Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00507982

  Virus:  

Human herpesvirus 5 strain AD169

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.7311

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US25-1-5p:  MIMAT0001581          CASP8AP2:  NM_001137668     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-US25-1-5p	CASP8AP2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0001581	9994
Organism	Human herpesvirus 5 strain AD169	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	CED-4//FLASH//RIP25

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position
Lncediting	CASP8AP2	chr6: 90567059     chr6: 90541028     chr6: 90540993     chr6: 90541020

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	CASP8AP2	chr6:90581768(+) A-I      intronic chr6:90581776(+) A-I      intronic chr6:90555971(+) A-I      intronic chr6:90559600(+) A-I      intronic chr6:90567900(+) A-I      intronic chr6:90567871(+) A-I      intronic chr6:90559609(+) A-I      intronic chr6:90554817(+) A-I      intronic chr6:90554820(+) A-I      intronic chr6:90582648(+) A-I      intronic chr6:90568463(+) A-I      intronic chr6:90551594(+) A-I      intronic chr6:90551589(+) A-I      intronic chr6:90541568(+) A-I      intronic chr6:90556430(+) A-I      intronic chr6:90555085(+) A-I      intronic chr6:90555192(+) A-I      intronic chr6:90582639(+) A-I      intronic chr6:90582331(+) A-I      intronic chr6:90582172(+) A-I      intronic chr6:90582157(+) A-I      intronic chr6:90582127(+) A-I      intronic chr6:90582120(+) A-I      intronic chr6:90582072(+) A-I      intronic chr6:90582062(+) A-I      intronic chr6:90582038(+) A-I      intronic chr6:90582030(+) A-I      intronic chr6:90582003(+) A-I      intronic chr6:90581733(+) A-I      intronic chr6:90581702(+) A-I      intronic chr6:90581350(+) A-I      intronic chr6:90581344(+) A-I      intronic chr6:90580245(+) A-I      intronic chr6:90580227(+) A-I      intronic chr6:90579215(+) A-I      intronic chr6:90579106(+) A-I      intronic chr6:90575497(+) A-I      intronic chr6:90575484(+) A-I      intronic chr6:90555549(+) A-I      intronic chr6:90555586(+) A-I      intronic chr6:90556052(+) A-I      intronic chr6:90556068(+) A-I      intronic chr6:90556416(+) A-I      intronic chr6:90575056(+) A-I      intronic chr6:90575014(+) A-I      intronic chr6:90574979(+) A-I      intronic chr6:90574790(+) A-I      intronic chr6:90574787(+) A-I      intronic chr6:90574747(+) A-I      intronic chr6:90574683(+) A-I      intronic chr6:90574651(+) A-I      intronic chr6:90574380(+) A-I      intronic chr6:90574368(+) A-I      intronic chr6:90574365(+) A-I      intronic chr6:90574356(+) A-I      intronic chr6:90574338(+) A-I      intronic chr6:90574333(+) A-I      intronic chr6:90574300(+) A-I      intronic chr6:90574263(+) A-I      intronic chr6:90574257(+) A-I      intronic chr6:90571233(+) A-I      intronic chr6:90571221(+) A-I      intronic chr6:90568542(+) A-I      intronic chr6:90568488(+) A-I      intronic chr6:90568462(+) A-I      intronic chr6:90567961(+) A-I      intronic chr6:90567933(+) A-I      intronic chr6:90567682(+) A-I      intronic chr6:90567555(+) A-I      intronic chr6:90567261(+) A-I      intronic chr6:90565511(+) A-I      intronic chr6:90563470(+) A-I      intronic chr6:90563426(+) A-I      intronic chr6:90563414(+) A-I      intronic chr6:90563395(+) A-I      intronic chr6:90563369(+) A-I      intronic chr6:90562580(+) A-I      intronic chr6:90562457(+) A-I      intronic chr6:90562417(+) A-I      intronic chr6:90562043(+) A-I      intronic chr6:90560471(+) A-I      intronic chr6:90559546(+) A-I      intronic chr6:90559138(+) A-I      intronic chr6:90558760(+) A-I      intronic chr6:90558699(+) A-I      intronic chr6:90558221(+) A-I      intronic chr6:90558203(+) A-I      intronic chr6:90558188(+) A-I      intronic chr6:90558179(+) A-I      intronic chr6:90558173(+) A-I      intronic chr6:90558160(+) A-I      intronic chr6:90557657(+) A-I      intronic chr6:90557549(+) A-I      intronic chr6:90557522(+) A-I      intronic chr6:90557134(+) A-I      intronic chr6:90557129(+) A-I      intronic chr6:90541097(+) A-I      intronic chr6:90541149(+) A-I      intronic chr6:90543973(+) A-I      intronic chr6:90543978(+) A-I      intronic chr6:90543979(+) A-I      intronic chr6:90544002(+) A-I      intronic chr6:90544026(+) A-I      intronic chr6:90556525(+) A-I      intronic chr6:90544121(+) A-I      intronic chr6:90544276(+) A-I      intronic chr6:90544666(+) A-I      intronic chr6:90544669(+) A-I      intronic chr6:90545870(+) A-I      intronic chr6:90545908(+) A-I      intronic chr6:90546050(+) A-I      intronic chr6:90546068(+) A-I      intronic chr6:90546087(+) A-I      intronic chr6:90546653(+) A-I      intronic chr6:90547604(+) A-I      intronic chr6:90547691(+) A-I      intronic chr6:90547694(+) A-I      intronic chr6:90549162(+) A-I      intronic chr6:90549171(+) A-I      intronic chr6:90549237(+) A-I      intronic chr6:90549243(+) A-I      intronic chr6:90550007(+) A-I      intronic chr6:90554765(+) A-I      intronic chr6:90541028(+) A-I      5'UTR chr6:90541020(+) A-I      5'UTR chr6:90567059(+) A-I      3'UTR chr6:90581919(+) A-I      intronic chr6:90549971(+) A-I      intronic chr6:90555082(+) A-I      intronic chr6:90582327(+) A-I      intronic chr6:90580299(+) A-I      intronic chr6:90555482(+) A-I      intronic chr6:90555700(+) A-I      intronic chr6:90549198(+) A-I      intronic chr6:90581436(+) A-I      intronic chr6:90558336(+) A-I      intronic chr6:90574906(+) A-I      intronic chr6:90568618(+) A-I      intronic chr6:90567467(+) A-I      intronic chr6:90571139(+) A-I      intronic chr6:90565452(+) A-I      intronic chr6:90581178(+) A-I      intronic chr6:90567776(+) A-I      intronic chr6:90559509(+) A-I      intronic chr6:90575380(+) A-I      intronic chr6:90546917(+) A-I      intronic chr6:90571588(+) A-I      intronic chr6:90555895(+) A-I      intronic chr6:90561276(+) A-I      intronic chr6:90546696(+) A-I      intronic chr6:90574627(+) A-I      intronic chr6:90574425(+) A-I      intronic chr6:90581187(+) A-I      intronic chr6:90557035(+) A-I      intronic chr6:90581524(+) A-I      intronic chr6:90555958(+) A-I      intronic chr6:90581808(+) A-I      intronic chr6:90557028(+) A-I      intronic chr6:90563520(+) A-I      intronic chr6:90556529(+) A-I      intronic chr6:90581849(+) A-I      intronic chr6:90581517(+) A-I      intronic chr6:90544679(+) A-I      intronic chr6:90581522(+) A-I      intronic chr6:90558148(+) A-I      intronic chr6:90546978(+) A-I      intronic chr6:90581764(+) A-I      intronic chr6:90564388(+) A-I      intronic chr6:90555894(+) A-I      intronic chr6:90574339(+) A-I      intronic chr6:90559588(+) A-I      intronic chr6:90571254(+) A-I      intronic chr6:90581918(+) A-I      intronic chr6:90557029(+) A-I      intronic chr6:90558294(+) A-I      intronic chr6:90562703(+) A-I      intronic chr6:90543986(+) A-I      intronic chr6:90547926(+) A-I      intronic chr6:90574970(+) A-I      intronic chr6:90567844(+) A-I      intronic chr6:90549895(+) A-I      intronic chr6:90579204(+) A-I      intronic chr6:90541177(+) A-I      intronic chr6:90562697(+) A-I      intronic chr6:90555068(+) A-I      intronic chr6:90549227(+) A-I      intronic chr6:90579195(+) A-I      intronic chr6:90567128(+) A-I      intronic chr6:90564320(+) A-I      intronic chr6:90549307(+) A-I      intronic chr6:90549278(+) A-I      intronic chr6:90567867(+) A-I      intronic chr6:90581799(+) A-I      intronic chr6:90549247(+) A-I      intronic chr6:90558870(+) A-I      intronic chr6:90580158(+) A-I      intronic chr6:90570331(+) A-I      3'UTR chr6:90569322(+) A-I      3'UTR chr6:90570335(+) A-I      3'UTR chr6:90569347(+) A-I      3'UTR chr6:90570488(+) A-I      3'UTR chr6:90569520(+) A-I      3'UTR chr6:90570544(+) A-I      3'UTR chr6:90569507(+) A-I      3'UTR chr6:90540993(+) A-I      5'UTR chr6:90569393(+) A-I      3'UTR chr6:90569384(+) A-I      3'UTR chr6:90570466(+) A-I      3'UTR chr6:90570317(+) A-I      3'UTR chr6:90569546(+) A-I      3'UTR chr6:90569549(+) A-I      3'UTR chr6:90569396(+) A-I      3'UTR chr6:90569367(+) A-I      3'UTR chr6:90546972(+) A-I      intronic chr6:90567714(+) A-I      intronic chr6:90544408(+) A-I      intronic chr6:90549358(+) A-I      intronic chr6:90571133(+) A-I      intronic chr6:90562730(+) A-I      intronic chr6:90549716(+) A-I      intronic chr6:90571220(+) A-I      intronic chr6:90549333(+) A-I      intronic chr6:90551362(+) A-I      intronic chr6:90571314(+) A-I      intronic chr6:90555909(+) A-I      intronic chr6:90557645(+) A-I      intronic chr6:90558166(+) A-I      intronic chr6:90555228(+) A-I      