Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00509233

  Virus:  

Human herpesvirus 5 strain AD169

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.7311

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US25-1-5p:           TAB2:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hcmv-miR-US25-1-5p TAB2
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0001581 23118
Organism Human herpesvirus 5 strain AD169 Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - CHTD2//MAP3K7IP2//TAB-2

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position
Lncediting TAB2
    chr6: 149542018
    chr6: 149541962
Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR TAB2
chr6:149670452(+) A-I      intronic
chr6:149717344(+) A-I      intronic
chr6:149718306(+) A-I      intronic
chr6:149718344(+) A-I      intronic
chr6:149670445(+) A-I      intronic
chr6:149670462(+) A-I      intronic
chr6:149670468(+) A-I      intronic
chr6:149670481(+) A-I      intronic
chr6:149655614(+) A-I      intronic
chr6:149671123(+) A-I      intronic
chr6:149671148(+) A-I      intronic
chr6:149671197(+) A-I      intronic
chr6:149671251(+) A-I      intronic
chr6:149671350(+) A-I      intronic
chr6:149676546(+) A-I      intronic
chr6:149676547(+) A-I      intronic
chr6:149676552(+) A-I      intronic
chr6:149676642(+) A-I      intronic
chr6:149676707(+) A-I      intronic
chr6:149676714(+) A-I      intronic
chr6:149678396(+) A-I      intronic
chr6:149678437(+) A-I      intronic
chr6:149678467(+) A-I      intronic
chr6:149678892(+) A-I      intronic
chr6:149678953(+) A-I      intronic
chr6:149704893(+) A-I      intronic
chr6:149717271(+) A-I      intronic
chr6:149679011(+) A-I      intronic
chr6:149679080(+) A-I      intronic
chr6:149702107(+) A-I      intronic
chr6:149702123(+) A-I      intronic
chr6:149660352(+) A-I      intronic
chr6:149660395(+) A-I      intronic
chr6:149660405(+) A-I      intronic
chr6:149660783(+) A-I      intronic
chr6:149660814(+) A-I      intronic
chr6:149660815(+) A-I      intronic
chr6:149660834(+) A-I      intronic
chr6:149660864(+) A-I      intronic
chr6:149704864(+) A-I      intronic
chr6:149704087(+) A-I      intronic
chr6:149704848(+) A-I      intronic
chr6:149702137(+) A-I      intronic
chr6:149718498(+) A-I      intronic
chr6:149669981(+) A-I      intronic
chr6:149704980(+) A-I      intronic
chr6:149706542(+) A-I      intronic
chr6:149706552(+) A-I      intronic
chr6:149706596(+) A-I      intronic
chr6:149660871(+) A-I      intronic
chr6:149660884(+) A-I      intronic
chr6:149656629(+) A-I      intronic
chr6:149702145(+) A-I      intronic
chr6:149702163(+) A-I      intronic
chr6:149702779(+) A-I      intronic
chr6:149702789(+) A-I      intronic
chr6:149702809(+) A-I      intronic
chr6:149702810(+) A-I      intronic
chr6:149669982(+) A-I      intronic
chr6:149710155(+) A-I      intronic
chr6:149710257(+) A-I      intronic
chr6:149702854(+) A-I      intronic
chr6:149656693(+) A-I      intronic
chr6:149704928(+) A-I      intronic
chr6:149710352(+) A-I      intronic
chr6:149669924(+) A-I      intronic
chr6:149670399(+) A-I      intronic
chr6:149669919(+) A-I      intronic
chr6:149702946(+) A-I      intronic
chr6:149703571(+) A-I      intronic
chr6:149703572(+) A-I      intronic
chr6:149703574(+) A-I      intronic
chr6:149710660(+) A-I      intronic
chr6:149710661(+) A-I      intronic
chr6:149710687(+) A-I      intronic
chr6:149710786(+) A-I      intronic
chr6:149710790(+) A-I      intronic
chr6:149669295(+) A-I      intronic
chr6:149669279(+) A-I      intronic
chr6:149661001(+) A-I      intronic
chr6:149660991(+) A-I      intronic
chr6:149660982(+) A-I      intronic
chr6:149703626(+) A-I      intronic
chr6:149660892(+) A-I      intronic
chr6:149656526(+) A-I      intronic
chr6:149710504(+) A-I      intronic
chr6:149710526(+) A-I      intronic
chr6:149710543(+) A-I      intronic
chr6:149710654(+) A-I      intronic
chr6:149704819(+) A-I      intronic
chr6:149704793(+) A-I      intronic
chr6:149656542(+) A-I      intronic
chr6:149669328(+) A-I      intronic
chr6:149655561(+) A-I      intronic
chr6:149641456(+) A-I      intronic
chr6:149641410(+) A-I      intronic
chr6:149702850(+) A-I      intronic
chr6:149670436(+) A-I      intronic
chr6:149704746(+) A-I      intronic
chr6:149656699(+) A-I      5'UTR
chr6:149656732(+) A-I      5'UTR
chr6:149660388(+) A-I      intronic
chr6:149660338(+) A-I      intronic
chr6:149660935(+) A-I      intronic
chr6:149704860(+) A-I      intronic
chr6:149660368(+) A-I      intronic
chr6:149655560(+) A-I      intronic
chr6:149676758(+) A-I      intronic
chr6:149655707(+) A-I      intronic
chr6:149676638(+) A-I      intronic
chr6:149671257(+) A-I      intronic
chr6:149702144(+) A-I      intronic
chr6:149710266(+) A-I      intronic
chr6:149656572(+) A-I      intronic
chr6:149667872(+) A-I      intronic
chr6:149701282(+) A-I      intronic
chr6:149710351(+) A-I      intronic
chr6:149671289(+) A-I      intronic
chr6:149660337(+) A-I      intronic
chr6:149710191(+) A-I      intronic
chr6:149702146(+) A-I      intronic
chr6:149702983(+) A-I      intronic
chr6:149704822(+) A-I      intronic
chr6:149702168(+) A-I      intronic
chr6:149704248(+) A-I      intronic
chr6:149656567(+) A-I      intronic
