285(+) A-G intron -    22484847 chr12:120895599(+) A-G intron -    22484847 chr12:120896708(+) A-G intron -    22484847 chr12:120896744(+) A-G intron -    22484847 chr12:120896750(+) A-G intron -    22484847 chr12:120896753(+) T-C intron -    22484847 chr12:120896789(+) A-G intron -    22484847 chr12:120896792(+) T-C intron -    22484847 chr12:120896818(+) A-G intron -    22484847 chr12:120896824(+) T-C intron -    22484847 chr12:120896870(+) A-G intron -    22484847 chr12:120896911(+) T-C intron -    22484847 chr12:120896941(+) T-C intron -    22484847 chr12:120897512(+) A-G intron -    22484847 chr12:120897612(+) A-G intron -    22484847 chr12:120897613(+) T-C intron -    22484847 chr12:120898554(+) A-G intron -    22484847 chr12:120898721(+) T-C intron -    22484847 chr12:120899076(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	GATC	chr12:120884517-120884518(+) m6A 5'UTR//CDS       24284625//27773535//22608085 chr12:120884589-120884590(+) m6A 5'UTR//CDS       24284625 chr12:120884628-120884629(+) m6A CDS       24284625 chr12:120892771-120892772(+) m6A CDS//intron       24284625 chr12:120894940-120894941(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//22608085 chr12:120897737-120897738(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//22608085 chr12:120897794-120897795(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr12:120897910-120897911(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085 chr12:120898030-120898031(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085 chr12:120898064-120898065(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085 chr12:120898088-120898089(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085 chr12:120898200-120898201(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085 chr12:120898286-120898287(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr12:120898300-120898301(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr12:120898314-120898315(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr12:120898392-120898393(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr12:120898422-120898423(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr12:120901334-120901335(+) m6A 3'UTR       - chr12:120901382-120901383(+) m6A 3'UTR       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	GATC	Chromatin K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus K562 cells     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hbv-miR-B7-5p
Interactor2: GATC

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg