Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00504233

  Virus:  

Human herpesvirus 5 strain AD169

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.7311

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US25-1-5p:           MAP3K3:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hcmv-miR-US25-1-5p MAP3K3
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0001581 4215
Organism Human herpesvirus 5 strain AD169 Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - MAPKKK3//MEKK3

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR MAP3K3
chr17:61749493(+) A-I      intronic
chr17:61715516(+) A-I      intronic
chr17:61715469(+) A-I      intronic
chr17:61747793(+) A-I      intronic
chr17:61715478(+) A-I      intronic
chr17:61710381(+) A-I      intronic
chr17:61715479(+) A-I      intronic
chr17:61749482(+) A-I      intronic
chr17:61715500(+) A-I      intronic
chr17:61761288(+) A-I      intronic
chr17:61740803(+) A-I      intronic
chr17:61720284(+) A-I      intronic
chr17:61720244(+) A-I      intronic
chr17:61761283(+) A-I      intronic
chr17:61725983(+) A-I      intronic
chr17:61732875(+) A-I      intronic
chr17:61761267(+) A-I      intronic
chr17:61749535(+) A-I      intronic
chr17:61749532(+) A-I      intronic
chr17:61749512(+) A-I      intronic
chr17:61749496(+) A-I      intronic
chr17:61715503(+) A-I      intronic
chr17:61720247(+) A-I      intronic
chr17:61715515(+) A-I      intronic
chr17:61719758(+) A-I      intronic
chr17:61719770(+) A-I      intronic
chr17:61749487(+) A-I      intronic
chr17:61749484(+) A-I      intronic
chr17:61740097(+) A-I      intronic
chr17:61710412(+) A-I      intronic
chr17:61719786(+) A-I      intronic
chr17:61715662(+) A-I      intronic
chr17:61720257(+) A-I      intronic
chr17:61720270(+) A-I      intronic
chr17:61747747(+) A-I      intronic
chr17:61747733(+) A-I      intronic
chr17:61715664(+) A-I      intronic
chr17:61725961(+) A-I      intronic
chr17:61715694(+) A-I      intronic
chr17:61715672(+) A-I      intronic
chr17:61715668(+) A-I      intronic
chr17:61740751(+) A-I      intronic
chr17:61725922(+) A-I      intronic
chr17:61725965(+) A-I      intronic
chr17:61725966(+) A-I      intronic
chr17:61725968(+) A-I      intronic
chr17:61740742(+) A-I      intronic
chr17:61749492(+) A-I      intronic
chr17:61740741(+) A-I      intronic
chr17:61732925(+) A-I      intronic
chr17:61740774(+) A-I      intronic
chr17:61746981(+) A-I      intronic
chr17:61747212(+) A-I      intronic
chr17:61747309(+) A-I      intronic
chr17:61715456(+) A-I      intronic
chr17:61756946(+) A-I      intronic
chr17:61756487(+) A-I      intronic
chr17:61756483(+) A-I      intronic
chr17:61756368(+) A-I      intronic
chr17:61756225(+) A-I      intronic
chr17:61756203(+) A-I      intronic
chr17:61751805(+) A-I      intronic
chr17:61751361(+) A-I      intronic
chr17:61751199(+) A-I      intronic
chr17:61751037(+) A-I      intronic
chr17:61751013(+) A-I      intronic
chr17:61749613(+) A-I      intronic
chr17:61749588(+) A-I      intronic
chr17:61749555(+) A-I      intronic
chr17:61749490(+) A-I      intronic
chr17:61749467(+) A-I      intronic
chr17:61749448(+) A-I      intronic
chr17:61749444(+) A-I      intronic
chr17:61749443(+) A-I      intronic
chr17:61749396(+) A-I      intronic
chr17:61748813(+) A-I      intronic
chr17:61748801(+) A-I      intronic
chr17:61748790(+) A-I      intronic
chr17:61748755(+) A-I      intronic
chr17:61740704(+) A-I      intronic
chr17:61748742(+) A-I      intronic
chr17:61748733(+) A-I      intronic
