Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00508977

  Virus:  

Human herpesvirus 5 strain AD169

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.7311

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US25-1-5p:  MIMAT0001581          VPS45:  NR_103998     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-US25-1-5p	VPS45
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0001581	11311
Organism	Human herpesvirus 5 strain AD169	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	H1//H1VPS45//SCN5//VPS45A//VPS45B//VPS54A//VSP45//VSP45A

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	VPS45	chr1:150081295(+) A-I      ncRNA chr1:150076870(+) A-I      intronic chr1:150073925(+) A-I      intronic chr1:150073935(+) A-I      intronic chr1:150074769(+) A-I      intronic chr1:150073890(+) A-I      intronic chr1:150076480(+) A-I      intronic chr1:150071421(+) A-I      intronic chr1:150074753(+) A-I      intronic chr1:150074777(+) A-I      intronic chr1:150073924(+) A-I      intronic chr1:150081319(+) A-I      ncRNA chr1:150108603(+) A-I      intronic chr1:150076990(+) A-I      intronic chr1:150109154(+) A-I      intronic chr1:150074775(+) A-I      intronic chr1:150108556(+) A-I      intronic chr1:150111786(+) A-I      intronic chr1:150111735(+) A-I      intronic chr1:150109938(+) A-I      intronic chr1:150108614(+) A-I      intronic chr1:150073891(+) A-I      intronic chr1:150108579(+) A-I      intronic chr1:150108571(+) A-I      intronic chr1:150108568(+) A-I      intronic chr1:150108567(+) A-I      intronic chr1:150073968(+) A-I      intronic chr1:150069678(+) A-I      intronic chr1:150076950(+) A-I      intronic chr1:150077150(+) A-I      intronic chr1:150074773(+) A-I      intronic chr1:150074807(+) A-I      intronic chr1:150076552(+) A-I      intronic chr1:150108566(+) A-I      intronic chr1:150077170(+) A-I      intronic chr1:150108560(+) A-I      intronic chr1:150077130(+) A-I      intronic chr1:150074781(+) A-I      intronic chr1:150074768(+) A-I      intronic chr1:150101015(+) A-I      intronic chr1:150115504(+) A-I      intronic chr1:150115490(+) A-I      intronic chr1:150101785(+) A-I      intronic chr1:150098460(+) A-I      intronic chr1:150114972(+) A-I      intronic chr1:150098428(+) A-I      intronic chr1:150101925(+) A-I      intronic chr1:150101939(+) A-I      intronic chr1:150098415(+) A-I      intronic chr1:150101978(+) A-I      intronic chr1:150101984(+) A-I      intronic chr1:150112330(+) A-I      intronic chr1:150102103(+) A-I      intronic chr1:150112199(+) A-I      intronic chr1:150102121(+) A-I      intronic chr1:150102473(+) A-I      intronic chr1:150112183(+) A-I      intronic chr1:150108263(+) A-I      intronic chr1:150111768(+) A-I      intronic chr1:150097978(+) A-I      intronic chr1:150109306(+) A-I      intronic chr1:150097892(+) A-I      intronic chr1:150097887(+) A-I      intronic chr1:150103499(+) A-I      intronic chr1:150103502(+) A-I      intronic chr1:150103504(+) A-I      intronic chr1:150099613(+) A-I      intronic chr1:150096947(+) A-I      intronic chr1:150103513(+) A-I      intronic chr1:150103880(+) A-I      intronic chr1:150103913(+) A-I      intronic chr1:150096713(+) A-I      intronic chr1:150109262(+) A-I      intronic chr1:150103927(+) A-I      intronic chr1:150103948(+) A-I      intronic chr1:150108330(+) A-I      intronic chr1:150096522(+) A-I      intronic chr1:150096487(+) A-I      intronic chr1:150107463(+) A-I      intronic chr1:150096484(+) A-I      intronic chr1:150096407(+) A-I      intronic chr1:150107535(+) A-I      intronic chr1:150107616(+) A-I      intronic chr1:150107649(+) A-I      intronic chr1:150109208(+) A-I      intronic chr1:150114946(+) A-I      intronic chr1:150107656(+) A-I      intronic chr1:150099538(+) A-I      intronic chr1:150096402(+) A-I      intronic chr1:150096391(+) A-I      intronic chr1:150096316(+) A-I      intronic chr1:150089143(+) A-I      intronic chr1:150089142(+) A-I      intronic chr1:150089137(+) A-I      intronic chr1:150089049(+) A-I      intronic chr1:150086784(+) A-I      intronic chr1:150086779(+) A-I      intronic chr1:150086758(+) A-I      intronic chr1:150086757(+) A-I      intronic chr1:150086735(+) A-I      intronic chr1:150086417(+) A-I      intronic chr1:150086402(+) A-I      intronic chr1:150085965(+) A-I      intronic chr1:150069635(+) A-I      intronic chr1:150085913(+) A-I      intronic chr1:150085890(+) A-I      intronic chr1:150085825(+) A-I      intronic chr1:150085824(+) A-I      intronic chr1:150069710(+) A-I      intronic chr1:150069714(+) A-I      intronic chr1:150073644(+) A-I      intronic chr1:150085786(+) A-I      intronic chr1:150107966(+) A-I      intronic chr1:150085778(+) A-I      intronic chr1:150069974(+) A-I      intronic chr1:150081272(+) A-I      intronic chr1:150069978(+) A-I      intronic chr1:150081245(+) A-I      intronic chr1:150107980(+) A-I      intronic chr1:150079947(+) A-I      intronic chr1:150079936(+) A-I      intronic chr1:150079829(+) A-I      intronic chr1:150070136(+) A-I      intronic chr1:150079750(+) A-I      intronic chr1:150076907(+) A-I      intronic chr1:150076763(+) A-I      intronic chr1:150108200(+) A-I      intronic chr1:150073639(+) A-I      intronic chr1:150112197(+) A-I      intronic chr1:150070160(+) A-I      intronic chr1:150070171(+) A-I      intronic chr1:150073622(+) A-I      intronic chr1:150090816(+) A-I      intronic chr1:150044497(+) A-I      intronic chr1:150046186(+) A-I      intronic chr1:150046198(+) A-I      intronic chr1:150074538(+) A-I      intronic chr1:150067578(+) A-I      intronic chr1:150074520(+) A-I      intronic chr1:150071861(+) A-I      intronic chr1:150067592(+) A-I      intronic chr1:150069317(+) A-I      intronic chr1:150070173(+) A-I      intronic chr1:150074479(+) A-I      intronic chr1:150074464(+) A-I      intronic chr1:150074080(+) A-I      intronic chr1:150073654(+) A-I      intronic chr1:150101804(+) A-I      intronic chr1:150089198(+) A-I      intronic chr1:150074580(+) A-I      intronic chr1:150089204(+) A-I      intronic chr1:150071432(+) A-I      intronic chr1:150090786(+) A-I      intronic chr1:150071511(+) A-I      intronic chr1:150089699(+) A-I      intronic chr1:150089800(+) A-I      intronic chr1:150071757(+) A-I      intronic chr1:150089835(+) A-I      intronic chr1:150089897(+) A-I      intronic chr1:150090627(+) A-I      intronic chr1:150090653(+) A-I      intronic chr1:150090721(+) A-I      intronic chr1:150090746(+) A-I      intronic chr1:150099635(+) A-I      intronic chr1:150098559(+) A-I      intronic chr1:150100171(+) A-I      intronic chr1:150098544(+) A-I      intronic chr1:150098536(+) A-I      intronic chr1:150100225(+) A-I      intronic chr1:150098525(+) A-I      intronic chr1:150108643(+) A-I      intronic chr1:150100312(+) A-I      intronic chr1:150100336(+) A-I      intronic chr1:150098519(+) A-I      intronic chr1:150098513(+) A-I      intronic chr1:150090784(+) A-I      intronic chr1:150098474(+) A-I      intronic chr1:150090767(+) A-I      intronic chr1:150100953(+) A-I      intronic chr1:150098461(+) A-I      intronic chr1:150100998(+) A-I      intronic chr1:150090759(+) A-I      intronic chr1:150101002(+) A-I      intronic chr1:150081354(+) A-I      ncRNA chr1:150101012(+) A-I      intronic chr1:150089362(+) A-I      intronic chr1:150073720(+) A-I      intronic chr1:150096479(+) A-I      intronic chr1:150097899(+) A-I      intronic chr1:150098835(+) A-I      intronic chr1:150115012(+) A-I      intronic chr1:150076989(+) A-I      intronic chr1:150081249(+) A-I      intronic chr1:150071450(+) A-I      intronic chr1:150070024(+) A-I      intronic chr1:150067632(+) A-I      intronic chr1:150071504(+) A-I      intronic chr1:150115611(+) A-I      intronic chr1:150052366(+) A-I      intronic chr1:150103917(+) A-I      intronic chr1:150108290(+) A-I      intronic chr1:150071375(+) A-I      intronic chr1:150093234(+) A-I      intronic chr1:150090327(+) A-I      intronic chr1:150081196(+) A-I      intronic chr1:150115645(+) A-I      intronic chr1:150109140(+) A-I      intronic chr1:150096324(+) A-I      intronic chr1:150074094(+) A-I      intronic chr1:150096400(+) A-I      intronic chr1:150103508(+) A-I      intronic chr1:150096376(+) A-I      intronic chr1:150069438(+) A-I      intronic chr1:150109298(+) A-I      intronic chr1:150079839(+) A-I      intronic chr1:150102434(+) A-I      intronic chr1:150094861(+) A-I      intronic chr1:150069784(+) A-I      intronic chr1:150076891(+) A-I      intronic chr1:150089239(+) A-I      intronic chr1:150098919(+) A-I      intronic chr1:150086511(+) A-I      intronic chr1:150098062(+) A-I      intronic