intronic chr6:90544697(+) A-I      intronic chr6:90549626(+) A-I      intronic chr6:90583103(+) A-I      intronic chr6:90582712(+) A-I      intronic chr6:90567854(+) A-I      intronic chr6:90567845(+) A-I      intronic chr6:90555957(+) A-I      intronic chr6:90574733(+) A-I      intronic chr6:90564315(+) A-I      intronic chr6:90549119(+) A-I      intronic chr6:90579228(+) A-I      intronic chr6:90549583(+) A-I      intronic chr6:90571238(+) A-I      intronic chr6:90581920(+) A-I      intronic chr6:90546969(+) A-I      intronic chr6:90567798(+) A-I      intronic chr6:90562497(+) A-I      intronic chr6:90558262(+) A-I      intronic chr6:90557046(+) A-I      intronic chr6:90567909(+) A-I      intronic chr6:90545063(+) A-I      intronic chr6:90542659(+) A-I      intronic chr6:90544247(+) A-I      intronic chr6:90571473(+) A-I      intronic chr6:90549225(+) A-I      intronic chr6:90582345(+) A-I      intronic chr6:90579107(+) A-I      intronic chr6:90582558(+) A-I      intronic chr6:90583143(+) A-I      intronic chr6:90544344(+) A-I      intronic chr6:90555848(+) A-I      intronic chr6:90581813(+) A-I      intronic chr6:90571179(+) A-I      intronic chr6:90549281(+) A-I      intronic chr6:90555452(+) A-I      intronic chr6:90568920(+) A-I      intronic chr6:90560307(+) A-I      intronic chr6:90546069(+) A-I      intronic chr6:90581382(+) A-I      intronic chr6:90556022(+) A-I      intronic chr6:90574606(+) A-I      intronic chr6:90567270(+) A-I      intronic chr6:90544327(+) A-I      intronic chr6:90574759(+) A-I      intronic chr6:90554842(+) A-I      intronic chr6:90580192(+) A-I      intronic chr6:90555682(+) A-I      intronic chr6:90581462(+) A-I      intronic chr6:90581485(+) A-I      intronic chr6:90557548(+) A-I      intronic chr6:90549197(+) A-I      intronic chr6:90549379(+) A-I      intronic chr6:90544240(+) A-I      intronic chr6:90582033(+) A-I      intronic chr6:90551548(+) A-I      intronic chr6:90564387(+) A-I      intronic chr6:90558798(+) A-I      intronic chr6:90567246(+) A-I      intronic chr6:90549142(+) A-I      intronic chr6:90580267(+) A-I      intronic chr6:90563915(+) A-I      intronic chr6:90556064(+) A-I      intronic chr6:90549919(+) A-I      intronic chr6:90578970(+) A-I      intronic chr6:90579112(+) A-I      intronic chr6:90567886(+) A-I      intronic chr6:90583120(+) A-I      intronic chr6:90555655(+) A-I      intronic chr6:90581773(+) A-I      intronic chr6:90580228(+) A-I      intronic chr6:90544746(+) A-I      intronic chr6:90564305(+) A-I      intronic chr6:90581721(+) A-I      intronic chr6:90563475(+) A-I      intronic chr6:90546764(+) A-I      intronic chr6:90582400(+) A-I      intronic chr6:90557120(+) A-I      intronic chr6:90555296(+) A-I      intronic chr6:90581591(+) A-I      intronic chr6:90559506(+) A-I      intronic chr6:90545204(+) A-I      intronic chr6:90574750(+) A-I      intronic chr6:90549288(+) A-I      intronic chr6:90555869(+) A-I      intronic chr6:90574269(+) A-I      intronic chr6:90555908(+) A-I      intronic chr6:90565466(+) A-I      intronic chr6:90567435(+) A-I      intronic chr6:90555956(+) A-I      intronic chr6:90555284(+) A-I      intronic chr6:90583168(+) A-I      intronic chr6:90549961(+) A-I      intronic chr6:90582112(+) A-I      intronic chr6:90567444(+) A-I      intronic chr6:90567699(+) A-I      intronic chr6:90568620(+) A-I      intronic chr6:90562511(+) A-I      intronic chr6:90555654(+) A-I      intronic chr6:90568782(+) A-I      intronic chr6:90556023(+) A-I      intronic chr6:90558664(+) A-I      intronic chr6:90544312(+) A-I      intronic chr6:90544409(+) A-I      intronic chr6:90567424(+) A-I      intronic chr6:90580178(+) A-I      intronic chr6:90555120(+) A-I      intronic chr6:90555640(+) A-I      intronic chr6:90579172(+) A-I      intronic chr6:90583142(+) A-I      intronic chr6:90582539(+) A-I      intronic chr6:90555984(+) A-I      intronic chr6:90555514(+) A-I      intronic chr6:90555903(+) A-I      intronic chr6:90558271(+) A-I      intronic chr6:90541142(+) A-I      intronic chr6:90549148(+) A-I      intronic chr6:90579501(+) A-I      intronic chr6:90565316(+) A-I      intronic chr6:90545946(+) A-I      intronic chr6:90543865(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	CASP8AP2	chr6:90565242(+) A-I exon CDS    15342557 