Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00509090

  Virus:  

Human herpesvirus 5 strain AD169

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.7311

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US25-1-5p:  MIMAT0001581          RUFY3:  NM_001345840     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-US25-1-5p	RUFY3
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0001581	22902
Organism	Human herpesvirus 5 strain AD169	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	RIPX//SINGAR1//ZFYVE30

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	RUFY3	chr4:71653174(+) A-I      intronic chr4:71653044(+) A-I      intronic chr4:71652996(+) A-I      intronic chr4:71651532(+) A-I      intronic chr4:71651528(+) A-I      intronic chr4:71651502(+) A-I      intronic chr4:71648531(+) A-I      intronic chr4:71648509(+) A-I      intronic chr4:71648501(+) A-I      intronic chr4:71648472(+) A-I      intronic chr4:71648471(+) A-I      intronic chr4:71648468(+) A-I      intronic chr4:71648465(+) A-I      intronic chr4:71648380(+) A-I      intronic chr4:71648375(+) A-I      intronic chr4:71648372(+) A-I      intronic chr4:71648276(+) A-I      intronic chr4:71648274(+) A-I      intronic chr4:71648185(+) A-I      intronic chr4:71646992(+) A-I      intronic chr4:71646991(+) A-I      intronic chr4:71646972(+) A-I      intronic chr4:71646928(+) A-I      intronic chr4:71646093(+) A-I      intronic chr4:71634949(+) A-I      intronic chr4:71631660(+) A-I      intronic chr4:71631641(+) A-I      intronic chr4:71631621(+) A-I      intronic chr4:71631560(+) A-I      intronic chr4:71630653(+) A-I      intronic chr4:71630631(+) A-I      intronic chr4:71621561(+) A-I      intronic chr4:71621547(+) A-I      intronic chr4:71621534(+) A-I      intronic chr4:71621466(+) A-I      intronic chr4:71621465(+) A-I      intronic chr4:71621457(+) A-I      intronic chr4:71612211(+) A-I      intronic chr4:71612174(+) A-I      intronic chr4:71611923(+) A-I      intronic chr4:71611885(+) A-I      intronic chr4:71611884(+) A-I      intronic chr4:71610179(+) A-I      intronic chr4:71610154(+) A-I      intronic chr4:71610153(+) A-I      intronic chr4:71610152(+) A-I      intronic chr4:71603813(+) A-I      intronic chr4:71603611(+) A-I      intronic chr4:71603586(+) A-I      intronic chr4:71603565(+) A-I      intronic chr4:71601716(+) A-I      intronic chr4:71601662(+) A-I      intronic chr4:71601660(+) A-I      intronic chr4:71601630(+) A-I      intronic chr4:71601601(+) A-I      intronic chr4:71601598(+) A-I      intronic chr4:71601590(+) A-I      intronic chr4:71601585(+) A-I      intronic chr4:71601584(+) A-I      intronic chr4:71601566(+) A-I      intronic chr4:71601484(+) A-I      intronic chr4:71601430(+) A-I      intronic chr4:71601329(+) A-I      intronic chr4:71597520(+) A-I      intronic chr4:71596390(+) A-I      intronic chr4:71596342(+) A-I      intronic chr4:71596254(+) A-I      intronic chr4:71596246(+) A-I      intronic chr4:71595801(+) A-I      intronic chr4:71595751(+) A-I      intronic chr4:71595716(+) A-I      intronic chr4:71595210(+) A-I      intronic chr4:71595131(+) A-I      intronic chr4:71595115(+) A-I      intronic chr4:71595113(+) A-I      intronic chr4:71595103(+) A-I      intronic chr4:71664424(+) A-I      intronic chr4:71594999(+) A-I      intronic chr4:71593410(+) A-I      intronic chr4:71593393(+) A-I      intronic chr4:71593384(+) A-I      intronic chr4:71664448(+) A-I      intronic chr4:71664756(+) A-I      intronic chr4:71664783(+) A-I      intronic chr4:71664787(+) A-I      intronic chr4:71664807(+) A-I      intronic chr4:71669265(+) A-I      intronic chr4:71669274(+) A-I      intronic chr4:71670437(+) A-I      intronic chr4:71670447(+) A-I      intronic chr4:71593202(+) A-I      intronic chr4:71593142(+) A-I      intronic chr4:71595043(+) A-I      intronic chr4:71586909(+) A-I      intronic chr4:71586908(+) A-I      intronic chr4:71586882(+) A-I      intronic chr4:71586879(+) A-I      intronic chr4:71586878(+) A-I      intronic chr4:71586873(+) A-I      intronic chr4:71586853(+) A-I      intronic chr4:71586842(+) A-I      intronic chr4:71586833(+) A-I      intronic chr4:71586827(+) A-I      intronic chr4:71586822(+) A-I      intronic chr4:71586792(+) A-I      intronic chr4:71586784(+) A-I      intronic chr4:71586091(+) A-I      intronic chr4:71585986(+) A-I      intronic chr4:71585908(+) A-I      intronic chr4:71585902(+) A-I      intronic chr4:71584535(+) A-I      intronic chr4:71584504(+) A-I      intronic chr4:71583843(+) A-I      intronic chr4:71583839(+) A-I      intronic chr4:71583822(+) A-I      intronic chr4:71583807(+) A-I      intronic chr4:71583799(+) A-I      intronic chr4:71583785(+) A-I      intronic chr4:71583704(+) A-I      intronic chr4:71583680(+) A-I      intronic chr4:71583862(+) A-I      intronic chr4:71585886(+) A-I      intronic chr4:71585894(+) A-I      intronic chr4:71585895(+) A-I      intronic chr4:71586914(+) A-I      intronic chr4:71586963(+) A-I      intronic chr4:71595779(+) A-I      intronic chr4:71595781(+) A-I      intronic chr4:71595793(+) A-I      intronic chr4:71605593(+) A-I      intronic chr4:71583631(+) A-I      intronic chr4:71582514(+) A-I      intronic chr4:71582482(+) A-I      intronic chr4:71582430(+) A-I      intronic chr4:71582405(+) A-I      intronic chr4:71582402(+) A-I      intronic chr4:71582390(+) A-I      intronic chr4:71582362(+) A-I      intronic chr4:71582351(+) A-I      intronic chr4:71582336(+) A-I      intronic chr4:71582297(+) A-I      intronic chr4:71582139(+) A-I      intronic chr4:71582124(+) A-I      intronic chr4:71582029(+) A-I      intronic chr4:71581924(+) A-I      intronic chr4:71581815(+) A-I      intronic chr4:71581720(+) A-I      intronic chr4:71581668(+) A-I      intronic chr4:71581628(+) A-I      intronic chr4:71581606(+) A-I      intronic chr4:71581575(+) A-I      intronic chr4:71581141(+) A-I      intronic chr4:71581054(+) A-I      intronic chr4:71578974(+) A-I      intronic chr4:71578923(+) A-I      intronic chr4:71605629(+) A-I      intronic chr4:71605636(+) A-I      intronic chr4:71605658(+) A-I      intronic chr4:71653154(+) A-I      intronic chr4:71578925(+) A-I      intronic chr4:71653183(+) A-I      intronic chr4:71653817(+) A-I      intronic chr4:71653848(+) A-I      intronic chr4:71578898(+) A-I      intronic chr4:71578886(+) A-I      intronic chr4:71578840(+) A-I      intronic chr4:71578805(+) A-I      intronic chr4:71578771(+) A-I      intronic chr4:71578759(+) A-I      intronic chr4:71576956(+) A-I      intronic chr4:71576885(+) A-I      intronic chr4:71576783(+) A-I      intronic chr4:71576694(+) A-I      intronic chr4:71576671(+) A-I      intronic chr4:71576667(+) A-I      intronic chr4:71576662(+) A-I      intronic chr4:71576332(+) A-I      intronic chr4:71576198(+) A-I      intronic chr4:71576173(+) A-I      intronic chr4:71574692(+) A-I      intronic chr4:71574668(+) A-I      intronic chr4:71574664(+) A-I      intronic chr4:71574542(+) A-I      intronic chr4:71574499(+) A-I      intronic chr4:71574152(+) A-I      intronic chr4:71574107(+) A-I      intronic chr4:71574075(+) A-I      intronic chr4:71574072(+) A-I      intronic chr4:71574028(+) A-I      intronic chr4:71574018(+) A-I      intronic chr4:71574015(+) A-I      intronic chr4:71573989(+) A-I      intronic chr4:71573982(+) A-I      intronic chr4:71573963(+) A-I      intronic chr4:71573953(+) A-I      intronic chr4:71573944(+) A-I      intronic chr4:71573939(+) A-I      intronic chr4:71573937(+) A-I      intronic chr4:71573921(+) A-I      intronic chr4:71573915(+) A-I      intronic chr4:71573215(+) A-I      intronic chr4:71573210(+) A-I      intronic chr4:71573198(+) A-I      intronic chr4:71573153(+) A-I      intronic chr4:71573076(+) A-I      intronic chr4:71573056(+) A-I      intronic chr4:71573050(+) A-I      intronic