chr1:150051702(+) A-I      intronic chr1:150089043(+) A-I      intronic chr1:150051592(+) A-I      intronic chr1:150098889(+) A-I      intronic chr1:150071445(+) A-I      intronic chr1:150102516(+) A-I      intronic chr1:150069567(+) A-I      intronic chr1:150103946(+) A-I      intronic chr1:150094402(+) A-I      intronic chr1:150094360(+) A-I      intronic chr1:150101772(+) A-I      intronic chr1:150099648(+) A-I      intronic chr1:150100896(+) A-I      intronic chr1:150103586(+) A-I      intronic chr1:150115607(+) A-I      intronic chr1:150108667(+) A-I      intronic chr1:150073663(+) A-I      intronic chr1:150108176(+) A-I      intronic chr1:150108289(+) A-I      intronic chr1:150096480(+) A-I      intronic chr1:150098888(+) A-I      intronic chr1:150076967(+) A-I      intronic chr1:150067693(+) A-I      intronic chr1:150079972(+) A-I      intronic chr1:150044604(+) A-I      intronic chr1:150114936(+) A-I      intronic chr1:150096731(+) A-I      intronic chr1:150070141(+) A-I      intronic chr1:150112127(+) A-I      intronic chr1:150089163(+) A-I      intronic chr1:150102116(+) A-I      intronic chr1:150108062(+) A-I      intronic chr1:150074097(+) A-I      intronic chr1:150103556(+) A-I      intronic chr1:150076928(+) A-I      intronic chr1:150086436(+) A-I      intronic chr1:150076777(+) A-I      intronic chr1:150081199(+) A-I      intronic chr1:150101924(+) A-I      intronic chr1:150086478(+) A-I      intronic chr1:150079904(+) A-I      intronic chr1:150097992(+) A-I      intronic chr1:150115548(+) A-I      intronic chr1:150051551(+) A-I      intronic chr1:150071343(+) A-I      intronic chr1:150109930(+) A-I      intronic chr1:150096401(+) A-I      intronic chr1:150089883(+) A-I      intronic chr1:150114907(+) A-I      intronic chr1:150074495(+) A-I      intronic chr1:150071756(+) A-I      intronic chr1:150109956(+) A-I      intronic chr1:150105456(+) A-I      intronic chr1:150108555(+) A-I      intronic chr1:150076908(+) A-I      intronic chr1:150071548(+) A-I      intronic chr1:150102219(+) A-I      intronic chr1:150071825(+) A-I      intronic chr1:150109178(+) A-I      intronic chr1:150074539(+) A-I      intronic chr1:150109245(+) A-I      intronic chr1:150054508(+) A-I      intronic chr1:150076968(+) A-I      intronic chr1:150103454(+) A-I      intronic chr1:150096416(+) A-I      intronic chr1:150081325(+) A-I      ncRNA chr1:150081345(+) A-I      ncRNA chr1:150081328(+) A-I      ncRNA chr1:150081379(+) A-I      ncRNA chr1:150081380(+) A-I      ncRNA chr1:150081342(+) A-I      ncRNA chr1:150081365(+) A-I      ncRNA chr1:150081307(+) A-I      ncRNA chr1:150081384(+) A-I      ncRNA chr1:150081407(+) A-I      ncRNA chr1:150077183(+) A-I      intronic chr1:150054500(+) A-I      intronic chr1:150103543(+) A-I      intronic chr1:150073885(+) A-I      intronic chr1:150111857(+) A-I      intronic chr1:150100952(+) A-I      intronic chr1:150099596(+) A-I      intronic chr1:150077141(+) A-I      intronic chr1:150109337(+) A-I      intronic chr1:150101870(+) A-I      intronic chr1:150089385(+) A-I      intronic chr1:150076381(+) A-I      intronic chr1:150096392(+) A-I      intronic chr1:150102629(+) A-I      intronic chr1:150071395(+) A-I      intronic chr1:150096377(+) A-I      intronic chr1:150109895(+) A-I      intronic chr1:150069290(+) A-I      intronic chr1:150096811(+) A-I      intronic chr1:150073854(+) A-I      intronic chr1:150070151(+) A-I      intronic chr1:150115602(+) A-I      intronic chr1:150094359(+) A-I      intronic chr1:150071415(+) A-I      intronic chr1:150046368(+) A-I      intronic chr1:150073929(+) A-I      intronic chr1:150071360(+) A-I      intronic chr1:150111781(+) A-I      intronic chr1:150107877(+) A-I      intronic chr1:150102213(+) A-I      intronic chr1:150070081(+) A-I      intronic chr1:150074762(+) A-I      intronic chr1:150099634(+) A-I      intronic chr1:150102599(+) A-I      intronic chr1:150089169(+) A-I      intronic chr1:150090624(+) A-I      intronic chr1:150109200(+) A-I      intronic chr1:150097882(+) A-I      intronic chr1:150093235(+) A-I      intronic chr1:150107872(+) A-I      intronic chr1:150099598(+) A-I      intronic chr1:150102582(+) A-I      intronic chr1:150052356(+) A-I      intronic chr1:150080023(+) A-I      intronic chr1:150073892(+) A-I      intronic chr1:150086751(+) A-I      intronic