chr17:61748716(+) A-I      intronic
chr17:61748715(+) A-I      intronic
chr17:61747913(+) A-I      intronic
chr17:61747903(+) A-I      intronic
chr17:61747893(+) A-I      intronic
chr17:61747888(+) A-I      intronic
chr17:61747858(+) A-I      intronic
chr17:61747836(+) A-I      intronic
chr17:61747832(+) A-I      intronic
chr17:61747828(+) A-I      intronic
chr17:61747796(+) A-I      intronic
chr17:61747761(+) A-I      intronic
chr17:61747412(+) A-I      intronic
chr17:61747395(+) A-I      intronic
chr17:61747311(+) A-I      intronic
chr17:61747304(+) A-I      intronic
chr17:61747285(+) A-I      intronic
chr17:61747279(+) A-I      intronic
chr17:61747277(+) A-I      intronic
chr17:61747207(+) A-I      intronic
chr17:61747072(+) A-I      intronic
chr17:61747055(+) A-I      intronic
chr17:61747047(+) A-I      intronic
chr17:61746946(+) A-I      intronic
chr17:61746880(+) A-I      intronic
chr17:61742777(+) A-I      intronic
chr17:61742712(+) A-I      intronic
chr17:61742606(+) A-I      intronic
chr17:61742505(+) A-I      intronic
chr17:61742503(+) A-I      intronic
chr17:61742453(+) A-I      intronic
chr17:61742448(+) A-I      intronic
chr17:61742434(+) A-I      intronic
chr17:61742429(+) A-I      intronic
chr17:61742413(+) A-I      intronic
chr17:61742407(+) A-I      intronic
chr17:61740849(+) A-I      intronic
chr17:61740832(+) A-I      intronic
chr17:61740807(+) A-I      intronic
chr17:61740720(+) A-I      intronic
chr17:61740710(+) A-I      intronic
chr17:61740705(+) A-I      intronic
chr17:61740318(+) A-I      intronic
chr17:61740198(+) A-I      intronic
chr17:61740159(+) A-I      intronic
chr17:61740087(+) A-I      intronic
chr17:61740082(+) A-I      intronic
chr17:61739725(+) A-I      intronic
chr17:61739537(+) A-I      intronic
chr17:61739511(+) A-I      intronic
chr17:61739492(+) A-I      intronic
chr17:61739412(+) A-I      intronic
chr17:61739404(+) A-I      intronic
chr17:61739352(+) A-I      intronic
chr17:61739348(+) A-I      intronic
chr17:61739252(+) A-I      intronic
chr17:61739247(+) A-I      intronic
chr17:61739246(+) A-I      intronic
chr17:61739244(+) A-I      intronic
chr17:61739235(+) A-I      intronic
chr17:61739217(+) A-I      intronic
chr17:61739200(+) A-I      intronic
chr17:61738500(+) A-I      intronic
chr17:61737076(+) A-I      intronic
chr17:61737059(+) A-I      intronic
chr17:61736358(+) A-I      intronic
chr17:61736279(+) A-I      intronic
chr17:61736234(+) A-I      intronic
chr17:61736115(+) A-I      intronic
chr17:61733505(+) A-I      intronic
chr17:61733074(+) A-I      intronic
chr17:61732915(+) A-I      intronic
chr17:61732302(+) A-I      intronic
chr17:61732285(+) A-I      intronic
chr17:61728739(+) A-I      intronic
chr17:61728164(+) A-I      intronic
chr17:61728102(+) A-I      intronic
chr17:61726547(+) A-I      intronic
chr17:61725931(+) A-I      intronic
chr17:61722645(+) A-I      intronic
chr17:61722584(+) A-I      intronic
chr17:61722583(+) A-I      intronic
chr17:61721674(+) A-I      intronic
chr17:61720800(+) A-I      intronic
chr17:61720786(+) A-I      intronic
chr17:61720395(+) A-I      intronic
chr17:61719943(+) A-I      intronic
chr17:61719939(+) A-I      intronic
chr17:61719756(+) A-I      intronic
chr17:61718720(+) A-I      intronic
chr17:61716158(+) A-I      intronic
chr17:61710521(+) A-I      intronic
chr17:61710429(+) A-I      intronic
chr17:61710426(+) A-I      intronic
chr17:61708566(+) A-I      intronic
chr17:61705862(+) A-I      intronic
chr17:61705860(+) A-I      intronic