chr4:71653851(+) A-I      intronic chr4:71586993(+) A-I      intronic chr4:71662713(+) A-I      intronic chr4:71670591(+) A-I      intronic chr4:71670498(+) A-I      intronic chr4:71670457(+) A-I      intronic chr4:71670449(+) A-I      intronic chr4:71670431(+) A-I      intronic chr4:71662719(+) A-I      intronic chr4:71662762(+) A-I      intronic chr4:71662807(+) A-I      intronic chr4:71662810(+) A-I      intronic chr4:71662813(+) A-I      intronic chr4:71662815(+) A-I      intronic chr4:71662936(+) A-I      intronic chr4:71663413(+) A-I      intronic chr4:71663488(+) A-I      intronic chr4:71670396(+) A-I      intronic chr4:71663927(+) A-I      intronic chr4:71663906(+) A-I      intronic chr4:71663899(+) A-I      intronic chr4:71663878(+) A-I      intronic chr4:71663516(+) A-I      intronic chr4:71663466(+) A-I      intronic chr4:71663456(+) A-I      intronic chr4:71663376(+) A-I      intronic chr4:71663364(+) A-I      intronic chr4:71663359(+) A-I      intronic chr4:71663353(+) A-I      intronic chr4:71663312(+) A-I      intronic chr4:71663284(+) A-I      intronic chr4:71662921(+) A-I      intronic chr4:71662895(+) A-I      intronic chr4:71662894(+) A-I      intronic chr4:71662881(+) A-I      intronic chr4:71662845(+) A-I      intronic chr4:71662805(+) A-I      intronic chr4:71662708(+) A-I      intronic chr4:71662691(+) A-I      intronic chr4:71662685(+) A-I      intronic chr4:71662680(+) A-I      intronic chr4:71661831(+) A-I      intronic chr4:71664020(+) A-I      intronic chr4:71664027(+) A-I      intronic chr4:71664038(+) A-I      intronic chr4:71664372(+) A-I      intronic chr4:71664376(+) A-I      intronic chr4:71664378(+) A-I      intronic chr4:71664379(+) A-I      intronic chr4:71664388(+) A-I      intronic chr4:71664406(+) A-I      intronic chr4:71661828(+) A-I      intronic chr4:71661822(+) A-I      intronic chr4:71661818(+) A-I      intronic chr4:71660237(+) A-I      intronic chr4:71660187(+) A-I      intronic chr4:71660183(+) A-I      intronic chr4:71660178(+) A-I      intronic chr4:71660127(+) A-I      intronic chr4:71660122(+) A-I      intronic chr4:71660064(+) A-I      intronic chr4:71653881(+) A-I      intronic chr4:71653859(+) A-I      intronic chr4:71653855(+) A-I      intronic chr4:71653757(+) A-I      intronic chr4:71653749(+) A-I      intronic chr4:71653157(+) A-I      intronic chr4:71653136(+) A-I      intronic chr4:71673486(+) A-I      3'UTR chr4:71673456(+) A-I      3'UTR chr4:71673339(+) A-I      3'UTR chr4:71673256(+) A-I      3'UTR chr4:71673312(+) A-I      3'UTR chr4:71673338(+) A-I      3'UTR chr4:71673343(+) A-I      3'UTR chr4:71673261(+) A-I      3'UTR chr4:71673293(+) A-I      3'UTR chr4:71673301(+) A-I      3'UTR chr4:71673375(+) A-I      3'UTR chr4:71673364(+) A-I      3'UTR chr4:71673305(+) A-I      3'UTR chr4:71673493(+) A-I      3'UTR chr4:71673465(+) A-I      3'UTR chr4:71663358(+) A-I      intronic chr4:71578821(+) A-I      intronic chr4:71646947(+) A-I      intronic chr4:71581091(+) A-I      intronic chr4:71653240(+) A-I      intronic chr4:71663328(+) A-I      intronic chr4:71654008(+) A-I      intronic chr4:71662928(+) A-I      intronic chr4:71586918(+) A-I      intronic chr4:71663350(+) A-I      intronic chr4:71574006(+) A-I      intronic chr4:71663266(+) A-I      intronic chr4:71578870(+) A-I      intronic chr4:71581125(+) A-I      intronic chr4:71574716(+) A-I      intronic chr4:71669403(+) A-I      intronic chr4:71581679(+) A-I      intronic chr4:71652637(+) A-I      intronic chr4:71615466(+) A-I      intronic chr4:71602518(+) A-I      intronic chr4:71595826(+) A-I      intronic chr4:71646271(+) A-I      intronic chr4:71643797(+) A-I      intronic chr4:71583861(+) A-I      intronic chr4:71581962(+) A-I      intronic chr4:71581559(+) A-I      intronic chr4:71576950(+) A-I      intronic chr4:71582115(+) A-I      intronic chr4:71574600(+) A-I      intronic chr4:71663963(+) A-I      intronic chr4:71574507(+) A-I      