chr1:150090801(+) A-I      intronic chr1:150076839(+) A-I      intronic chr1:150070113(+) A-I      intronic chr1:150074763(+) A-I      intronic chr1:150073595(+) A-I      intronic chr1:150100153(+) A-I      intronic chr1:150079917(+) A-I      intronic chr1:150077108(+) A-I      intronic chr1:150114908(+) A-I      intronic chr1:150090707(+) A-I      intronic chr1:150100242(+) A-I      intronic chr1:150115512(+) A-I      intronic chr1:150109097(+) A-I      intronic chr1:150107986(+) A-I      intronic chr1:150076384(+) A-I      intronic chr1:150079811(+) A-I      intronic chr1:150071815(+) A-I      intronic chr1:150104000(+) A-I      intronic chr1:150074671(+) A-I      intronic chr1:150094161(+) A-I      intronic chr1:150115678(+) A-I      intronic chr1:150051728(+) A-I      intronic chr1:150074672(+) A-I      intronic chr1:150074512(+) A-I      intronic chr1:150115112(+) A-I      intronic chr1:150102104(+) A-I      intronic chr1:150089079(+) A-I      intronic chr1:150115543(+) A-I      intronic chr1:150074714(+) A-I      intronic chr1:150099586(+) A-I      intronic chr1:150098611(+) A-I      intronic chr1:150076515(+) A-I      intronic chr1:150098358(+) A-I      intronic chr1:150101850(+) A-I      intronic chr1:150094967(+) A-I      intronic chr1:150074458(+) A-I      intronic chr1:150073689(+) A-I      intronic chr1:150071396(+) A-I      intronic chr1:150086862(+) A-I      intronic chr1:150086504(+) A-I      intronic chr1:150103922(+) A-I      intronic chr1:150109297(+) A-I      intronic chr1:150103544(+) A-I      intronic chr1:150103972(+) A-I      intronic chr1:150054477(+) A-I      intronic chr1:150071793(+) A-I      intronic chr1:150086780(+) A-I      intronic chr1:150103598(+) A-I      intronic chr1:150074892(+) A-I      intronic chr1:150050719(+) A-I      intronic chr1:150076844(+) A-I      intronic chr1:150103712(+) A-I      intronic chr1:150076470(+) A-I      intronic chr1:150103941(+) A-I      intronic chr1:150090215(+) A-I      intronic chr1:150070134(+) A-I      intronic chr1:150114947(+) A-I      intronic chr1:150089475(+) A-I      intronic chr1:150115698(+) A-I      intronic chr1:150112247(+) A-I      intronic chr1:150100165(+) A-I      intronic chr1:150076830(+) A-I      intronic chr1:150074718(+) A-I      intronic chr1:150051585(+) A-I      intronic chr1:150102527(+) A-I      intronic chr1:150107983(+) A-I      intronic chr1:150089921(+) A-I      intronic chr1:150115014(+) A-I      intronic chr1:150114874(+) A-I      intronic chr1:150108342(+) A-I      intronic chr1:150044475(+) A-I      intronic chr1:150067633(+) A-I      intronic chr1:150103377(+) A-I      intronic chr1:150076846(+) A-I      intronic chr1:150109912(+) A-I      intronic chr1:150112258(+) A-I      intronic chr1:150081239(+) A-I      intronic chr1:150096566(+) A-I      intronic chr1:150094263(+) A-I      intronic chr1:150108620(+) A-I      intronic chr1:150050729(+) A-I      intronic chr1:150077154(+) A-I      intronic chr1:150077158(+) A-I      intronic chr1:150114960(+) A-I      intronic chr1:150101860(+) A-I      intronic chr1:150076927(+) A-I      intronic chr1:150051623(+) A-I      intronic chr1:150071411(+) A-I      intronic chr1:150096471(+) A-I      intronic chr1:150070097(+) A-I      intronic chr1:150079876(+) A-I      intronic chr1:150069305(+) A-I      intronic chr1:150107553(+) A-I      intronic chr1:150074089(+) A-I      intronic chr1:150102129(+) A-I      intronic chr1:150055654(+) A-I      intronic chr1:150100248(+) A-I      intronic chr1:150107573(+) A-I      intronic chr1:150076568(+) A-I      intronic chr1:150077102(+) A-I      intronic chr1:150100240(+) A-I      intronic chr1:150099539(+) A-I      intronic chr1:150107939(+) A-I      intronic chr1:150109876(+) A-I      intronic chr1:150111835(+) A-I      intronic chr1:150109084(+) A-I      intronic chr1:150107929(+) A-I      intronic chr1:150074158(+) A-I      intronic chr1:150080758(+) A-I      intronic chr1:150079748(+) A-I      intronic chr1:150115672(+) A-I      intronic chr1:150096782(+) A-I      intronic chr1:150115632(+) A-I      intronic chr1:150109259(+) A-I      intronic chr1:150115513(+) A-I      intronic chr1:150069809(+) A-I      intronic chr1:150071779(+) A-I      intronic chr1:150115496(+) A-I      intronic chr1:150089479(+) A-I      intronic chr1:150076981(+) A-I      intronic