Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00506190

  Virus:  

Human herpesvirus 5 strain AD169

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.7311

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US25-1-5p:  MIMAT0001581          TMPO:  NM_001307975     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-US25-1-5p	TMPO
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0001581	7112
Organism	Human herpesvirus 5 strain AD169	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	CMD1T//LAP2//LEMD4//PRO0868//TP

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	TMPO	chr12:98943127(+) A-I      3'UTR chr12:98923433(+) A-I      intronic chr12:98942882(+) A-I      3'UTR chr12:98943082(+) A-I      3'UTR chr12:98943106(+) A-I      3'UTR chr12:98923462(+) A-I      intronic chr12:98921042(+) A-I      intronic chr12:98921027(+) A-I      intronic chr12:98923463(+) A-I      intronic chr12:98923973(+) A-I      intronic chr12:98923981(+) A-I      intronic chr12:98936521(+) A-I      intronic chr12:98943161(+) A-I      3'UTR chr12:98936542(+) A-I      intronic chr12:98940356(+) A-I      intronic chr12:98917549(+) A-I      intronic chr12:98936478(+) A-I      intronic chr12:98917580(+) A-I      intronic chr12:98921015(+) A-I      intronic chr12:98921014(+) A-I      intronic chr12:98919318(+) A-I      intronic chr12:98915625(+) A-I      intronic chr12:98934365(+) A-I      intronic chr12:98936473(+) A-I      intronic chr12:98940438(+) A-I      intronic chr12:98913838(+) A-I      intronic chr12:98922172(+) A-I      intronic chr12:98921271(+) A-I      intronic chr12:98921099(+) A-I      intronic chr12:98919451(+) A-I      intronic chr12:98922579(+) A-I      intronic chr12:98922608(+) A-I      intronic chr12:98924016(+) A-I      intronic chr12:98922720(+) A-I      intronic chr12:98922885(+) A-I      intronic chr12:98922237(+) A-I      intronic chr12:98918634(+) A-I      intronic chr12:98918632(+) A-I      intronic chr12:98918615(+) A-I      intronic chr12:98918607(+) A-I      intronic chr12:98918569(+) A-I      intronic chr12:98922184(+) A-I      intronic chr12:98918553(+) A-I      intronic chr12:98936615(+) A-I      intronic chr12:98918546(+) A-I      intronic chr12:98918537(+) A-I      intronic chr12:98922943(+) A-I      intronic chr12:98918489(+) A-I      intronic chr12:98940342(+) A-I      intronic chr12:98922262(+) A-I      intronic chr12:98915150(+) A-I      intronic chr12:98923085(+) A-I      intronic chr12:98923109(+) A-I      intronic chr12:98918476(+) A-I      intronic chr12:98923393(+) A-I      intronic chr12:98918471(+) A-I      intronic chr12:98923454(+) A-I      intronic chr12:98918467(+) A-I      intronic chr12:98915142(+) A-I      intronic chr12:98923860(+) A-I      intronic chr12:98922315(+) A-I      intronic chr12:98923934(+) A-I      intronic chr12:98918200(+) A-I      intronic chr12:98923965(+) A-I      intronic chr12:98924000(+) A-I      intronic chr12:98924008(+) A-I      intronic chr12:98934296(+) A-I      intronic chr12:98932235(+) A-I      intronic chr12:98918165(+) A-I      intronic chr12:98932270(+) A-I      intronic chr12:98918127(+) A-I      intronic chr12:98932292(+) A-I      intronic chr12:98932803(+) A-I      intronic chr12:98932817(+) A-I      intronic chr12:98917731(+) A-I      intronic chr12:98917727(+) A-I      intronic chr12:98922329(+) A-I      intronic chr12:98917639(+) A-I      intronic chr12:98932831(+) A-I      intronic chr12:98917634(+) A-I      intronic chr12:98932839(+) A-I      intronic chr12:98933312(+) A-I      intronic chr12:98917583(+) A-I      intronic chr12:98919317(+) A-I      intronic chr12:98922503(+) A-I      intronic chr12:98910674(+) A-I      intronic chr12:98934234(+) A-I      intronic chr12:98934274(+) A-I      intronic chr12:98917517(+) A-I      intronic chr12:98917221(+) A-I      intronic chr12:98915726(+) A-I      intronic chr12:98934283(+) A-I      intronic chr12:98915691(+) A-I      intronic chr12:98934322(+) A-I      intronic chr12:98915608(+) A-I      intronic chr12:98940873(+) A-I      intronic chr12:98915703(+) A-I      intronic chr12:98933474(+) A-I      intronic chr12:98940953(+) A-I      intronic chr12:98914250(+) A-I      intronic chr12:98940907(+) A-I      intronic chr12:98933435(+) A-I      intronic chr12:98915769(+) A-I      intronic chr12:98922555(+) A-I      intronic chr12:98933413(+) A-I      intronic chr12:98932899(+) A-I      intronic chr12:98922639(+) A-I      intronic chr12:98922468(+) A-I      intronic chr12:98940993(+) A-I      intronic chr12:98932814(+) A-I      intronic chr12:98932819(+) A-I      intronic chr12:98941042(+) A-I      intronic chr12:98922547(+) A-I      intronic chr12:98932818(+) A-I      intronic