intronic chr4:71576866(+) A-I      intronic chr4:71596325(+) A-I      intronic chr4:71669250(+) A-I      intronic chr4:71662843(+) A-I      intronic chr4:71611617(+) A-I      intronic chr4:71624644(+) A-I      intronic chr4:71592149(+) A-I      intronic chr4:71670385(+) A-I      intronic chr4:71601796(+) A-I      intronic chr4:71596178(+) A-I      intronic chr4:71661837(+) A-I      intronic chr4:71605660(+) A-I      intronic chr4:71664352(+) A-I      intronic chr4:71595670(+) A-I      intronic chr4:71662725(+) A-I      intronic chr4:71664613(+) A-I      intronic chr4:71586775(+) A-I      intronic chr4:71663829(+) A-I      intronic chr4:71662775(+) A-I      intronic chr4:71669240(+) A-I      intronic chr4:71648287(+) A-I      intronic chr4:71623236(+) A-I      intronic chr4:71662860(+) A-I      intronic chr4:71582037(+) A-I      intronic chr4:71634810(+) A-I      intronic chr4:71601518(+) A-I      intronic chr4:71581115(+) A-I      intronic chr4:71670570(+) A-I      intronic chr4:71663505(+) A-I      intronic chr4:71581619(+) A-I      intronic chr4:71664812(+) A-I      intronic chr4:71662737(+) A-I      intronic chr4:71586931(+) A-I      intronic chr4:71670548(+) A-I      intronic chr4:71651291(+) A-I      intronic chr4:71584612(+) A-I      intronic chr4:71602345(+) A-I      intronic chr4:71582106(+) A-I      intronic chr4:71596450(+) A-I      intronic chr4:71586776(+) A-I      intronic chr4:71664691(+) A-I      intronic chr4:71641621(+) A-I      intronic chr4:71583876(+) A-I      intronic chr4:71664011(+) A-I      intronic chr4:71601528(+) A-I      intronic chr4:71662722(+) A-I      intronic chr4:71651268(+) A-I      intronic chr4:71582002(+) A-I      intronic chr4:71573797(+) A-I      intronic chr4:71601594(+) A-I      intronic chr4:71582408(+) A-I      intronic chr4:71582028(+) A-I      intronic chr4:71669459(+) A-I      intronic chr4:71663882(+) A-I      intronic chr4:71581671(+) A-I      intronic chr4:71586999(+) A-I      intronic chr4:71573077(+) A-I      intronic chr4:71576299(+) A-I      intronic chr4:71582360(+) A-I      intronic chr4:71663445(+) A-I      intronic chr4:71603664(+) A-I      intronic chr4:71573093(+) A-I      intronic chr4:71663440(+) A-I      intronic chr4:71583729(+) A-I      intronic chr4:71669349(+) A-I      intronic chr4:71574660(+) A-I      intronic chr4:71673368(+) A-I      3'UTR chr4:71673406(+) A-I      3'UTR chr4:71673296(+) A-I      3'UTR chr4:71673351(+) A-I      3'UTR chr4:71673307(+) A-I      3'UTR chr4:71673491(+) A-I      3'UTR chr4:71673302(+) A-I      3'UTR chr4:71586937(+) A-I      intronic chr4:71581963(+) A-I      intronic chr4:71663881(+) A-I      intronic chr4:71601756(+) A-I      intronic chr4:71593357(+) A-I      intronic chr4:71662934(+) A-I      intronic chr4:71624634(+) A-I      intronic chr4:71576936(+) A-I      intronic chr4:71605587(+) A-I      intronic chr4:71581670(+) A-I      intronic chr4:71581980(+) A-I      intronic chr4:71663903(+) A-I      intronic chr4:71662799(+) A-I      intronic chr4:71635644(+) A-I      intronic chr4:71601325(+) A-I      intronic chr4:71596194(+) A-I      intronic chr4:71582410(+) A-I      intronic chr4:71647076(+) A-I      intronic chr4:71664752(+) A-I      intronic chr4:71584564(+) A-I      intronic chr4:71604264(+) A-I      intronic chr4:71603491(+) A-I      intronic chr4:71646766(+) A-I      intronic chr4:71586991(+) A-I      intronic chr4:71605633(+) A-I      intronic chr4:71581144(+) A-I      intronic chr4:71581143(+) A-I      intronic chr4:71647019(+) A-I      intronic chr4:71601805(+) A-I      intronic chr4:71663510(+) A-I      intronic chr4:71634962(+) A-I      intronic chr4:71579001(+) A-I      intronic chr4:71573001(+) A-I      intronic chr4:71601527(+) A-I      intronic chr4:71578993(+) A-I      intronic chr4:71573037(+) A-I      intronic chr4:71638478(+) A-I      intronic chr4:71581658(+) A-I      intronic chr4:71612103(+) A-I      intronic chr4:71660223(+) A-I      