chr1:150071447(+) A-I      intronic chr1:150108607(+) A-I      intronic chr1:150096772(+) A-I      intronic chr1:150074891(+) A-I      intronic chr1:150074738(+) A-I      intronic chr1:150100328(+) A-I      intronic chr1:150098599(+) A-I      intronic chr1:150076363(+) A-I      intronic chr1:150074712(+) A-I      intronic chr1:150114900(+) A-I      intronic chr1:150093225(+) A-I      intronic chr1:150107498(+) A-I      intronic chr1:150067492(+) A-I      intronic chr1:150115617(+) A-I      intronic chr1:150090249(+) A-I      intronic chr1:150094230(+) A-I      intronic chr1:150098904(+) A-I      intronic chr1:150093253(+) A-I      intronic chr1:150115592(+) A-I      intronic chr1:150074609(+) A-I      intronic chr1:150103511(+) A-I      intronic chr1:150098903(+) A-I      intronic chr1:150103735(+) A-I      intronic chr1:150085733(+) A-I      intronic chr1:150103464(+) A-I      intronic chr1:150051761(+) A-I      intronic chr1:150052372(+) A-I      intronic chr1:150108245(+) A-I      intronic chr1:150102234(+) A-I      intronic chr1:150115591(+) A-I      intronic chr1:150094931(+) A-I      intronic chr1:150089384(+) A-I      intronic chr1:150115539(+) A-I      intronic chr1:150077129(+) A-I      intronic chr1:150073675(+) A-I      intronic chr1:150112122(+) A-I      intronic chr1:150079940(+) A-I      intronic chr1:150096885(+) A-I      intronic chr1:150079894(+) A-I      intronic chr1:150079810(+) A-I      intronic chr1:150071517(+) A-I      intronic chr1:150112268(+) A-I      intronic chr1:150107517(+) A-I      intronic chr1:150073899(+) A-I      intronic chr1:150074088(+) A-I      intronic chr1:150112159(+) A-I      intronic chr1:150081246(+) A-I      intronic chr1:150067663(+) A-I      intronic chr1:150096789(+) A-I      intronic chr1:150108663(+) A-I      intronic chr1:150115655(+) A-I      intronic chr1:150096325(+) A-I      intronic chr1:150102567(+) A-I      intronic chr1:150079778(+) A-I      intronic chr1:150103426(+) A-I      intronic chr1:150109292(+) A-I      intronic chr1:150115005(+) A-I      intronic chr1:150071494(+) A-I      intronic chr1:150097913(+) A-I      intronic chr1:150098598(+) A-I      intronic chr1:150099602(+) A-I      intronic chr1:150108195(+) A-I      intronic chr1:150081275(+) A-I      intronic chr1:150076871(+) A-I      intronic chr1:150071397(+) A-I      intronic chr1:150112241(+) A-I      intronic chr1:150108625(+) A-I      intronic chr1:150073664(+) A-I      intronic chr1:150105455(+) A-I      intronic chr1:150096744(+) A-I      intronic chr1:150098522(+) A-I      intronic chr1:150108260(+) A-I      intronic chr1:150100291(+) A-I      intronic chr1:150079908(+) A-I      intronic chr1:150069805(+) A-I      intronic chr1:150076374(+) A-I      intronic chr1:150108611(+) A-I      intronic chr1:150114943(+) A-I      intronic chr1:150114942(+) A-I      intronic chr1:150081189(+) A-I      intronic chr1:150100359(+) A-I      intronic chr1:150108678(+) A-I      intronic chr1:150051562(+) A-I      intronic chr1:150061691(+) A-I      intronic chr1:150109172(+) A-I      intronic chr1:150073586(+) A-I      intronic chr1:150115536(+) A-I      intronic chr1:150074815(+) A-I      intronic chr1:150103435(+) A-I      intronic chr1:150076541(+) A-I      intronic chr1:150076969(+) A-I      intronic chr1:150097977(+) A-I      intronic chr1:150116394(+) A-I      intronic chr1:150109881(+) A-I      intronic chr1:150071527(+) A-I      intronic chr1:150076524(+) A-I      intronic chr1:150101888(+) A-I      intronic chr1:150100149(+) A-I      intronic chr1:150096758(+) A-I      intronic chr1:150099687(+) A-I      intronic chr1:150111743(+) A-I      intronic chr1:150115646(+) A-I      intronic chr1:150111751(+) A-I      intronic chr1:150096558(+) A-I      intronic chr1:150098970(+) A-I      intronic chr1:150103732(+) A-I      intronic chr1:150099651(+) A-I      intronic chr1:150074459(+) A-I      intronic chr1:150076583(+) A-I      intronic chr1:150076905(+) A-I      intronic chr1:150050628(+) A-I      intronic chr1:150096797(+) A-I      intronic chr1:150109188(+) A-I      intronic chr1:150109325(+) A-I      intronic chr1:150105665(+) A-I      intronic chr1:150100406(+) A-I      intronic chr1:150071770(+) A-I      intronic chr1:150073587(+) A-I      intronic chr1:150071398(+) A-I      intronic chr1:150097861(+) A-I      intronic chr1:150096396(+) A-I      