chr6:90569322(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr6:90569393(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr6:90569396(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr6:90569494(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr6:90569507(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr6:90569549(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr6:90569634(+) A-I intron -    15342557 chr6:90570317(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr6:90570335(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr6:90570382(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr6:90570442(+) A-I intron -    15342557 chr6:90570459(+) A-I intron -    15342557 chr6:90570466(+) A-I intron -    15342557 chr6:90541167(+) A-G intron -    22484847 chr6:90541192(+) A-G intron -    22484847 chr6:90542629(+) G-A intron -    22484847 chr6:90543865(+) A-G intron -    22484847 chr6:90543986(+) A-G intron -    22484847 chr6:90544240(+) A-G intron -    22484847 chr6:90544312(+) A-G intron -    22484847 chr6:90544344(+) A-G intron -    22484847 chr6:90544409(+) A-G intron -    22484847 chr6:90544801(+) A-G intron -    22484847 chr6:90545063(+) A-G intron -    22484847 chr6:90545204(+) A-G intron -    22484847 chr6:90546069(+) A-G intron -    22484847 chr6:90547131(+) A-G intron -    22484847 chr6:90547301(+) T-C intron -    22484847 chr6:90549119(+) A-G intron -    22484847 chr6:90549142(+) A-G intron -    22484847 chr6:90549197(+) A-G intron -    22484847 chr6:90549281(+) A-G intron -    22484847 chr6:90549583(+) A-G intron -    22484847 chr6:90554775(+) A-G intron -    22484847 chr6:90554842(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555082(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555228(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555296(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555452(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555521(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555629(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555640(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555655(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555700(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555848(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555869(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555894(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555895(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555900(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555903(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555908(+) A-G intron -    22484847 chr6:90555909(+) A-G intron -    22484847 chr6:90556058(+) A-G intron -    22484847 chr6:90556064(+) A-G intron -    22484847 chr6:90557548(+) A-G intron -    22484847 chr6:90558148(+) A-G intron -    22484847 chr6:90558798(+) A-G intron -    22484847 chr6:90558870(+) A-G intron -    22484847 chr6:90560307(+) A-G intron -    22484847 chr6:90562511(+) A-G intron -    22484847 chr6:90563398(+) A-G intron -    22484847 chr6:90563475(+) A-G intron -    22484847 chr6:90563520(+) A-G intron -    22484847 chr6:90564064(+) A-G intron -    22484847 chr6:90564305(+) A-G intron -    22484847 chr6:90567128(+) A-G intron -    22484847 chr6:90567145(+) A-G intron -    22484847 chr6:90567157(+) A-G intron -    22484847 chr6:90567699(+) A-G intron -    22484847 chr6:90569079(+) C-G intron -    22484847 chr6:90571254(+) A-G intron -    22484847 chr6:90574269(+) A-G intron -    22484847 chr6:90574339(+) A-G intron -    22484847 chr6:90574364(+) A-G intron -    22484847 chr6:90574627(+) A-G intron -    22484847 chr6:90574906(+) A-G intron -    22484847 chr6:90579195(+) A-G intron -    22484847 chr6:90580158(+) A-G intron -    22484847 chr6:90580184(+) A-G intron -    22484847 chr6:90580192(+) A-G intron -    22484847 chr6:90580228(+) A-G intron -    22484847 chr6:90581462(+) A-G intron -    22484847 chr6:90581522(+) A-G intron -    22484847 chr6:90581721(+) A-G intron -    22484847 chr6:90581726(+) A-G intron -    22484847 chr6:90581918(+) A-G intron -    22484847 chr6:90581919(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	CASP8AP2	chr6:90539624-90539625(+) m6A 5'UTR       24284625 chr6:90539685-90539686(+) m6A 5'UTR//exon//intron       - chr6:90566862-90566863(+) m6A CDS//exon       22608085 