chr17:61704948(+) A-I      intronic
chr17:61704944(+) A-I      intronic
chr17:61704864(+) A-I      intronic
chr17:61703310(+) A-I      intronic
chr17:61703296(+) A-I      intronic
chr17:61703170(+) A-I      intronic
chr17:61720816(+) A-I      intronic
chr17:61748745(+) A-I      intronic
chr17:61762112(+) A-I      intronic
chr17:61762111(+) A-I      intronic
chr17:61762074(+) A-I      intronic
chr17:61762052(+) A-I      intronic
chr17:61762049(+) A-I      intronic
chr17:61742710(+) A-I      intronic
chr17:61739209(+) A-I      intronic
chr17:61720252(+) A-I      intronic
chr17:61741077(+) A-I      intronic
chr17:61719842(+) A-I      intronic
chr17:61721655(+) A-I      intronic
chr17:61739590(+) A-I      intronic
chr17:61738468(+) A-I      intronic
chr17:61739669(+) A-I      intronic
chr17:61747778(+) A-I      intronic
chr17:61757313(+) A-I      intronic
chr17:61728285(+) A-I      intronic
chr17:61722623(+) A-I      intronic
chr17:61740271(+) A-I      intronic
chr17:61742665(+) A-I      intronic
chr17:61739716(+) A-I      intronic
chr17:61719853(+) A-I      intronic
chr17:61746850(+) A-I      intronic
chr17:61720752(+) A-I      intronic
chr17:61739687(+) A-I      intronic
chr17:61708383(+) A-I      intronic
chr17:61742736(+) A-I      intronic
chr17:61720392(+) A-I      intronic
chr17:61747086(+) A-I      intronic
chr17:61747342(+) A-I      intronic
chr17:61747229(+) A-I      intronic
chr17:61720394(+) A-I      intronic
chr17:61757106(+) A-I      intronic
chr17:61737010(+) A-I      intronic
chr17:61746909(+) A-I      intronic
chr17:61748876(+) A-I      intronic
chr17:61743725(+) A-I      intronic
chr17:61751675(+) A-I      intronic
chr17:61751015(+) A-I      intronic
chr17:61747688(+) A-I      intronic
chr17:61756554(+) A-I      intronic
chr17:61747073(+) A-I      intronic
chr17:61749523(+) A-I      intronic
chr17:61731503(+) A-I      intronic
chr17:61739546(+) A-I      intronic
chr17:61720142(+) A-I      intronic
chr17:61762038(+) A-I      intronic
chr17:61703174(+) A-I      intronic
chr17:61736196(+) A-I      intronic
chr17:61739762(+) A-I      intronic
chr17:61761255(+) A-I      intronic
chr17:61739660(+) A-I      intronic
chr17:61751151(+) A-I      intronic
chr17:61738082(+) A-I      intronic
chr17:61751852(+) A-I      intronic
chr17:61737168(+) A-I      intronic
chr17:61732937(+) A-I      intronic
chr17:61756310(+) A-I      intronic
chr17:61762119(+) A-I      intronic
chr17:61747378(+) A-I      intronic
chr17:61727007(+) A-I      intronic
chr17:61742543(+) A-I      intronic
chr17:61721598(+) A-I      intronic
chr17:61751840(+) A-I      intronic
chr17:61747316(+) A-I      intronic
chr17:61726676(+) A-I      intronic
chr17:61748888(+) A-I      intronic
chr17:61739724(+) A-I      intronic
chr17:61746933(+) A-I      intronic
chr17:61747000(+) A-I      intronic
chr17:61762042(+) A-I      intronic
chr17:61742643(+) A-I      intronic
chr17:61720678(+) A-I      intronic
chr17:61740184(+) A-I      intronic
chr17:61742732(+) A-I      intronic
chr17:61749522(+) A-I      intronic
chr17:61747015(+) A-I      intronic
chr17:61720686(+) A-I      intronic
chr17:61742517(+) A-I      intronic
chr17:61708391(+) A-I      intronic
chr17:61707805(+) A-I      intronic
chr17:61740183(+) A-I      intronic
chr17:61736415(+) A-I      intronic
chr17:61751739(+) A-I      intronic
chr17:61742579(+) A-I      intronic
chr17:61749564(+) A-I      intronic
chr17:61720196(+) A-I      intronic
chr17:61737081(+) A-I      intronic
chr17:61739342(+) A-I      intronic
