Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00541140

  Virus:  

Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hbv-miR-B2-3p:  MIMAT0031763          RNF207:  NM_207396     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hbv-miR-B2-3p	RNF207
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0031763	388591
Organism	Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	C1orf188

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	RNF207	chr1:6273371(+) A-I      intronic chr1:6279739(+) A-I      3'UTR chr1:6273430(+) A-I      intronic chr1:6273427(+) A-I      intronic chr1:6273317(+) A-I      intronic chr1:6275862(+) A-I      intronic chr1:6274646(+) A-I      intronic chr1:6275852(+) A-I      intronic chr1:6277191(+) A-I      intronic chr1:6277071(+) A-I      intronic chr1:6273517(+) A-I      intronic chr1:6273429(+) A-I      intronic chr1:6280006(+) A-I      3'UTR chr1:6280141(+) A-I      3'UTR chr1:6279652(+) A-I      3'UTR chr1:6279653(+) A-I      3'UTR chr1:6279670(+) A-I      3'UTR chr1:6280023(+) A-I      3'UTR chr1:6279806(+) A-I      3'UTR chr1:6275490(+) A-I      intronic chr1:6277151(+) A-I      intronic chr1:6273395(+) A-I      intronic chr1:6279872(+) A-I      3'UTR chr1:6276953(+) A-I      intronic chr1:6273332(+) A-I      intronic chr1:6280032(+) A-I      3'UTR chr1:6279986(+) A-I      3'UTR chr1:6279974(+) A-I      3'UTR chr1:6277164(+) A-I      intronic chr1:6280041(+) A-I      3'UTR chr1:6275777(+) A-I      intronic chr1:6276948(+) A-I      intronic chr1:6274602(+) A-I      intronic chr1:6280014(+) A-I      3'UTR chr1:6279956(+) A-I      3'UTR chr1:6275218(+) A-I      intronic chr1:6274834(+) A-I      intronic chr1:6273461(+) A-I      intronic chr1:6279950(+) A-I      3'UTR chr1:6280038(+) A-I      3'UTR chr1:6277189(+) A-I      intronic chr1:6279419(+) A-I      Syn:Lys->Lys chr1:6273434(+) A-I      intronic chr1:6273431(+) A-I      intronic chr1:6273428(+) A-I      intronic chr1:6277192(+) A-I      intronic chr1:6279912(+) A-I      3'UTR chr1:6277168(+) A-I      intronic chr1:6275462(+) A-I      intronic chr1:6279969(+) A-I      3'UTR chr1:6277102(+) A-I      intronic chr1:6280086(+) A-I      3'UTR chr1:6279734(+) A-I      3'UTR chr1:6279996(+) A-I      3'UTR chr1:6280119(+) A-I      3'UTR chr1:6279877(+) A-I      3'UTR chr1:6279873(+) A-I      3'UTR chr1:6276902(+) A-I      intronic chr1:6273470(+) A-I      intronic chr1:6276810(+) A-I      intronic chr1:6273325(+) A-I      intronic chr1:6276949(+) A-I      intronic chr1:6276835(+) A-I      intronic chr1:6277163(+) A-I      intronic chr1:6279957(+) A-I      3'UTR chr1:6280120(+) A-I      3'UTR chr1:6277059(+) A-I      intronic chr1:6276778(+) A-I      intronic chr1:6277140(+) A-I      intronic chr1:6280037(+) A-I      3'UTR chr1:6276760(+) A-I      intronic chr1:6273361(+) A-I      intronic chr1:6275228(+) A-I      intronic chr1:6279828(+) A-I      3'UTR chr1:6273394(+) A-I      intronic chr1:6280058(+) A-I      3'UTR chr1:6273460(+) A-I      intronic chr1:6279931(+) A-I      3'UTR chr1:6277113(+) A-I      intronic chr1:6279937(+) A-I      3'UTR chr1:6279823(+) A-I      3'UTR chr1:6279737(+) A-I      3'UTR chr1:6280092(+) A-I      3'UTR chr1:6277069(+) A-I      intronic chr1:6276750(+) A-I      intronic chr1:6279920(+) A-I      3'UTR chr1:6276762(+) A-I      intronic chr1:6276813(+) A-I      intronic chr1:6277095(+) A-I      intronic chr1:6274628(+) A-I      intronic chr1:6273326(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	RNF207	chr1:6268241(+) A-I intron -    19478186 chr1:6277113(+) A-I intron -    15342557 chr1:6277151(+) A-I intron -    15342557 chr1:6277163(+) A-I intron -    15342557   //22327324 chr1:6277164(+) A-I intron -    15342557   //22327324 chr1:6277168(+) A-I