intronic chr4:71663409(+) A-I      intronic chr4:71581967(+) A-I      intronic chr4:71663329(+) A-I      intronic chr4:71584616(+) A-I      intronic chr4:71584712(+) A-I      intronic chr4:71635643(+) A-I      intronic chr4:71581664(+) A-I      intronic chr4:71576524(+) A-I      intronic chr4:71573755(+) A-I      intronic chr4:71597451(+) A-I      intronic chr4:71664846(+) A-I      intronic chr4:71633735(+) A-I      intronic chr4:71664266(+) A-I      intronic chr4:71663300(+) A-I      intronic chr4:71582414(+) A-I      intronic chr4:71652806(+) A-I      intronic chr4:71661762(+) A-I      intronic chr4:71581992(+) A-I      intronic chr4:71583874(+) A-I      intronic chr4:71624741(+) A-I      intronic chr4:71669195(+) A-I      intronic chr4:71595832(+) A-I      intronic chr4:71597308(+) A-I      intronic chr4:71582319(+) A-I      intronic chr4:71663374(+) A-I      intronic chr4:71576910(+) A-I      intronic chr4:71663875(+) A-I      intronic chr4:71576132(+) A-I      intronic chr4:71573143(+) A-I      intronic chr4:71608969(+) A-I      intronic chr4:71582457(+) A-I      intronic chr4:71651439(+) A-I      intronic chr4:71583739(+) A-I      intronic chr4:71635563(+) A-I      intronic chr4:71669304(+) A-I      intronic chr4:71584572(+) A-I      intronic chr4:71662732(+) A-I      intronic chr4:71605585(+) A-I      intronic chr4:71573712(+) A-I      intronic chr4:71593203(+) A-I      intronic chr4:71646244(+) A-I      intronic chr4:71601387(+) A-I      intronic chr4:71663992(+) A-I      intronic chr4:71612145(+) A-I      intronic chr4:71594997(+) A-I      intronic chr4:71663395(+) A-I      intronic chr4:71581051(+) A-I      intronic chr4:71663835(+) A-I      intronic chr4:71610186(+) A-I      intronic chr4:71595243(+) A-I      intronic chr4:71581669(+) A-I      intronic chr4:71582048(+) A-I      intronic chr4:71582092(+) A-I      intronic chr4:71611574(+) A-I      intronic chr4:71596472(+) A-I      intronic chr4:71578873(+) A-I      intronic chr4:71573950(+) A-I      intronic chr4:71601382(+) A-I      intronic chr4:71663384(+) A-I      intronic chr4:71653196(+) A-I      intronic chr4:71611545(+) A-I      intronic chr4:71663934(+) A-I      intronic chr4:71576679(+) A-I      intronic chr4:71662711(+) A-I      intronic chr4:71662721(+) A-I      intronic chr4:71663979(+) A-I      intronic chr4:71663923(+) A-I      intronic chr4:71573743(+) A-I      intronic chr4:71584599(+) A-I      intronic chr4:71586940(+) A-I      intronic chr4:71663429(+) A-I      intronic chr4:71635639(+) A-I      intronic chr4:71586935(+) A-I      intronic chr4:71598641(+) A-I      intronic chr4:71662823(+) A-I      intronic chr4:71578975(+) A-I      intronic chr4:71663439(+) A-I      intronic chr4:71574727(+) A-I      intronic chr4:71664041(+) A-I      intronic chr4:71573765(+) A-I      intronic chr4:71646116(+) A-I      intronic chr4:71630727(+) A-I      intronic chr4:71582097(+) A-I      intronic chr4:71594993(+) A-I      intronic chr4:71573105(+) A-I      intronic chr4:71630732(+) A-I      intronic chr4:71634963(+) A-I      intronic chr4:71652723(+) A-I      intronic chr4:71621588(+) A-I      intronic chr4:71601804(+) A-I      intronic chr4:71576648(+) A-I      intronic chr4:71601551(+) A-I      intronic chr4:71586819(+) A-I      intronic chr4:71635561(+) A-I      intronic chr4:71670551(+) A-I      intronic chr4:71610846(+) A-I      intronic chr4:71664265(+) A-I      intronic chr4:71582441(+) A-I      intronic chr4:71586998(+) A-I      intronic chr4:71581180(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	RUFY3	