chr17:61739285(+) A-I      intronic
chr17:61748717(+) A-I      intronic
chr17:61757021(+) A-I      intronic
chr17:61739690(+) A-I      intronic
chr17:61740270(+) A-I      intronic
chr17:61741609(+) A-I      intronic
chr17:61708373(+) A-I      intronic
chr17:61721633(+) A-I      intronic
chr17:61737067(+) A-I      intronic
chr17:61719898(+) A-I      intronic
chr17:61746852(+) A-I      intronic
chr17:61747864(+) A-I      intronic
chr17:61746932(+) A-I      intronic
chr17:61747764(+) A-I      intronic
chr17:61739388(+) A-I      intronic
chr17:61726954(+) A-I      intronic
chr17:61740192(+) A-I      intronic
chr17:61749633(+) A-I      intronic
chr17:61739504(+) A-I      intronic
chr17:61740309(+) A-I      intronic
chr17:61747849(+) A-I      intronic
chr17:61728753(+) A-I      intronic
chr17:61720251(+) A-I      intronic
chr17:61739306(+) A-I      intronic
chr17:61740585(+) A-I      intronic
chr17:61738536(+) A-I      intronic
chr17:61748696(+) A-I      intronic
chr17:61739316(+) A-I      intronic
chr17:61740118(+) A-I      intronic
chr17:61727011(+) A-I      intronic
chr17:61747791(+) A-I      intronic
chr17:61740707(+) A-I      intronic
chr17:61757000(+) A-I      intronic
chr17:61740147(+) A-I      intronic
chr17:61749388(+) A-I      intronic
chr17:61751892(+) A-I      intronic
chr17:61756314(+) A-I      intronic
chr17:61737034(+) A-I      intronic
chr17:61751150(+) A-I      intronic
chr17:61751320(+) A-I      intronic
chr17:61739309(+) A-I      intronic
chr17:61747264(+) A-I      intronic
chr17:61749489(+) A-I      intronic
chr17:61721644(+) A-I      intronic
chr17:61740263(+) A-I      intronic
chr17:61751994(+) A-I      intronic
chr17:61707908(+) A-I      intronic
chr17:61741167(+) A-I      intronic
chr17:61720601(+) A-I      intronic
chr17:61751022(+) A-I      intronic
chr17:61741228(+) A-I      intronic
chr17:61746980(+) A-I      intronic
chr17:61746998(+) A-I      intronic
chr17:61725939(+) A-I      intronic
chr17:61740851(+) A-I      intronic
chr17:61738621(+) A-I      intronic
chr17:61751070(+) A-I      intronic
chr17:61741194(+) A-I      intronic
chr17:61751734(+) A-I      intronic
chr17:61746928(+) A-I      intronic
chr17:61748680(+) A-I      intronic
chr17:61747822(+) A-I      intronic
chr17:61728627(+) A-I      intronic
chr17:61741177(+) A-I      intronic
chr17:61756936(+) A-I      intronic
chr17:61757035(+) A-I      intronic
chr17:61732119(+) A-I      intronic
chr17:61747204(+) A-I      intronic
chr17:61736151(+) A-I      intronic
chr17:61708413(+) A-I      intronic
chr17:61747383(+) A-I      intronic
chr17:61751963(+) A-I      intronic
chr17:61739556(+) A-I      intronic
chr17:61757115(+) A-I      intronic
chr17:61751319(+) A-I      intronic
chr17:61720357(+) A-I      intronic
chr17:61715697(+) A-I      intronic
chr17:61739284(+) A-I      intronic
chr17:61747298(+) A-I      intronic
chr17:61737073(+) A-I      intronic
chr17:61749387(+) A-I      intronic
chr17:61740255(+) A-I      intronic
chr17:61747310(+) A-I      intronic
chr17:61747792(+) A-I      intronic
chr17:61746854(+) A-I      intronic
chr17:61747804(+) A-I      intronic
chr17:61733479(+) A-I      intronic
chr17:61740297(+) A-I      intronic
chr17:61751870(+) A-I      intronic
chr17:61707741(+) A-I      intronic
chr17:61737152(+) A-I      intronic
chr17:61747790(+) A-I      intronic
chr17:61732900(+) A-I      intronic
chr17:61740608(+) A-I      intronic
chr17:61722570(+) A-I      intronic
chr17:61741132(+) A-I      intronic
chr17:61728730(+) A-I      intronic
chr17:61747074(+) A-I      intronic