chr6:149704788(+) A-I      intronic
chr6:149702961(+) A-I      intronic
chr6:149718457(+) A-I      intronic
chr6:149669422(+) A-I      intronic
chr6:149656534(+) A-I      intronic
chr6:149704740(+) A-I      intronic
chr6:149679020(+) A-I      intronic
chr6:149655766(+) A-I      intronic
chr6:149655793(+) A-I      intronic
chr6:149704981(+) A-I      intronic
chr6:149660341(+) A-I      intronic
chr6:149710312(+) A-I      intronic
chr6:149656724(+) A-I      5'UTR
chr6:149670004(+) A-I      intronic
chr6:149671268(+) A-I      intronic
chr6:149704971(+) A-I      intronic
chr6:149710275(+) A-I      intronic
chr6:149660299(+) A-I      intronic
chr6:149704140(+) A-I      intronic
chr6:149669922(+) A-I      intronic
chr6:149660890(+) A-I      intronic
chr6:149671207(+) A-I      intronic
chr6:149703478(+) A-I      intronic
chr6:149671344(+) A-I      intronic
chr6:149669327(+) A-I      intronic
chr6:149704144(+) A-I      intronic
chr6:149703460(+) A-I      intronic
chr6:149678969(+) A-I      intronic
chr6:149717337(+) A-I      intronic
chr6:149670099(+) A-I      intronic
chr6:149669398(+) A-I      intronic
chr6:149678929(+) A-I      intronic
chr6:149671288(+) A-I      intronic
chr6:149710557(+) A-I      intronic
chr6:149678936(+) A-I      intronic
chr6:149704780(+) A-I      intronic
chr6:149669319(+) A-I      intronic
chr6:149678859(+) A-I      intronic
chr6:149676641(+) A-I      intronic
chr6:149703612(+) A-I      intronic
chr6:149655692(+) A-I      intronic
chr6:149702754(+) A-I      intronic
chr6:149710797(+) A-I      intronic
chr6:149676540(+) A-I      intronic
chr6:149660835(+) A-I      intronic
chr6:149660852(+) A-I      intronic
chr6:149671330(+) A-I      intronic
chr6:149670409(+) A-I      intronic
chr6:149678304(+) A-I      intronic
chr6:149678390(+) A-I      intronic
chr6:149671315(+) A-I      intronic
chr6:149676651(+) A-I      intronic
chr6:149704139(+) A-I      intronic
chr6:149671351(+) A-I      intronic
chr6:149704858(+) A-I      intronic
chr6:149704135(+) A-I      intronic
chr6:149670369(+) A-I      intronic
chr6:149660290(+) A-I      intronic
chr6:149660861(+) A-I      intronic
chr6:149655619(+) A-I      intronic
chr6:149660339(+) A-I      intronic
chr6:149660460(+) A-I      intronic
chr6:149710185(+) A-I      intronic
chr6:149710195(+) A-I      intronic
chr6:149718527(+) A-I      intronic
chr6:149660298(+) A-I      intronic
chr6:149702848(+) A-I      intronic
chr6:149704236(+) A-I      intronic
chr6:149718588(+) A-I      intronic
chr6:149671265(+) A-I      intronic
chr6:149704777(+) A-I      intronic
chr6:149660847(+) A-I      intronic
chr6:149670498(+) A-I      intronic
chr6:149669265(+) A-I      intronic
chr6:149660874(+) A-I      intronic
chr6:149679037(+) A-I      intronic
chr6:149704141(+) A-I      intronic
chr6:149660334(+) A-I      intronic
chr6:149710328(+) A-I      intronic
chr6:149671320(+) A-I      intronic
chr6:149669875(+) A-I      intronic
chr6:149678445(+) A-I      intronic
chr6:149671828(+) A-I      intronic
chr6:149669296(+) A-I      intronic
chr6:149664522(+) A-I      intronic
chr6:149702836(+) A-I      intronic
chr6:149660446(+) A-I      intronic
chr6:149655644(+) A-I      intronic
chr6:149671868(+) A-I      intronic
chr6:149701347(+) A-I      intronic
chr6:149704086(+) A-I      intronic
chr6:149660230(+) A-I      intronic
chr6:149678502(+) A-I      intronic
chr6:149669844(+) A-I      intronic
chr6:149660945(+) A-I      intronic
chr6:149660790(+) A-I      intronic
chr6:149667646(+) A-I      ncRNA
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED TAB2
chr6:149641271(+) A-G intron -    22484847
chr6:149646991(+) T-C intron -    22484847
chr6:149655619(+) A-G intron -    22484847
chr6:149655766(+) A-G intron -    22484847
chr6:149656534(+) A-G intron -    22484847
chr6:149656724(+) A-G exon 5'UTR    22484847
chr6:149656730(+) A-G exon 5'UTR    22484847
chr6:149660230(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660242(+) C-A intron -    22484847
chr6:149660290(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660298(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660299(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660305(+) T-G intron -    22484847
chr6:149660334(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660337(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660338(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660339(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660340(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660341(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660368(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660388(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660790(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660835(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660847(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660852(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660861(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660874(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660876(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660890(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660918(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660935(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660945(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660955(+) A-G intron -    22484847