chr12:98936456(+) A-I      intronic chr12:98918203(+) A-I      intronic chr12:98917216(+) A-I      intronic chr12:98915530(+) A-I      intronic chr12:98915097(+) A-I      intronic chr12:98917070(+) A-I      intronic chr12:98915688(+) A-I      intronic chr12:98923914(+) A-I      intronic chr12:98922587(+) A-I      intronic chr12:98936447(+) A-I      intronic chr12:98924004(+) A-I      intronic chr12:98925156(+) A-I      intronic chr12:98922551(+) A-I      intronic chr12:98923558(+) A-I      intronic chr12:98917302(+) A-I      intronic chr12:98919528(+) A-I      intronic chr12:98922973(+) A-I      intronic chr12:98934286(+) A-I      intronic chr12:98914573(+) A-I      intronic chr12:98936493(+) A-I      intronic chr12:98917620(+) A-I      intronic chr12:98922488(+) A-I      intronic chr12:98940983(+) A-I      intronic chr12:98940954(+) A-I      intronic chr12:98923605(+) A-I      intronic chr12:98922880(+) A-I      intronic chr12:98915782(+) A-I      intronic chr12:98940931(+) A-I      intronic chr12:98910762(+) A-I      intronic chr12:98923611(+) A-I      intronic chr12:98936458(+) A-I      intronic chr12:98941067(+) A-I      intronic chr12:98918517(+) A-I      intronic chr12:98925275(+) A-I      intronic chr12:98940971(+) A-I      intronic chr12:98933544(+) A-I      intronic chr12:98942810(+) A-I      3'UTR chr12:98942827(+) A-I      3'UTR chr12:98942878(+) A-I      3'UTR chr12:98942831(+) A-I      3'UTR chr12:98942833(+) A-I      3'UTR chr12:98942635(+) A-I      3'UTR chr12:98943046(+) A-I      3'UTR chr12:98942851(+) A-I      3'UTR chr12:98942687(+) A-I      3'UTR chr12:98942692(+) A-I      3'UTR chr12:98942713(+) A-I      3'UTR chr12:98943214(+) A-I      3'UTR chr12:98942910(+) A-I      3'UTR chr12:98942690(+) A-I      3'UTR chr12:98943149(+) A-I      3'UTR chr12:98943083(+) A-I      3'UTR chr12:98943096(+) A-I      3'UTR chr12:98942847(+) A-I      3'UTR chr12:98943216(+) A-I      3'UTR chr12:98943202(+) A-I      3'UTR chr12:98942903(+) A-I      3'UTR chr12:98942880(+) A-I      3'UTR chr12:98943011(+) A-I      3'UTR chr12:98942904(+) A-I      3'UTR chr12:98942752(+) A-I      3'UTR chr12:98942695(+) A-I      3'UTR chr12:98942888(+) A-I      3'UTR chr12:98915164(+) A-I      intronic chr12:98917238(+) A-I      intronic chr12:98916028(+) A-I      intronic chr12:98915835(+) A-I      intronic chr12:98918235(+) A-I      intronic chr12:98932778(+) A-I      intronic chr12:98936362(+) A-I      intronic chr12:98936455(+) A-I      intronic chr12:98915674(+) A-I      intronic chr12:98921021(+) A-I      intronic chr12:98932230(+) A-I      intronic chr12:98940349(+) A-I      intronic chr12:98933352(+) A-I      intronic chr12:98918472(+) A-I      intronic chr12:98940354(+) A-I      intronic chr12:98915770(+) A-I      intronic chr12:98915647(+) A-I      intronic chr12:98932210(+) A-I      intronic chr12:98924034(+) A-I      intronic chr12:98933486(+) A-I      intronic chr12:98936515(+) A-I      intronic chr12:98917215(+) A-I      intronic chr12:98936448(+) A-I      intronic chr12:98932351(+) A-I      intronic chr12:98932820(+) A-I      intronic chr12:98914433(+) A-I      intronic chr12:98933391(+) A-I      intronic chr12:98920527(+) A-I      intronic chr12:98933432(+) A-I      intronic chr12:98918191(+) A-I      intronic chr12:98917663(+) A-I      intronic chr12:98917637(+) A-I      intronic chr12:98932248(+) A-I      intronic chr12:98939785(+) A-I      intronic chr12:98934419(+) A-I      intronic chr12:98917172(+) A-I      intronic chr12:98922643(+) A-I      intronic chr12:98932715(+) A-I      intronic chr12:98917571(+) A-I      intronic chr12:98913855(+) A-I      intronic chr12:98932414(+) A-I      intronic chr12:98922538(+) A-I      intronic chr12:98936525(+) A-I      intronic chr12:98934185(+) A-I      intronic chr12:98918497(+) A-I      intronic chr12:98919363(+) A-I      intronic chr12:98940346(+) A-I      intronic chr12:98936551(+) A-I      intronic chr12:98932884(+) A-I      intronic chr12:98922585(+) A-I      intronic chr12:98919263(+) A-I      intronic chr12:98933526(+) A-I      intronic chr12:98923847(+) A-I      intronic chr12:98933369(+) A-I      intronic chr12:98915637(+) A-I      intronic chr12:98936401(+) A-I      intronic chr12:98932906(+) A-I      intronic chr12:98917593(+) A-I      intronic chr12:98932764(+) A-I      intronic chr12:98922728(+) A-I      intronic chr12:98915527(+) A-I      intronic chr12:98936516(+) A-I      intronic chr12:98918096(+) A-I      intronic chr12:98940387(+) A-I      intronic chr12:98936489(+) A-I      intronic chr12:98936529(+) A-I      intronic chr12:98920609(+) A-I      intronic chr12:98922888(+) A-I      intronic chr12:98916055(+) A-I      intronic chr12:98932257(+) A-I      intronic