chr17:61742408(+) A-I      intronic
chr17:61747206(+) A-I      intronic
chr17:61716460(+) A-I      intronic
chr17:61720677(+) A-I      intronic
chr17:61740715(+) A-I      intronic
chr17:61756243(+) A-I      intronic
chr17:61736164(+) A-I      intronic
chr17:61756528(+) A-I      intronic
chr17:61756879(+) A-I      intronic
chr17:61721606(+) A-I      intronic
chr17:61717026(+) A-I      intronic
chr17:61751918(+) A-I      intronic
chr17:61733866(+) A-I      intronic
chr17:61747088(+) A-I      intronic
chr17:61728083(+) A-I      intronic
chr17:61751985(+) A-I      intronic
chr17:61733114(+) A-I      intronic
chr17:61710481(+) A-I      intronic
chr17:61760987(+) A-I      intronic
chr17:61751176(+) A-I      intronic
chr17:61739296(+) A-I      intronic
chr17:61756269(+) A-I      intronic
chr17:61720338(+) A-I      intronic
chr17:61740157(+) A-I      intronic
chr17:61726898(+) A-I      intronic
chr17:61740850(+) A-I      intronic
chr17:61749316(+) A-I      intronic
chr17:61756299(+) A-I      intronic
chr17:61721847(+) A-I      intronic
chr17:61749549(+) A-I      intronic
chr17:61747365(+) A-I      intronic
chr17:61757038(+) A-I      intronic
chr17:61736224(+) A-I      intronic
chr17:61733443(+) A-I      intronic
chr17:61746929(+) A-I      intronic
chr17:61731565(+) A-I      intronic
chr17:61748866(+) A-I      intronic
chr17:61727003(+) A-I      intronic
chr17:61741069(+) A-I      intronic
chr17:61720746(+) A-I      intronic
chr17:61757105(+) A-I      intronic
chr17:61722647(+) A-I      intronic
chr17:61726542(+) A-I      intronic
chr17:61736924(+) A-I      intronic
chr17:61737156(+) A-I      intronic
chr17:61747220(+) A-I      intronic
chr17:61751842(+) A-I      intronic
chr17:61756189(+) A-I      intronic
chr17:61721320(+) A-I      intronic
chr17:61741201(+) A-I      intronic
chr17:61736466(+) A-I      intronic
chr17:61746995(+) A-I      intronic
chr17:61703194(+) A-I      intronic
chr17:61742544(+) A-I      intronic
chr17:61720769(+) A-I      intronic
chr17:61756866(+) A-I      intronic
chr17:61747312(+) A-I      intronic
chr17:61737592(+) A-I      intronic
chr17:61740607(+) A-I      intronic
chr17:61740812(+) A-I      intronic
chr17:61720301(+) A-I      intronic
chr17:61740234(+) A-I      intronic
chr17:61707909(+) A-I      intronic
chr17:61721649(+) A-I      intronic
chr17:61747284(+) A-I      intronic
chr17:61749459(+) A-I      intronic
chr17:61740657(+) A-I      intronic
chr17:61751670(+) A-I      intronic
chr17:61756545(+) A-I      intronic
chr17:61756859(+) A-I      intronic
chr17:61728819(+) A-I      intronic
chr17:61749485(+) A-I      intronic
chr17:61751669(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED MAP3K3
chr17:61746928(+) A-I intron -    22327324
chr17:61751319(+) A-I intron -    22327324
chr17:61746928(+) A-G intron -    22484847
chr17:61746929(+) A-G intron -    22484847
chr17:61747298(+) A-G intron -    22484847
chr17:61749564(+) A-G intron -    22484847
chr17:61751319(+) A-G intron -    22484847
chr17:61751320(+) A-G intron -    22484847
chr17:61756528(+) A-G intron -    22484847
chr17:61756545(+) A-G intron -    22484847
chr17:61756554(+) A-G intron -    22484847
chr17:61756866(+) A-G intron -    22484847
chr17:61756879(+) A-G intron -    22484847
chr17:61757035(+) A-G intron -    22484847
chr17:61757105(+) A-G intron -    22484847
chr17:61757115(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase MAP3K3
chr17:61699823-61699824(+) m6A 5'UTR//intron       24209618//25456834
chr17:61699839-61699840(+) m6A 5'UTR//intron       24209618//25456834