chr6:149660986(+) G-A intron -    22484847
chr6:149664522(+) A-G intron -    22484847
chr6:149669282(+) A-G intron -    22484847
chr6:149669302(+) G-A intron -    22484847
chr6:149669319(+) A-G intron -    22484847
chr6:149669327(+) A-G intron -    22484847
chr6:149669398(+) A-G intron -    22484847
chr6:149669422(+) A-G intron -    22484847
chr6:149669467(+) A-G intron -    22484847
chr6:149669922(+) A-G intron -    22484847
chr6:149670004(+) A-G intron -    22484847
chr6:149670307(+) A-G intron -    22484847
chr6:149670417(+) A-G intron -    22484847
chr6:149670427(+) G-A intron -    22484847
chr6:149670498(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671132(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671137(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671167(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671168(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671185(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671207(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671233(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671257(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671265(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671268(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671288(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671289(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671315(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671320(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671330(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671336(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671344(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671351(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671820(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671828(+) A-G intron -    22484847
chr6:149671868(+) A-G intron -    22484847
chr6:149678304(+) A-G intron -    22484847
chr6:149678381(+) A-G intron -    22484847
chr6:149678390(+) A-G intron -    22484847
chr6:149678445(+) A-G intron -    22484847
chr6:149678477(+) A-G intron -    22484847
chr6:149678502(+) A-G intron -    22484847
chr6:149678515(+) A-G intron -    22484847
chr6:149678859(+) A-G intron -    22484847
chr6:149678929(+) A-G intron -    22484847
chr6:149678936(+) A-G intron -    22484847
chr6:149678969(+) A-G intron -    22484847
chr6:149679017(+) A-G intron -    22484847
chr6:149679020(+) A-G intron -    22484847
chr6:149679037(+) A-G intron -    22484847
chr6:149701142(+) A-G intron -    22484847
chr6:149701269(+) A-G intron -    22484847
chr6:149702144(+) A-G intron -    22484847
chr6:149702146(+) A-G intron -    22484847
chr6:149702822(+) A-G intron -    22484847
chr6:149702961(+) A-G intron -    22484847
chr6:149703478(+) A-G intron -    22484847
chr6:149703612(+) A-G intron -    22484847
chr6:149703687(+) A-G intron -    22484847
chr6:149704086(+) A-G intron -    22484847
chr6:149704248(+) A-G intron -    22484847
chr6:149704314(+) G-A intron -    22484847
chr6:149704740(+) A-G intron -    22484847
chr6:149704777(+) A-G intron -    22484847
chr6:149704780(+) A-G intron -    22484847
chr6:149704788(+) A-G intron -    22484847
chr6:149704822(+) A-G intron -    22484847
chr6:149704836(+) A-G intron -    22484847
chr6:149704858(+) A-G intron -    22484847
chr6:149704860(+) A-G intron -    22484847
chr6:149706529(+) A-G intron -    22484847
chr6:149710185(+) A-G intron -    22484847
chr6:149710191(+) A-G intron -    22484847
chr6:149710192(+) A-G intron -    22484847
chr6:149710195(+) A-G intron -    22484847
chr6:149710196(+) A-G intron -    22484847
chr6:149710221(+) A-G intron -    22484847
chr6:149710258(+) A-G intron -    22484847
chr6:149710266(+) A-G intron -    22484847
chr6:149710275(+) A-G intron -    22484847
chr6:149710312(+) A-G intron -    22484847
chr6:149710328(+) A-G intron -    22484847
chr6:149710351(+) A-G intron -    22484847
chr6:149710527(+) A-G intron -    22484847
chr6:149710557(+) A-G intron -    22484847
chr6:149717227(+) T-C intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase TAB2
chr6:149565037-149565038(+) m6A intron       -
chr6:149565120-149565121(+) m6A intron       -
chr6:149565146-149565147(+) m6A intron       -
chr6:149565203-149565204(+) m6A intron       -
chr6:149668328-149668329(+) m6A exon//intron       24981863
chr6:149691055-149691056(+) m6A 5'UTR//intron       24209618
chr6:149693528-149693529(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618
chr6:149699226-149699227(+) m6A 5'UTR//CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149699292-149699293(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149699307-149699308(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149699354-149699355(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149699380-149699381(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149699410-149699411(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149699432-149699433(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149699540-149699541(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149699561-149699562(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149699609-149699610(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149699735-149699736(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085