chr6:90566881-90566882(+) m6A CDS//exon       22608085 chr6:90570551-90570552(+) m6A intron       24981863//22608085 chr6:90571881-90571882(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90571890-90571891(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90571908-90571909(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90571956-90571957(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90572036-90572037(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90572087-90572088(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863//22608085 chr6:90572180-90572181(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572202-90572203(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572221-90572222(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572249-90572250(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572285-90572286(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572312-90572313(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572319-90572320(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572403-90572404(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572434-90572435(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572453-90572454(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572462-90572463(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572512-90572513(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572540-90572541(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//27773535//22608085 chr6:90572560-90572561(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//27773535//22608085 chr6:90572686-90572687(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572698-90572699(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572743-90572744(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572751-90572752(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572761-90572762(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572825-90572826(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572832-90572833(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572855-90572856(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90572912-90572913(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572925-90572926(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572937-90572938(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572946-90572947(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572966-90572967(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572975-90572976(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90572982-90572983(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90573072-90573073(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573079-90573080(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573085-90573086(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573115-90573116(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573231-90573232(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573260-90573261(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573290-90573291(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573306-90573307(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573326-90573327(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573356-90573357(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573378-90573379(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573462-90573463(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573495-90573496(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573527-90573528(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573582-90573583(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573598-90573599(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90573702-90573703(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//22608085 chr6:90573858-90573859(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr6:90573882-90573883(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr6:90573895-90573896(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr6:90573918-90573919(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr6:90573980-90573981(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr6:90574022-90574023(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//22575960//22608085 chr6:90575776-90575777(+) m6A CDS//exon//intron       