chr17:61700089-61700090(+) m6A 5'UTR       24209618
chr17:61710044-61710045(+) m6A CDS       -
chr17:61710058-61710059(+) m6A CDS       -
chr17:61710094-61710095(+) m6A CDS       -
chr17:61710123-61710124(+) m6A CDS       -
chr17:61710133-61710134(+) m6A CDS       -
chr17:61710139-61710140(+) m6A CDS       -
chr17:61712073-61712074(+) m6A CDS//intron       -
chr17:61714194-61714195(+) m6A intron       -
chr17:61714228-61714229(+) m6A intron       -
chr17:61714243-61714244(+) m6A intron       -
chr17:61714251-61714252(+) m6A intron       -
chr17:61729948-61729949(+) Am 3'UTR//CDS       -
chr17:61729982-61729983(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863
chr17:61730008-61730009(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863
chr17:61767311-61767312(+) m6A exon//intron       -
chr17:61767707-61767708(+) m6A 3'UTR//CDS       -
chr17:61767720-61767721(+) m6A 3'UTR//CDS       -
chr17:61768546-61768547(+) m6A 3'UTR//CDS       -
chr17:61768560-61768561(+) m6A 3'UTR//CDS       -
chr17:61769105-61769106(+) m6A 3'UTR//CDS       -
chr17:61769213-61769214(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625
chr17:61769619-61769620(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618
chr17:61769646-61769647(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618
chr17:61770947-61770948(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr17:61771037-61771038(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr17:61771048-61771049(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr17:61771085-61771086(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr17:61771236-61771237(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr17:61771324-61771325(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr17:61771398-61771399(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr17:61771489-61771490(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085
chr17:61771561-61771562(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863
chr17:61772878-61772879(+) m6A 3'UTR       24284625
chr17:61773160-61773161(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085
chr17:61773172-61773173(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085
chr17:61773195-61773196(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085
chr17:61773222-61773223(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085
chr17:61773229-61773230(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085
chr17:61773253-61773254(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085
chr17:61773462-61773463(+) m6A 3'UTR       25456834//27371828
chr17:61773557-61773558(+) m6A 3'UTR       24209618//25456834//27773535
chr17:61773565-61773566(+) m6A 3'UTR       24209618//25456834//27773535

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate MAP3K3
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hcmv-miR-US25-1-5p
Interactor2: MAP3K3

Evidence Support:


Strong-Evidence RISC-IP
Support Database ViRBase

References:


PMID 20585629 Target region 5'UTR
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line HEK293 cells Interactor2 expression None
Description Here, we identify cellular transcript targets of one of the most highly expressed HCMV encoded miRNAs, miR-US25-1, using a recently developed biochemical approach called RISC immunoprecipitation. Strikingly, the majority of identified transcripts contained miR-US25-1 target sites within the 5'UTR rather than the 3'UTR.

Starting a new search, please wait ...