chr6:149699778-149699779(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085
chr6:149699819-149699820(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085
chr6:149699888-149699889(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085
chr6:149700010-149700011(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr6:149700021-149700022(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr6:149700037-149700038(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr6:149700043-149700044(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr6:149700070-149700071(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr6:149700085-149700086(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr6:149700092-149700093(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr6:149700125-149700126(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr6:149700132-149700133(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr6:149700244-149700245(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//22575960//22608085
chr6:149700285-149700286(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//22575960//22608085
chr6:149700312-149700313(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//22575960//22608085
chr6:149700508-149700509(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085
chr6:149700548-149700549(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149700573-149700574(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149700608-149700609(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr6:149700616-149700617(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr6:149701273-149701274(+) m6A 3'UTR//intron       24981863
chr6:149718785-149718786(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863
chr6:149718936-149718937(+) m6A exon//intron       24981863
chr6:149720312-149720313(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//27773535//22608085
chr6:149721598-149721599(+) m6A intron       -
chr6:149721638-149721639(+) m6A intron       24209618
chr6:149721652-149721653(+) m6A intron       24209618
chr6:149721673-149721674(+) m6A intron       24209618
chr6:149722162-149722163(+) Y intron       25219674
chr6:149730732-149730733(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085
chr6:149730741-149730742(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149730748-149730749(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149730802-149730803(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149730827-149730828(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149730882-149730883(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149730903-149730904(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149731075-149731076(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr6:149731252-149731253(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22608085
chr6:149731276-149731277(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22608085
chr6:149731297-149731298(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22608085
chr6:149731335-149731336(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22575960//22608085
chr6:149731759-149731760(+) m6A 3'UTR       22608085
chr6:149731885-149731886(+) m6A 3'UTR       22608085
chr6:149731914-149731915(+) m6A 3'UTR       22608085
chr6:149731953-149731954(+) m6A 3'UTR       22608085
chr6:149731994-149731995(+) m6A 3'UTR       22608085
chr6:149732111-149732112(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//27773535//22608085
chr6:149732132-149732133(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//27773535//22608085
chr6:149732159-149732160(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//27773535//22608085
chr6:149732167-149732168(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//27773535//22608085
chr6:149732173-149732174(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//27773535//22608085
chr6:149732275-149732276(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//27773535//22608085
chr6:149732294-149732295(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//27773535//22608085
chr6:149732376-149732377(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//27773535//22608085

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate TAB2
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -
Ribosome-free cytosol Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hcmv-miR-US25-1-5p
Interactor2: TAB2

Evidence Support:


Strong-Evidence RISC-IP
Support Database ViRBase

References:


PMID 20585629 Target region 5'UTR
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line HEK293 cells Interactor2 expression None
Description Here, we identify cellular transcript targets of one of the most highly expressed HCMV encoded miRNAs, miR-US25-1, using a recently developed biochemical approach called RISC immunoprecipitation. Strikingly, the majority of identified transcripts contained miR-US25-1 target sites within the 5'UTR rather than the 3'UTR.

Starting a new search, please wait ...