chr12:98932180(+) A-I      intronic chr12:98918513(+) A-I      intronic chr12:98932393(+) A-I      intronic chr12:98924992(+) A-I      intronic chr12:98933417(+) A-I      intronic chr12:98917176(+) A-I      intronic chr12:98920482(+) A-I      intronic chr12:98934339(+) A-I      intronic chr12:98922925(+) A-I      intronic chr12:98933355(+) A-I      intronic chr12:98922105(+) A-I      intronic chr12:98914343(+) A-I      intronic chr12:98932231(+) A-I      intronic chr12:98918465(+) A-I      intronic chr12:98936425(+) A-I      intronic chr12:98922622(+) A-I      intronic chr12:98923539(+) A-I      intronic chr12:98932260(+) A-I      intronic chr12:98932169(+) A-I      intronic chr12:98936385(+) A-I      intronic chr12:98921159(+) A-I      intronic chr12:98940381(+) A-I      intronic chr12:98933491(+) A-I      intronic chr12:98940391(+) A-I      intronic chr12:98940424(+) A-I      intronic chr12:98917518(+) A-I      intronic chr12:98936557(+) A-I      intronic chr12:98933282(+) A-I      intronic chr12:98915697(+) A-I      intronic chr12:98911844(+) A-I      intronic chr12:98925204(+) A-I      intronic chr12:98922630(+) A-I      intronic chr12:98934237(+) A-I      intronic chr12:98930315(+) A-I      intronic chr12:98922932(+) A-I      intronic chr12:98934226(+) A-I      intronic chr12:98933462(+) A-I      intronic chr12:98918555(+) A-I      intronic chr12:98922586(+) A-I      intronic chr12:98917242(+) A-I      intronic chr12:98934257(+) A-I      intronic chr12:98932185(+) A-I      intronic chr12:98923988(+) A-I      intronic chr12:98934256(+) A-I      intronic chr12:98936384(+) A-I      intronic chr12:98933294(+) A-I      intronic chr12:98918243(+) A-I      intronic chr12:98917719(+) A-I      intronic chr12:98940364(+) A-I      intronic chr12:98924777(+) A-I      intronic chr12:98936494(+) A-I      intronic chr12:98923366(+) A-I      intronic chr12:98918295(+) A-I      intronic chr12:98940404(+) A-I      intronic chr12:98932957(+) A-I      intronic chr12:98917248(+) A-I      intronic chr12:98917733(+) A-I      intronic chr12:98932835(+) A-I      intronic chr12:98924772(+) A-I      intronic chr12:98917197(+) A-I      intronic chr12:98932867(+) A-I      intronic chr12:98910772(+) A-I      intronic chr12:98940379(+) A-I      intronic chr12:98923428(+) A-I      intronic chr12:98911801(+) A-I      intronic chr12:98918097(+) A-I      intronic chr12:98917554(+) A-I      intronic chr12:98922614(+) A-I      intronic chr12:98918301(+) A-I      intronic chr12:98918395(+) A-I      intronic chr12:98916054(+) A-I      intronic chr12:98932874(+) A-I      intronic chr12:98917587(+) A-I      intronic chr12:98922590(+) A-I      intronic chr12:98918475(+) A-I      intronic chr12:98933442(+) A-I      intronic chr12:98917611(+) A-I      intronic chr12:98934251(+) A-I      intronic chr12:98917619(+) A-I      intronic chr12:98940386(+) A-I      intronic chr12:98940410(+) A-I      intronic chr12:98936378(+) A-I      intronic chr12:98932923(+) A-I      intronic chr12:98934430(+) A-I      intronic chr12:98924072(+) A-I      intronic chr12:98943140(+) A-I      3'UTR chr12:98943103(+) A-I      3'UTR chr12:98942808(+) A-I      3'UTR chr12:98942886(+) A-I      3'UTR chr12:98943187(+) A-I      3'UTR chr12:98942885(+) A-I      3'UTR chr12:98942819(+) A-I      3'UTR chr12:98942778(+) A-I      3'UTR chr12:98943137(+) A-I      3'UTR chr12:98943058(+) A-I      3'UTR chr12:98943200(+) A-I      3'UTR chr12:98942820(+) A-I      3'UTR chr12:98942849(+) A-I      3'UTR chr12:98943201(+) A-I      3'UTR chr12:98942811(+) A-I      3'UTR chr12:98942824(+) A-I      3'UTR chr12:98943182(+) A-I      3'UTR chr12:98943042(+) A-I      3'UTR chr12:98942698(+) A-I      3'UTR chr12:98942912(+) A-I      3'UTR chr12:98943021(+) A-I      3'UTR chr12:98942797(+) A-I      3'UTR chr12:98943107(+) A-I      3'UTR chr12:98942696(+) A-I      3'UTR chr12:98942909(+) A-I      3'UTR chr12:98942643(+) A-I      3'UTR chr12:98943162(+) A-I      3'UTR chr12:98942805(+) A-I      3'UTR chr12:98943003(+) A-I      3'UTR chr12:98943018(+) A-I      3'UTR chr12:98942844(+) A-I      3'UTR chr12:98943033(+) A-I      3'UTR chr12:98942644(+) A-I      3'UTR chr12:98942688(+) A-I      3'UTR chr12:98942621(+) A-I      3'UTR chr12:98943102(+) A-I      3'UTR chr12:98942665(+) A-I      3'UTR

