Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00535683

  Virus:  

Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hbv-miR-B20-3p:  MIMAT0031158          SLCO3A1:  NR_135775     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hbv-miR-B20-3p	SLCO3A1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0031158	28232
Organism	Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	OATP-D//OATP-RP3//OATP3A1//OATPD//OATPRP3//SLC21A11

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	SLCO3A1	chr15:92516300(+) A-I      intronic chr15:92608500(+) A-I      intronic chr15:92608454(+) A-I      intronic chr15:92512663(+) A-I      intronic chr15:92516240(+) A-I      intronic chr15:92565737(+) A-I      intronic chr15:92502807(+) A-I      intronic chr15:92565769(+) A-I      intronic chr15:92512661(+) A-I      intronic chr15:92512677(+) A-I      intronic chr15:92565774(+) A-I      intronic chr15:92502811(+) A-I      intronic chr15:92565788(+) A-I      intronic chr15:92565825(+) A-I      intronic chr15:92565830(+) A-I      intronic chr15:92516257(+) A-I      intronic chr15:92516266(+) A-I      intronic chr15:92516277(+) A-I      intronic chr15:92516295(+) A-I      intronic chr15:92565773(+) A-I      intronic chr15:92608438(+) A-I      intronic chr15:92608452(+) A-I      intronic chr15:92514570(+) A-I      intronic chr15:92514546(+) A-I      intronic chr15:92514510(+) A-I      intronic chr15:92514473(+) A-I      intronic chr15:92514463(+) A-I      intronic chr15:92514453(+) A-I      intronic chr15:92514424(+) A-I      intronic chr15:92514370(+) A-I      intronic chr15:92514364(+) A-I      intronic chr15:92512757(+) A-I      intronic chr15:92512719(+) A-I      intronic chr15:92512702(+) A-I      intronic chr15:92512636(+) A-I      intronic chr15:92512629(+) A-I      intronic chr15:92505523(+) A-I      intronic chr15:92503294(+) A-I      intronic chr15:92502710(+) A-I      intronic chr15:92480870(+) A-I      intronic chr15:92480869(+) A-I      intronic chr15:92480864(+) A-I      intronic chr15:92480688(+) A-I      intronic chr15:92480672(+) A-I      intronic chr15:92505524(+) A-I      intronic chr15:92705623(+) A-I      intronic chr15:92705500(+) A-I      intronic chr15:92702852(+) A-I      intronic chr15:92702840(+) A-I      intronic chr15:92702699(+) A-I      intronic chr15:92702685(+) A-I      intronic chr15:92702675(+) A-I      intronic chr15:92702539(+) A-I      intronic chr15:92702533(+) A-I      intronic chr15:92702506(+) A-I      intronic chr15:92702500(+) A-I      intronic chr15:92702470(+) A-I      intronic chr15:92691214(+) A-I      intronic chr15:92630203(+) A-I      intronic chr15:92630200(+) A-I      intronic chr15:92514595(+) A-I      intronic chr15:92514585(+) A-I      intronic chr15:92705600(+) A-I      intronic chr15:92702884(+) A-I      intronic chr15:92445507(+) A-I      intronic chr15:92514475(+) A-I      intronic chr15:92502773(+) A-I      intronic chr15:92412947(+) A-I      intronic chr15:92514419(+) A-I      intronic chr15:92512567(+) A-I      intronic chr15:92702897(+) A-I      intronic chr15:92705577(+) A-I      intronic chr15:92480912(+) A-I      intronic chr15:92514371(+) A-I      intronic chr15:92505589(+) A-I      intronic chr15:92705619(+) A-I      intronic chr15:92702626(+) A-I      intronic chr15:92702660(+) A-I      intronic chr15:92512701(+) A-I      intronic chr15:92502874(+) A-I      intronic chr15:92702848(+) A-I      intronic chr15:92514504(+) A-I      intronic chr15:92700779(+) A-I      intronic chr15:92705642(+) A-I      intronic chr15:92705601(+) A-I      intronic chr15:92702625(+) A-I      intronic chr15:92512811(+) A-I      intronic chr15:92702665(+) A-I      intronic chr15:92705563(+) A-I      intronic chr15:92700821(+) A-I      intronic chr15:92514442(+) A-I      intronic chr15:92478208(+) A-I      intronic chr15:92702702(+) A-I      intronic chr15:92705451(+) A-I      intronic chr15:92512691(+) A-I      intronic chr15:92502784(+) A-I      intronic chr15:92705602(+) A-I      intronic chr15:92566016(+) A-I      intronic chr15:92514478(+) A-I      intronic chr15:92445520(+) A-I      intronic chr15:92608336(+) A-I      intronic chr15:92702611(+) A-I      intronic chr15:92705421(+) A-I      intronic chr15:92502722(+) A-I      intronic chr15:92664291(+) A-I      intronic chr15:92705654(+) A-I      intronic chr15:92538659(+) A-I      intronic chr15:92702656(+) A-I      intronic chr15:92702871(+) A-I      intronic chr15:92502812(+) A-I      intronic chr15:92534418(+) A-I      intronic chr15:92705580(+) A-I      intronic chr15:92565700(+) A-I      intronic chr15:92502698(+) A-I      intronic chr15:92630971(+) A-I      intronic chr15:92702613(+) A-I      intronic chr15:92516331(+) A-I      intronic chr15:92512737(+) A-I      intronic chr15:92502789(+) A-I      intronic chr15:92705641(+) A-I      intronic chr15:92503420(+) A-I      intronic chr15:92503487(+) A-I      intronic chr15:92700777(+) A-I      intronic chr15:92534421(+) A-I      intronic chr15:92565641(+) A-I      intronic chr15:92565693(+) A-I      intronic chr15:92502842(+) A-I      intronic chr15:92559623(+) A-I      intronic chr15:92514468(+) A-I      intronic chr15:92478349(+) A-I      intronic chr15:92418451(+) A-I      intronic chr15:92631023(+) A-I      intronic chr15:92505448(+) A-I      intronic chr15:92512665(+) A-I      intronic chr15:92512653(+) A-I      intronic chr15:92512599(+) A-I      intronic chr15:92530853(+) A-I      intronic chr15:92503395(+) A-I      intronic chr15:92502875(+) A-I      intronic chr15:92565895(+) A-I      intronic chr15:92498640(+) A-I      intronic chr15:92702828(+) A-I      intronic chr15:92516209(+) A-I      intronic chr15:92502835(+) A-I      intronic chr15:92632463(+) A-I      intronic chr15:92613837(+) A-I      intronic chr15:92706775(+) A-I      3'UTR