intronic chr1:150089172(+) A-I      intronic chr1:150071574(+) A-I      intronic chr1:150089301(+) A-I      intronic chr1:150115620(+) A-I      intronic chr1:150107965(+) A-I      intronic chr1:150069700(+) A-I      intronic chr1:150071380(+) A-I      intronic chr1:150098021(+) A-I      intronic chr1:150109821(+) A-I      intronic chr1:150076364(+) A-I      intronic chr1:150070078(+) A-I      intronic chr1:150074737(+) A-I      intronic chr1:150071456(+) A-I      intronic chr1:150102533(+) A-I      intronic chr1:150102137(+) A-I      intronic chr1:150069645(+) A-I      intronic chr1:150085777(+) A-I      intronic chr1:150071549(+) A-I      intronic chr1:150107501(+) A-I      intronic chr1:150107851(+) A-I      intronic chr1:150094252(+) A-I      intronic chr1:150108668(+) A-I      intronic chr1:150069327(+) A-I      intronic chr1:150112303(+) A-I      intronic chr1:150103932(+) A-I      intronic chr1:150076758(+) A-I      intronic chr1:150090118(+) A-I      intronic chr1:150103956(+) A-I      intronic chr1:150076391(+) A-I      intronic chr1:150099633(+) A-I      intronic chr1:150081285(+) A-I      intronic chr1:150100329(+) A-I      intronic chr1:150086429(+) A-I      intronic chr1:150107563(+) A-I      intronic chr1:150099622(+) A-I      intronic chr1:150074736(+) A-I      intronic chr1:150079921(+) A-I      intronic chr1:150044603(+) A-I      intronic chr1:150102483(+) A-I      intronic chr1:150105447(+) A-I      intronic chr1:150107610(+) A-I      intronic chr1:150076377(+) A-I      intronic chr1:150108074(+) A-I      intronic chr1:150074382(+) A-I      intronic chr1:150115637(+) A-I      intronic chr1:150102055(+) A-I      intronic chr1:150077153(+) A-I      intronic chr1:150076447(+) A-I      intronic chr1:150071526(+) A-I      intronic chr1:150067703(+) A-I      intronic chr1:150074804(+) A-I      intronic chr1:150094253(+) A-I      intronic chr1:150114924(+) A-I      intronic chr1:150079779(+) A-I      intronic chr1:150086894(+) A-I      intronic chr1:150046335(+) A-I      intronic chr1:150090698(+) A-I      intronic chr1:150069564(+) A-I      intronic chr1:150090162(+) A-I      intronic chr1:150076987(+) A-I      intronic chr1:150109970(+) A-I      intronic chr1:150076834(+) A-I      intronic chr1:150070091(+) A-I      intronic chr1:150076446(+) A-I      intronic chr1:150108351(+) A-I      intronic chr1:150115701(+) A-I      intronic chr1:150070077(+) A-I      intronic chr1:150103425(+) A-I      intronic chr1:150076852(+) A-I      intronic chr1:150103569(+) A-I      intronic chr1:150086841(+) A-I      intronic chr1:150115656(+) A-I      intronic chr1:150071564(+) A-I      intronic chr1:150103517(+) A-I      intronic chr1:150101926(+) A-I      intronic chr1:150114968(+) A-I      intronic chr1:150090282(+) A-I      intronic chr1:150079854(+) A-I      intronic chr1:150076942(+) A-I      intronic chr1:150076376(+) A-I      intronic chr1:150086442(+) A-I      intronic chr1:150097877(+) A-I      intronic chr1:150108597(+) A-I      intronic chr1:150115687(+) A-I      intronic chr1:150076499(+) A-I      intronic chr1:150069844(+) A-I      intronic chr1:150086989(+) A-I      intronic chr1:150074179(+) A-I      intronic chr1:150100224(+) A-I      intronic chr1:150108177(+) A-I      intronic chr1:150114866(+) A-I      intronic chr1:150081207(+) A-I      intronic chr1:150095042(+) A-I      intronic chr1:150109092(+) A-I      intronic chr1:150107541(+) A-I      intronic chr1:150081263(+) A-I      intronic chr1:150079787(+) A-I      intronic chr1:150108598(+) A-I      intronic chr1:150073693(+) A-I      intronic chr1:150090205(+) A-I      intronic chr1:150054509(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	VPS45	chr1:150071395(+) A-I intron -    15545495 chr1:150071396(+) A-I intron -    15545495 chr1:150071398(+) A-I intron -    15545495 chr1:150071415(+) A-I intron -    15545495   //22327324 chr1:150071456(+) A-I intron -    15545495 chr1:150071494(+) A-I intron -    15545495 chr1:150074714(+) A-I intron -    22327324 chr1:150074804(+) A-I intron -    21960545   //22327324 chr1:150074892(+) A-I intron -    22327324 chr1:150076446(+) A-I intron -    21960545   //22327324 chr1:150076470(+) A-I intron -    22327324 chr1:150076758(+) A-I intron -    22327324 chr1:150081199(+) A-I intron -    22327324 chr1:150081380(+) A-I intron -    