chr4:71663300(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr4:71663306(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr4:71663307(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr4:71663351(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr4:71663374(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr4:71663384(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr4:71663429(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr4:71663440(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr4:71663481(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr4:71663505(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr4:71663510(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr4:71663544(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr4:71664846(+) A-I intron -    15258596 chr4:71574661(+) A-I intron -    22327324 chr4:71662722(+) A-I intron -    22327324 chr4:71663822(+) A-I intron -    21960545   //22327324 chr4:71663903(+) A-I intron -    21960545   //22327324 chr4:71662843(+) A-I intron -    21960545 chr4:71662860(+) A-I intron -    21960545 chr4:71663920(+) A-I intron -    21960545 chr4:71664041(+) A-I intron -    21960545 chr4:71673406(+) A-I intron -    21960545 chr4:71663936(+) A-I intron -    21960545

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	RUFY3	chr4:71570662-71570663(+) m6A CDS//intron       24209618 chr4:71570768-71570769(+) m6A CDS//intron       24209618 chr4:71628322-71628323(+) m6A CDS       - chr4:71628333-71628334(+) m6A CDS       - chr4:71628395-71628396(+) m6A CDS       - chr4:71629276-71629277(+) m6A CDS       - chr4:71629287-71629288(+) m6A CDS       - chr4:71629317-71629318(+) m6A CDS       - chr4:71634364-71634365(+) m6A CDS       27773535 chr4:71634370-71634371(+) m6A CDS       27773535 chr4:71639267-71639268(+) m6A CDS       27773535 chr4:71640910-71640911(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr4:71640919-71640920(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr4:71640932-71640933(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr4:71640937-71640938(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr4:71644096-71644097(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr4:71644142-71644143(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr4:71648820-71648821(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr4:71650525-71650526(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr4:71650530-71650531(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr4:71650581-71650582(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr4:71654536-71654537(+) m6A CDS       24981863 chr4:71655294-71655295(+) m6A CDS       22608085 chr4:71655303-71655304(+) m6A CDS       22608085 chr4:71655334-71655335(+) m6A 3'UTR//intron       22608085 chr4:71655424-71655425(+) m6A 3'UTR//intron       22608085 chr4:71659542-71659543(+) m6A CDS//intron       - chr4:71659558-71659559(+) m6A CDS//intron       - chr4:71659563-71659564(+) m6A CDS//intron       - chr4:71659572-71659573(+) m6A CDS//intron       24981863 chr4:71660431-71660432(+) m6A exon//intron       - chr4:71665400-71665401(+) m6A exon//intron       22608085 chr4:71672245-71672246(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       22608085 chr4:71672256-71672257(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//22608085 chr4:71672285-71672286(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//22608085 chr4:71672377-71672378(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085 chr4:71672390-71672391(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085 chr4:71672396-71672397(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	RUFY3	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-US25-1-5p
Interactor2: RUFY3

Evidence Support:

Strong-Evidence	RISC-IP
Support Database	ViRBase

References:

PMID	20585629	Target region	5'UTR
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	HEK293 cells	Interactor2 expression	None
Description	Here, we identify cellular transcript targets of one of the most highly expressed HCMV encoded miRNAs, miR-US25-1, using a recently developed biochemical approach called RISC immunoprecipitation. Strikingly, the majority of identified transcripts contained miR-US25-1 target sites within the 5'UTR rather than the 3'UTR.