Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00535288

  Virus:  

Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hbv-miR-B20-3p:           KDELR2:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hbv-miR-B20-3p KDELR2
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0031158 11014
Organism Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - ELP-1//ELP1//ERD2.2//OI21

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR KDELR2
chr7:6511008(-) A-I      intronic
chr7:6511015(-) A-I      intronic
chr7:6511643(-) A-I      intronic
chr7:6510489(-) A-I      intronic
chr7:6503103(-) A-I      intronic
chr7:6503771(-) A-I      intronic
chr7:6520939(-) A-I      intronic
chr7:6503782(-) A-I      intronic
chr7:6503784(-) A-I      intronic
chr7:6503895(-) A-I      intronic
chr7:6510629(-) A-I      intronic
chr7:6510626(-) A-I      intronic
chr7:6510624(-) A-I      intronic
chr7:6505010(-) A-I      intronic
chr7:6505086(-) A-I      intronic
chr7:6510620(-) A-I      intronic
chr7:6510578(-) A-I      intronic
chr7:6521806(-) A-I      intronic
chr7:6521771(-) A-I      intronic
chr7:6521745(-) A-I      intronic
chr7:6521269(-) A-I      intronic
chr7:6520995(-) A-I      intronic
chr7:6507200(-) A-I      intronic
chr7:6507222(-) A-I      intronic
chr7:6507226(-) A-I      intronic
chr7:6507268(-) A-I      intronic
chr7:6507292(-) A-I      intronic
chr7:6507309(-) A-I      intronic
chr7:6504586(-) A-I      intronic
chr7:6504545(-) A-I      intronic
chr7:6507348(-) A-I      intronic
chr7:6507370(-) A-I      intronic
chr7:6508265(-) A-I      intronic
chr7:6508308(-) A-I      intronic
chr7:6508311(-) A-I      intronic
chr7:6508408(-) A-I      intronic
chr7:6504640(-) A-I      intronic
chr7:6508499(-) A-I      intronic
chr7:6508545(-) A-I      intronic
chr7:6508721(-) A-I      intronic
chr7:6504041(-) A-I      intronic
chr7:6504067(-) A-I      intronic
chr7:6520957(-) A-I      intronic
chr7:6504068(-) A-I      intronic
chr7:6504478(-) A-I      intronic
chr7:6504271(-) A-I      intronic
chr7:6504038(-) A-I      intronic
chr7:6514296(-) A-I      intronic
chr7:6514387(-) A-I      intronic
chr7:6514392(-) A-I      intronic
chr7:6514427(-) A-I      intronic
chr7:6514957(-) A-I      intronic
chr7:6514963(-) A-I      intronic
chr7:6504862(-) A-I      intronic
chr7:6504947(-) A-I      intronic
chr7:6504599(-) A-I      intronic
chr7:6508856(-) A-I      intronic
chr7:6521834(-) A-I      intronic
chr7:6521812(-) A-I      intronic
chr7:6521811(-) A-I      intronic
chr7:6521810(-) A-I      intronic
chr7:6521809(-) A-I      intronic
chr7:6511712(-) A-I      intronic
chr7:6504594(-) A-I      intronic
chr7:6511670(-) A-I      intronic
chr7:6511628(-) A-I      intronic
chr7:6511620(-) A-I      intronic
chr7:6511084(-) A-I      intronic
chr7:6511066(-) A-I      intronic
chr7:6511038(-) A-I      intronic
chr7:6511018(-) A-I      intronic
chr7:6510980(-) A-I      intronic
chr7:6510969(-) A-I      intronic
chr7:6518699(-) A-I      intronic
chr7:6518946(-) A-I      intronic
chr7:6508497(-) A-I      intronic
chr7:6519219(-) A-I      intronic
chr7:6519236(-) A-I      intronic
chr7:6519246(-) A-I      intronic
chr7:6519272(-) A-I      intronic
chr7:6520826(-) A-I      intronic
chr7:6520881(-) A-I      intronic
chr7:6504081(-) A-I      intronic
chr7:6507310(-) A-I      intronic
chr7:6503993(-) A-I      intronic
chr7:6503917(-) A-I      intronic
chr7:6509051(-) A-I      intronic
chr7:6510941(-) A-I      intronic
chr7:6510726(-) A-I      intronic
chr7:6510661(-) A-I      intronic
chr7:6515055(-) A-I      intronic
chr7:6517978(-) A-I      intronic
chr7:6509011(-) A-I      intronic
chr7:6508522(-) A-I      intronic
chr7:6517982(-) A-I      intronic
chr7:6514446(-) A-I      intronic
chr7:6520888(-) A-I      intronic
chr7:6515051(-) A-I      intronic
chr7:6504201(-) A-I      intronic
chr7:6521231(-) A-I      intronic
chr7:6505108(-) A-I      intronic
chr7:6514839(-) A-I      intronic
chr7:6518516(-) A-I      intronic
chr7:6509115(-) A-I      intronic
chr7:6510556(-) A-I      intronic
chr7:6521268(-) A-I      intronic
chr7:6521803(-) A-I      intronic
chr7:6504549(-) A-I      intronic
chr7:6521661(-) A-I      intronic
chr7:6521911(-) A-I      intronic
chr7:6504289(-) A-I      intronic
chr7:6511727(-) A-I      intronic
chr7:6519229(-) A-I      intronic
chr7:6510983(-) A-I      intronic
chr7:6504505(-) A-I      intronic
chr7:6503144(-) A-I      intronic
chr7:6519102(-) A-I      intronic
chr7:6508637(-) A-I      intronic
chr7:6504103(-) A-I      intronic
chr7:6504464(-) A-I      intronic
chr7:6511078(-) A-I      intronic
chr7:6507135(-) A-I      intronic
chr7:6518841(-) A-I      intronic
chr7:6504504(-) A-I      intronic
chr7:6504943(-) A-I      intronic
chr7:6510636(-) A-I      intronic
chr7:6517942(-) A-I      intronic
chr7:6504292(-) A-I      intronic
chr7:6503151(-) A-I      intronic
chr7:6508983(-) A-I      intronic
chr7:6517959(-) A-I      intronic
chr7:6520757(-) A-I      intronic
chr7:6517895(-) A-I      intronic
chr7:6518634(-) A-I      intronic
chr7:6511007(-) A-I      intronic
chr7:6518614(-) A-I      intronic
chr7:6514856(-) A-I      intronic
chr7:6503249(-) A-I      intronic
chr7:6510710(-) A-I      intronic
chr7:6514298(-) A-I      intronic
chr7:6503571(-) A-I      intronic
chr7:6508372(-) A-I      intronic
chr7:6504223(-) A-I      intronic
chr7:6503105(-) A-I      intronic
chr7:6521291(-) A-I      intronic
chr7:6514946(-) A-I      intronic
chr7:6507264(-) A-I      intronic
chr7:6518782(-) A-I      intronic
chr7:6510977(-) A-I      intronic
chr7:6507209(-) A-I      intronic
chr7:6521294(-) A-I      intronic
chr7:6503288(-) A-I      intronic
chr7:6522590(-) A-I      intronic
chr7:6508764(-) A-I      intronic
chr7:6507305(-) A-I      intronic
chr7:6508655(-) A-I      intronic
chr7:6504953(-) A-I      intronic
chr7:6518959(-) A-I      intronic
chr7:6520878(-) A-I      intronic
chr7:6517877(-) A-I      intronic
chr7:6504241(-) A-I      intronic
chr7:6508464(-) A-I      intronic
chr7:6518640(-) A-I      intronic
chr7:6503908(-) A-I      intronic
chr7:6520900(-) A-I      intronic
chr7:6512753(-) A-I      intronic
chr7:6510961(-) A-I      intronic
chr7:6503114(-) A-I      intronic
chr7:6514379(-) A-I      intronic
chr7:6511664(-) A-I      intronic
chr7:6508954(-) A-I      intronic
chr7:6505043(-) A-I      intronic
chr7:6511014(-) A-I      intronic
chr7:6522568(-) A-I      intronic
chr7:6507244(-) A-I      intronic
chr7:6518954(-) A-I      intronic
chr7:6521730(-) A-I      intronic
chr7:6515026(-) A-I      intronic
chr7:6522526(-) A-I      intronic
chr7:6521337(-) A-I      intronic
chr7:6511740(-) A-I      intronic
chr7:6518865(-) A-I      intronic
chr7:6507229(-) A-I      intronic
chr7:6508084(-) A-I      intronic
chr7:6508491(-) A-I      intronic
chr7:6521876(-) A-I      intronic
chr7:6514402(-) A-I      intronic
chr7:6521731(-) A-I      intronic
chr7:6518881(-) A-I      intronic
chr7:6508301(-) A-I      intronic
chr7:6507270(-) A-I      intronic
chr7:6505085(-) A-I      intronic
chr7:6508144(-) A-I      intronic
chr7:6504037(-) A-I      intronic
chr7:6518955(-) A-I      intronic
chr7:6507148(-) A-I      intronic
chr7:6503099(-) A-I      intronic
chr7:6505011(-) A-I      intronic
chr7:6520817(-) A-I      intronic
chr7:6514416(-) A-I      intronic
chr7:6511037(-) A-I      intronic
chr7:6503939(-) A-I      intronic
chr7:6511751(-) A-I      intronic
chr7:6511669(-) A-I      intronic
chr7:6509101(-) A-I      intronic
chr7:6507243(-) A-I      intronic
chr7:6514433(-) A-I      intronic
chr7:6511604(-) A-I      intronic
chr7:6504409(-) A-I      intronic
chr7:6510685(-) A-I      intronic
chr7:6515682(-) A-I      intronic
chr7:6507175(-) A-I      intronic
chr7:6521798(-) A-I      intronic
chr7:6508989(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED KDELR2
chr7:6503970(-) A-I intron -    22327324
chr7:6510495(-) A-I intron -    22327324
chr7:6510556(-) A-I intron -    22327324
chr7:6514402(-) A-I intron -    21960545   //22327324
chr7:6515026(-) A-I intron -    21960545   //22327324
chr7:6505085(-) A-I intron -    21960545
chr7:6507175(-) A-I intron -    21960545
chr7:6511680(-) A-I intron -    21960545
chr7:6511696(-) A-I intron -    21960545
chr7:6514446(-) A-I intron -    21960545
chr7:6521268(-) A-I intron -    21960545
chr7:6521269(-) A-I intron -    21960545
chr7:6503151(-) A-G intron -    22484847
chr7:6503249(-) A-G intron -    22484847
chr7:6503288(-) A-G intron -    22484847
chr7:6503939(-) A-G intron -    22484847
chr7:6504642(-) A-G intron -    22484847
chr7:6504953(-) A-G intron -    22484847
chr7:6505019(-) A-G intron -    22484847
chr7:6507175(-) A-G intron -    22484847
chr7:6507243(-) A-G intron -    22484847
chr7:6507244(-) A-G intron -    22484847
chr7:6507264(-) A-G intron -    22484847
chr7:6507280(-) A-G intron -    22484847
chr7:6507305(-) A-G intron -    22484847
chr7:6508301(-) A-G intron -    22484847
chr7:6508491(-) A-G intron -    22484847
chr7:6508744(-) T-C intron -    22484847
chr7:6508872(-) A-G intron -    22484847
chr7:6508954(-) A-G intron -    22484847
chr7:6508983(-) A-G intron -    22484847
chr7:6508989(-) A-G intron -    22484847
chr7:6510556(-) A-G intron -    22484847
chr7:6510950(-) A-G intron -    22484847
chr7:6510961(-) A-G intron -    22484847
chr7:6510977(-) A-G intron -    22484847
chr7:6511078(-) A-G intron -    22484847
chr7:6511083(-) A-G intron -    22484847
chr7:6511664(-) A-G intron -    22484847
chr7:6511669(-) A-G intron -    22484847
chr7:6511680(-) A-G intron -    22484847
chr7:6511727(-) A-G intron -    22484847
chr7:6511728(-) A-G intron -    22484847
chr7:6511740(-) A-G intron -    22484847
chr7:6514990(-) A-G intron -    22484847
chr7:6515026(-) A-G intron -    22484847
chr7:6515682(-) A-G intron -    22484847
chr7:6518841(-) A-G intron -    22484847
chr7:6520757(-) A-G intron -    22484847
chr7:6520817(-) A-G intron -    22484847
chr7:6520828(-) A-G intron -    22484847
chr7:6520837(-) A-G intron -    22484847
chr7:6520843(-) A-G intron -    22484847
chr7:6520878(-) A-G intron -    22484847
chr7:6520900(-) A-G intron -    22484847
chr7:6521268(-) A-G intron -    22484847
chr7:6521337(-) A-G intron -    22484847
chr7:6521730(-) A-G intron -    22484847
chr7:6521876(-) A-G intron -    22484847
chr7:6522474(-) T-C intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase KDELR2
chr7:6500801-6500802(-) m6A 3'UTR//intron       24284625//25456834//24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chr7:6500830-6500831(-) m6A 3'UTR//intron       24284625//25456834//24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chr7:6500865-6500866(-) m6A 3'UTR//intron       24284625//25456834//24981863//26404942//27773535//27371828//22575960//22608085
chr7:6501872-6501873(-) m6A 3'UTR//exon//intron       26404942
chr7:6501946-6501947(-) m6A 3'UTR//exon//intron       26404942
chr7:6502549-6502550(-) Y 3'UTR//exon//intron       25219674
chr7:6502674-6502675(-) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625//24981863//26404942//27371828//22575960//22608085
chr7:6502727-6502728(-) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625//24981863//26404942//27773535//27371828//22575960//22608085
chr7:6502761-6502762(-) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625//24981863//26404942//27773535//27371828//22575960//22608085
chr7:6505743-6505744(-) m6A CDS//exon//intron       24284625//27773535
chr7:6505869-6505870(-) m6A CDS//exon//intron       27773535
chr7:6505884-6505885(-) m6A CDS//exon//intron       27773535
chr7:6505944-6505945(-) m6A CDS//exon//intron       27773535
chr7:6509550-6509551(-) m6A exon//intron       27773535
chr7:6509555-6509556(-) m6A exon//intron       27773535
chr7:6509596-6509597(-) m6A exon//intron       27773535
chr7:6509687-6509688(-) m6A exon//intron       27773535
chr7:6509694-6509695(-) m6A exon//intron       27773535
chr7:6509701-6509702(-) m6A exon//intron       27773535
chr7:6523624-6523625(-) Am CDS//exon       -
chr7:6523662-6523663(-) m6A CDS//exon       24209618//25456834//22575960
chr7:6523683-6523684(-) m6A CDS//exon       24209618//25456834//24981863//27773536//22575960

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate KDELR2
Chromatin K562 cells     -
Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus K562 cells     -
Ribosome HEK-293 cells     22199352

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hbv-miR-B20-3p
Interactor2: KDELR2

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//Targetscan
Support Database VmiReg

Starting a new search, please wait ...