22327324 chr1:150065928(+) A-I intron -    21960545 chr1:150074672(+) A-I intron -    21960545 chr1:150076646(+) A-I intron -    21960545 chr1:150077183(+) A-I intron -    21960545 chr1:150098970(+) A-I intron -    21960545 chr1:150103712(+) A-I intron -    21960545 chr1:150114866(+) A-I intron -    21960545 chr1:150114874(+) A-I intron -    21960545 chr1:150074714(+) A-G intron -    22484847 chr1:150074738(+) A-G intron -    22484847 chr1:150074762(+) A-G intron -    22484847 chr1:150074892(+) A-G intron -    22484847 chr1:150076446(+) A-G intron -    22484847 chr1:150076541(+) A-G intron -    22484847 chr1:150076583(+) A-G intron -    22484847 chr1:150077154(+) A-G intron -    22484847 chr1:150077158(+) A-G intron -    22484847 chr1:150077183(+) A-G intron -    22484847 chr1:150046335(+) A-G intron -    22484847 chr1:150051551(+) A-G intron -    22484847 chr1:150051585(+) A-G intron -    22484847 chr1:150051592(+) A-G intron -    22484847 chr1:150051702(+) A-G intron -    22484847 chr1:150051728(+) A-G intron -    22484847 chr1:150067492(+) A-G intron -    22484847 chr1:150069290(+) A-G intron -    22484847 chr1:150069305(+) A-G intron -    22484847 chr1:150069564(+) A-G intron -    22484847 chr1:150069645(+) A-G intron -    22484847 chr1:150069700(+) A-G intron -    22484847 chr1:150070024(+) A-G intron -    22484847 chr1:150070077(+) A-G intron -    22484847 chr1:150070141(+) A-G intron -    22484847 chr1:150071395(+) A-G intron -    22484847 chr1:150071396(+) A-G intron -    22484847 chr1:150071397(+) A-G intron -    22484847 chr1:150071398(+) A-G intron -    22484847 chr1:150071411(+) A-G intron -    22484847 chr1:150071415(+) A-G intron -    22484847 chr1:150071456(+) A-G intron -    22484847 chr1:150071494(+) A-G intron -    22484847 chr1:150071504(+) A-G intron -    22484847 chr1:150071548(+) A-G intron -    22484847 chr1:150071756(+) A-G intron -    22484847 chr1:150071815(+) A-G intron -    22484847 chr1:150073201(+) T-C intron -    22484847 chr1:150073595(+) A-G intron -    22484847 chr1:150074179(+) A-G intron -    22484847 chr1:150074539(+) A-G intron -    22484847 chr1:150074671(+) A-G intron -    22484847 chr1:150076758(+) A-G intron -    22484847 chr1:150076777(+) A-G intron -    22484847 chr1:150076908(+) A-G intron -    22484847 chr1:150076967(+) A-G intron -    22484847 chr1:150079787(+) A-G intron -    22484847 chr1:150079839(+) A-G intron -    22484847 chr1:150079866(+) G-T intron -    22484847 chr1:150079894(+) A-G intron -    22484847 chr1:150079904(+) A-G intron -    22484847 chr1:150079908(+) A-G intron -    22484847 chr1:150079917(+) A-G intron -    22484847 chr1:150079940(+) A-G intron -    22484847 chr1:150079972(+) A-G intron -    22484847 chr1:150081196(+) A-G intron -    22484847 chr1:150081199(+) A-G intron -    22484847 chr1:150081207(+) A-G intron -    22484847 chr1:150081239(+) A-G intron -    22484847 chr1:150081246(+) A-G intron -    22484847 chr1:150081263(+) A-G intron -    22484847 chr1:150081307(+) A-G intron -    22484847 chr1:150081325(+) A-G intron -    22484847 chr1:150081328(+) A-G intron -    22484847 chr1:150081345(+) A-G intron -    22484847 chr1:150081354(+) A-G intron -    22484847 chr1:150081365(+) A-G intron -    22484847 chr1:150081380(+) A-G intron -    22484847 chr1:150089079(+) A-G intron -    22484847 chr1:150089385(+) A-G intron -    22484847 chr1:150090624(+) A-G intron -    22484847 chr1:150094230(+) A-G intron -    22484847 chr1:150094252(+) A-G intron -    22484847 chr1:150094253(+) A-G intron -    22484847 chr1:150094263(+) A-G intron -    22484847 chr1:150094360(+) A-G intron -    22484847 chr1:150096325(+) A-G intron -    22484847 chr1:150096376(+) A-G intron -    22484847 chr1:150096377(+) A-G intron -    22484847 chr1:150096392(+) A-G intron -    22484847 chr1:150096396(+) A-G intron -    22484847 chr1:150096400(+) A-G intron -    22484847 chr1:150096401(+) A-G intron -    22484847 chr1:150096471(+) A-G intron -    22484847 chr1:150096479(+) A-G intron -    22484847 chr1:150096480(+) A-G intron -    22484847 chr1:150096744(+) A-G intron -    22484847 chr1:150096758(+) A-G intron -    22484847 chr1:150096789(+) A-G intron -    22484847 chr1:150096797(+) A-G intron -    22484847 chr1:150096832(+) T-C intron -    22484847 chr1:150096885(+) A-G intron -    22484847 chr1:150097861(+) A-G intron -    22484847 chr1:150097882(+) A-G intron -    22484847 chr1:150097899(+) A-G intron -    22484847 chr1:150097977(+) A-G intron -    22484847 chr1:150098358(+) A-G intron -    22484847 chr1:150098522(+) A-G intron -    22484847 chr1:150098598(+) A-G intron -    22484847 chr1:150098599(+) A-G intron -    22484847 chr1:150098611(+) A-G intron -    22484847 chr1:150098888(+) A-G intron -    22484847 chr1:150098889(+) A-G intron -    22484847 chr1:150099596(+) A-G intron -    22484847 chr1:150099633(+) A-G intron -    22484847 chr1:150099687(+) A-G intron -    22484847 chr1:150100149(+) A-G intron -    22484847 chr1:150100165(+) A-G intron -    22484847 chr1:150100224(+) A-G intron -    22484847 chr1:150100240(+) A-G intron -    22484847 chr1:150100242(+) A-G intron -    22484847 chr1:150100248(+) A-G intron -    22484847 chr1:150100291(+) A-G intron -    22484847 chr1:150100896(+) A-G intron -    22484847 chr1:150100952(+) A-G intron -    22484847 chr1:150101772(+) A-G intron -    22484847 chr1:150101924(+) A-G intron -    22484847 chr1:150101926(+) A-G intron -    22484847 chr1:150102055(+) A-G intron -    22484847 chr1:150102104(+) A-G intron -    22484847 chr1:150102483(+) A-G intron -    22484847 chr1:150102516(+) A-G intron -    22484847 chr1:150102567(+) A-G intron -    22484847 chr1:150102582(+) A-G intron -    22484847 chr1:150102599(+) A-G intron -    22484847 chr1:150103426(+) A-G intron -    22484847 chr1:150103517(+) A-G intron -    22484847 chr1:150103544(+) A-G intron -    22484847 chr1:150103917(+) A-G intron -    22484847 chr1:150103922(+) A-G intron -    22484847 chr1:150103946(+) A-G intron -    22484847 chr1:150103956(+) A-G intron -    22484847 chr1:150107851(+) A-G intron -    22484847 chr1:150107872(+) A-G intron -    22484847 chr1:150108176(+) A-G intron -    22484847 chr1:150108195(+) A-G intron -    22484847 chr1:150109084(+) A-G intron -    22484847 chr1:150109092(+) A-G intron -    22484847 chr1:150109097(+) A-G intron -    22484847 chr1:150109188(+) A-G intron -    22484847 chr1:150109245(+) A-G intron -    22484847 chr1:150109259(+) A-G intron -    22484847 chr1:150109895(+) A-G intron -    22484847 chr1:150109930(+) A-G intron -    22484847 chr1:150109956(+) A-G intron -    22484847 chr1:150112127(+) A-G intron -    22484847 chr1:150112241(+) A-G intron -    22484847 chr1:150112258(+) A-G intron -    22484847 chr1:150112268(+) A-G intron -    22484847 chr1:150114866(+) A-G intron -    22484847 chr1:150114874(+) A-G intron -    22484847 chr1:150114900(+) A-G intron -    22484847 chr1:150114908(+) A-G intron -    22484847 chr1:150114943(+) A-G intron -    22484847 chr1:150115012(+) A-G intron -    22484847 chr1:150115070(+) A-G intron -    22484847 chr1:150115512(+) A-G intron -    22484847 chr1:150115539(+) A-G intron -    22484847 chr1:150115592(+) A-G intron -    22484847 chr1:150115637(+) A-G intron -    22484847 chr1:150115646(+) A-G intron -    22484847 chr1:150115687(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	VPS45	chr1:150039537-150039538(+) m6A 5'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//22608085 chr1:150039764-150039765(+) m6A 5'UTR//intron       25456834//24981863//22608085 chr1:150039794-150039795(+) m6A 5'UTR//intron       25456834//24981863//22608085 chr1:150039835-150039836(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24981863//22608085 chr1:150039848-150039849(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24981863//22608085 chr1:150039963-150039964(+) m6A 5'UTR//CDS//exon//intron       24981863//22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	VPS45	Chromatin K562 cells     - Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Membrane K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-US25-1-5p
Interactor2: VPS45

Evidence Support:

Strong-Evidence	RISC-IP
Support Database	ViRBase

References:

PMID	20585629	Target region	5'UTR
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	HEK293 cells	Interactor2 expression	None
Description	Here, we identify cellular transcript targets of one of the most highly expressed HCMV encoded miRNAs, miR-US25-1, using a recently developed biochemical approach called RISC immunoprecipitation. Strikingly, the majority of identified transcripts contained miR-US25-1 target sites within the 5'UTR rather than the 3'UTR.