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	SLCO3A1	chr15:92702625(+) A-I intron -    15545495 chr15:92702626(+) A-I intron -    15545495 chr15:92702828(+) A-I intron -    15545495 chr15:92702848(+) A-I intron -    15545495 chr15:92702871(+) A-I intron -    15545495 chr15:92705451(+) A-I intron -    15342557 chr15:92705563(+) A-I intron -    15342557 chr15:92705577(+) A-I intron -    15342557 chr15:92705580(+) A-I intron -    15342557 chr15:92705600(+) A-I intron -    15342557 chr15:92705619(+) A-I intron -    15342557 chr15:92705641(+) A-I intron -    15342557 chr15:92705642(+) A-I intron -    15342557 chr15:92705654(+) A-I intron -    15342557 chr15:92706775(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr15:92686243(+) A-I intron -    21960545

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	SLCO3A1	chr15:92397150-92397151(+) m1A CDS//exon       26863196 chr15:92397214-92397215(+) m6A CDS//exon       24209618//25456834//24981863 chr15:92459297-92459298(+) Gm CDS//exon       - chr15:92460807-92460808(+) Am intron       - chr15:92549641-92549642(+) Tm intron       - chr15:92647517-92647518(+) m6A CDS//exon       24284625 chr15:92647695-92647696(+) m6A CDS//exon       24284625 chr15:92647739-92647740(+) m6A CDS//exon       24284625 chr15:92690363-92690364(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625 chr15:92706183-92706184(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863 chr15:92706204-92706205(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863 chr15:92706258-92706259(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960 chr15:92706273-92706274(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960 chr15:92706288-92706289(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960 chr15:92706293-92706294(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960 chr15:92706302-92706303(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960 chr15:92706327-92706328(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960 chr15:92706345-92706346(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960 chr15:92706383-92706384(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//25456834//24981863//22575960 chr15:92706447-92706448(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//24981863 chr15:92706453-92706454(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//24981863 chr15:92706494-92706495(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//24209618//24981863 chr15:92706537-92706538(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863 chr15:92706686-92706687(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//25456834//24981863 chr15:92706712-92706713(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//25456834//24981863 chr15:92706741-92706742(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//25456834//24981863 chr15:92706748-92706749(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//25456834//24981863 chr15:92706797-92706798(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863 chr15:92706812-92706813(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863 chr15:92707068-92707069(+) m6A 3'UTR//intron       24284625 chr15:92707745-92707746(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr15:92708188-92708189(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863 chr15:92708223-92708224(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863 chr15:92708251-92708252(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863 chr15:92708289-92708290(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863 chr15:92708316-92708317(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863 chr15:92708374-92708375(+) m6A 3'UTR//intron       24284625 chr15:92708447-92708448(+) m6A 3'UTR//intron       24284625 chr15:92714962-92714963(+) m6A exon//intron       24284625 chr15:92715024-92715025(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625 chr15:92715032-92715033(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625 chr15:92715041-92715042(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//25456834 chr15:92715072-92715073(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//25456834 chr15:92715185-92715186(+) m6A 3'UTR//exon       24284625 chr15:92715260-92715261(+) m6A 3'UTR//exon       24284625 chr15:92715295-92715296(+) m6A 3'UTR//exon       24284625

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	SLCO3A1	Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleus HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hbv-miR-B20-3p
Interactor2: SLCO3A1

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg