Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00520505

  Virus:  

Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hbv-miR-B2RC:  MIMAT0012170          RAB2A:  NM_002865     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hbv-miR-B2RC	RAB2A
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0012170	5862
Organism	Macacine alphaherpesvirus 1 (CeHV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	LHX//RAB2

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	RAB2A	chr8:61497911(+) A-I      intronic chr8:61525135(+) A-I      intronic chr8:61525117(+) A-I      intronic chr8:61525115(+) A-I      intronic chr8:61525110(+) A-I      intronic chr8:61525100(+) A-I      intronic chr8:61500736(+) A-I      intronic chr8:61500757(+) A-I      intronic chr8:61500762(+) A-I      intronic chr8:61497996(+) A-I      intronic chr8:61477943(+) A-I      intronic chr8:61477957(+) A-I      intronic chr8:61499403(+) A-I      intronic chr8:61499421(+) A-I      intronic chr8:61499437(+) A-I      intronic chr8:61516348(+) A-I      intronic chr8:61516379(+) A-I      intronic chr8:61446435(+) A-I      intronic chr8:61449881(+) A-I      intronic chr8:61449907(+) A-I      intronic chr8:61502650(+) A-I      intronic chr8:61449910(+) A-I      intronic chr8:61450369(+) A-I      intronic chr8:61453315(+) A-I      intronic chr8:61454127(+) A-I      intronic chr8:61454137(+) A-I      intronic chr8:61454141(+) A-I      intronic chr8:61454144(+) A-I      intronic chr8:61454819(+) A-I      intronic chr8:61454820(+) A-I      intronic chr8:61454828(+) A-I      intronic chr8:61454846(+) A-I      intronic chr8:61454850(+) A-I      intronic chr8:61454953(+) A-I      intronic chr8:61456834(+) A-I      intronic chr8:61456846(+) A-I      intronic chr8:61456851(+) A-I      intronic chr8:61456867(+) A-I      intronic chr8:61457538(+) A-I      intronic chr8:61457991(+) A-I      intronic chr8:61458036(+) A-I      intronic chr8:61463135(+) A-I      intronic chr8:61469936(+) A-I      intronic chr8:61469961(+) A-I      intronic chr8:61469964(+) A-I      intronic chr8:61470163(+) A-I      intronic chr8:61470251(+) A-I      intronic chr8:61470255(+) A-I      intronic chr8:61470387(+) A-I      intronic chr8:61477723(+) A-I      intronic chr8:61530279(+) A-I      intronic chr8:61510659(+) A-I      intronic chr8:61510592(+) A-I      intronic chr8:61502963(+) A-I      intronic chr8:61477800(+) A-I      intronic chr8:61477847(+) A-I      intronic chr8:61477867(+) A-I      intronic chr8:61477935(+) A-I      intronic chr8:61479755(+) A-I      intronic chr8:61530212(+) A-I      intronic chr8:61530208(+) A-I      intronic chr8:61519894(+) A-I      intronic chr8:61518614(+) A-I      intronic chr8:61514111(+) A-I      intronic chr8:61514080(+) A-I      intronic chr8:61510667(+) A-I      intronic chr8:61510663(+) A-I      intronic chr8:61430954(+) A-I      intronic chr8:61430995(+) A-I      intronic chr8:61431094(+) A-I      intronic chr8:61434309(+) A-I      intronic chr8:61441369(+) A-I      intronic chr8:61445212(+) A-I      intronic chr8:61445259(+) A-I      intronic chr8:61445308(+) A-I      intronic chr8:61446268(+) A-I      intronic chr8:61446309(+) A-I      intronic chr8:61446369(+) A-I      intronic chr8:61446378(+) A-I      intronic chr8:61446414(+) A-I      intronic chr8:61482089(+) A-I      intronic chr8:61482253(+) A-I      intronic chr8:61497903(+) A-I      intronic chr8:61477794(+) A-I      intronic chr8:61512865(+) A-I      intronic chr8:61477932(+) A-I      intronic chr8:61499304(+) A-I      intronic chr8:61499385(+) A-I      intronic chr8:61446288(+) A-I      intronic chr8:61470229(+) A-I      intronic chr8:61499388(+) A-I      intronic chr8:61494293(+) A-I      intronic chr8:61434319(+) A-I      intronic chr8:61530226(+) A-I      intronic chr8:61520125(+) A-I      intronic chr8:61445139(+) A-I      intronic chr8:61469806(+) A-I      intronic chr8:61477874(+) A-I      intronic chr8:61502941(+) A-I      intronic chr8:61516355(+) A-I      intronic chr8:61499297(+) A-I      intronic chr8:61453263(+) A-I      intronic chr8:61500711(+) A-I      intronic chr8:61446274(+) A-I      intronic chr8:61499296(+) A-I      intronic chr8:61499367(+) A-I      intronic chr8:61499390(+) A-I      intronic chr8:61513966(+) A-I      intronic chr8:61527032(+) A-I      intronic chr8:61514563(+) A-I      intronic chr8:61510580(+) A-I      intronic chr8:61431029(+) A-I      intronic chr8:61449963(+) A-I      intronic chr8:61439460(+) A-I      intronic chr8:61453276(+) A-I      intronic chr8:61527008(+) A-I      intronic chr8:61499258(+) A-I      intronic chr8:61516351(+) A-I      intronic chr8:61477749(+) A-I      intronic chr8:61469177(+) A-I      intronic chr8:61514009(+) A-I      intronic chr8:61478399(+) A-I      intronic chr8:61503015(+) A-I      intronic chr8:61446323(+) A-I      intronic chr8:61489717(+) A-I      intronic chr8:61454062(+) A-I      intronic chr8:61455001(+) A-I      intronic chr8:61482189(+) A-I      intronic chr8:61530207(+) A-I      intronic chr8:61498107(+) A-I      intronic chr8:61453168(+) A-I      intronic chr8:61514554(+) A-I      intronic chr8:61520071(+) A-I      intronic chr8:61510746(+) A-I      intronic chr8:61498865(+) A-I      intronic chr8:61449942(+) A-I      intronic chr8:61470254(+) A-I      intronic chr8:61453288(+) A-I      intronic chr8:61455056(+) A-I      intronic chr8:61516398(+) A-I      intronic chr8:61514087(+) A-I      intronic chr8:61497971(+) A-I      intronic chr8:61502965(+) A-I      intronic chr8:61500715(+) A-I      intronic chr8:61494303(+) A-I      intronic chr8:61446440(+) A-I      intronic chr8:61446365(+) A-I      intronic chr8:61499256(+) A-I      intronic chr8:61454887(+) A-I      intronic chr8:61469981(+) A-I      intronic chr8:61498056(+) A-I      intronic chr8:61499459(+) A-I      intronic chr8:61516389(+) A-I      intronic chr8:61499413(+) A-I      intronic chr8:61500622(+) A-I      intronic chr8:61445303(+) A-I      intronic chr8:61514083(+) A-I      intronic chr8:61430960(+) A-I      intronic chr8:61509481(+) A-I      intronic chr8:61470226(+) A-I      intronic chr8:61469923(+) A-I      intronic chr8:61482131(+) A-I      intronic chr8:61482101(+) A-I      intronic chr8:61516324(+) A-I      intronic chr8:61449920(+) A-I      intronic chr8:61454994(+) A-I      intronic chr8:61477792(+) A-I      intronic chr8:61514689(+) A-I      intronic chr8:61445182(+) A-I      intronic chr8:61498092(+) A-I      intronic chr8:61499274(+) A-I      intronic chr8:61514117(+) A-I      intronic chr8:61445222(+) A-I      intronic chr8:61469924(+) A-I      intronic chr8:61482121(+) A-I      intronic chr8:61512896(+) A-I      intronic chr8:61453241(+) A-I      intronic chr8:61499243(+) A-I      intronic chr8:61482211(+) A-I      intronic chr8:61477720(+) A-I      intronic chr8:61478404(+) A-I      intronic chr8:61456788(+) A-I      intronic chr8:61470386(+) A-I      intronic chr8:61446409(+) A-I      intronic chr8:61477750(+) A-I      intronic chr8:61469865(+) A-I      intronic chr8:61514133(+) A-I      intronic chr8:61456782(+) A-I      intronic chr8:61497997(+) A-I      intronic chr8:61498053(+) A-I      intronic chr8:61470224(+) A-I      intronic chr8:61456444(+) A-I      intronic chr8:61453178(+) A-I      intronic chr8:61520083(+) A-I      intronic chr8:61469817(+) A-I      intronic chr8:61499409(+) A-I      intronic chr8:61516394(+) A-I      intronic chr8:61502638(+) A-I      intronic chr8:61453095(+) A-I      intronic chr8:61454034(+) A-I      intronic chr8:61453224(+) A-I      intronic chr8:61477876(+) A-I      intronic chr8:61445289(+) A-I      intronic chr8:61477799(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	RAB2A	chr8:61499296(+) A-I intron -    15545495 chr8:61499297(+) A-I intron -    15545495 chr8:61499381(+) A-I intron -    15545495 chr8:61499385(+) A-I intron -    15545495   //21960545 chr8:61499388(+) A-I intron -    15545495 chr8:61499390(+) A-I intron -    15545495 chr8:61499409(+) A-I intron -    15545495 chr8:61499413(+) A-I intron -    15545495 chr8:61499459(+) A-I intron -    15545495 chr8:61499476(+) A-I intron -    15545495 chr8:61517660(+) A-I intron -    22327324 chr8:61437839(+) A-I intron -    21960545 chr8:61437921(+) A-I intron -    21960545 chr8:61437923(+) A-I intron -    21960545 chr8:61437924(+) A-I intron -    21960545 chr8:61439212(+) A-I intron -    21960545 chr8:61439825(+) A-I intron -    21960545 chr8:61439998(+) A-I intron -    21960545 chr8:61441322(+) A-I intron -    21960545 chr8:61445222(+) A-I intron -    21960545 chr8:61445227(+) A-I intron -    21960545 chr8:61445304(+) A-I intron -    21960545 chr8:61446365(+) A-I intron -    21960545 chr8:61453138(+) A-I intron -    21960545 chr8:61453139(+) A-I intron -    21960545 chr8:61457887(+) A-I intron -    21960545 chr8:61477795(+) A-I intron -    21960545 chr8:61477857(+) A-I intron -    21960545 chr8:61499198(+) A-I intron -    21960545 chr8:61499258(+) A-I intron -    21960545 chr8:61502540(+) A-I intron -    21960545 chr8:61517592(+) A-I intron -    21960545 chr8:61519309(+) A-I intron -    21960545 chr8:61519442(+) A-I intron -    21960545 chr8:61437921(+) A-G intron -    22484847 chr8:61439212(+) A-G intron -    22484847 chr8:61439707(+) A-G intron -    22484847 chr8:61439759(+) A-G intron -    22484847 chr8:61517660(+) A-G intron -    22484847 chr8:61444379(+) A-T intron -    22484847 chr8:61445182(+) A-G intron -    22484847 chr8:61445222(+) A-G intron -    22484847 chr8:61445289(+) A-G intron -    22484847 chr8:61445303(+) A-G intron -    22484847 chr8:61446288(+) A-G intron -    22484847 chr8:61446320(+) A-G intron -    22484847 chr8:61446323(+) A-G intron -    22484847 chr8:61446328(+) A-G intron -    22484847 chr8:61446329(+) A-G intron -    22484847 chr8:61446365(+) A-G intron -    22484847 chr8:61446409(+) A-G intron -    22484847 chr8:61449837(+) A-G intron -    22484847 chr8:61449920(+) A-G intron -    22484847 chr8:61449942(+) A-G intron -    22484847 chr8:61449963(+) A-G intron -    22484847 chr8:61453095(+) A-G intron -    22484847 chr8:61453178(+) A-G intron -    22484847 chr8:61453241(+) A-G intron -    22484847 chr8:61453263(+) A-G intron -    22484847 chr8:61454034(+) A-G intron -    22484847 chr8:61454062(+) A-G intron -    22484847 chr8:61454913(+) A-G intron -    22484847 chr8:61454994(+) A-G intron -    22484847 chr8:61455001(+) A-G intron -    22484847 chr8:61455056(+) A-G intron -    22484847 chr8:61456344(+) A-G intron -    22484847 chr8:61456383(+) A-G intron -    22484847 chr8:61456387(+) A-G intron -    22484847 chr8:61456782(+) A-G intron -    22484847 chr8:61456788(+) A-G intron -    22484847 chr8:61469817(+) A-G intron -    22484847 chr8:61469865(+) A-G intron -    22484847 chr8:61470224(+) A-G intron -    22484847 chr8:61470226(+) A-G intron -    22484847 chr8:61470229(+) A-G intron -    22484847 chr8:61470254(+) A-G intron -    22484847 chr8:61470386(+) A-G intron -    22484847 chr8:61477720(+) A-G intron -    22484847 chr8:61477795(+) A-G intron -    22484847 chr8:61477965(+) A-G intron -    22484847 chr8:61478399(+) A-G intron -    22484847 chr8:61478404(+) A-G intron -    22484847 chr8:61478409(+) A-G intron -    22484847 chr8:61482121(+) A-G intron -    22484847 chr8:61482131(+) A-G intron -    22484847 chr8:61492193(+) T-C intron -    22484847 chr8:61497875(+) T-G intron -    22484847 chr8:61497895(+) A-G intron -    22484847 chr8:61497941(+) A-G intron -    22484847 chr8:61497971(+) A-G intron -    22484847 chr8:61498053(+) A-G intron -    22484847 chr8:61498056(+) A-G intron -    22484847 chr8:61498107(+) A-G intron -    22484847 chr8:61498865(+) A-G intron -    22484847 chr8:61498867(+) G-A intron -    22484847 chr8:61498870(+) A-T intron -    22484847 chr8:61499258(+) A-G intron -    22484847 chr8:61499492(+) G-A intron -    22484847 chr8:61500715(+) A-G intron -    22484847 chr8:61500761(+) A-G intron -    22484847 chr8:61500817(+) A-G intron -    22484847 chr8:61502540(+) A-G intron -    22484847 chr8:61502638(+) A-G intron -    22484847 chr8:61513971(+) G-A intron -    22484847 chr8:61514087(+) A-G intron -    22484847 chr8:61514627(+) A-G intron -    22484847 chr8:61516389(+) A-G intron -    22484847 chr8:61516394(+) A-G intron -    22484847 chr8:61516398(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	RAB2A	chr8:61429497-61429498(+) m6A 5'UTR       24209618//24981863 chr8:61429674-61429675(+) Y 5'UTR       26075521 chr8:61470992-61470993(+) m6A 5'UTR//intron       24209618 chr8:61504473-61504474(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       27773535 chr8:61504479-61504480(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       27773535 chr8:61504507-61504508(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       27773535 chr8:61533405-61533406(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr8:61533412-61533413(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr8:61534068-61534069(+) m6A 3'UTR       27773535 chr8:61534118-61534119(+) m6A 3'UTR       27773535 chr8:61534217-61534218(+) m6A 3'UTR       26404942 chr8:61534235-61534236(+) m6A 3'UTR       26404942

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	RAB2A	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Nucleoplasm K562 cells     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hbv-miR-B2RC
Interactor2: RAB2A

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//RNAHybrid
Support Database	VmiReg