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	TMPO	chr12:98942688(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22327324 chr12:98942695(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22327324 chr12:98943018(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22327324 chr12:98943033(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22327324 chr12:98943042(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22327324 chr12:98922630(+) A-I intron -    22327324 chr12:98932899(+) A-I intron -    22327324 chr12:98940386(+) A-I intron -    22327324 chr12:98942643(+) A-I intron -    22327324 chr12:98942805(+) A-I intron -    22327324 chr12:98942820(+) A-I intron -    22327324 chr12:98942824(+) A-I intron -    22327324 chr12:98942831(+) A-I intron -    22327324 chr12:98942885(+) A-I intron -    22327324 chr12:98942886(+) A-I intron -    22327324 chr12:98943011(+) A-I intron -    22327324 chr12:98943102(+) A-I intron -    22327324 chr12:98943103(+) A-I intron -    22327324 chr12:98943182(+) A-I intron -    22327324 chr12:98942819(+) A-I intron -    21960545 chr12:98929408(+) C-A intron -    21725310 chr12:98917518(+) A-G intron -    22484847 chr12:98920609(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922630(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922728(+) A-G intron -    22484847 chr12:98923366(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932814(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932819(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932835(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932899(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932923(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933435(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933462(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936448(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936493(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936494(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936515(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936516(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936525(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936529(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940386(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940387(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940404(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942621(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942643(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942688(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942690(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942695(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942696(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942698(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942805(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942820(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942824(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942847(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942878(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942880(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942885(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942886(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942888(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942904(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942912(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943011(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943018(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943021(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943033(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943042(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943083(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943096(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943102(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943103(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943137(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943149(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943182(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943187(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943201(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943202(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943214(+) A-G intron -    22484847 chr12:98913165(+) A-C intron -    22484847 chr12:98913855(+) A-G intron -    22484847 chr12:98915097(+) A-G intron -    22484847 chr12:98915527(+) A-G intron -    22484847 chr12:98915530(+) A-G intron -    22484847 chr12:98915637(+) A-G intron -    22484847 chr12:98915647(+) A-G intron -    22484847 chr12:98915674(+) A-G intron -    22484847 chr12:98915703(+) A-G intron -    22484847 