intron -    15342557 chr1:6277189(+) A-I intron -    15342557 chr1:6277192(+) A-I intron -    15342557 chr1:6278414(+) A-I exon CDS    15342557 chr1:6279419(+) A-I exon CDS    15342557 chr1:6279616(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr1:6273326(+) A-G intron -    22484847 chr1:6273332(+) A-G intron -    22484847 chr1:6273395(+) A-G intron -    22484847 chr1:6273428(+) A-G intron -    22484847 chr1:6273460(+) A-G intron -    22484847 chr1:6273461(+) A-G intron -    22484847 chr1:6274690(+) C-T intron -    22484847 chr1:6276760(+) A-G intron -    22484847 chr1:6276810(+) A-G intron -    22484847 chr1:6276835(+) A-G intron -    22484847 chr1:6276948(+) A-G intron -    22484847 chr1:6276949(+) A-G intron -    22484847 chr1:6276953(+) A-G intron -    22484847 chr1:6277059(+) A-G intron -    22484847 chr1:6277069(+) A-G intron -    22484847 chr1:6277095(+) A-G intron -    22484847 chr1:6277102(+) A-G intron -    22484847 chr1:6277163(+) A-G intron -    22484847 chr1:6277164(+) A-G intron -    22484847 chr1:6277168(+) A-G intron -    22484847 chr1:6277192(+) A-G intron -    22484847 chr1:6279872(+) A-G intron -    22484847 chr1:6279873(+) A-G intron -    22484847 chr1:6279950(+) A-G intron -    22484847 chr1:6279957(+) A-G intron -    22484847 chr1:6279960(+) G-A intron -    22484847 chr1:6279969(+) A-G intron -    22484847 chr1:6279974(+) A-G intron -    22484847 chr1:6279986(+) A-G intron -    22484847 chr1:6279996(+) A-G intron -    22484847 chr1:6280032(+) A-G intron -    22484847 chr1:6280037(+) A-G intron -    22484847 chr1:6280041(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	RNF207	chr1:6265821-6265822(+) m6A exon       24981863 chr1:6265881-6265882(+) m6A exon       25456834//24981863//27371828//27773536 chr1:6266204-6266205(+) m6A exon//intron       24981863 chr1:6266227-6266228(+) m6A exon//intron       24981863 chr1:6267720-6267721(+) m6A exon//intron       24981863//22575960 chr1:6267742-6267743(+) m6A exon//intron       24284625//24981863//22575960 chr1:6267755-6267756(+) m6A exon//intron       24284625//24981863//22575960 chr1:6267762-6267763(+) m6A exon//intron       24284625//24981863//22575960 chr1:6267780-6267781(+) m6A exon//intron       24284625//24981863//22575960 chr1:6267851-6267852(+) m6A exon//intron       24981863//22575960 chr1:6267954-6267955(+) m6A exon//intron       24284625//24981863 chr1:6267994-6267995(+) m6A exon//intron       24284625 chr1:6268233-6268234(+) m6A exon//intron       - chr1:6270673-6270674(+) m6A exon//intron       24981863 chr1:6270822-6270823(+) m6A exon//intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr1:6270843-6270844(+) m6A exon//intron       24284625//25456834 chr1:6272800-6272801(+) m6A exon//intron       - chr1:6272819-6272820(+) m6A exon//intron       - chr1:6275993-6275994(+) Cm intron       - chr1:6279454-6279455(+) m6A CDS//exon       24981863 chr1:6279475-6279476(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr1:6279513-6279514(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr1:6279519-6279520(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr1:6279526-6279527(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr1:6280196-6280197(+) m6A 3'UTR//exon       25456834 chr1:6280328-6280329(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//27773535 chr1:6280457-6280458(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863 chr1:6280708-6280709(+) m6A 3'UTR//exon       22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	RNF207	Chromatin K562 cells     - Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Nucleus K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hbv-miR-B2-3p
Interactor2: RNF207

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	VmiReg