22608085 chr6:90575838-90575839(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90575846-90575847(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90575910-90575911(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr6:90575953-90575954(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90575964-90575965(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90575985-90575986(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90576008-90576009(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90576036-90576037(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90576113-90576114(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//22608085 chr6:90576117-90576118(+) Gm CDS//exon//intron       - chr6:90576149-90576150(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//22608085 chr6:90576503-90576504(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90576513-90576514(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90576521-90576522(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90576562-90576563(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//22608085 chr6:90576610-90576611(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//22608085 chr6:90576667-90576668(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90576745-90576746(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr6:90576837-90576838(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr6:90576890-90576891(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr6:90576982-90576983(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90577026-90577027(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90577050-90577051(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr6:90577679-90577680(+) m6A CDS//exon//intron       22608085 chr6:90577721-90577722(+) m6A CDS//exon//intron       22608085 chr6:90577745-90577746(+) m6A CDS//exon//intron       22608085 chr6:90577774-90577775(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//22608085 chr6:90577807-90577808(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//22608085 chr6:90577850-90577851(+) m6A CDS//exon//intron       22608085 chr6:90577869-90577870(+) m6A CDS//exon//intron       22608085 chr6:90577974-90577975(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578039-90578040(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578050-90578051(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578088-90578089(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863//22608085 chr6:90578095-90578096(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863//22608085 chr6:90578185-90578186(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr6:90578290-90578291(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578356-90578357(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr6:90578385-90578386(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578490-90578491(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr6:90578521-90578522(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578552-90578553(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578565-90578566(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578589-90578590(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578597-90578598(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:90578796-90578797(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//22608085 chr6:90581062-90581063(+) m6A CDS//exon       22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	CASP8AP2	Chromatin K562 cells     - Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)     - Membrane HCC cell line (HepG2)     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Colon cancer cells     24393600 Nucleus K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-US25-1-5p
Interactor2: CASP8AP2

Evidence Support:

Strong-Evidence	RISC-IP
Support Database	ViRBase

References:

PMID	20585629	Target region	5'UTR
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	HEK293 cells	Interactor2 expression	None
Description	Here, we identify cellular transcript targets of one of the most highly expressed HCMV encoded miRNAs, miR-US25-1, using a recently developed biochemical approach called RISC immunoprecipitation. Strikingly, the majority of identified transcripts contained miR-US25-1 target sites within the 5'UTR rather than the 3'UTR.