chr12:98916028(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917070(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917215(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917216(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917238(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917248(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917554(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917571(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917587(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917593(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917611(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917619(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917620(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917637(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917663(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917719(+) A-G intron -    22484847 chr12:98917733(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918096(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918191(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918203(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918235(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918243(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918295(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918301(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918465(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918472(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918475(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918497(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918513(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918517(+) A-G intron -    22484847 chr12:98918555(+) A-G intron -    22484847 chr12:98919363(+) A-G intron -    22484847 chr12:98920482(+) A-G intron -    22484847 chr12:98920527(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922468(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922551(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922555(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922585(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922586(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922587(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922590(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922614(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922622(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922639(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922643(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922880(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922888(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922925(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922932(+) A-G intron -    22484847 chr12:98922973(+) A-G intron -    22484847 chr12:98924797(+) C-T intron -    22484847 chr12:98925128(+) T-C intron -    22484847 chr12:98925233(+) G-A intron -    22484847 chr12:98932173(+) G-A intron -    22484847 chr12:98932185(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932231(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932257(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932351(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932820(+) A-G intron -    22484847 chr12:98932867(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933355(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933369(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933391(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933413(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933432(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933474(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933486(+) A-G intron -    22484847 chr12:98933526(+) A-G intron -    22484847 chr12:98934257(+) A-G intron -    22484847 chr12:98934286(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936447(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936455(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936458(+) A-G intron -    22484847 chr12:98936462(+) T-C intron -    22484847 chr12:98936472(+) G-A intron -    22484847 chr12:98936551(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940349(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940354(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940364(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940379(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940381(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940391(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940424(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940954(+) A-G intron -    22484847 chr12:98940971(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942808(+) A-G intron -    22484847 chr12:98942819(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943107(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943140(+) A-G intron -    22484847 chr12:98943195(+) T-C intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	TMPO	chr12:98909664-98909665(+) m6A CDS//intron       24284625//24981863//27371828//27773536//22575960 chr12:98909685-98909686(+) m6A CDS//intron       24284625//24981863//26404942//27371828//27773536//22575960 chr12:98909835-98909836(+) m6A CDS//exon       24981863//27371828//27773536//22575960 chr12:98909842-98909843(+) Cm CDS//exon       - chr12:98910209-98910210(+) m6A exon//intron       24284625//24981863//27371828//27773536 chr12:98910244-98910245(+) m6A exon//intron       24284625//24981863//27371828//27773536 chr12:98921619-98921620(+) m6A exon//intron       24981863 chr12:98921650-98921651(+) m6A exon//intron       24981863 chr12:98921678-98921679(+) m6A CDS//exon       26404942 chr12:98921686-98921687(+) m6A CDS//exon       26404942 chr12:98921692-98921693(+) m6A CDS//exon       26404942 chr12:98925459-98925460(+) m6A CDS//exon       26404942//27773535 chr12:98925494-98925495(+) m6A CDS//exon       27773535 chr12:98925503-98925504(+) m6A CDS//exon       27773535 chr12:98925510-98925511(+) m6A CDS//exon       27773535 chr12:98925700-98925701(+) m6A exon//intron       24284625//24981863//27773535 chr12:98929406-98929407(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863 chr12:98931286-98931287(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535 chr12:98931308-98931309(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535 chr12:98931460-98931461(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr12:98938034-98938035(+) m6A CDS//exon//intron       24981863 chr12:98938043-98938044(+) m6A CDS//exon//intron       24981863 chr12:98938066-98938067(+) m6A CDS//exon//intron       24981863 chr12:98938112-98938113(+) m6A CDS//exon//intron       24981863 chr12:98938225-98938226(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//27773535 chr12:98938233-98938234(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//27773535 chr12:98938285-98938286(+) m6A CDS//exon//intron       24981863 chr12:98938439-98938440(+) m6A exon//intron       24981863 chr12:98938795-98938796(+) m6A CDS//exon//intron       24981863 chr12:98938820-98938821(+) m6A CDS//exon//intron       24981863 chr12:98940148-98940149(+) m6A CDS//exon       24981863 chr12:98941365-98941366(+) m6A CDS//exon       24981863 chr12:98941398-98941399(+) m6A CDS//exon       24284625 chr12:98941483-98941484(+) m6A CDS//exon       24284625//22575960 chr12:98941576-98941577(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22575960 chr12:98941692-98941693(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr12:98941721-98941722(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr12:98941775-98941776(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr12:98941794-98941795(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr12:98941815-98941816(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr12:98941822-98941823(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr12:98941873-98941874(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr12:98941968-98941969(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:98942697-98942698(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:98942720-98942721(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:98942796-98942797(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:98942819-98942820(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:98943161-98943162(+) m6A 3'UTR       - chr12:98943305-98943306(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:98943369-98943370(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:98943382-98943383(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:98943914-98943915(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:98943924-98943925(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:98943945-98943946(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:98944048-98944049(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	TMPO	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     - Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HeLa-S3 cells     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-US25-1-5p
Interactor2: TMPO

Evidence Support:

Strong-Evidence	RISC-IP
Support Database	ViRBase

References:

PMID	20585629	Target region	5'UTR
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	HEK293 cells	Interactor2 expression	None
Description	Here, we identify cellular transcript targets of one of the most highly expressed HCMV encoded miRNAs, miR-US25-1, using a recently developed biochemical approach called RISC immunoprecipitation. Strikingly, the majority of identified transcripts contained miR-US25-1 target sites within the 5'UTR rather than the 3'UTR.